CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_LS483313	Staphylococcus simulans strain NCTC11046 chromosome 1	1 crisprs	csa3,WYL,DEDDh,cas3,DinG,cas2,cas1	0	5	7	0

1. NZ_LS483313

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_LS483313_1

• CRISPR_ID: NZ_LS483313_1
• CRISPR_location: 1852490-1853181
• CRISPR_type: Unclear
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 10 spacers
• Cas_protein_info: cas2,cas1

Consensus repeat of NZ_LS483313_1

Consensus_repeat	Method
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	CRISPRCasFinder
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	CRT

spacers of NZ_LS483313_1

>1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT
TAACTCTAGTGATTTGTTGTGGTACTTATC
>1.2|1852592|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT
CCTAGCTGTTCGGCGTATTGTTCCGCTTCA
>1.3|1852658|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT
GTTGTATCGACCCTCTGTCATTGAAATAA
>1.4|1852723|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT
CTAAACAAGAATGTAAATCACGTAGGAAG
>1.5|1852788|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT
CGTTGGAGCGACGGAAGAGTTAAATACGAA
>1.6|1852854|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT
TGTCGTATGTTGTACCTAACTGCTTCAAC
>1.7|1852919|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT
ACTTCCATTACTCGTGTAGGAATCATTAGA
>1.8|1852985|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT
GCGTTTTGCTCACTTGCTTTTAAAAACCTC
>1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT
TATGATAAACGAATAAAAGAATTAGGAAGT
>1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT
ATCTGTGTTGCTGATATATTTTCTTTCAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483313_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483313_1

>merge|NZ_LS483313|1|1852490-1853181|CRISPRCasFinder,CRT
TGTTTAAATCATTCTAAAAGATCACAATTCTAAAACTAACTCTAGTGATTTGTTGTGGTACTTATCGTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAACCCTAGCTGTTCGGCGTATTGTTCCGCTTCAGTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAACGTTGTATCGACCCTCTGTCATTGAAATAAGTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAACCTAAACAAGAATGTAAATCACGTAGGAAGGTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAACCGTTGGAGCGACGGAAGAGTTAAATACGAAGTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAACTGTCGTATGTTGTACCTAACTGCTTCAACGTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAACACTTCCATTACTCGTGTAGGAATCATTAGAGTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAACGCGTTTTGCTCACTTGCTTTTAAAAACCTCGTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAACTATGATAAACGAATAAAAGAATTAGGAAGTGTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAACATCTGTGTTGCTGATATATTTTCTTTCAAGTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC

>NZ_LS483313|1|1|1852490-1853181|CRISPRCasFinder
TGTTTAAATCATTCTAAAAGATCACAATTCTAAAAC	TAACTCTAGTGATTTGTTGTGGTACTTATC
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	CCTAGCTGTTCGGCGTATTGTTCCGCTTCA
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	GTTGTATCGACCCTCTGTCATTGAAATAA
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	CTAAACAAGAATGTAAATCACGTAGGAAG
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	CGTTGGAGCGACGGAAGAGTTAAATACGAA
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	TGTCGTATGTTGTACCTAACTGCTTCAAC
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	ACTTCCATTACTCGTGTAGGAATCATTAGA
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	GCGTTTTGCTCACTTGCTTTTAAAAACCTC
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	TATGATAAACGAATAAAAGAATTAGGAAGT
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	ATCTGTGTTGCTGATATATTTTCTTTCAA
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC

>NZ_LS483313|1|1|1852490-1853181|CRT
TGTTTAAATCATTCTAAAAGATCACAATTCTAAAAC	TAACTCTAGTGATTTGTTGTGGTACTTATC
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	CCTAGCTGTTCGGCGTATTGTTCCGCTTCA
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	GTTGTATCGACCCTCTGTCATTGAAATAA
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	CTAAACAAGAATGTAAATCACGTAGGAAG
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	CGTTGGAGCGACGGAAGAGTTAAATACGAA
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	TGTCGTATGTTGTACCTAACTGCTTCAAC
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	ACTTCCATTACTCGTGTAGGAATCATTAGA
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	GCGTTTTGCTCACTTGCTTTTAAAAACCTC
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	TATGATAAACGAATAAAAGAATTAGGAAGT
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC	ATCTGTGTTGCTGATATATTTTCTTTCAA
GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483313.1|WP_051035996.1|1854079_1854388_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	mkCas0206_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III	gnl|CDD|226043
NZ_LS483313.1|WP_103364183.1|1854422_1855298_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09720_cas1_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	gnl|CDD|274694
NZ_LS483313.1|WP_103363680.1|1866207_1866933_-|RNA-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225185
NZ_LS483313.1|WP_002480619.1|1846741_1847842_-|glutamine-hydrolyzing-carbamoyl-phosphate-synthase-small-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|237139
NZ_LS483313.1|WP_002480616.1|1850045_1851347_-|uracil-xanthine-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|236744
NZ_LS483313.1|WP_023015765.1|1859577_1860495_-|RluA-family-pseudouridine-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|223638
NZ_LS483313.1|WP_023015769.1|1865566_1866181_-|DivIVA-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377456
NZ_LS483313.1|WP_002480607.1|1860507_1860990_-|signal-peptidase-II	unknown	unknown	gnl|CDD|234739
NZ_LS483313.1|WP_023015755.1|1840522_1841134_-|orotate-phosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|234771
NZ_LS483313.1|WP_103364182.1|1853231_1854083_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483313.1|WP_057511005.1|1851568_1852096_-|bifunctional-pyr-operon-transcriptional-regulator/uracil-phosphoribosyltransferase-PyrR	unknown	unknown	gnl|CDD|235365
NZ_LS483313.1|WP_002480623.1|1841135_1841840_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase	unknown	unknown	gnl|CDD|234695
NZ_LS483313.1|WP_103364178.1|1842753_1843518_-|dihydroorotate-dehydrogenase-electron-transfer-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|99814
NZ_LS483313.1|WP_103364181.1|1849106_1850015_-|aspartate-carbamoyltransferase-catalytic-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|234849
NZ_LS483313.1|WP_170121965.1|1861119_1861578_-|CHAP-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226451
NZ_LS483313.1|WP_103364180.1|1847848_1849120_-|dihydroorotase	unknown	unknown	gnl|CDD|236479
NZ_LS483313.1|WP_057511010.1|1841839_1842757_-|dihydroorotate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|235982
NZ_LS483313.1|WP_103363681.1|1862584_1865332_-|isoleucine--tRNA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|235588
NZ_LS483313.1|WP_002480605.1|1861611_1862406_-|VOC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225312
NZ_LS483313.1|WP_103364179.1|1843575_1846749_-|carbamoyl-phosphate-synthase-large-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|235393

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_LS483313.1|WP_051035996.1|1854079_1854388_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	mkCas0206_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III	1.2e-33	110.1	0.3
NZ_LS483313.1|WP_103364183.1|1854422_1855298_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09720_cas1_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	3.5e-85	280.2	8.9

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483313.1|WP_051035996.1|1854079_1854388_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	gnl|CDD|226043	COG3512, COG3512, CRISPR-associated protein, Cas2 homolog [Defense mechanisms].	5.44995e-28
NZ_LS483313.1|WP_103364183.1|1854422_1855298_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	gnl|CDD|274694	TIGR03639, cas1_NMENI, CRISPR-associated endonuclease Cas1, subtype II/NMENI. The CRISPR-associated protein Cas1 is virtually universal to CRISPR systems. CRISPR, an acronym for Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats, is a prokaryotic immunity system for foreign DNA, mostly from phage. CRISPR systems belong to different subtypes, distinguished by both nature of the repeats, the makeup of the cohort of associated Cas proteins, and by molecular phylogeny within the more universal Cas proteins such as this one. This model is of type EXCEPTION and provides more specific information than the EQUIVALOG model TIGR00287. It describes the Cas1 variant of the NMENI subtype of CRISPR/Cas system.	6.18762e-92
NZ_LS483313.1|WP_103363680.1|1866207_1866933_-|RNA-binding-protein	gnl|CDD|225185	COG2302, COG2302, Uncharacterized conserved protein, contains S4-like domain [Function unknown].	1.50623e-93
NZ_LS483313.1|WP_002480619.1|1846741_1847842_-|glutamine-hydrolyzing-carbamoyl-phosphate-synthase-small-subunit	gnl|CDD|237139	PRK12564, PRK12564, carbamoyl-phosphate synthase small subunit.	0
NZ_LS483313.1|WP_002480616.1|1850045_1851347_-|uracil-xanthine-permease	gnl|CDD|236744	PRK10720, PRK10720, uracil transporter; Provisional.	1.09017e-142
NZ_LS483313.1|WP_023015765.1|1859577_1860495_-|RluA-family-pseudouridine-synthase	gnl|CDD|223638	COG0564, RluA, Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	8.28012e-124
NZ_LS483313.1|WP_023015769.1|1865566_1866181_-|DivIVA-domain-containing-protein	gnl|CDD|377456	pfam05103, DivIVA, DivIVA protein. The Bacillus subtilis divIVA1 mutation causes misplacement of the septum during cell division, resulting in the formation of small, circular, anucleate mini-cells. Inactivation of divIVA produces a mini-cell phenotype, whereas overproduction of DivIVA results in a filamentation phenotype. These proteins appear to contain coiled-coils.	1.79557e-27
NZ_LS483313.1|WP_002480607.1|1860507_1860990_-|signal-peptidase-II	gnl|CDD|234739	PRK00376, lspA, lipoprotein signal peptidase.	1.37287e-51
NZ_LS483313.1|WP_023015755.1|1840522_1841134_-|orotate-phosphoribosyltransferase	gnl|CDD|234771	PRK00455, pyrE, orotate phosphoribosyltransferase; Validated.	4.78352e-77
NZ_LS483313.1|WP_103363681.1|1862584_1865332_-|isoleucine--tRNA-ligase	gnl|CDD|235588	PRK05743, ileS, isoleucyl-tRNA synthetase; Reviewed.	0
NZ_LS483313.1|WP_057511005.1|1851568_1852096_-|bifunctional-pyr-operon-transcriptional-regulator/uracil-phosphoribosyltransferase-PyrR	gnl|CDD|235365	PRK05205, PRK05205, bifunctional pyr operon transcriptional regulator/uracil phosphoribosyltransferase PyrR.	1.72282e-88
NZ_LS483313.1|WP_002480623.1|1841135_1841840_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase	gnl|CDD|234695	PRK00230, PRK00230, orotidine-5'-phosphate decarboxylase.	1.78708e-129
NZ_LS483313.1|WP_103364178.1|1842753_1843518_-|dihydroorotate-dehydrogenase-electron-transfer-subunit	gnl|CDD|99814	cd06218, DHOD_e_trans, FAD/NAD binding domain in the electron transfer subunit of dihydroorotate dehydrogenase. Dihydroorotate dehydrogenases (DHODs) catalyze the only redox reaction in pyrimidine de novo biosynthesis. They catalyze the oxidation of (S)-dihydroorotate to orotate coupled with the reduction of NAD+. In L. lactis, DHOD B (encoded by pyrDa) is co-expressed with pyrK and both gene products are required for full activity, as well as 3 cofactors: FMN, FAD, and an [2Fe-2S] cluster.	2.03307e-121
NZ_LS483313.1|WP_103364181.1|1849106_1850015_-|aspartate-carbamoyltransferase-catalytic-subunit	gnl|CDD|234849	PRK00856, pyrB, aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit.	2.1764e-169
NZ_LS483313.1|WP_170121965.1|1861119_1861578_-|CHAP-domain-containing-protein	gnl|CDD|226451	COG3942, COG3942, Surface antigen [General function prediction only].	1.0149e-28
NZ_LS483313.1|WP_103364180.1|1847848_1849120_-|dihydroorotase	gnl|CDD|236479	PRK09357, pyrC, dihydroorotase; Validated.	0
NZ_LS483313.1|WP_057511010.1|1841839_1842757_-|dihydroorotate-dehydrogenase	gnl|CDD|235982	PRK07259, PRK07259, dihydroorotate dehydrogenase.	6.45178e-174
NZ_LS483313.1|WP_002480605.1|1861611_1862406_-|VOC-family-protein	gnl|CDD|225312	COG2514, COG2514, Predicted ring-cleavage extradiol dioxygenase [General function prediction only].	4.78216e-79
NZ_LS483313.1|WP_103364179.1|1843575_1846749_-|carbamoyl-phosphate-synthase-large-subunit	gnl|CDD|235393	PRK05294, carB, carbamoyl-phosphate synthase large subunit.	0

Protein sequences

>NZ_LS483313.1|WP_057511005.1|1851568_1852096_-|bifunctional-pyr-operon-transcriptional-regulator/uracil-phosphoribosyltransferase-PyrR
MTERIVLDDAGMQRTLTRIAHEILEYNKGTENLVLLGVKTRGEFLAKRIQTKIQQIEDVSVPTGTLDITQFRDDLELPTPKMSEKSYVIDVDLKDKVVIIIDDVLYTGRTVRASLDAILLHSRPQKIGLATLVDRGHRELPIRADFVGKNIPTAKDEEVLVYVDETDGRNAVIIE
>NZ_LS483313.1|WP_002480616.1|1850045_1851347_-|uracil-xanthine-permease
MENEQMFERTVKPVLDVNEKPKAGQWAFLSLQHLFAMFGATVLVPFLTGLPISAALLASGIGTLLYILITKSMIPAYLGSSFAFITPIITGLSTHSLGDMLVALFMSGVMYVIIGILIKLSGIGWLMHLLPPVVVGPVIMVIGLSLAPTAANMAMFENTADMKGYNVTYLIVAMITLITTLVVQGYMKGFFSLIPVLIGIIVGYIAGIIFGIVDFKPVMKASWFDWPHIYVPFVDYHPSFHFGLVLLMVPIVFVTVSEHIGHQMVINKIVGRNFFEKPGLHRSIIGDGVSTMFASIIGGPPSTTYGENIGVLAITKIYSIYVIGGAAVIAIILAFVGKFTALISSIPTPVMGGVSILLFGIIASSGLRMLVESKVDFSENRNLVIASVILVVGIGNLMFDIHGVKVEGMALAALSGIVLNLILPKVKPETSNK
>NZ_LS483313.1|WP_103364181.1|1849106_1850015_-|aspartate-carbamoyltransferase-catalytic-subunit
MKQLVSMEHLSNEEIYSLIETAIEYKQGKKVHKLNDTYVANLFFENSTRTKCSFEMAEHRLGMQEIPFETSTSSVKKGESLYDTCKTLESIGVDALVIRHPQNDYYKELEGLNIPVINGGDGSGQHPTQSLLDIMTIYEEYKKFKGLNVLICGDIKNSRVARSNYQALTALGANVKFAAPDEWVDDTLDAPYVKIDDVIEETDIVMLLRVQHERHDGELNFDPHEYHEKYGLTKERYNRMKPNAIVMHPAPVNRGVEIDTELVEAPKARIFKQMKNGMFLRMSVISHIIAEQQKGVLIDVAN
>NZ_LS483313.1|WP_103364180.1|1847848_1849120_-|dihydroorotase
MLLIKNAKVLKDGKLTEASILVEDDKVKEIAPEITVGSEVEVIDAKGRFAAPGLVDVHVHLREPGGEHKETIETGTKAAARGGFTTVCPMPNTRPVPDTVEHLEKLNKLIEDNARVRVLPYASITIRQAGSELVDFKGLAEHGAFAFTDDGVGVQTAGTMYEAMQQAAKLNKAVVAHCEDNSLIYGGAMHEGIRSKELGIPGIPNICEAVQIARDVLLAEAADCHYHVCHVSTKESVRAIRDAKAAGIKVTAEVTPHHLLMTEDDVPGDNAMYKMNPPLRSKEDRDALIEGLLDGTIDCIATDHAPHAADEKAQPMTKAPFGIVGSETAFPLLYTHFVKNGDWSLQQLVDYLTIKPAQIFDLPYGILEEGKTADLTLIDLEEEREIKAEDFHSKASNTPFIGYKVYGNPVLTMVAGEVAFKEE
>NZ_LS483313.1|WP_002480619.1|1846741_1847842_-|glutamine-hydrolyzing-carbamoyl-phosphate-synthase-small-subunit
MLEKRYLVFEDGSIYEGRKLGSDNLTKGEIVFNTAMTGYQETISDPSYTGQIITFTYPLIGNYGINRDDFESLVPTLSGVVVKEASTHPSNFRQQKTFNDVLVQYDIPGISGVDTRSITRKIREHGVLKAGFTDHAEDIPAFIEELKQFELSRDEVPMVSTKTPYVSTGSDLSVVLVDFGKKQNIVRELNARGCNVTVVPYNTPAEIILGMSPDGVMLSNGPGDPEDVPEAVEMIQGILGKIPFFGICLGHQLFALSQGAEAFKMKFGHRGANHPVKDLATGKIALTSQNHGYAIDEASVAHTDLEVTHIALNDGTVEGLKHKTLPAFSVQYHPEACPGPTDSNYLFDQFIDMMKEFKAKERTVNA
>NZ_LS483313.1|WP_103364179.1|1843575_1846749_-|carbamoyl-phosphate-synthase-large-subunit
MPRNNDIKTILVIGSGPIIIGQAAEFDYAGTQACLALKEEGYRVILVNSNPATIMTDKEIADKVYIEPLTHDFIARIIRKEQPDALLPTLGGQTGLNMAIQLHDSGVLEANNVRLLGTKLSSIQQAEDRELFRSLMNDLDVPVPESDIVHTVEQAFAFKEQVGYPLIVRPAFTMGGTGGGICHNDEELKEVVTNGLHYSPATQCLIEKSIAGFKEIEYEVMRDKNDNAIVVCNMENIDPVGIHTGDSIVVAPSQTLTDVEYQMLRDVSLKVIRALGIEGGCNVQLALDPYSMNYYIIEVNPRVSRSSALASKATGYPIAKLAAKIAVGLTLDEMLNPVTGTSYAAFEPALDYVISKIPRFPFDKFEKGERVLGTQMKATGEVMAIGRTYEESLLKAIRSLEYGVHHLGLPNGESYDLDYIKERILQQDDERLFFIGEAIRRGTTLEEIHEMTKIDYFFLNKFQHIIDIERELKAHKGDIEYLKYAKDYGFSDKVIAHRFDMEEEDVYRLRHENDIKPVYKMVDTCAAEFESATPYYYGTYERDNESIVTDKEKVIVLGSGPIRIGQGVEFDYATVHAVWAIQNAGYEAIIVNNNPETVSTDFSISDKLYFEPLTEEDVMNIIELEQPKGVVVQFGGQTAINLAEKLAKHGVQILGTSLENLNRAEDRKEFEELLNTIDVPQPKGKTATSPAEALDNAREIGYPVVVRPSYVLGGRAMEIVYNDAELENYMREAVKASPEHPVLVDRYLTGKEIEVDAISDGETVIIPGIMEHIERAGVHSGDSIAVYPPQTLSDEVIQTLEAYTTKLAKGLDIIGLINIQFVLAHDGVYVLEVNPRSSRTVPFLSKITDIPMAQLAMRAILGEKLSELGYKPGLQPYSEGVYVKAPVFSFNKLKNVDITLGPEMKSTGEVMGKDLTLEKALFKGLTASGVEVKDHGTVLITVSDKDKEKMVKIAKRLHEVGYKVLATSGTAAKLAENHIPVETVGKIGGEDDLLNRIQNGDVQIVINTMTKGKTIERDGFQIRRASVENGVPCLTSLDTANALTNVIESMTFTMRSM
>NZ_LS483313.1|WP_103364178.1|1842753_1843518_-|dihydroorotate-dehydrogenase-electron-transfer-subunit
MEQNIIVSNREIADRIFEIKVKGPVTRKMTQPGQFVHIKVGEGSLHMLRRPISICHIEPEIETFTMLYRAEGAGTQRLSQMRENDAIDIIAPLGNGFPVEKAERKALLVGGGIGVPPLYELSKQLNRQGIETVHVLGFRSKKDVFYADEFAQLGETHIVTEDGTMGSKGFVTNVISELPVDYDIYYTCGPKPMLKAIKEHDKLADVEGFLSLEERMGCGIGACYACVCHTPESETSYVKVCTEGPVFEKGAVIL
>NZ_LS483313.1|WP_057511010.1|1841839_1842757_-|dihydroorotate-dehydrogenase
MSRLNVEIPGLELKNPIMPASGCFAFGAEFSQFYDLSELGAIMIKAATKEARYGNETPRVAETDSGMINAIGLQNPGVHHIIEHELKKLEQFDVPIIANVAGSTEEDYVYVAEHISKAPNVKALELNISCPNVKEGGMQFGVDPVVAAELTRKVKAVSEVPVYVKLSPNVTDIVAMAKAIAQYADGLTMINTLVGLRIDAKTGRPIIANTVGGLSGPAIKPVAMRMVYQVRQAVDIPIIAMGGVQNAQDVIDYISVGANAVAVGTANFQNPMVCKEIIDELPALLDDLGVNHINELYKRTFEVTK
>NZ_LS483313.1|WP_002480623.1|1841135_1841840_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase
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>NZ_LS483313.1|WP_103363680.1|1866207_1866933_-|RNA-binding-protein
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MGE targeting detection<

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NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135476	Enterococcus faecium isolate E8423 plasmid 2	114923-114952	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135175	Enterococcus faecium isolate E4402 plasmid 2	133565-133594	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135180	Enterococcus faecium isolate E0595 plasmid 2	137978-138007	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135227	Enterococcus faecium isolate E7025 plasmid 2	133686-133715	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135489	Enterococcus faecium isolate E8414 plasmid 2	198652-198681	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135365	Enterococcus faecium isolate E8195 plasmid 2	190785-190814	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135220	Enterococcus faecium isolate E7040 plasmid 2	151423-151452	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135415	Enterococcus faecium isolate E8328 plasmid 2	208788-208817	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135395	Enterococcus faecium isolate E8290 plasmid 2	208788-208817	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NC_021987	Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1, complete sequence	72749-72778	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135345	Enterococcus faecium isolate E8202 plasmid 2	157810-157839	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135325	Enterococcus faecium isolate E7654 plasmid 2	148757-148786	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135358	Enterococcus faecium isolate E7948 plasmid 2	277868-277897	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135358	Enterococcus faecium isolate E7948 plasmid 2	95957-95986	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135409	Enterococcus faecium isolate E8284 plasmid 2	208788-208817	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135352	Enterococcus faecium isolate E8014 plasmid 2	222979-223008	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135352	Enterococcus faecium isolate E8014 plasmid 2	113075-113104	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135385	Enterococcus faecium isolate E7933 plasmid 2	207241-207270	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP044265	Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-1, complete sequence	180575-180604	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135318	Enterococcus faecium isolate E7663 plasmid 2	148728-148757	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR134106	Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 2	150004-150033	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135373	Enterococcus faecium isolate E8172 plasmid 2	128282-128311	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR132068	Enterococcus faecium isolate E0139 plasmid 2	139988-140017	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_AP019395	Enterococcus faecium strain QU 50 plasmid pQL50, complete sequence	178277-178306	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP045013	Enterococcus faecium strain LAC7.2 plasmid pI, complete sequence	162028-162057	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP040741	Enterococcus faecium strain VRE1 plasmid pVRE1-1, complete sequence	224572-224601	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP040741	Enterococcus faecium strain VRE1 plasmid pVRE1-1, complete sequence	99106-99135	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP014530	Enterococcus faecium strain E745 plasmid pl1, complete sequence	189428-189457	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP023424	Enterococcus faecium strain K60-39 plasmid pTT39_p1, complete sequence	181601-181630	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_AP022342	Enterococcus faecium strain KUHS13 plasmid pKO1, complete sequence	181301-181330	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP040704	Enterococcus faecium strain HOU503 plasmid p1, complete sequence	45500-45529	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP040873	Enterococcus faecium strain DB-1 plasmid punnamed1	18042-18071	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP044275	Enterococcus faecium strain V2937 plasmid pHVH-V2937-1, complete sequence	169992-170021	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP017793	Enterococcus faecium strain E240 plasmid unnamed1, complete sequence	139442-139471	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP035655	Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed1, complete sequence	115308-115337	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP035655	Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed1, complete sequence	241361-241390	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP023790	Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04462.3A plasmid pER04462.3A.1, complete sequence	168717-168746	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP023800	Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04526.5A plasmid pER04526.5A.1, complete sequence	172189-172218	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP035137	Enterococcus faecium strain SRCM103341 plasmid unnamed1, complete sequence	165176-165205	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP035661	Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence	108939-108968	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP035661	Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence	279451-279480	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP035667	Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence	108824-108853	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP035667	Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence	279318-279347	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR134096	Enterococcus faecium isolate E1334 plasmid 2	109546-109575	6	0.8
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NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP035649	Enterococcus faecium strain UAMSEF_01 plasmid unnamed1, complete sequence	241427-241456	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP040850	Enterococcus faecium strain F17E0263 plasmid p_unnamned1, complete sequence	25237-25266	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_LR135171	Enterococcus faecium isolate E4227 plasmid 2	150715-150744	6	0.8
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NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP037956	Enterococcus hirae strain CQP3-9 plasmid pCQP3-9_1, complete sequence	32805-32834	6	0.8
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NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP018066	Enterococcus faecium strain E1 plasmid pE1_230, complete sequence	147833-147862	6	0.8
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NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP023805	Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04619.3A isolate isolate plasmid pER04619.3A.1, complete sequence	170856-170885	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP035221	Enterococcus faecium strain SRCM103470 plasmid unnamed1	72446-72475	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_AP019409	Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence	105595-105624	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NC_020208	Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence	224-253	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP034948	Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed5, complete sequence	128600-128629	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP016164	Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_11 plasmid ISMMS_VRE11_p1, complete sequence	147235-147264	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP018827	Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence	176754-176783	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP018827	Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence	213322-213351	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	LR135186	Enterococcus faecium isolate E4413 genome assembly, plasmid: 2	171077-171106	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP023795	Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04484.3A plasmid pER04484.3A.1, complete sequence	172202-172231	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_MG674581	Enterococcus faecium strain HL1 plasmid pHLSA, complete sequence	156704-156733	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP023781	Enterococcus faecium strain Efaecium_ER03933.3A isolate isolate plasmid pER93933.3A.1, complete sequence	169525-169554	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	MK719709	Rheinheimera phage vB_RspM_Barba5A, complete genome	5396-5425	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	MK719748	Rheinheimera phage vB_RspM_Barba29S, complete genome	5396-5425	6	0.8
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NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP040905	Enterococcus faecium strain N56454 plasmid unnamed, complete sequence	161464-161493	6	0.8
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NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NC_017395	Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp26, complete sequence	8604-8633	6	0.8
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NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NC_019225	Borrelia burgdorferi plasmid cp26, complete sequence	8601-8630	6	0.8
NZ_LS483313_1	1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853117-1853145	29	NC_022650	Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_4, complete sequence	742-770	6	0.793
NZ_LS483313_1	1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853117-1853145	29	MN692949	Marine virus AFVG_117M85, complete genome	10014-10042	6	0.793
NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NZ_LR215005	Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 9	135880-135909	7	0.767
NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NZ_LR214999	Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 3	10338-10367	7	0.767
NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NC_014937	Bacillus thuringiensis CT43 plasmid pBMB0558, complete sequence	85570-85599	7	0.767
NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NZ_CP010580	Bacillus thuringiensis serovar morrisoni strain BGSC 4AA1 plasmid pBMB76, complete sequence	55567-55596	7	0.767
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NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	KY554772	Lactococcus phage AM5, complete genome	70627-70656	7	0.767
NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NC_049856	Lactococcus phage AM4, complete genome	52672-52701	7	0.767
NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NZ_CP004875	Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMB95, complete sequence	64857-64886	7	0.767
NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NC_017202	Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT127, complete sequence	123734-123763	7	0.767
NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NZ_CP011357	Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC20, complete sequence	79026-79055	7	0.767
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NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NZ_CP021063	Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh2, complete sequence	59288-59317	7	0.767
NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NC_020239	Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT77, complete sequence	73498-73527	7	0.767
NZ_LS483313_1	1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853117-1853145	29	ACSJ01000017	Clostridium phage D-1873 CLG.Contig173, whole genome shotgun sequence	46594-46622	7	0.759
NZ_LS483313_1	1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853117-1853145	29	MK672798	Escherichia phage Skure, complete genome	53260-53288	7	0.759
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP022766	Ralstonia solanacearum strain T78 plasmid unnamed, complete sequence	588177-588206	8	0.733
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NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052069	Ralstonia solanacearum strain FJAT91.F50 plasmid Plas1, complete sequence	576896-576925	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP022769	Ralstonia solanacearum strain T60 plasmid unnamed, complete sequence	590631-590660	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP022791	Ralstonia solanacearum strain SL3103 plasmid unnamed, complete sequence	507050-507079	8	0.733
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NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP022779	Ralstonia solanacearum strain SL3882 plasmid unnamed, complete sequence	590636-590665	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052075	Ralstonia solanacearum strain FJAT448.F1 plasmid Plas1, complete sequence	606447-606476	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052105	Ralstonia solanacearum strain FJAT15252.F1 plasmid Plas1, complete sequence	606448-606477	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052077	Ralstonia solanacearum strain FJAT445.F50 plasmid Plas1, complete sequence	584321-584350	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052115	Ralstonia solanacearum strain FJAT1463.F50 plasmid Plas1, complete sequence	606450-606479	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052079	Ralstonia solanacearum strain FJAT445.F1 plasmid Plas1, complete sequence	584349-584378	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052107	Ralstonia solanacearum strain FJAT15249.F50 plasmid Plas1, complete sequence	606450-606479	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052117	Ralstonia solanacearum strain FJAT1463.F1 plasmid Plas1, complete sequence	606450-606479	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052125	Ralstonia solanacearum strain FJAT1452.F1 plasmid Plas1, complete sequence	584349-584378	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP022793	Ralstonia solanacearum strain SL2729 plasmid unnamed, complete sequence	606376-606405	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP022785	Ralstonia solanacearum strain SL3730 plasmid unnamed, complete sequence	606324-606353	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP022787	Ralstonia solanacearum strain SL3300 plasmid unnamed, complete sequence	636439-636468	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP022756	Ralstonia solanacearum strain T117 plasmid unnamed, complete sequence	592648-592677	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052121	Ralstonia solanacearum strain FJAT1458.F1 plasmid Plas1, complete sequence	606450-606479	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052123	Ralstonia solanacearum strain FJAT1452.F50 plasmid Plas1, complete sequence	584349-584378	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052073	Ralstonia solanacearum strain FJAT448.F50 plasmid Plas1, complete sequence	606444-606473	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052081	Ralstonia solanacearum strain FJAT442.F50 plasmid Plas1, complete sequence	584349-584378	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052083	Ralstonia solanacearum strain FJAT442.F1 plasmid Plas1, complete sequence	584349-584378	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052109	Ralstonia solanacearum strain FJAT15249.F1 plasmid Plas1, complete sequence	606450-606479	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052103	Ralstonia solanacearum strain FJAT15252.F50 plasmid Plas1, complete sequence	606450-606479	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP052119	Ralstonia solanacearum strain FJAT1458.F50 plasmid Plas1, complete sequence	606450-606479	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP016613	Ralstonia solanacearum FJAT-91 plasmid unnamed1, complete sequence	53134-53163	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP016905	Ralstonia solanacearum strain KACC 10709 plasmid unnamed1	1560257-1560286	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP015851	Ralstonia solanacearum strain YC40-M plasmid, complete sequence	1587909-1587938	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852526-1852555	30	NZ_CP022781	Ralstonia solanacearum strain SL3822 plasmid unnamed, complete sequence	1505979-1506008	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.8|1852985|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852985-1853014	30	AP014110	Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C35-MedDCM-OCT-S36-C65, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***	27366-27395	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.8|1852985|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852985-1853014	30	NZ_CP013238	Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence	721125-721154	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.8|1852985|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852985-1853014	30	NZ_CP039041	Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence	197404-197433	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	JQ680370	Unidentified phage clone 2204_scaffold812 genomic sequence	20277-20306	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	NC_047911	Faecalibacterium phage FP_Lagaffe, complete genome	28291-28320	8	0.733
NZ_LS483313_1	1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853117-1853145	29	NZ_LR134399	Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 2, complete sequence	40551-40579	8	0.724
NZ_LS483313_1	1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853117-1853145	29	NZ_CP045273	Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence	730421-730449	8	0.724
NZ_LS483313_1	1.2|1852592|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852592-1852621	30	NC_022049	Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI4, complete sequence	236234-236263	9	0.7
NZ_LS483313_1	1.8|1852985|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1852985-1853014	30	EU861004	Staphylococcus phage phiSauS-IPLA88, complete genome	19444-19473	9	0.7
NZ_LS483313_1	1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT	1853051-1853080	30	MK448925	Streptococcus phage Javan386, complete genome	6458-6487	9	0.7

1. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011282 (Enterococcus faecium strain E39 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* * **************** ** ****  

2. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to LT603679 (Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* * **************** ** ****  

3. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to LT603679 (Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

taactctagtgatttgttgtggtacttatc	CRISPR spacer
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* * **************** ** ****  

4. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018832 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* * **************** ** ****  

5. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018832 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* * **************** ** ****  

6. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040369 (Enterococcus faecium strain VB3240 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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7. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040369 (Enterococcus faecium strain VB3240 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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8. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043485 (Enterococcus faecium strain DMEA02 plasmid pDMEA1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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9. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020485 (Enterococcus faecium strain CFSAN059070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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10. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020485 (Enterococcus faecium strain CFSAN059070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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11. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041262 (Enterococcus faecium strain VVEswe-R plasmid pVVEswe-R1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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12. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012367 (Enterococcus durans strain KLDS 6.0933 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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13. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013995 (Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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14. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013995 (Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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15. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018073 (Enterococcus faecium strain VRE001 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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16. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027518 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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17. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027518 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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18. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027498 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004167 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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19. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027507 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004055 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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20. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027507 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004055 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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21. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027502 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004142 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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22. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135298 (Enterococcus faecium isolate E7429 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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23. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135288 (Enterococcus faecium isolate E7199 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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24. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135333 (Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 3) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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25. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT074686 (Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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26. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025756 (Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-99d7, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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27. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025756 (Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-99d7, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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28. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027513 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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29. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135244 (Enterococcus faecium isolate E6988 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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30. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135279 (Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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31. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135279 (Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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32. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135783 (Enterococcus faecium isolate E4239 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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33. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135294 (Enterococcus faecium isolate E7237 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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34. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135255 (Enterococcus faecium isolate E7098 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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35. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135236 (Enterococcus faecium isolate E7067 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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36. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135198 (Enterococcus faecium isolate E6055 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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37. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135259 (Enterococcus faecium isolate E4457 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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38. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135182 (Enterococcus faecium isolate E1774 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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39. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019209 (Enterococcus faecium strain 2014-VREF-41 plasmid p41-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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40. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019209 (Enterococcus faecium strain 2014-VREF-41 plasmid p41-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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41. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019989 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-63 plasmid p63-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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42. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019989 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-63 plasmid p63-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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43. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017798 (Enterococcus faecium strain E243 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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44. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135429 (Enterococcus faecium isolate E8927 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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45. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135436 (Enterococcus faecium isolate E8691 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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46. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135483 (Enterococcus faecium isolate E4456 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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47. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135476 (Enterococcus faecium isolate E8423 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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48. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135476 (Enterococcus faecium isolate E8423 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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49. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135175 (Enterococcus faecium isolate E4402 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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50. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135180 (Enterococcus faecium isolate E0595 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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51. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135227 (Enterococcus faecium isolate E7025 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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52. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135489 (Enterococcus faecium isolate E8414 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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53. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135365 (Enterococcus faecium isolate E8195 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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54. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135220 (Enterococcus faecium isolate E7040 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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55. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135415 (Enterococcus faecium isolate E8328 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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56. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135395 (Enterococcus faecium isolate E8290 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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57. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021987 (Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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58. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135345 (Enterococcus faecium isolate E8202 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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59. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135325 (Enterococcus faecium isolate E7654 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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60. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135358 (Enterococcus faecium isolate E7948 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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61. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135358 (Enterococcus faecium isolate E7948 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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62. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135409 (Enterococcus faecium isolate E8284 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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63. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135352 (Enterococcus faecium isolate E8014 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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64. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135352 (Enterococcus faecium isolate E8014 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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65. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135385 (Enterococcus faecium isolate E7933 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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66. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044265 (Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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67. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135318 (Enterococcus faecium isolate E7663 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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68. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134106 (Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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69. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135373 (Enterococcus faecium isolate E8172 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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70. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR132068 (Enterococcus faecium isolate E0139 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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71. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019395 (Enterococcus faecium strain QU 50 plasmid pQL50, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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72. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045013 (Enterococcus faecium strain LAC7.2 plasmid pI, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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73. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040741 (Enterococcus faecium strain VRE1 plasmid pVRE1-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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74. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040741 (Enterococcus faecium strain VRE1 plasmid pVRE1-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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75. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014530 (Enterococcus faecium strain E745 plasmid pl1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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76. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023424 (Enterococcus faecium strain K60-39 plasmid pTT39_p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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77. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP022342 (Enterococcus faecium strain KUHS13 plasmid pKO1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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78. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040704 (Enterococcus faecium strain HOU503 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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79. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040873 (Enterococcus faecium strain DB-1 plasmid punnamed1) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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80. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044275 (Enterococcus faecium strain V2937 plasmid pHVH-V2937-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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81. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017793 (Enterococcus faecium strain E240 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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82. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035655 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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83. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035655 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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84. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023790 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04462.3A plasmid pER04462.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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85. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023800 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04526.5A plasmid pER04526.5A.1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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86. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035137 (Enterococcus faecium strain SRCM103341 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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87. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035661 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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88. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035661 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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89. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035667 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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90. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035667 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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91. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134096 (Enterococcus faecium isolate E1334 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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92. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035649 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_01 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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93. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035649 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_01 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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94. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040850 (Enterococcus faecium strain F17E0263 plasmid p_unnamned1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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95. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135171 (Enterococcus faecium isolate E4227 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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96. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135192 (Enterococcus faecium isolate E4438 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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97. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041271 (Enterococcus faecium strain VVEswe-S plasmid pVVEswe-S1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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98. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP037956 (Enterococcus hirae strain CQP3-9 plasmid pCQP3-9_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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99. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135308 (Enterococcus faecium isolate E7240 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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100. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040237 (Enterococcus faecium strain VB3025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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101. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018066 (Enterococcus faecium strain E1 plasmid pE1_230, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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102. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023809 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04526.3A plasmid pER04562.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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103. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023805 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04619.3A isolate isolate plasmid pER04619.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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104. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035221 (Enterococcus faecium strain SRCM103470 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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105. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019409 (Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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106. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020208 (Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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107. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034948 (Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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108. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016164 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_11 plasmid ISMMS_VRE11_p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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109. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018827 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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110. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018827 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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111. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to LR135186 (Enterococcus faecium isolate E4413 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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112. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023795 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04484.3A plasmid pER04484.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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113. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG674581 (Enterococcus faecium strain HL1 plasmid pHLSA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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114. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023781 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER03933.3A isolate isolate plasmid pER93933.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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115. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719709 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba5A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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116. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719748 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba29S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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117. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719716 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba10A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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118. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497235 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-9H, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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119. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497268 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-9B, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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120. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719713 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba8A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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121. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497239 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-6A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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122. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719753 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba34A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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123. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497261 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-8C, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

124. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497273 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-9G, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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125. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719746 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba28S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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126. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497255 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-7G, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

127. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719734 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba21S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

128. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497254 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-7F, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

129. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497238 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba11-8A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

130. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719744 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba27S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

131. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719717 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba10S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

132. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719732 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba20S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

133. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497247 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-6I, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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134. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497263 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-8F, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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135. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719711 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba6A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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136. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497278 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba13-8A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

137. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497250 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-7B, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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138. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719727 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba17A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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139. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719743 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba26S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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140. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719724 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba15A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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141. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497276 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba13-4A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

142. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497234 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-9G, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

143. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719708 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba4S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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144. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497249 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-7A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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145. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048191 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba21A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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146. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497269 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-9C, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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147. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497248 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-6J, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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148. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719725 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba15S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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149. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719712 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba7A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

150. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497274 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-9I, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

151. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497228 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-9A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

152. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497271 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-9E, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

153. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719704 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba2S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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154. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497244 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-6F, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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155. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719705 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba3A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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156. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719706 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba3S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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157. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048188 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba8S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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158. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719735 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba22A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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159. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719751 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba32A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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160. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048189 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba18A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

161. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719707 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba4A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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162. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497277 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba13-6A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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163. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719721 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba13A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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164. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497233 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-9F, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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165. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719701 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba1A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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166. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719722 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba14A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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167. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497241 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-6C, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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168. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497252 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-7D, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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169. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719738 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba23S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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170. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719737 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba23A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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171. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719703 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba2A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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172. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719739 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba24S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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173. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719715 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba9A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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174. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719741 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba25S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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175. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497240 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-6B, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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176. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719754 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba35A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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177. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719720 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba12S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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178. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719749 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba30A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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179. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719752 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba33A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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180. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719728 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba17S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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181. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497253 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-7E, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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182. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719702 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba1S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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183. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497229 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-9B, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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184. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719718 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba11S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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185. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719719 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba12A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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186. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719745 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba28A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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187. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497251 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-7C, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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188. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719740 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba25A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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189. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048187 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba5S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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190. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719726 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba16S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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191. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497267 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-9A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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192. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497237 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-9J, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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193. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719742 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba26A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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194. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497275 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-9J, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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195. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719736 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba22S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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196. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497224 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba1-3A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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197. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497262 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-8E, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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198. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497243 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-6E, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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199. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719747 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba29A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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200. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497265 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-8H, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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201. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497279 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba5-7A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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202. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719723 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba14S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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203. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497231 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-9D, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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204. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK719731 (Rheinheimera phage vB_RspM_Barba20A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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205. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025426 (Enterococcus faecium strain SC4 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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206. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025426 (Enterococcus faecium strain SC4 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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207. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040906 (Enterococcus faecium strain FB-1 plasmid punnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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208. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027401 (Enterococcus faecium strain FDAARGOS_323 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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209. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012385 (Enterococcus durans strain KLDS 6.0930 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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210. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014450 (Enterococcus faecium strain ATCC 700221 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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211. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135340 (Enterococcus faecium isolate E7356 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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212. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046076 (Enterococcus faecium strain VRE plasmid p5_03A17012, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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213. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046076 (Enterococcus faecium strain VRE plasmid p5_03A17012, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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214. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040905 (Enterococcus faecium strain N56454 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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215. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041256 (Enterococcus faecium strain 515 plasmid p26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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216. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR135204 (Enterococcus faecium isolate E7171 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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217. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050649 (Enterococcus faecium strain BIOPOP-3 ALE plasmid pBIOPOP-3_ALE) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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218. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050651 (Enterococcus faecium strain BIOPOP-3 WT plasmid pBIOPOP-3_WT) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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219. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011829 (Enterococcus faecium strain UW8175 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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220. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LN999988 (Enterococcus faecium isolate EFE11651 plasmid II, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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221. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033042 (Enterococcus faecium strain Enterococcus faecium JE1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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222. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025687 (Enterococcus faecium strain CBA7134 plasmid pCBA710401, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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223. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040877 (Enterococcus faecium strain HB-1 plasmid punnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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224. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032307 (Enterococcus faecium strain HY07 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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225. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019993 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-268 plasmid p268-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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226. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019993 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-268 plasmid p268-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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227. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017963 (Enterococcus faecium DO plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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228. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042840 (Enterococcus sp. DA9 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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229. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033207 (Enterococcus faecium strain RBWH1 plasmid pRBWH1.1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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230. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018129 (Enterococcus faecium strain A_020709_82 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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231. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034947 (Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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232. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042833 (Enterococcus faecium strain FA3 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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233. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012461 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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234. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012461 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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235. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LT598664 (Enterococcus faecium isolate Ef_aus00233 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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236. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497264 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-8G, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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237. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497226 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-8B, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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238. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497232 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-9E, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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239. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497256 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-7H, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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240. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497242 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-6D, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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241. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497246 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-6H, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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242. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497260 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-8B, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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243. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497272 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-9F, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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244. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497225 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-8A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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245. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497257 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-7I, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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246. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497227 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-8D, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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247. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497266 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-8I, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

248. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497270 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-9D, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

249. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497258 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-7J, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

250. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497230 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-9C, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

251. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497259 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-8A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

252. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497236 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba10-9I, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

253. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT497245 (Rheinheimera phage vB_RspM_barba12-6G, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .* ***.********.*********** *

254. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018983 (Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* ******** ************ ..** *

255. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017401 (Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* ******** ************ ..** *

256. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017395 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* ******** ************ ..** *

257. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031398 (Borreliella burgdorferi strain MM1 plasmid plsm_cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* ******** ************ ..** *

258. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017202 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* ******** ************ ..** *

259. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019225 (Borrelia burgdorferi plasmid cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* ******** ************ ..** *

260. spacer 1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022650 (Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

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   * ********** ************ 

261. spacer 1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN692949 (Marine virus AFVG_117M85, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

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 ********* ******** **** *..*

262. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR215005 (Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 9) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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  *** ******************..**..

263. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214999 (Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 3) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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  *** ******************..**..

264. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014937 (Bacillus thuringiensis CT43 plasmid pBMB0558, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

265. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010580 (Bacillus thuringiensis serovar morrisoni strain BGSC 4AA1 plasmid pBMB76, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

266. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013058 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

267. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007614 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB95, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

268. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP020756 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-17, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

269. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to KY554772 (Lactococcus phage AM5, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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  ******* ****.********** *.*.

270. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049856 (Lactococcus phage AM4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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  ******* ****.********** *.*.

271. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004875 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMB95, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

272. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017202 (Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT127, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

273. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011357 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC20, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

274. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015155 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

275. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004868 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB94, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

276. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010110 (Bacillus thuringiensis serovar indiana strain HD521 plasmid pBTHD521-4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

277. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020393 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-107, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

278. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010092 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB126, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

279. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021063 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

280. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020239 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT77, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **  ****** *************.**. 

281. spacer 1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to ACSJ01000017 (Clostridium phage D-1873 CLG.Contig173, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

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 .   **************  ********

282. spacer 1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK672798 (Escherichia phage Skure, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

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...******.*************.**.* 

283. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022766 (Ralstonia solanacearum strain T78 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

284. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016555 (Ralstonia solanacearum FJAT-1458 plasmid plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

285. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052069 (Ralstonia solanacearum strain FJAT91.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

286. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022769 (Ralstonia solanacearum strain T60 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

287. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022791 (Ralstonia solanacearum strain SL3103 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

288. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052071 (Ralstonia solanacearum strain FJAT454.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

289. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022779 (Ralstonia solanacearum strain SL3882 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

290. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052075 (Ralstonia solanacearum strain FJAT448.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

291. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052105 (Ralstonia solanacearum strain FJAT15252.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

292. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052077 (Ralstonia solanacearum strain FJAT445.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

293. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052115 (Ralstonia solanacearum strain FJAT1463.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

294. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052079 (Ralstonia solanacearum strain FJAT445.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

295. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052107 (Ralstonia solanacearum strain FJAT15249.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

296. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052117 (Ralstonia solanacearum strain FJAT1463.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

297. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052125 (Ralstonia solanacearum strain FJAT1452.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

298. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022793 (Ralstonia solanacearum strain SL2729 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

299. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022785 (Ralstonia solanacearum strain SL3730 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

300. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022787 (Ralstonia solanacearum strain SL3300 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

301. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022756 (Ralstonia solanacearum strain T117 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

302. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052121 (Ralstonia solanacearum strain FJAT1458.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

303. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052123 (Ralstonia solanacearum strain FJAT1452.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

304. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052073 (Ralstonia solanacearum strain FJAT448.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

305. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052081 (Ralstonia solanacearum strain FJAT442.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

306. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052083 (Ralstonia solanacearum strain FJAT442.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

307. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052109 (Ralstonia solanacearum strain FJAT15249.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

308. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052103 (Ralstonia solanacearum strain FJAT15252.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

309. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052119 (Ralstonia solanacearum strain FJAT1458.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

310. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016613 (Ralstonia solanacearum FJAT-91 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

311. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016905 (Ralstonia solanacearum strain KACC 10709 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

312. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015851 (Ralstonia solanacearum strain YC40-M plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

313. spacer 1.1|1852526|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022781 (Ralstonia solanacearum strain SL3822 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * *  ************ ********  .

314. spacer 1.8|1852985|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014110 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C35-MedDCM-OCT-S36-C65, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*.. ******************* ** ...

315. spacer 1.8|1852985|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*   ************* ******* *. .

316. spacer 1.8|1852985|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.. ********** ***** ******.  *

317. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to JQ680370 (Unidentified phage clone 2204_scaffold812 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   .******* * *************.* 

318. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047911 (Faecalibacterium phage FP_Lagaffe, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   .******* * *************.* 

319. spacer 1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134399 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724

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 .  .*** *****************.* 

320. spacer 1.10|1853117|29|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045273 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724

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 ...  ****************.** ***

321. spacer 1.2|1852592|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022049 (Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

cctagctgttcggcgtattgttccgcttca	CRISPR spacer
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  . **** ****** ***********. .

322. spacer 1.8|1852985|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to EU861004 (Staphylococcus phage phiSauS-IPLA88, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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....  **** ******.***********.

323. spacer 1.9|1853051|30|NZ_LS483313|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448925 (Streptococcus phage Javan386, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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. ********.************ ..* . 

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	672256 : 702728	28	Enterobacteria_phage(33.33%)	protease,holin	NA
DBSCAN-SWA_2	1226468 : 1260837	35	Staphylococcus_phage(92.59%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_3	1381869 : 1391942	7	Klosneuvirus(33.33%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	1967904 : 1976326	9	Prochlorococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_5	1990416 : 2037344	69	uncultured_Caudovirales_phage(38.71%)	capsid,head,plate,portal,terminase,protease,tail	NA
DBSCAN-SWA_6	2228840 : 2324843	123	Staphylococcus_phage(54.43%)	capsid,head,portal,transposase,terminase,integrase,protease,tail	attL 2268066:2268081|attR 2331436:2331451
DBSCAN-SWA_7	2365643 : 2378124	10	uncultured_Caudovirales_phage(50.0%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_LS483313|672256:702728|DBSCAN-SWA
TATGAATAACGGATTTTTCGGAAATGAATTTGACTCAATTTTTAGAAGAATGATGCAAGATATGCAAAATGCAGATGGAAATAAAAAATATTATATTAATGGTCGTGAAGTATCACCTGAACAATTACAAGCATTACAACAACATCAAGGTGGTCACCCTTCACAACAAGTACAAAGTGCACAACCAGGACAAGCTGGCGGTGGACAAGGCGGCGAAGACTACTTAGAAAAAGTAGGCCGTAACTTAACTGAAGAAGCAAGACAAGGCTTATTAGATCCAGTAATCGGACGTGACAAAGAAGTTCAAGATACTGCAGAAGTATTAAGCCGTCGTAATAAAAACAATCCAATCTTAGTCGGTGAAGCTGGTGTAGGTAAATCAGCAATCGTTGAAGGATTGGCACAAGCAATTGTGAAAGGTAATGTACCAGCAGCAATTAAAGATAAAGAAATTATCTCAGTAAACATTTCTTCATTAGAAGCAGGTACTCAATACCGTGGTGCTTTCGAAGAAAACATTCAACAATTGCTAGACAGCGTTAAAGAACGAAAAAATGTCATCTTATTCTTTGACGAAATTCACCAAATCATCGGATCAGGTTCTACTGGCGGAGATTCAGGCAGCAAAGGCTTATCTGATATTATCAAACCAGCATTGAGCCGTGGTGAAATTTCAGTTATCGGTGCAACTACTCAAGACGAATATAGAAACAACATCTTGAAAGACCCAGCTTTAGCACGTCGTTTCAACGAAGTAGTTGTTAAAGAACCATCAGCACAAGATACAATCAAAATCTTAGAAGGTGTTCGTGAAAAATTCGAAGAACACCACAATGTAACATTACCTGATGATGTATTGAAAGCTTGTGTAGACTTATCTATCCAATACGTGCCACAACGTTTATTACCGGATAAAGCATTAGATATCTTAGATATCACAGCTGCACATTTAGCTGCACAAAATCCTGTAGTAGACAAAGTGGAAGTTGAAAAAGAAATTAAAGAATTAGAAGATAAAAAATCTAAAGCAGTCAGTGAAGAAGCTTATTCTGATGCAGACAAATATCAAAAAGAAATCAAAGAATTACAAGACAGACTTGAATCAGGTCATGGTGAAGGTTCAACAGCAACTGTTCAAGATGTAGCAGACACTGTAGAACGTATGACTGGTATTCCGGTATCACAAATGGACGACAATGATATTGCTCGTTTGAAAAACATTTCTAAACGACTAAAAAGCAAAATCATTGGTCAAGATAAAGCAGTAGATATGGTAGCTCGTGCCATCCGTCGTAACCGTGCAGGTTTCGATGAAGGTAACAGACCAATCGGTAGCTTCTTATTCGTAGGTCCTACTGGTGTAGGTAAAACTGAATTAGCAAAACAATTATCAATCGACTTATTCGGTAATAAAGAAGCGCTTATTAAATTAGACATGAGTGAATACATGGACCGTACAGCTGTATCTAAATTGATTGGTACATCTGCTGGTTATGTAGGTTATGATGATAACTCTAATACTTTAACTGAAAAAGTTAGACGTAACCCTTACTCAGTCATCTTATTCGATGAAATCGAAAAAGCGAACCCACAAATCTTAACTTTATTACTACAAGTAATGGATGACGGTAACTTAACAGACGGTCAAGGTAATGTCGTAAACTTCAAAAATACAATCATCATCTGTACTTCAAACGCAGGTTTCGGTGATGAAGATGAAAAAGATCGCGAAGCATTAATGGACGACCTTAAAAAATTCTTCCGTCCAGAATTCCTTAACCGCTTCAACGGTATCGTAGAATTCGTTCATTTAGACAAAGATGCATTACAAGATATCATCAACTTATTATTAGATGATGTTGCTGATACACTTGATAAAAAAGGTATCTCACTTGAAGTAAGCCAAGATGCTAAAGATTGGTTAATTGATCAAGGTTACGATGCAGAACTTGGTGCACGTCCATTACGTCGTGTGGTTGAAAGAGAAATTCGTGACCGTATCACAGACTACTACCTAGAACACACAGATGTGAAAGACATCGAAGTAACACTTGATGGCGATGACATCTTAATCAACGGTGAAAAAGTAGATTCTCTATAATCCACCACGATTGAATAATTAAATCACATTTAAATTTCACGCTCTCATCTATAGAAATATGGATGAGGGCTTTTTTATTACTTTCTTGTAAGCGATTGCAATCTTCGAAACTTTGTATTAATATACTTGTATACAAGTATGTAGAACGAAAAGAGGTGCGTGATGGAAAAACAATATCCGAAACAATGGTTAGCGAATATGACAACAGGGGAAACAGTTGCGGCTGAGTTACGTTTGAAGATTATCAATGGTGAATTGACATCAGACGATGCCTTGACTGAAAATCAAGTCGCTAAACAATTCAATGTCAGTCGTTCTCCTGTGCGTGATGCGTTTAAATTATTGAAACAAGATCAATTGATTCGTTTAGAACGTATGGGGGCAGATGTCTTAACATTTGGAGAAGCTGAACGTCGTGAAGTGTATGATTTACGCATTATGATGGAATCTTTTGCGTTTGCGCGTATTAAAGATGAAGAACGTGCAGCGTTAGCTAAAACTATGCGTAAGCATTTAGAGATGATGAAAGTAGCGGTACAGTTTGAAGATGCAGAATCTTTTACTGAACATGATATTTTGTTCCATGAAGTGTTAATTCATGCGACGAAGCACCGTTATTTACTCAGCAGCTGGAATAATATTAAACCTATTTTATTGTGTTTAATCTTGTTATCGATGCGAGATAGAATGCAGACGGACCCTGATGATTTTGAAAGAATTCATGCCAACCACGAAGTATACGCACAAGCCGTTGAACATAACGATACGACATTATTACGCGATGCATTCCATCGTAATTTTGATGATGTCGGAGATTATATCAGCGCATTATTTTTAGAGAAGAAATAAGGAGGTCAAACCATGCAGTATATGATTGGAGTCGATATTGGCACAACGAGTACGAAAGCTGTTCTTTATAATGAAAATGGTCAATATTTGTTAAAACATAATATTGGTTACGACATGCAGACACCAGATGTCGATACCTCTGAAGAAAATCCAGATGAAATTTTTGATGCCGTTTTAATGACGATTAAAGCAGTCATACGAGAAGGCAAAGTAGGACCAGATGATGTGAAGTTAATCGCATTCAGTGCACAAATGCATAGTTTAATTGCGATGGGCAACGAACAAAAACCATTAACACAAAGTATTACTTGGGCCGATAACCGCGCAAGTCGTCATGCTGAAGAAATTCGTCAACAACATCACGGACACGAAATCTATAAACGTACAGGGACACCGATTCATCCAATGTCTCCGTTATCTAAAATCTATTGGTTGAAAGATGAGCATCCAGAGATTTATCAACAAGCGACAAAATATATTGATATTAAAAGTTATGTCTTATACCAACTTTATGGACGCTATGTGATGGACCATTCTATCGCTTCAGCAACAGGTATGATGGACCTTGAAACATTGACATGGGATAAACCAGCATTAGATTTGCTTGGGATTACACCAGAACAATTACCAGAACTTGTGCCGACAACATATATTTTAAAAGGAATGAAACAACGCTATGCGACACTATTAGGTTTAAACAAAGAAACACCTGTAGTTATCGGCGCAAGTGATGGCGTGTTATCAAACTTAGGTGTGAACAGCTTCAAGAAAGGCGAAGTAGCGGTTACTATCGGTACATCAGGTGCGATTCGTACTGTGATTGATCATCCAAGAACAGATGAGAAAGAACGTATTTTCTGTTATGTCTTAGATGAAGGACAGTATGTGATTGGCGGTCCAGTAAATAATGGCGGTATTATTTTACGTTGGTTGCGTGATGAATTGCTTGCGAGTGAGGTAGAAACAGCGAAACGTCTTGGTGTCGATCCTTATGATGTTTTGACAAAAATCGCAAGCCGTGTAGAACCAGGTGCGAAAGGTCTGATTTTCCATCCTTACCTTGCGGGTGAACGTGCACCTTTATGGAATGCGGATGCAAGAGGTTCGTACTTTGGTTTAACGTTATCACACCAAAAAGAACATATGATTCGTGCAGCGCTTGAAGGTATTTTATACAATCTGTATACCGTTTATCTTGCGTTAATTGAGATGATGGGTGAAACACCAACGGCCATTAAGGCAACAGGTGGTTTTGCGAAGAGTGAAATGTGGCGCCAAATGATGTCGGATATTTTTGACACGGATTTAATTGTACCTGAAAGTTATGAGAGCTCTTCTCTTGGTGCGTGTGTTCTAGGCCTGAAAGCATTAGGAGAAATTGAAGACTTTTCAATTATCGAAGACATGGTCGGAACAACACATGCACATCAACCGAACCAAGAAGCGGTAGAGATTTATCAGCAATTGATTAGTATTTATATTGATTTGAGTCGTAGTTTGGCTCCGCAATATCGTAAGATCGCAGATTTCCAAAGAAAACATTTATAAAAACAAAAAGCCATGAGCCACTGAGAAAAAGCAGTTGAAGTGTCTACCCATAATTATTAAGCACTTCGGCTTTTTCTTTGACTACTGATGTAAACGCTGTCAGTAAAGGTGCTCATAAGGAAAGCGAGGAAAAGTTATGTTTACAGAAATTTGGCCGTTAATCACGGTGGTCATTGGTATTTTAATTTTATTAGCACTCATTATTGTATTGAAGTTGAACACATTTATTTCCTTAATTATTACATCAATGGTCACTGCGTTGATGTTAGGTATGCCGTTAGATAAAGTCGTTGAAACCGTCGAAAAAGGTATGGGCAGCACGCTCGGACATATCGCAATTATCTTCGGTTTAGGTGCAATCTTAGGTAAGTTGCTCTCTGATGGTGGCGGTGCAACACGTATCGCAGATACCTTAATTGATAAATTTGGAGAGAAACATGTCCAATGGGCAATGGTTGTCGCTGCCTTTGTGATCGGGATTGCGTTGTTCTTCGAAGTTGGA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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_060803590.1|674518_675205_+	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_103363897.1|675217_676753_+	gluconokinase	NA	NA	NA	NA
WP_103363898.1|676889_678251_+	gluconate permease	NA	NA	NA	NA
WP_103363899.1|678321_679101_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_103363900.1|679145_680399_+	acetylornithine deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_002479785.1|680495_682664_-	RNA degradosome polyphosphate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_031262477.1|682870_684400_-	exopolyphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_002479783.1|684745_685207_+	DUF1307 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_103363901.1|685417_686026_+	stage II sporulation protein M	NA	NA	NA	NA
WP_103363902.1|686218_687007_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_103363903.1|687194_687938_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_023015085.1|688106_688775_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	8.8e-19	34.2
WP_002479779.1|688771_689551_+	iron export ABC transporter permease subunit FetB	NA	NA	NA	NA
WP_023015084.1|689722_690886_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_103363904.1|690924_692307_-	carboxylesterase/lipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_103363905.1|692386_694024_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_070625145.1|694501_695098_+	YdeI/OmpD-associated family protein	NA	NA	NA	NA
WP_023015081.1|695565_696780_+|holin	betaine/proline/choline family ABC transporter ATP-binding protein	Q6GZ03	Mycoplasma_phage	3.8e-20	50.5
WP_002479772.1|696779_697409_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_002479771.1|697440_698385_+	osmoprotectant ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_002479770.1|698384_699074_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_103363906.1|699167_699935_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_103363907.1|700048_700591_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_002479767.1|700592_700955_-	DUF3147 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_002479766.1|700974_701334_-	DUF3147 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_002479765.1|701568_702270_-|holin	antiholin-like protein LrgB	NA	NA	NA	NA
WP_002479764.1|702266_702728_-|holin	antiholin-like murein hydrolase modulator LrgA	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_LS483313|1226468:1260837|DBSCAN-SWA
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MSSHEHTHKNGQHKHHEHTTDNGHNHHMHHHGNFKRKFFISLIFTIPIIILSPMMGIQLPFQVTFSGSDWIVLILSTILFFYGGMPFLSGAKDEIASKKPGMMTLVALGISVAYFYSLYAFYMNNFSDSSSHTMDFFWELATLIIIMLLGHWIEMNAVGSASSALKKMAELLPNTAVKVTEDGQRQKLKISDIHNGDIVEIKAGESIPTDGVIVDGKTSIDESLVTGESKKVLKNKNDNVIGGSMNGSGTIQVKVTATGEDGYLSQVMGLVSQAQNDKSDAELLSDKVAGYLFYFAVISGLIAFIVWMLIQNDIDFALERLVTVLVIACPHALGLAIPLVTARSTSIGAHNGLIIKNRESVEIAQHIDYIMMDKTGTLTEGNFSVNHYESFTDEFSHKEILSLFASLESSSEHPLAVGIVEYAKEENISYSYPEDVNNISGVGLEGSVDGKEIKIVNASYLDKKDLKYNKKQFKELAQQGNSISYLIYEQQVIGIIALGDQIKESSKQMVADLIAKNITPVMLTGDNHEVAQAVAKELGIKDVHAQLMPEDKERIIKNYQKKGSKVMMVGDGINDAPSLVRADIGMAIGAGTDVAVESGDVILVKSNPSDIINFLTLSKNTMRKMVQNLWWGAGYNIIAVPLAAGVLAFMGIILSPAVGAILMSLSTIIVAINAFTLKLK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_070626279.1|1226468_1228511_-	copper-translocating P-type ATPase	E4ZFI9	Streptococcus_phage	4.1e-67	30.3
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WP_023016242.1|1229462_1230155_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_103364061.1|1230270_1231659_+	o-succinylbenzoate--CoA ligase	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	5.0e-157	57.1
WP_103364060.1|1231661_1232672_+	o-succinylbenzoate synthase	A0A2H4PQM0	Staphylococcus_phage	6.7e-95	53.4
WP_002481260.1|1232662_1232920_-	membrane protein insertion efficiency factor YidD	A0A2H4PQM5	Staphylococcus_phage	4.7e-29	75.7
WP_002481259.1|1232997_1233489_+	nucleoside triphosphatase YtkD	A0A2H4PQM4	Staphylococcus_phage	1.0e-35	50.3
WP_057509771.1|1233454_1234228_+	S9 family peptidase	A0A2H4PQM6	Staphylococcus_phage	1.3e-93	66.5
WP_002481257.1|1234280_1235873_-	phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)	A0A2H4PQN1	Staphylococcus_phage	4.0e-259	81.4
WP_002481256.1|1236260_1237457_+	methionine adenosyltransferase	A0A2H4PQS6	Staphylococcus_phage	8.8e-187	81.4
WP_103364059.1|1237553_1238453_+	NERD domain-containing protein	A0A2H4PQQ8	Staphylococcus_phage	4.0e-99	75.4
WP_103364058.1|1238574_1239411_+	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	1.2e-102	65.7
WP_002481253.1|1239462_1239816_-	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_103364057.1|1239808_1240180_-	fluoride efflux transporter CrcB	A0A2H4PQR0	Staphylococcus_phage	8.0e-38	64.5
WP_057509776.1|1240240_1240549_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002481250.1|1240736_1241453_+	transaldolase	M1PR54	Cyanophage	3.8e-20	35.0
WP_103364056.1|1241594_1242056_+	hypothetical protein	A0A2H4PQT8	Staphylococcus_phage	1.8e-18	41.6
WP_126498008.1|1242030_1242390_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_103364054.1|1242470_1242968_-	RNA polymerase subunit sigma	A0A2H4PQT5	Staphylococcus_phage	2.4e-21	42.5
WP_023016000.1|1243172_1243394_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002481245.1|1243795_1244641_+	glucosaminidase domain-containing protein	A0A1W6JNR1	Staphylococcus_phage	4.2e-42	41.7
WP_002481244.1|1244782_1246264_+	FAD/NAD(P)-binding protein	A0A2H4PQX2	Staphylococcus_phage	1.0e-14	64.5
WP_103364053.1|1246657_1247707_+	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A2H4PQS8	Staphylococcus_phage	1.0e-117	59.4
WP_057509781.1|1247711_1248344_+	riboflavin synthase	A0A2H4PQS5	Staphylococcus_phage	2.8e-67	61.4
WP_103364052.1|1248359_1249541_+	GTP cyclohydrolase II	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	1.4e-168	73.5
WP_070626312.1|1249573_1250035_+	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	3.9e-58	75.2
WP_023015993.1|1250108_1251104_-	proline dehydrogenase family protein	A0A2H4PQT6	Staphylococcus_phage	5.8e-115	63.3
WP_002481238.1|1251365_1252196_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_002481237.1|1252372_1253329_+	L-lactate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_103364051.1|1253394_1253952_-	methyltransferase domain-containing protein	A0A2H4PQV0	Staphylococcus_phage	3.0e-60	61.6
WP_002481235.1|1253948_1254911_-	TIGR01212 family radical SAM protein	A0A2H4PQV5	Staphylococcus_phage	2.5e-67	84.4
WP_002481234.1|1255183_1256362_+	MFS transporter	A0A2H4PQR6	Staphylococcus_phage	3.0e-163	73.2
WP_103364050.1|1256741_1259156_+|tRNA	leucine--tRNA ligase	A0A2H4PQS0	Staphylococcus_phage	0.0e+00	84.8
WP_002481231.1|1259176_1259494_+	rhodanese-like domain-containing protein	A0A2H4PQR9	Staphylococcus_phage	1.5e-32	66.7
WP_103364049.1|1259580_1260837_-	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	A0A2H4PQX1	Staphylococcus_phage	2.6e-40	75.0

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_LS483313|1381869:1391942|DBSCAN-SWA
TATGATTAAAGCTAAGTATAAATGGGATTTACAATCGAATATATCAGAAATCACATCAGATGACGCTAAAGCATTAAAGCTTACACCTATCGTACAAAAAATATTACAAAGCAAAGGTGTAATAGCGTCTTCTGAAATCAAACAATTACTAGAACCATCTCAAATTCAGCATGACCCTTATGCGTTAAGTGATATGAAGAAAACTATTGAACGTATCAATCAAGCACTTGATAAAAAAGAACGTATTTTAGTTTATGGAGATTATGATGCTGATGGGGTAACATCTACATCTATATTAGTCAGTGCATTAAGAGAACTTGGTGCAGAAGTCGGATGGTATATTCCAAATCGATTTACTGAAGGATATGGACCAAATGAAGCAGCCTTTAGAAATGCAGCGGATGAAGGTATCGATTTGATTATTACAGTTGATAATGGTATCCAAGGTCATCATGAAATGCTAGTGGCTAAAGAATTAGACATAGATGTGATTATTACAGATCACCATGAAATTGGTGAAACGTTACCGGAAGCTTATGCGATTGTGCATCCGATGCATCCAGATTTTGACTATCCATTTAAATACTTAAGCGGTGCAGGGGTCGCATTAAAAATTGCTCAAGCATTACTTGATCATCCTGCACACGAATTTACAGCTTTGGCAGCCATAGGTACAGTTGCTGATTTGGTCTCATTAACAGATGAAAACCGAGCTATTGTACAACAAGGTATAAAGGTGATGAACAATCATCCATCAGTTGCCATCGAAGCGCTGCTAAGTCAAGCAGGGTATAACGACGCGATAAACGAAGAAACGATTGGTTTTATAATAGGACCGCGTTTGAATGCAGTAGGCCGTCTAGATGATGCAAGTTTAGCAGCGGAATTGTTAATGTGTGAAAGTGCGGAAGAAGCGGAATTCTTAGCTGAGCAAGTTGAACATTTTAATCAAGAACGAAAAGATATTGTTCAAGAGATTGCAGACGAAGCACTTGAAATGGCACAAGCGGAAGTAGAAGCTGGAAACCGCTTCTTAATCCTTGCCCAAGAAAATTGGCATGAAGGTGTTCTTGGCATCGTTGCCTCACGAATTGTTGAAACATATGGCTTGCCGACGATCATTCTAAACATTGATACTGCACAAGATTTTGCGAAAGGTTCTGCTCGCAGTATTGAACAAGTTTCAATGTATGAGATGCTAGATAAAGAAAGACCATTGATTTCAAAATTCGGTGGGCATCATATGGCAGCAGGAATGACTTTACCAATTGAAAATATAGAAAAGCTTAAAACAGCGTTAAATGCTCATATGGCAGAACTCGCAAAATACGAAGATTTAACACCTAGGAAAAAAGTAGATTTAGTATTAAGCGAATCTGATATTACGGTTAAAAATATTTCAGATATTGAAAAGTTACGACCATTCGGTACAGACTTTACTAGTCCTGTGTTTGAATTAGATGGGATTCAAGTCAAACAATCTAAAGGGATTGGTCAAGAAGGCAAACATTTAAAAATGACACTAGGTGATTCTAAGTTACAAGCCCTTTATTGGCAAAATGGTGCATATGCACACCAACTAGAACCGAACGAGCCCTTAAATTTAATCGGGACCTTACAAATAAATGAATGGAATGGTAATCAATCACCTCAATTCATGGTACAAGATATGGCTTCAGAACAGCTGCAAATTTTAGACTTCAGAGGCAAAGCACGTCAACATGAGATGCATGATAATGCATCGACTGCAGAAATTATCAATGCACAGGCTGAAAAAGCACATGAACATCAATATTTCTATGGAGATATAATTGAACAAGTTTATGACAGATATATCTTTAAAGAGTTACCATTGGATTTAGAAACCATGGCACAAACATTAAAGTCAATTCAAGCCAGTCAAATTATTTTAGAGTTGAACCATCAACACTCTATTTATTTTGACGGCATGCCGCAAATGAACCATTTTAAGGCGTGCTATAAAGCCTTATTTATGAAAGATGAAATCAACTTAGAACAAGATGGAATGCAGTTATGCAACTATTTAAAAATCAAACCGCCTTTATTGATATTTATGCTCAAAGTCTTTAATGAATTAGATTTTATTGAGAATAATCATGGTATAATTAAAGTGAATAAAAATGTAGATAAAAAGGACATTACTTCTAGTAAGCTTTATCAAGCAAGACTTAAACGGATAGATGTTGAGAAATTCTTGTTATATGATGACTTTTCAAAGGTGAAACTTTGGATTAAAGAACAGCTAGCTAAGTAATTAGGAGGAAATAAATAAATGGATTTAAAACAATATGTTTCAGAAGTACAAGATTGGCCTAAAGAAGGCGTCAATTTCAAAGATATCACAACGATTATGGATAATGGGGAAGCTTATGGTTATGCGACAGATCAAATCGTTGAATTTGCTAGAGAAAAAGAAGTAGATATCGTTGTAGGTCCTGAAGCACGTGGCTTTATCATCGGTTGTCCTGTAGCGTATTCAATGGGAATCGGATTTGCACCAGTACGTAAAGAAGGCAAACTTCCTAGAGAAGTCATCAAATATGAGTACAACTTGGAATATGGTACTAACGTTTTAACTATGCATAAGGATGCTATTAAACCAGGACAACGCGTCTTAATTACTGATGATTTGCTAGCGACAGGCGGCACGATTGAAGCTACAATCAAACTCGTTGAAGAACTAGGAGGTGTTGTAGCTGGTATTGCCTTTATCATCGAATTAAAATATTTACATGGTTATGAAAAGATTAAAGACTACGAAGTATTAAGCTTAATTTCATATGATGAGTAAAATAATGTATCGCTTACTAGTGAAGGGTAAGCGATACATTTATTTATTTGCAAAATTTGTTTTTTGTTTTTAAATAAAAGTTAATTCTACAAGGTGAGCTTGTAAACGACACTGACAAGATAATTGCGAAAGTTCACACAATACGTCGAAGTATAGTGGTTCAATTATCTGTCAATGTATAGTAGAATAGATATATTATTTAATATAAATGTAAGTTGTGATAAAAGGAACGAGTTGAAAATAGGCTGGTAACCTATATAACTATTGTTGAAATACGAAATATTCAAACAAACTGACAAGCAGTTTATAAAATAAAATGTACTTAAAAAGAAGATGTGGGGGTGTCTAATGTGAATAATGAATATCCATACAGCGCAGATGAAGTCTTATATAAAGCAAAATCCTACTTATCCAAAGAGGAGTATGAACATGTCTTGAAAAGCTATCATATCGCATATGAAGCGCATCAAGGCCAATTCAGAAAAAATGGTTTGCCTTATATTATGCACCCGATTCAAGTAGCTGGTATTTTAACTGAGATGCATCTTGACGGACCGACTATTGTTGCAGGCTTCTTACATGATGTAATTGAGGATACTCCTTACACATTTGATGACGTAAAAGCGATGTTTAACGATGAAGTAGCCATGATTGTTGAAGGGGTTACGAAATTAAAGAAAGTCAAATATCGTTCTAAAGAAGAACAACAAGCTGAGAACCATAGAAAGTTATTTATTGCGATTGCCAAAGATGTACGTGTTATCTTAGTTAAATTAGCAGATAGACTGCATAATATGCGTACTTTAAAAGCGATGCCGAGAGAAAAACAAATTAGAATTTCTAAAGAAACATTAGAGATTTACGCACCTCTTGCACACCGTTTAGGGATTAATACAATCAAATGGGAACTTGAAGATATAGCGCTTCGTTATATCGATGGTGTACAGTACTTCCGTATCGTCAATCTCATGAAGAAAAAACGTAGTGAGCGTGAAGCTTATATTGCAAACGCGATAGACAATATACGTGCTGAAATGGATAAAATGCATATTTCAGGTGAGATTAACGGCCGTCCTAAACATATTTACAGTATCTATCGTAAAATGATGAAACAAAAGAAACAATTCGATCAAATCTTTGATTTATTAGCAGTGCGTATTATTGTTGATTCAATTAAAGATTGTTATGCGGTATTAGGTTTAGTACATACTTTATGGAAACCGATGCCTGGCAGATTCAAAGACTATATTGCGATGCCTAAACAAAACATGTATCAATCGTTGCATACCACTGTTGTAGGTCCTAATGGCGATCCTTTAGAAATTCAAATCAGAACACATGAAATGCATGAAATTGCTGAACACGGGGTTGCGGCGCATTGGGCTTATAAAGAAGGCAAGAAAGTCACTGATGATAATTCAAGTTATGCTAAGAAACTATCATGGTTGAAAGACTTGGCAGAAGCGGATAAAACAGCGAATGATGCACAAGAATTTATGGAATCATTGAAGTTCGATTTACAAAGTGATAAAGTATATGCCTTCACACCACAAAGTGATGTGATTGAATTACCTTATGGTGCAGTTCCGATTGACTTCGCCTATGCCGTACACAGTGAAGTCGGCAACAAAATGATCGGTGCAAAGGTCAATGGTAAAATCGAACCGATTGATTACGTATTGCAAACTGGAGATATTGTTGAAATACGAACAAGCAAACATTCCTATGGACCAAGCAGAGACTGGTTGAAAATTGTTCGTTCTTCCAGTGCAAAAAGCAAAATTAAAAGCTTCTTCAAAAAACAAGACCGTTCTTCAAACATTGAAAAAGGTAAGTTTATGGTAGAAGCGGAAATTAAGGAACAAGGCTTTAAAGTTGATGAAGTATTGACAGAAGCGAATATAGATATCGTCAATCAAAAATATAATTTCTCAAGTGAAGATGATTTATTTGCGGCAGTAGGTTTTGGCGGTGTGACATCATCACAAATCGTTAACAAGTTAACGGAAAAACAACGTATTCTTGACAAGCAACGTGCATTGAATGAAGCGCAAGAAGTCACAAAATCTGTACCGATTAAAGACAATATCACCACAGACAGCGGTGTTTATGTTGAAGGTATTGAAAACGTATTGATCAAATTATCTAAATGCTGTAATCCGATTCCAGGTGACGATATTGTAGGTTA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CATTAATGACACAAGCACCAAGTGAAGTTTCTAATAAACAATTAGAAGAATTAGCATTGCGCATTCGTCATTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_LS483313|1381869:1391942|1387684_1388560_+|WP_002481115.1|DBSCAN-SWA
MNRIERWFKKHRLKPIPVLIAALLIIIVVFTIILVANYQDKHDDSVTMKEDAELRTGPNAVYPEIFPAEKGETFHKLDKKGKWIYVETSNGKQKGWVAGWHTDLDIPPDNDPNAKPLKGKVIVLDPGHGGGDQGAASGTKYKSLEKVYTLKTGLELKKKLEQEGATVKMTRDNDNYVKLKDRNLKGDAFISLHNDALESPEANGATVYWYKKKQEDLAQVLSMSIQKKGLLSPKGARQENYQVLRQSKIPAVLIELGYISNPTDEMMIRDKLHRQILEQSIVDGLRMYFSA
>NZ_LS483313|1381869:1391942|1385030_1387220_+|WP_103363650.1|DBSCAN-SWA
MNNEYPYSADEVLYKAKSYLSKEEYEHVLKSYHIAYEAHQGQFRKNGLPYIMHPIQVAGILTEMHLDGPTIVAGFLHDVIEDTPYTFDDVKAMFNDEVAMIVEGVTKLKKVKYRSKEEQQAENHRKLFIAIAKDVRVILVKLADRLHNMRTLKAMPREKQIRISKETLEIYAPLAHRLGINTIKWELEDIALRYIDGVQYFRIVNLMKKKRSEREAYIANAIDNIRAEMDKMHISGEINGRPKHIYSIYRKMMKQKKQFDQIFDLLAVRIIVDSIKDCYAVLGLVHTLWKPMPGRFKDYIAMPKQNMYQSLHTTVVGPNGDPLEIQIRTHEMHEIAEHGVAAHWAYKEGKKVTDDNSSYAKKLSWLKDLAEADKTANDAQEFMESLKFDLQSDKVYAFTPQSDVIELPYGAVPIDFAYAVHSEVGNKMIGAKVNGKIEPIDYVLQTGDIVEIRTSKHSYGPSRDWLKIVRSSSAKSKIKSFFKKQDRSSNIEKGKFMVEAEIKEQGFKVDEVLTEANIDIVNQKYNFSSEDDLFAAVGFGGVTSSQIVNKLTEKQRILDKQRALNEAQEVTKSVPIKDNITTDSGVYVEGIENVLIKLSKCCNPIPGDDIVGYITKGHGIKVHRTDCPNIRNEKERLISVEWVKSKDSTQRYQVDLEVTAYDRNGLLNEVLQAVNATDSNLVKVSGKSDVEKNAIINLSVMVKNVNEVFKVVERIKQLGDVYTVTRVWN
>NZ_LS483313|1381869:1391942|1387235_1387688_+|WP_002481116.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MRVVVQRVKQASVTNETLNNQIGKGLCLLVGVGKDSTEADVQAVAKKIANARIFEDEEGKMNLNVQQIGGEILSISQFTLYADVKKGNRPGFSNSKSPDEANRLYEALNDTLRTYDLEVKTGEFGTDMLVDIANDGPVTIIYESQDGKVI
>NZ_LS483313|1381869:1391942|1384161_1384680_+|WP_103363649.1|DBSCAN-SWA
MDLKQYVSEVQDWPKEGVNFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVEFAREKEVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIKYEYNLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEATIKLVEELGGVVAGIAFIIELKYLHGYEKIKDYEVLSLISYDE
>NZ_LS483313|1381869:1391942|1381869_1384143_+|WP_103363648.1|DBSCAN-SWA
MIKAKYKWDLQSNISEITSDDAKALKLTPIVQKILQSKGVIASSEIKQLLEPSQIQHDPYALSDMKKTIERINQALDKKERILVYGDYDADGVTSTSILVSALRELGAEVGWYIPNRFTEGYGPNEAAFRNAADEGIDLIITVDNGIQGHHEMLVAKELDIDVIITDHHEIGETLPEAYAIVHPMHPDFDYPFKYLSGAGVALKIAQALLDHPAHEFTALAAIGTVADLVSLTDENRAIVQQGIKVMNNHPSVAIEALLSQAGYNDAINEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLAAELLMCESAEEAEFLAEQVEHFNQERKDIVQEIADEALEMAQAEVEAGNRFLILAQENWHEGVLGIVASRIVETYGLPTIILNIDTAQDFAKGSARSIEQVSMYEMLDKERPLISKFGGHHMAAGMTLPIENIEKLKTALNAHMAELAKYEDLTPRKKVDLVLSESDITVKNISDIEKLRPFGTDFTSPVFELDGIQVKQSKGIGQEGKHLKMTLGDSKLQALYWQNGAYAHQLEPNEPLNLIGTLQINEWNGNQSPQFMVQDMASEQLQILDFRGKARQHEMHDNASTAEIINAQAEKAHEHQYFYGDIIEQVYDRYIFKELPLDLETMAQTLKSIQASQIILELNHQHSIYFDGMPQMNHFKACYKALFMKDEINLEQDGMQLCNYLKIKPPLLIFMLKVFNELDFIENNHGIIKVNKNVDKKDITSSKLYQARLKRIDVEKFLLYDDFSKVKLWIKEQLAK
>NZ_LS483313|1381869:1391942|1388885_1390160_+|WP_002481114.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MIKIPRGTQDILPDQSRKWRYIETKLDELMELYNYKEIRTPIFESTDLFARGVGDSTDVVQKEMYTFKDKGDRSITLRPEGTAAVVRSYIENKMQGDPNQPIKLYYNGPMFRYERKQKGRYRQFNQFGVEAIGAEDPSIDAEVLAMVMHIYESFGLKHLKLVINSVGDFDSRKEYNEALIKHFEPVIDTFCSDCQSRLYTNPMRILDCKVDRDKEAVKTAPRITEYLNEESKAYYEQVKSYLDELGIPYVEDPNLVRGLDYYTHTAFELMIDSPDYDGAITTLCGGGRYNGLLELLDGPKQTGIGFALSIERLLLALEEEGIEIEDEDHLDLFIVTMGEKADRYAVKLLNDLRHHGIKADKDYLKRKIKGQMKQANRVGAEYTIVIGDQELEDGNINIKHMESGESEAIQLTDLVSYFEEKKAK
>NZ_LS483313|1381869:1391942|1390175_1391942_+|WP_103363651.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MSKKTTYCGLVTEDLLGQHVTLKGWVHNRRDLGGLIFVDLRDREGYVQIVFNPDFSKEALEVAESIRSEYVIEVEGTVTKRDTETVNPKIKTGNVEVQVDKINIINKAQTPPFSINDDSQQVDENIRLKYRYLDLRRQELAQTIKMRHHITRAIHEYLDKEGFLDIETPFLTKSTPEGARDYLVPSRVHEGKFYALPQSPQLFKQLLMISGFDKYYQIVKCFRDEDLRADRQPEFTQVDIEMSFVDQEDVMELGEDMLKSVVKDVKGVELTEQFPRMTYAEAMSRYGSDKPDTRFDMELLDVSKLGETMDFKVFKDTVEKGGEVKALVAKGASDKYTRKDIDKLTEFVNIYGAKGLAWVKVVEDGLSGPIARFFEDENVETLKSLTDAEAGDLVLFVADKPSVVAQSLGALRVKLAHELGLIDEDKLNFLWVTDWPLLEYDEDEKRYVAAHHPFTSPKDEDLDKLDSEPEKAQAKAYDIVLNGYELGGGSIRIHNGDIQEKMFEVLGFTKEEAQDQFGFLLDAFKYGAPPHGGIALGLDRFVMLLTGRTNLRDTIAFPKTASAVSLMTQAPSEVSNKQLEELALRIRH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_103363648.1|1381869_1384143_+	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	A7KV88	Bacillus_phage	2.7e-75	30.9
WP_103363649.1|1384161_1384680_+	adenine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SKE5	Klosneuvirus	6.2e-28	44.4
WP_103363650.1|1385030_1387220_+	bifunctional (p)ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase	A0A1B1IUF0	uncultured_Mediterranean_phage	9.0e-12	38.0
WP_002481116.1|1387235_1387688_+|tRNA	D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_002481115.1|1387684_1388560_+	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	A0A0N9SGH1	Paenibacillus_phage	6.8e-11	33.1
WP_002481114.1|1388885_1390160_+|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2K9L6G5	Tupanvirus	3.9e-15	23.8
WP_103363651.1|1390175_1391942_+|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A1V0SIS0	Klosneuvirus	9.2e-07	33.7

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_LS483313|1967904:1976326|DBSCAN-SWA
CTTATCGAATAATTTTTGCGATGACTCTAGGATAAAGTTCATATTCTAAATTTTTAATACGTTCTTCTAGTTGTGCTTTTGTATCATCTGGATAGATGTCGCATTGACTTTGTTCAATGATTTCACCTGTATCCATGCCACTGTCTACATAATGAACAGTAGAACCTGTCACTTTATCTCCACTTTCAAAGGCTTGACCAATTGCATCAATGCCTTTGTATTTCGGTAATAAAGCCGGATGAATGTTTAAAATACGGCCTTCATACGCATTCAATAAATCTGGACCGATTAAACGCATATAGCCTGCAAGTATAATCCATTCCACTTCTTCTTCTTTTAACAATTCTAATAAACGTTGTTCATAATCACTTTTAGAATCAAAAGTTTTAGGAAGTGTCACATGGACAGGAATGTTTAATTTCTCTGCACGTTCAATCGCGAATGCATCGTCGTGATCAACATAAAGCGCTGTGATTTCAATATTATCTAATCTGCCGTCTTGAACTCGTTGTGCAATATTTTCAAAGTTGCTGCCAGAACCTGACGCAAAGATGGCTACTTTAGTCACGCTTTAACCCCCGTTAACTCGATAGGTTCTTCTTTACCTTCAACGATTTTACCGATTTTGAACGCTTCAACATTTTGACCTTTTAAGATATCTAATGTTTTATCTGCGTCCGCTTCATCTACAACTAATGTGAAACCAATACCCATGTTGAAGATATTGTACATCTCTTCAGTTGCGATTTTGCCTGCTTCTTGTAACCAATCAAACACTTTAGGTGTATTGAATGATTGAACGTCAATTTCAGCAGTGACACCTTCAGGTAAAGCACGTGGAATATTCTCATAGAAACCGCCGCCTGTGATATGTGTCATCGCATGCAATTTCACTTGTTCTTTCACAGCTAATACAGGTTTAACATATAAACGAGTCGGTTCTAAGAAAGTGTCTAAATACGTACGACCATTTTCGAATTCAGCATTTAAATCAACGCCTGATTCTTTAATTAAATGACGTACTAAGCTATAACCGTTAGAGTGGATACCACTTGAAGCTAAACCGATAATTACTTGTCCTGGTTTAACTGTTGAACCATCGATGTATTCATCTTTTTCAACTGCGCCCACTGCGAAACCAGCTAAATCGTATTCACCTTCATGGTACATTTCGCCCATTTCAGCAGTTTCACCGCCGATTAAAGCTGTATTTGTTTCTTCACAACCATCGCTGACACCTTTAACAATTTGTTCGATGACTTCAGGTACAACTTTGTTTGTTGCGATATAGTCAAGGAAATAAAGCGGCTCTGCACCTGTTGTTAAAATATCGTTGACACACATAGCCACTGCATCGATACCGATTGTGTCATGTTTGTTGTGATCAATCGCAAGTTTCAACTTAGTACCTACACCGTCTGTACCAGAAACTAAGACAGGTTTTTGCATGTTTAATTGTGATAAATCAAACGCTGCACCGAATCCTCCTAGTCCACCTAGTACTTCTTTACGCATTGTACGTTGCACATGGCTCTTCATTCGCTCAACTGCTTCATATCCAGCATGAATATCCACACCGGCATTTTTATAAGAATTTGCTGCCACAGCTTTACACTCCTCTTCTTTTCAGTTCTTTAACTTCTGGTAATTGATGATCTACAATTTCAATTGGATAATTGCCTGTAAAGCAAGCGTCACACTCGCCTTTTGAGTCAAATTCTTTAAACACTTCATGCATGCCTTCTACAGATAAATACGTAAGTGAGTCTGCACCAATCATGTCTTTGATTTCATCGACACTATGTTGTGCTGCCATTAATTCTGCATGTGTAGACACATCGATACCGTAATAACATGGATCGACTAATGGTGGTGATGAAATACCCATATGCACTTCTTTCGCACCAGCAGATTTTAATGCTTTCACAATGTATTTACTTGTCGTACCACGCACAATAGAGTCATCAATGACAACGACACGTTTGCCTTCAATGACGTCTCTGATCGGCGCATGTTTCATACGTACTTGTTTTTCACGGACGCTTTGGTCTGGTGTGATAAATGTACGGCCGATATAACGGTTTTTCAATAAACCTTGTTCGTTTGGAATACCTGAGTATTCAGAGAAGCCTTTTGCTGCTTGTAAAGACGAGTCTGGTACACCGATAACAATATCAGCGTCAATACCCATCTCACTTGCTAACTTCTTACCTAAAGCTTTACGCACATTATAGATAGAGTGTTTATGGAACTCTGAATCTGGACGTGCAAAGTATACATATTCCATTGAACACATATTATGGTGAATTTGGTTCGTGTACGTATCATAATCTATGTCATGGTCACCGCTGAATGTAATTAATTCACCTGGTTCGATGTCACGAATATATGTTGCACCGATTGCTTGGAACGCACATGTTTCACTTGCGACACAATACGCACCATCTACTTCACCTAACATGAGTGGACGTACACCATTGTTATCTCTAACCGCTGCAAGTTGATTAGTATTCAGCATGACACAGCTGAATGCCCCTTTAACTTGATTCAATGCTGCTTTTTGGTTTGATTTAATGCTTGGAGATTTGCCTCTGATTAATAAATGCGCTAATACTTCTGAATCACTTGTTGTTTGGAAGACGCTGCCTTCAGATTCTAAAGCCTTACGAATTTGGACAGCATTCGTTAAGTTACCATTATGCGCAAGTCCTAAATCACCTTTTGAATGCTTGAACAAGAAAGGTTGAACATTGGCGATTTCACTGGCACCTGTTGTCGCATAGCGTACATGTCCAATCGCATGTTGGAATCCTTGTAAAGATTCTAATTGCGCGTCTGAAATAGCTTCAGTTAATAAACCCATGCCGCGTGCCCCAAACAGCGATTCGCCGTTTGAGCACACGATCCCAGCACCTTCTTGACCACGGTGTTGCAGACTATGCAACGCCATATAAGTTAAAGTTGCTGCATGGGGGTGATTCCAAATTCCAAAGACTCCACATTCTTCGTTTAATCCGCGGATGTCATACATTGAGGAATTGCTCCTTCCCAAATTTCGTTTAACGTCGACACGTTTTCTTCTACAGTTGTTTGACCGTTTGTAACTTTGAACTTGTCATCCTCAGTGATAGTTCCGATTTCTTGTGCATTAGGAATATCTAATGATTGTCCTGCTTTAACTGCAACAATGTAACGACCTTGTGATTCACTGAATAATTGTGCATCAGTCACGTCTAATGTTGCATCTACACCTAAACCGTAGTGTGCACTGATTCGTGCTAACGAAATCAATAAGCCGCCTTTACCGACAGTTTGTACATGAGACGCTTTGCCGCTTCTGATTGCTTCTTTGATTTGTTCGCCTTTTTCAACTTCATTTGATAAGTCAAGTGCTTCTGATTCATGGTTGACTTTACCGTATAATAATTTTTCGATTTGGCTGCCGCCGAAGTCATCGCGTGTTTCACCAACAACATACAATTTATCGCCTGCATGTGGGTGGAAATCATTTAAGTAATCGATGTCTTCAATTAAGCCGACCATACCTACTACAGGTGTTGGGAAGATAGAAGTTCCTTTTGTTTCGTTATAAAGTGAAACGTTACCTGAAACAACTGGTGTTTTCAGAACTTCACATGCTTCTGCCATACCTTTTGTAGAATCAGTTAATTGTTGATAGATTTCTTTTTTCTCTGGTGAACCGTAGTTTAAGCAGTCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCTACAGCAATTAAGTTGCGGTATGCTTCAGCAACGACCATTTTACCGCCTTCGTATGGTTGGTTGAATACATAACGTGCTTCGCCATCGATTGTAGAAGCGATTGCTTTGTTTGTACCTTCAACACGTACTACAGACGCTTGTAAACCAGATTTAACAACTGTGTTTGCACCAACTTGTTGGTCATATTGTTCGTATAAATAACGTTTTGACGCAATTGTCGGATGTGCTAATAATTTATGGAATACATCTTTAACATCTACATTGCTGTAGTCGTTTTTAGATGTGTTATATTCTTTTGCTTCACCTTCTAAAATATATACAGGTGATTCATCTGCTAATGGTTGTACTGGGATGTCTGCATAAACTTCATCATCATAAGTTAATACGAAACGATCTGTATCCGTAACTTCACCGATAACAGCACTATCTAATTCACGTCTGTCAAATAAGTCTAAGAATTTTTGTTCCGTACCTTTTTCAACAACAAGCAACATACGTTCTTGTGTTTCAGAAAGCATCATTTCGTATGGAGAGATTCCTTCTTCACGTACAGGTACTTTTTCTAACTGCATGTGTAAACCACTGCCGCCTTTAGCTGCCATTTCTGAAGAAGATGATGTTAAACCAGCTGCACCCATATCTTGGATACCGACTAATTCTGGGTAAGTGATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATCAATTTTTTACCTACAAATGGGTCACCGATTTGTACTGATGGACGTTTGCTTTCACTTTCTTCACTTAATTCTTCAGATGCGAAAGTTGCACCATGGATACCGTCACGGCCTGTTTTTAAACCAACGTAGATGACTGAGTTGCCGACACCTTTAGCTGTACCTTTTTGGATTTTATCGTGATCAATGATACCTACGCACATTGCGTTAACTAATGGGTTACCATCATAGCGTTCATCGAATTCGATTTCACCTGCTGTAGTTGGGATACCGATACAGTTACCGTATCCGCCGATACCTGCTACAACACCACGTAATAATGTACGGTTTGGGATTTCATCTAATTCACCGAAACGTAAGCTGTTTAATAAGTTGATTGGACGTGCACCGATTGATACGATGTCACGAATAATACCGCCGACACCTGTTGCTGCACCTTGGTAAGGTTCAATCGCAGATGGGTGGTTATGTGATTCAACTTTGAATACAACCGCTTGGTTATCACCGATATCTACAACACCAGCACCTTCACCAGGTCCCATTAAGACATGTTCGCCTGTTGTAGGGAATTGTTTCAAGAATGGTTTTGAGTGTTTGTATGAGCAGTGTTCACTCCACATTACAGAGAAAATACCAATTTCAGTAAAGTTTGGTTGACGACCTAAAATTTCGACAACTTTATCATATTCAGCGTCTGTTAATCCCATATCACGGTATAAATGTTCTGATTTAATTTCTTCGATACTTGGTTCAATAAACTTAGGCATTTTGTTCCCTCCAACTATTTACCATTGACTCAAATAATTTCACGCCATCATCTGTTCCTAAAATTGATTCTAATGCACGTTCTGGGTGAGGCATCATGCCGCACACATTACCTTTTTCGTTAACAATACCAGCAATATCGTGGTAAGAACCATTTGGATTATCTTTATATTTCAAGATAATTTGATTATTATCTTCTAATTCTTTGTACATCTCTTTTGTGCAGTAGTAGCTGCCTTCACCATGTGCAACTGGGTATACTACTGTTTCACCTTCAGCATATGCTTTTGTGAATGGTGTGTTGTTATTTACAACTTCTAATGATTCGTTACGGCTCACAAATAAATGTGAACTGTTGTGTAATAACGCACCTGGTAATAAACCGATTTCTGTTAAAATTTGGAATCCATTACATACACCTAATACTGGTTTGCCTTCATCTGCAAAACGTTTCACTTCTTTGATAACTGGTGCAACACTCGCCATCGCACCTGAACGTAAGTAGTCACCAAATGAGAAACCGCCAGGGATTAACACCCCATCAAATCCTTCTAATGATGTCTCACGATAATCAACATACTCTGCGTCTACGCCTGTTTTCAAAGCTGCGTTCAACATATCTCTGTCACAGTTTGATCCAGGGAATACAAGTACTGCGAATTTCATTATGCATTCTCCTTTTCGTCAACTACTTTATAGTTGTACTCTTCAATGACTGTGTTCGCAAATAATTTTTCACTTAAAGTTGTAACGATATTATGAACCGCTTCATCTGTTGCTTCGTCCACTGTCATGTAAAGTAATTTACCTACACGGATATCATTCACTTGGTTATAGCCTAAGTCATGTACGGCACGGTTAAGTGCTTGTCCTTGTGTATCTAATACCTGTGGTTGTAATGTGATGTGCAATTCGATAGTTTTCATTATTTAAGATCCTCCAGTTTATTTAAGAAAGTTTGATAAGTCTCGATAATTGAACCGCGGTCTTCACGGTATACGTCTTTGTCAAAATTAGTGTCACTGTCTTTTTCCCAAATACGACAAGTATCTGGTGAAATTTCATCTGCTAAAAGAATTTGACCATCTTTTGTACGGCCGAATTCTACTTTAAAGTCAATCAAACGTAAGTTGATACTATCAAGCAATTCAACTAACGCTTTATTAACGCCTAATACCTTTTCTTTCAATTGTGCAATTTCTTCAGTTGTTGCGATGTTTAATAATCTGACATGGTCATCTGTCACTAAAGGGTCATTTAAAGCATCATTTTTATAGAAGAATTCTACAAGTGGTGTTTCAAATTTTTGTCCTTTTTCAAAACCTAAGCGTCTTGTGATAGAACCTGCCGCAATATTACGTACGACCACTTCTAACGGAATGATTTCTACAGATTGAACAAGTTGTTCAGTCTCAGACGTTTGTTTGATAAAGTGGCTTTTGATGCCTTTTTCTTTAAGGTGTTCAAACAAGATTGAAGTGATTTTATTATTTAAGCGGCCTTTACCGTCAATATGGTCTTTTTTCGCACCATTGCCGGCAGTCACTTCATCTTTGTATTCCACGCGTAATACGCCGTCTTCATCTGTTGAGAAAATTCGTTTTGCTTTACCTTCGTATAATAATGACATTATTTTGCTCCTCCTCTAAAGGTTGCCAACATGTCTTGTTCAGTTTTATCAATGTCATCAGTTAAAACTGTTATGTGACCCATTTTTCGTGCTGGTTTTCTAGATGCTTTGCCATAAATATGAACATGCCATTCAGGATGATCGCCGAATTCATCTTCAAGTAAATCTAAATCCTTACCAAGCAAATTCATCATGACAGCTGGTTTTAAAATTTCAATGCGTTCTGGTAATTTTTGACCCGTAACCGCTAAGATGTGTGTATCAAATTGTGAGAAGTCACAAGCTTCAATAGAATAATGACCAGAATTGTGAGGTCTTGGTGCAATTTCGTTTACATATAAGTTGTTATCTTTATCAATAAAGAACTCTACTGTAAATGTACCCACAAAATGCACTTTTTCTTTAATTTTATCCACTTCTGCACGTGCTTCTGCTTCTTTATCAGAACGTGCGGGTACGATTGTTTTAAATAAAATTTGGTGACGATGTTCGTTTTCTTGTAATGGGAAATAAACGATTTGACCGCCATTTCCAATTGTCACAGTTAATGACACTTCTTTATAAAGGTCTAAGAATTTTTCTGCTACACATTCTTGTACTTTGATTAATGATTCAGCCTCTGCTAAATCTTCTTCTGAACGTACTAGCACTTGACCTTTACCGTCATAACCGCCGAAACGTGTTTTCACCATAAATGGATAATCTAATTTTTCAACAGCATGCTCTAAATCTTCAGCATTTGTGATTTGTGCATACGGAACGATTTTCGTACCTGCTGATTCTAATGTTTGTTTTTCAGTTAAACGGTCTTGTAATAAATGGATGGCTTGATAGCCTTGAGGAACATTAAATTCTTTTGTGAGTGTTTCTAATTGATCTGCAGCAATGTTTTCAAATTCATATGTTACAACATCAGAAGCTTCACCAAGTTGTCTTAATGCATCTAGGTCATCATAAGCTGCATTAATAAATTCATGTGCTACATATTGACACGGTGCTTCTTTGTCTGGATCTAAGACGATGACTCTAAAGCCCATTTTTTGAGCAGATTGTGCCATCATTTTGCCAAGTTGTCCGCCGCCAATAATACCGACAGTTGATCCAAACTTTAATTTACTGAAGTTCACTTTGCATCTCTCCTACTTTATCTACTAGTGATTGCTGATAAGCTTCTAATTTCTCTTTCACTTCATCGCTTTGAATACTTAAGATTCTCACTGCAAGGATTCCAGCATTTTTCGCACCTGCTTTACCAATTGCAGTAGTTGCAACTGGAATTCCGCCAGGCATTTGGACGATTGAAAGTAATGAATCTAAACCTTTCAAACTCTTAGATTCAATCGGAACGCCGATAACTGGTAATGTCGTCATTGAAGCAACCATACCAGGCAAGTGTGCTGCACCGCCTGCGCCTGCAATAATAACGTCATAACCGTTCAATCTTGCTTCTGTCGCAAAATCAAACATCAGTTTTGGTGTACGATGTGCTGAAACGACTTTCTTATCGTACGGGATTCCAAATTGATCTAACATCTGACAACTTTCTGACATCATATCCCAGTCAGATGAGCTGCCCATAATAACTGCCACTTTCAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_LS483313|1967904:1976326|1967904_1968471_-|WP_023015953.1|DBSCAN-SWA
MTKVAIFASGSGSNFENIAQRVQDGRLDNIEITALYVDHDDAFAIERAEKLNIPVHVTLPKTFDSKSDYEQRLLELLKEEEVEWIILAGYMRLIGPDLLNAYEGRILNIHPALLPKYKGIDAIGQAFESGDKVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQSQCDIYPDDTKAQLEERIKNLEYELYPRVIAKIIR
>NZ_LS483313|1967904:1976326|1973094_1973766_-|WP_002480498.1|DBSCAN-SWA
MKFAVLVFPGSNCDRDMLNAALKTGVDAEYVDYRETSLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPVIKEVKRFADEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNSSHLFVSRNESLEVVNNNTPFTKAYAEGETVVYPVAHGEGSYYCTKEMYKELEDNNQIILKYKDNPNGSYHDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALESILGTDDGVKLFESMVNSWREQNA
>NZ_LS483313|1967904:1976326|1970912_1973102_-|WP_103364331.1|DBSCAN-SWA
MPKFIEPSIEEIKSEHLYRDMGLTDAEYDKVVEILGRQPNFTEIGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDEIPNRTLLRGVVAGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGIIDHDKIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELSEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITYPELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHMQLEKVPVREEGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDRRELDSAVIGEVTDTDRFVLTYDDEVYADIPVQPLADESPVYILEGEAKEYNTSKNDYSNVDVKDVFHKLLAHPTIASKRYLYEQYDQQVGANTVVKSGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLTDSTKGMAEACEVLKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIEDIDYLNDFHPHAGDKLYVVGETRDDFGGSQIEKLLYGKVNHESEALDLSNEVEKGEQIKEAIRSGKASHVQTVGKGGLLISLARISAHYGLGVDATLDVTDAQLFSESQGRYIVAVKAGQSLDIPNAQEIGTITEDDKFKVTNGQTTVEENVSTLNEIWEGAIPQCMTSAD
>NZ_LS483313|1967904:1976326|1975843_1976326_-|WP_103364327.1|DBSCAN-SWA
MKVAVIMGSSSDWDMMSESCQMLDQFGIPYDKKVVSAHRTPKLMFDFATEARLNGYDVIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKAGAKNAGILAVRILSIQSDEVKEKLEAYQQSLVDKVGEMQSELQ
>NZ_LS483313|1967904:1976326|1973765_1974026_-|WP_103364330.1|DBSCAN-SWA
MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYNQVNDIRVGKLLYMTVDEATDEAVHNIVTTLSEKLFANTVIEEYNYKVVDEKENA
>NZ_LS483313|1967904:1976326|1974025_1974730_-|WP_103364329.1|DBSCAN-SWA
MSLLYEGKAKRIFSTDEDGVLRVEYKDEVTAGNGAKKDHIDGKGRLNNKITSILFEHLKEKGIKSHFIKQTSETEQLVQSVEIIPLEVVVRNIAAGSITRRLGFEKGQKFETPLVEFFYKNDALNDPLVTDDHVRLLNIATTEEIAQLKEKVLGVNKALVELLDSINLRLIDFKVEFGRTKDGQILLADEISPDTCRIWEKDSDTNFDKDVYREDRGSIIETYQTFLNKLEDLK
>NZ_LS483313|1967904:1976326|1974729_1975857_-|WP_103364328.1|DBSCAN-SWA
MNFSKLKFGSTVGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGFRVIVLDPDKEAPCQYVAHEFINAAYDDLDALRQLGEASDVVTYEFENIAADQLETLTKEFNVPQGYQAIHLLQDRLTEKQTLESAGTKIVPYAQITNAEDLEHAVEKLDYPFMVKTRFGGYDGKGQVLVRSEEDLAEAESLIKVQECVAEKFLDLYKEVSLTVTIGNGGQIVYFPLQENEHRHQILFKTIVPARSDKEAEARAEVDKIKEKVHFVGTFTVEFFIDKDNNLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDFSQFDTHILAVTGQKLPERIEILKPAVMMNLLGKDLDLLEDEFGDHPEWHVHIYGKASRKPARKMGHITVLTDDIDKTEQDMLATFRGGAK
>NZ_LS483313|1967904:1976326|1969512_1970934_-|WP_002480500.1|DBSCAN-SWA
MYDIRGLNEECGVFGIWNHPHAATLTYMALHSLQHRGQEGAGIVCSNGESLFGARGMGLLTEAISDAQLESLQGFQHAIGHVRYATTGASEIANVQPFLFKHSKGDLGLAHNGNLTNAVQIRKALESEGSVFQTTSDSEVLAHLLIRGKSPSIKSNQKAALNQVKGAFSCVMLNTNQLAAVRDNNGVRPLMLGEVDGAYCVASETCAFQAIGATYIRDIEPGELITFSGDHDIDYDTYTNQIHHNMCSMEYVYFARPDSEFHKHSIYNVRKALGKKLASEMGIDADIVIGVPDSSLQAAKGFSEYSGIPNEQGLLKNRYIGRTFITPDQSVREKQVRMKHAPIRDVIEGKRVVVIDDSIVRGTTSKYIVKALKSAGAKEVHMGISSPPLVDPCYYGIDVSTHAELMAAQHSVDEIKDMIGADSLTYLSVEGMHEVFKEFDSKGECDACFTGNYPIEIVDHQLPEVKELKRRGV
>NZ_LS483313|1967904:1976326|1968467_1969508_-|WP_103364332.1|DBSCAN-SWA
MAANSYKNAGVDIHAGYEAVERMKSHVQRTMRKEVLGGLGGFGAAFDLSQLNMQKPVLVSGTDGVGTKLKLAIDHNKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGVSDGCEETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKDEYIDGSTVKPGQVIIGLASSGIHSNGYSLVRHLIKESGVDLNAEFENGRTYLDTFLEPTRLYVKPVLAVKEQVKLHAMTHITGGGFYENIPRALPEGVTAEIDVQSFNTPKVFDWLQEAGKIATEEMYNIFNMGIGFTLVVDEADADKTLDILKGQNVEAFKIGKIVEGKEEPIELTGVKA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_023015953.1|1967904_1968471_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	2.6e-32	40.3
WP_103364332.1|1968467_1969508_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	9.1e-71	44.1
WP_002480500.1|1969512_1970934_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	5.6e-47	30.8
WP_103364331.1|1970912_1973102_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	7.4e-139	39.4
WP_002480498.1|1973094_1973766_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
WP_103364330.1|1973765_1974026_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_103364329.1|1974025_1974730_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	E3SPA9	Prochlorococcus_phage	4.3e-48	42.5
WP_103364328.1|1974729_1975857_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_103364327.1|1975843_1976326_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.2e-22	45.3

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_LS483313|1990416:2037344|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MNLGKEDIPMLEKYWKDIDKLRGQLSYRRYELLYTPRDENVGGGKSNLPNSPVEKEVIKLHEDNLYRNLSATIQAVEDVYRNATREQRLIAQYRYWEKDLMIYEWEDIAHELTKQRKDDKIISRNATLRMRNQMMRETAKRIGWIVTE

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_103364316.1|1993458_1994016_-	hypothetical protein	W5R8Q1	Staphylococcus_phage	9.2e-38	42.5
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WP_070626834.1|1996125_1996374_-	PTS mannose transporter subunit IID	Q4ZD59	Staphylococcus_phage	8.5e-36	86.6
WP_103364466.1|1996421_1996820_-	hypothetical protein	A0A2H4JCM1	uncultured_Caudovirales_phage	2.3e-59	88.6
WP_070626273.1|1996806_1997229_-	hypothetical protein	A0A2H4JID2	uncultured_Caudovirales_phage	8.2e-63	80.7
WP_083309983.1|1997266_1997419_-	XkdX family protein	A0A1W6JQ64	Staphylococcus_phage	1.1e-20	88.0
WP_103364467.1|1997420_1997822_-	hypothetical protein	A0A1W6JQ86	Staphylococcus_phage	6.2e-36	83.1
WP_159081712.1|1997835_1999341_-|plate	BppU family phage baseplate upper protein	A0A1W6JQ87	Staphylococcus_phage	2.2e-150	73.1
WP_103364469.1|1999352_2001968_-	peptidase G2	A0A2H4JF10	uncultured_Caudovirales_phage	0.0e+00	76.3
WP_103364470.1|2001982_2002549_-	hypothetical protein	A0A1W6JQ70	Staphylococcus_phage	3.0e-84	74.8
WP_103364471.1|2002541_2004131_-|tail	phage tail protein	A0A2H4JAF8	uncultured_Caudovirales_phage	4.5e-287	90.9
WP_103364472.1|2004140_2004968_-|tail	phage tail family protein	A0A2H4JAE4	uncultured_Caudovirales_phage	5.1e-149	91.3
WP_103364473.1|2004969_2009412_-	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	A0A2H4JDT7	uncultured_Caudovirales_phage	5.6e-295	60.5
WP_156423350.1|2009439_2009592_-	hypothetical protein	A0A0N9SKE8	Staphylococcus_phage	3.2e-17	86.0
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WP_060804352.1|2010258_2010894_-|tail	phage tail protein	A0A2H4JH93	uncultured_Caudovirales_phage	1.4e-101	90.0
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WP_060804355.1|2011719_2012049_-	hypothetical protein	A0A2H4J9E0	uncultured_Caudovirales_phage	1.7e-52	87.2
WP_103364474.1|2012038_2012380_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4JDD1	uncultured_Caudovirales_phage	7.6e-51	85.8
WP_060804357.1|2012398_2013733_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2H4J411	uncultured_Caudovirales_phage	5.3e-172	91.2
WP_103364475.1|2013774_2014332_-|head,protease	HK97 family phage prohead protease	A0A2H4J792	uncultured_Caudovirales_phage	5.4e-62	64.0
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WP_103364477.1|2015759_2017454_-|terminase	terminase large subunit	A0A2H4JC16	uncultured_Caudovirales_phage	9.6e-304	91.5
WP_103364478.1|2017440_2017908_-|terminase	phage terminase small subunit P27 family	A0A2H4J4D1	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-78	96.1
WP_103364479.1|2018079_2018439_-	HNH endonuclease	A0A2H4J8X0	uncultured_Caudovirales_phage	8.0e-51	81.7
WP_103364480.1|2018985_2019432_-	transcriptional regulator	A0A2H4JCR6	uncultured_Caudovirales_phage	3.8e-58	73.8
WP_103364481.1|2019627_2019804_-	transcriptional regulator	Q4ZC79	Staphylococcus_virus	9.4e-21	91.4
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WP_170121966.1|2020030_2020573_-	dUTP pyrophosphatase	I6SB33	Staphylococcus_virus	5.1e-57	65.6
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WP_158263702.1|2021901_2022078_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_103364445.1|2023217_2023625_-	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	Q4ZC94	Staphylococcus_virus	4.5e-58	75.6
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WP_070684218.1|2023790_2024576_-	ATP-binding protein	A0A1W6JPS4	Staphylococcus_phage	3.6e-96	63.6
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WP_103364446.1|2026129_2026792_-	hypothetical protein	Q4ZC99	Staphylococcus_virus	1.0e-123	95.9
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WP_070867124.1|2027250_2027922_-	ERF family protein	A0A1J0MF78	Staphylococcus_phage	8.4e-110	90.5
WP_103364448.1|2027921_2028407_-	siphovirus Gp157 family protein	W5R8N0	Staphylococcus_phage	4.1e-50	61.3
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WP_070626520.1|2029543_2029777_-	hypothetical protein	A0A2H4J7P2	uncultured_Caudovirales_phage	6.0e-23	79.2
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WP_070626518.1|2030183_2030402_-	hypothetical protein	A0A2H4JBS5	uncultured_Caudovirales_phage	5.8e-12	49.3
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WP_060803541.1|2030895_2031210_+	hypothetical protein	A0A2H4JBC2	uncultured_Caudovirales_phage	8.6e-49	88.5
WP_057510932.1|2031333_2031561_-	hypothetical protein	A0A0F6N4M2	Staphylococcus_phage	6.9e-24	73.0
WP_103364250.1|2031561_2032335_-	phage antirepressor KilAC domain-containing protein	Q4ZCB0	Staphylococcus_virus	9.5e-142	98.4
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WP_070626471.1|2033065_2033818_-	phage antirepressor KilAC domain-containing protein	S4SW96	Staphylococcus_phage	3.3e-131	93.6
WP_103364320.1|2033832_2034072_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A2H4J3I3	uncultured_Caudovirales_phage	4.7e-31	86.1
WP_103364319.1|2034261_2034936_+	LexA family transcriptional regulator	A0A1W6JPS3	Staphylococcus_phage	3.6e-113	89.3
WP_103364318.1|2034951_2035635_+	hypothetical protein	A0A2H4J5B8	uncultured_Caudovirales_phage	7.4e-05	52.4
WP_170121956.1|2035967_2037344_+	recombinase family protein	H9A0K0	Staphylococcus_phage	5.2e-98	47.4

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_LS483313|2228840:2324843|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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MAKYKVNQAYIDKELKRTLQKGEEVEMTVKRANEVNKNGKPKNGMLTRIDN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_070684441.1|2254170_2254554_-	hypothetical protein	A0A1J0MFN7	Staphylococcus_phage	4.3e-34	56.7
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WP_103364462.1|2255527_2255704_-	transcriptional regulator	Q4ZC79	Staphylococcus_virus	8.5e-22	91.4
WP_103364463.1|2255721_2255976_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_170121959.1|2255987_2256161_-	hypothetical protein	A0A1W6JQ45	Staphylococcus_phage	8.6e-19	71.9
WP_111713487.1|2256197_2256737_-	dUTP pyrophosphatase	A0A2H4J5Z8	uncultured_Caudovirales_phage	2.3e-57	67.4
WP_103364233.1|2256729_2256963_-	hypothetical protein	Q4ZC83	Staphylococcus_virus	1.1e-16	93.5
WP_103364234.1|2256962_2257409_-	hypothetical protein	Q4ZC87	Staphylococcus_virus	5.3e-44	61.9
WP_103364235.1|2257398_2257593_-	hypothetical protein	Q4ZC88	Staphylococcus_virus	3.2e-22	85.9
WP_103364236.1|2257593_2258064_-	DUF3310 domain-containing protein	Q4ZC89	Staphylococcus_virus	2.7e-83	95.5
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WP_103364239.1|2258784_2259192_-	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	Q4ZC94	Staphylococcus_virus	3.1e-67	92.6
WP_070468927.1|2259357_2260131_-	ATP-binding protein	A0A1W6JP70	Staphylococcus_phage	5.8e-107	81.4
WP_103364240.1|2260141_2260864_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A2H4JDN4	uncultured_Caudovirales_phage	1.6e-90	86.2
WP_103364241.1|2260856_2261264_-	HNH endonuclease	A0A2H4J7B0	uncultured_Caudovirales_phage	3.8e-65	91.1
WP_103364242.1|2261256_2261934_-	hypothetical protein	Q4ZC99	Staphylococcus_virus	4.6e-92	69.8
WP_103364243.1|2261948_2262470_-	DUF669 domain-containing protein	A9CR64	Staphylococcus_phage	7.8e-71	77.5
WP_103364244.1|2262492_2263266_-	AAA family ATPase	A0A0H4ITW3	Staphylococcus_phage	3.9e-119	83.7
WP_103364245.1|2263262_2263748_-	siphovirus Gp157 family protein	W5R8N0	Staphylococcus_phage	7.0e-50	62.0
WP_103364246.1|2263750_2264017_-	DUF1108 family protein	A0A223LGN1	Staphylococcus_phage	1.3e-10	40.0
WP_103364247.1|2264113_2264341_-	hypothetical protein	Q4ZCA4	Staphylococcus_virus	1.6e-20	71.2
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2331436:2331451	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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Homologous phage analysis in the prophage region

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