Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483317 | Staphylococcus aureus strain NCTC5663 chromosome 1 | 5 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 1 | 0 | 9 | 0 |
1. NZ_LS483317
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483317_1 | 1109278-1109368 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483317_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LS483317_1
>1.1|1109306|35|NZ_LS483317|CRISPRCasFinder AAAAAGTTGTAAGGAAGAAGAGGGATACTTGCTCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483317_1
The CRISPR arrays of NZ_LS483317_1 >merge|NZ_LS483317|1|1109278-1109368|CRISPRCasFinder GAGCGCAAGCATAAAATTCCCTAACAACAAAAAGTTGTAAGGAAGAAGAGGGATACTTGCTCTGAGCGCAAGCATAAAATCCCCTAACAAC >NZ_LS483317|1|1|1109278-1109368|CRISPRCasFinder GAGCGCAAGCATAAAATTCCCTAACAAC AAAAAGTTGTAAGGAAGAAGAGGGATACTTGCTCT GAGCGCAAGCATAAAATCCCCTAACAAC
>NZ_LS483317.1|WP_000033477.1|1108232_1108808_-|ECF-transporter-S-component MSKGLKLSEILVTVLISVVFAVIYNLWWFVYNGVQATGLHLEQLTNGVWFMAAIVCYLIIPKPGIALLAEFAAGAGETIIMGRFDIPTIVYAFIQGLACELVFAIFKYQSRSVMVAMLAGFCTAIAAFPIDYFYGYLNEVAGWNLTLFIVFRLISGAVVAGVLSYLLVKALDKTGVTKLFRPAAKEDYDNL >NZ_LS483317.1|WP_000921971.1|1106817_1108218_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKVSDLRLKYPSGQRKIFDHLNITIQDKEKVLLLGPSGCGKSTLLNVLSGIVPNLIELPMKYDELIVDPLSGVIFQDPDSQFCMPKVYEELAFVLENRQVPREDMDALIINALNMVNLNVTPETYIKDLSGGMKQKLAIVETILQQSKTLFLDEPTAMLDVQATEDLWTKLIELWEDQTVVIVEHKVKHIWNHVDRVILMDYNGNIIADECPEIILQKYVHLLSEYGVWHPRAWEFAPSRVDFPTTNSHLLQFKNGRIIRGKSTLLSFSDLEIGLGEWITITGANGSGKTTLLESIMQLIKYQGDVYFENQRLTKIKHAAKHMYLVYQNPELQFITNSVYDEINIHFNHLSKDQSDDETIQLLKLLDLENVKDQHPYELSIGQKRRLSVATALSSKADIIFLDEPTFGLDSHNTFQLIKLFQKRINLGQSIVMVTHDDEIIERYPSRRLKISDGALLDCDGDTNV >NZ_LS483317.1|WP_111762153.1|1106018_1106825_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MYEQWKVRQSFVDDVNIITKLFLGIILFFFIIFVHNFDFMLYITILMLVFLLMFNGTQFKITAIFITISIGFALLSSLFMILYGNGSHTILKFGFIHITTESLVRGLHVSLRTIAISFFGILIALTSQVVMIFYSLMQHLKVKSKVAYAFMAAIRMIPLMISSLIQLRRSLKMRYQMIDAANYRGLQRFKHLIIPLLSQNIRKAHQLSVAMESKGFRDGPRTYYYNVPFSYKDVIFIIVLIAIITLAYYCSINLPITGIDDVRLGRVG >NZ_LS483317.1|WP_111762152.1|1104504_1105752_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase MNVLVIGAGGREHALAYKLNRSNLVKQVFVIPGNEAMTPIAEVHTEISESDHQGILDFAKQQNVDWVVIGPEQPLIDGLADILRANGFKVFGPNKQAAQIEGSKLFAKKIMEKYNIPTADYKEVERKKDALTYIENCELPVVVKKDGLAAGKGVIIADTIEAARSAIEIMYGDEEEGTVVFETFLEGEEFSLMTFVNGDLAVPFDCIAQDHKRAFDHDEGPNTGGMGAYCPVPHISDDVLKLTNETIAQPIAKAMLNEGYQFFGVLYIGAILTKDGPKVIEFNARFGDPEAQVLLSRMESDLMQHIIDLDEGKRTEFKWKNESIVGVMLASKGYPDAYEKGHKVSGFDLNENYFVSGLKKQGDTFVTSGGRVILAIGKGDNVHDAQRAAYEKVSQIQSDHLFYRHDIANKALQLK >NZ_LS483317.1|WP_111762151.1|1103004_1104483_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase MKKAILSVSNKTGIVEFAKALTQLNYELYSTGGTKRILDEANVPVRSVSDLTHFPEIMDGRVKTLHPAVHGGILADRNKTQHLNELSEQHIDLIDMVVVNLYPFQQTVANPDVTMDEAIENIDIGGPTMLRAAAKNYKHVTTIVHPADYQEVLTRLRNDSLDESYRQSLMIKVFEHTAEYDEAIVRFFKGDKETLRYGENPQQSAYFVRTSNAKHTIAGAKQLHGKQLSYNNIKDADATLALVKKFDTPAAVAVKHMNPCGVGIGDTIEQAFQHAYEADSQSIFGGIVALNRAVTPELAEQLHSIFLEVIIAPKFTDEALDILKQKKNVRLLEIDMTIDSNEEEFVSVSGGYLVQDKDNYVVPKEEMKVVTEVAPTDEQWEAMLLGWKVVPSVKSNAIILSNNKQTVGIGAGQMNRVGAAKIALERAIEINDHVALVSDGFFPMGDTVELAAQHGIKAIIQPGGSIKDQDSIDMANKHGIAMVVTGTRHFKH >NZ_LS483317.1|WP_000238666.1|1102423_1102990_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_LS483317.1|WP_111762150.1|1101392_1102421_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYMVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_LS483317.1|WP_000483727.1|1099915_1101400_+|amidophosphoribosyltransferase MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_LS483317.1|WP_111762149.1|1097747_1099937_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTSYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_LS483317.1|WP_111762148.1|1097083_1097755_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-I MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRDEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_LS483317.1|WP_000064214.1|1109391_1109526_-|hypothetical-protein MSNENQNKKAAEKAKEVEEKLKDKKEEKTEDINQTKQDIQDTLN >NZ_LS483317.1|WP_000009069.1|1109677_1110973_+|hypothetical-protein MSFLRKHAEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSEIIKVMSRFIGNFPIVSAIVIIIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITLILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHFMWIIVSYGISYLITQIALYGRIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKGNVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMRKPKWVKPMYVELFCGVVIFLFTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIIIAYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIHGLLLSVFITPTLLLMLLAIIISYSLQLRERP >NZ_LS483317.1|WP_000685058.1|1111397_1112570_+|class-I-SAM-dependent-rRNA-methyltransferase MKIATLNKGKETKYFNGYPLIEEEDIYSQDHLKEGDIFQIVTDKSQYVATAYVGRQHKGLGWVLTYDKAQEINTAFFVKLFKTALAERDYYFNIDGTNAFRLFNAEGDGVGGLTIDNYDGHLLIQWYSKGIYKFKYAILEAVRKVFDYKSIYEKVRFKDSEYSGGFVEGDAPEFPIVIEENFTFYNVDLEDGLMTGIFLDQKEVRKKLRDQYAKERHVLNLFSYTGAFSVIAASEASSTTSVDLANRSRSLTEENFGLNAIDPKSQYIYVMDTFDFYKYAARHGHSYDTIVIDPPSFARNKKRTFSVQKDYDKLINGALNILSSEGTLLLCTNASVYPLKQFKNTIKKTLEESGVDYELTEVMGLPKDFKTHPHYKPSKYLKAVFVNIRH >NZ_LS483317.1|WP_000505962.1|1112623_1113166_+|hypothetical-protein MGFKNNLTSNLTNKIGNSVFKIENINEKGAMPTTIKELNERRQRAEAIVKRKSLMSSTMSVVPIPGLDFGVDLKLMKDIIEDVNKIYGLDHKQVNSLGDDVKERVMSAAAIQGSQFIGKRISSAFLKIVIRDVAKRTAAKQTKWFPVVGQAVSASISYYFMNKIGKDHIQKCENVIKNVM >NZ_LS483317.1|WP_000437472.1|1113319_1113586_+|phosphocarrier-protein-HPr MEQNSYVIIDETGIHARPATMLVQTASKFDSDIQLEYNGKKVNLKSIMGVMSLGVGKDAEITIYADGSDESDAIQAISDVLSKEGLTK >NZ_LS483317.1|WP_000040057.1|1113588_1115307_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MSKLIKGIAASDGVAIAKAYLLVEPDLTFDKNEKVTDVEGEVAKFNSAIEASKVELTKIRNNAEVQLGADKAAIFDAHLLVLDDPELIQPIQDKIKNENANAATALTDVTTQFVTIFESMDNEYMKERAADIRDVSKRVLSHILGVELPNPSMIDESVVIVGNDLTPSDTAQLNKEFVQGFATNIGGRTSHSAIMSRSLEIPAIVGTKSITQEVKQGDMIIVDGLNGDVIVNPTEDELIAYQDKRERYFADKKELQKLRDADTVTVDGVHAELAANIGTPNDLPGVIENGAQGIGLYRTEFLYMGRDQMPTEEEQFEAYKEVLEAMNGKRVVVRTLDIGGDKELSYLNLPEEMNPFLGYRAIRLCLAQQDIFRPQLRALLRASVYGKLNIMFPMVATINEFREAKAILLEEKENLKNEGHDISDDIELGIMVEIPATAALADVFAKEVDFFSIGTNDLIQYTLAADRMSERVSYLYQPYNPSILRLVKQVIEASHKEGKWTGMCGEMAGDETAIPLLLGLGLDEFSMSATSILKARRQINGLSKNEMTELANRAVDCATQEEVIELVNNYVK >NZ_LS483317.1|WP_111762154.1|1115543_1115777_-|glutaredoxin-like-protein-NrdH MSEIIVYTQNDCPPCTFVKNYLNEHQIDFEERNINNQQYRNEMIDFDAFSTPFILLNGNPMYHVDLDEINKELNIQD >NZ_LS483317.1|WP_000381849.1|1115974_1117336_+|cytochrome-ubiquinol-oxidase-subunit-I MDTVEISRFLTAMTLAVHIIFATIGVGMPLMFAIAEFLGIRKNDLQYIAMAKRWAKAYTITVAVGVVTGTIIGLQLSLIWPTFMEMGGHVIALPLFMETFAFFFEAIFLSIYLYTWDRFKNKWTHFLISIPVIIGGSFSAFFITSVNSFMNTPAGFELKNGKMVNVQPIEAMFNPSFIVRSFHVITTAGMTMAFVIASIAAFKLLRNRQPKDTVYHKKALKMSMIVGFFSTLLSMLAGDLSAKFLHKFQPEKLAAYEWHFDTSSHAKLLLFGVLDEKTQQVKGAIELPGLLSFLADNSVKTKVQGLNDFPKSLHPPMIVHYFFDLMVTMGILCFVISGVYVLTLMFKKLRKFSTHKWMLYGILLTGPASMLAIEFGWFLTEMGRQPWIVRGYMRVAEAATQAGGITFVTILFGILYIILMYTCAYVLIRMFKNKPAYEDVNRLAKKQGGEIEK >NZ_LS483317.1|WP_000638453.1|1117332_1118352_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIYAFIGITVLWLFLFCYIIIASIDFGAGFFALHSKLTGDEKKINHLISRYLNPVWEVTNVFFVFFFVGFVGFFPESIKYLGTVLLIPGSIALIMISLRNSFYAFENYGQDTKLAWMIMYGVSGLLIPASLSTALTITEGGYINVRNNVIDLDWVQLLLSPFAWSVVFLAIISVLYISSGFLTYYAKKANDEPAYNLTRQWHIFLGPPMIIICLFVFLSLRIQNSEHFYSAVFDYWWMFAISFLFFALASLLTFFKKKHGLAFVFVILQMMFAFFGYGISKLPYLLYPFVKITDAYVNPEMGWTLVIVFILGLLLLLPSLILLLRLFVFDKEYVEGKKS >NZ_LS483317.1|WP_111762155.1|1118484_1119147_+|TrkA-family-potassium-uptake-protein MGKEYVVIGLGRFGGSIVRELNALDMDVMAIDHDENRVNEYSDIATHAVVADTTDEAVMKSLGIRNFDHVIVAIGENIQSSTLTTLILKELGVKKVTAKAQNDYHAKILNKIGADTVVYPERDMGRRIAHNVASASVLDYLELADEHSIVELKATEKMAGQSIIDLDIRAQYGINIIAIKRGKEFIISPNPNINLEIGDILIMIGHDNDLNRFEKNIATR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483317_2 | 1265912-1266005 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483317_2
|
1 spacers
spacers of NZ_LS483317_2
>2.1|1265942|34|NZ_LS483317|CRISPRCasFinder AGATTAGAGGAACACCTGAGCTAAAGCTCATGCA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483317_2
The CRISPR arrays of NZ_LS483317_2 >merge|NZ_LS483317|2|1265912-1266005|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAAGTAGATTAGAGGAACACCTGAGCTAAAGCTCATGCATAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGT >NZ_LS483317|2|2|1265912-1266005|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAAGT AGATTAGAGGAACACCTGAGCTAAAGCTCATGCA TAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGT
>NZ_LS483317.1|WP_000167269.1|1264990_1265725_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MTKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKEKAEAVVEEIKAKGVDSFAIQANVADADEVKAMIKEVVSQFGSLDVLVNNAGITRDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKATPQMLRQRSGAIINLSSVVGAVGNPGQANYVATKAGVIGLTKSAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTDALSDELKEQMLTQIPLARFGQDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >NZ_LS483317.1|WP_111762215.1|1264071_1264998_+|ACP-S-malonyltransferase MSKTAIIFPGQGAQKVGMAQDLYNNNDQATEILTSAANTLDFDILETMFTDEDGKLGETENTQPALLTHSSALLAALKNLNPDFTMGHSLGEYSSLVAADVLSFEDAVKIIRKRGQLMAQAFPTGVGSMAAVLGLDFDKVNEICKSLSSDDKIIEPANINCPGQIVVSGHKALIDELVEKGKSLGAKRVMPLAVSGPFHSSLMKVIEEDFSSYINQFEWRDAKFPVVQNVNAQGETDKEVIKSNMVKQLYSPVQFINSTEWLIDQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKLTSIQTLEDVKGWNEND >NZ_LS483317.1|WP_000239738.1|1263092_1264079_+|phosphate-acyltransferase-PlsX MVKLAIDMMGGDNAPDIVLEAVQKAVEDFKDLEIILFGDEKKYKLNHERIEFRHCSEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTIDGKGFVFLDVGANADAKPEHLLQYAQLGDIYAQKIRGIDNPKISLLNIGTEPAKGNSLTKKSYELLNQDHSLNFVGNIEAKTLMDGDTDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKDTIMSSTKNKLAGAILKKDLAEFAKKMDYSEYGGSVLLGLEGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEQNIVQTMKETVGESNE >NZ_LS483317.1|WP_111762214.1|1262515_1263088_+|transcription-factor-FapR MRGETLKLKKDKRREAIRQQIDSNPFITDHELSDLFQVSIQTIRLDRTYLNIPELRKRIKLVAEKNYDQISSIEEQEFIGDLIQVNPNVKAQSILDITSDSVFHKTGIARGHVLFAQANSLCVALIKQPTVLTHESSIQFIEKVKLNDTVKAEARVVNQTAKHYYVEVKSYVKHTLVFKGNFKMFYDKRG >NZ_LS483317.1|WP_111762213.1|1260252_1262313_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MAKVNLIESPYSLLQLKGIGPKKIEVLQQLNIHTVEDLVLYLPTRYEDNTVIDLNQAEDQSNVTIEGQVYTAPVVAFFGRNKSKLTVHLMVNNIAVKCIFFNQPYLKKKIELNQTITVKGKWNRIKQEITGNRVFFNSQGTQTQENADVQLEPVYRIKEGIKQKQIRDQIRQALNDVTIHEWLTDELRGKYKLETLDFTLNTLHHPKSKEDLLRARRTYAFTELFLFELRMQWLNRLEKSSDEAIEIDYDLDQVKSFIDRLPFELTEAQKSSVNEIFRDLKAPIRMHRLLQGDVGSGKTVVAAICMYALKTAGYQSALMVPTEILAEQHAESLIALFGDFMNVALLTGSVKGKKRKILLEQLENGTIDCLVGTHALIQDDVIFHNVGLVITDEQHRFGVNQRQLLREKGAMTNVLFMTATPIPRTLAISVFGEMDVSSIKQLPKGRKPIITTWAKHEQYDKVLMQMTSELKKGRQAYVICPLIESSEHLEDVQNVVALYESLQQYYGVSRVGLLHGKLSADEKDEVMQKFSNHEIDVLVSTTVVEVGVNVPNATFMMIYDADRFGLSTLHQLRGRVGRSDQQSYCVLIASPKTETGIERMTIMTQTTDGFELSERDLEMRGPGDFFGVKQSGLPDFLVANLVEDYRMLEVARDEAAELIQSGVFFENTYQHLRRFVEENLLHRSFD >NZ_LS483317.1|WP_000623918.1|1258416_1260063_+|DAK2-domain-containing-protein MISKINGKLFADMIIQGAQNLSNNADLVDSLNVYPVPDGDTGTNMNLTMTSGREEVENNLSKNIGELGKTFSKGLLMGARGNSGVILSQLFRGFCKNIESESEINSKLLAESFQAGVETAYKAVMKPVEGTILTVAKDAAQAAVEKANNTEDCIELMEYIIVKANESLENTPNLLAVLKEVGVVDSGGKGLLCVYEGFLKALKGEKVEAKVAKLDKDEFVHDEHDFHGVINTEDIIYGYCTEMMVRFGKNKKAFDEQEFRQDMSQFGDSLLVINDEEIVKVHVHTEYPGKVFNYGQQYGELIKLKVENMREQHREVIRKEQHTAKPKMETVETAIITISMGEGISEIFKSMGATHIISGGQTMNPSTEDIVKVIEQSKCKRAIILPNNKNILMASEQAASIVDAEAVVIPTKSIPQGISALFQYDVDATLEENKAQMADSVNNVKSGSLTYAVRDTKIDGVEIKKDAFMGLIEDKIVSSQSDQLTTVTELLNEMLAEDSEILTVIIGQDAEQAVTDNMINWIEEQYPDVEVEVHEGGQPIYQYFFSVE >NZ_LS483317.1|WP_000171418.1|1258027_1258402_+|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MTLEISNDYGKIDISNEVIASVVGGKAVECYGIVGMASRQQVRDGIAEILGHENYAKGIKVTENNGVVDIDMYIIVSYGVKISEVANNVQSTVKYTLEKSLNVSVNSINIYVQGVRVNNTGKKA >NZ_LS483317.1|WP_000517908.1|1257396_1257585_-|50S-ribosomal-protein-L28 MGKQCFVTGRKASTGNRRSHALNSTKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVTRV >NZ_LS483317.1|WP_111762212.1|1256373_1257015_+|thiamine-diphosphokinase MHINLLCSDRHLPQDIWAKSNEGKWGGVDRGALILLKHQIIPFFSVGDFDSVSKEERQLLTEQLQIKPVQAEKADTDLALAVDKAVALGFDSITIYGATGGRLDHFFGAIQLLLKKAYYKHDVHIEVIDQQNKIELLPKGQHTVEKDKSYPYISFILMTDDVELSLAGFKYNLARQMLNIGSTLTISNEIESLQAKVTVHDGLILQIRSTDLN >NZ_LS483317.1|WP_000164332.1|1255722_1256367_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MTKLYPSLLSVDFLDLQHELKRLEEAGVDGVHFDVMDGQFVPNISIGLPILDAVRKGTTLPIDVHLMIENPEKYIASFAEHGADMISIHVESTPHIHRAIQMIKHLDKKAGVVINPGTPISQIEPILDIVDYVLVMTVNPGFGGQSFIDQCVEKIAGLNAIKMERQLNFDIEVDGGVNTDTAKVCVENGATMLVTGSFFFKQEDYKKVTQALKG >NZ_LS483317.1|WP_000426914.1|1266094_1266328_+|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >NZ_LS483317.1|WP_111762216.1|1266443_1267175_+|ribonuclease-III MSKQKKSEIVNRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHRQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >NZ_LS483317.1|WP_111762217.1|1267321_1270888_+|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIVVTVHDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGKRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLEERKKNQSETNARYEEEQENLIELLENISNEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEAKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQAYRYTEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIIDVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIQSRVVATDIKSIAKEANGFISIASEAVKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKASLKRLEDEIERYTKLSKEGKESVTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIELNEQIDAQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAVFIQLFGGGDAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >NZ_LS483317.1|WP_111762218.1|1270887_1272138_+|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFATNKENEEVKSLTEEQGQDKLEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIEQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGAK >NZ_LS483317.1|WP_000531320.1|1272124_1272457_+|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKQHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >NZ_LS483317.1|WP_054190212.1|1272482_1273850_+|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTKLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEVKDIAKPNEIMLVVDSMTGQDAVNVAESFDNQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >NZ_LS483317.1|WP_000268754.1|1274191_1274467_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >NZ_LS483317.1|WP_001261987.1|1274654_1275158_+|ribosome-maturation-factor-RimM MRVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTDVRFQPGQVLTVVHNNNDLEYTVKSHRVHKGLHMLTFEGINNINDIEHLKGSSIYQERDHEDIVLEENEFYYSDIIGCTVFDDQETPIGRVINIFETGANDVWVIKGSKEYLIPYIADVVKEVDVENKKIIITPMEGLLD >NZ_LS483317.1|WP_111762219.1|1275157_1275895_+|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFDGVLNHSIMKRAQENNKLQINTVNFRDYAINKHNQVDDYPYGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLDVTEQTRVILMCPQGEPFSHQKAVELSEADHIVFICGHYEGYDERIRTHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFKGLTVPDVLLSGNHANIDAWRHEQKLIRTYNKRPDLIEKYPLTNADKQILERYKIGLKKG >NZ_LS483317.1|WP_000181404.1|1275997_1276348_+|50S-ribosomal-protein-L19 MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_LS483317_3 | 2350009-2350090 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483317_3
|
1 spacers
spacers of NZ_LS483317_3
>3.1|2350033|34|NZ_LS483317|CRISPRCasFinder ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGAACACCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483317_3
The CRISPR arrays of NZ_LS483317_3 >merge|NZ_LS483317|3|2350009-2350090|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGAACACCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG >NZ_LS483317|3|3|2350009-2350090|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGAACACCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG
>NZ_LS483317.1|WP_111762596.1|2348513_2349668_-|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MNDMDNSFLITTEIQRKWIEKFKAIGDTFKAKSEYNDQHSQFPYKNIEWLIKEGYGKLTLPKAYGGEGATIEDMVILQSFLGELDGATALSIGWHVSVVGQIYEQKLWSQDMLEQFAVEINNGALVNRAVSEAEMGSPTRGGRPSTHAVKADDGYILNGVKTYTSMSKALTHIIVAAYIEELESVGFFLVDRNLPGVEIADNWNVLGMRATESHDLILNDVKVPLKHLVETEKSKAPNGWILHIPSCYLGIAQAARNYAVDFAIQHSPNSIEGTIATLPTVQQNLGKMETLLLCARQFLWSTAKGYQQYKDDSQIRNSTSASKVMVMNQGLEVIDLAMRIVGAKSLEMNRPLQRYYRDMRAGLHNPPMEDAAYTNIAKSITDTF >NZ_LS483317.1|WP_000735038.1|2347392_2348301_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLLLPLIIMLLVLAACGNQGEKNNKAETKSYKMDDGKTVDIPKDPKRIAVVAPTYAGGLKKLGANIVAVNQQVDQSKVLKDKFKGVTKIGDGDVEKVAKEKPDLIIVYSTDKDIKKYQKVAPTVVVDYNKHKYLEQQEMLGKIVGKEDKVKAWKKDWEETTAKDGKEIKKAIGQDATVSLFDEFDKKLYTYGDNWGRGGEVLYQAFGLKMQPEQQKLTAKAGWAEVKQEEIEKYAGDYIVSTSEGKPTPGYESTNMWKNLKATKEGHIVKVDAGTYWYNDPYTLDFMRKDLKEKLIKAAK >NZ_LS483317.1|WP_111762595.1|2346052_2346994_-|nucleoside-hydrolase MTKKVYFNHDGGVDDLVSLFLLLQMENVHLIGVSTIGADCYLEPSLSASVKIINRFSNEDIQVAPSYERGKNPFPKEWRMHAFFMDALPILNEPVKHVASNVSDKEAFEDIIQTLKRQSEKVTLLFTGPLTDLAKALQKDSSIVQYIEKLVWMGGTFLPKGNVEEPEHDGSAEWNAYWDPEAVKIVFDSDIEIDMVALESTNQVPLTLDVRQRWANERQYTGVDFLGVSYAAVPPLTHFITNSTYFLWDVLTTAYIGNKDLVHSIEKKVDVISYGPSQGKTFECNDGRKINVINHVDNNAFFDYITALAKKVN >NZ_LS483317.1|WP_000208737.1|2345377_2345932_-|biotin-transporter-BioY MTTKQLVYTALMTAIIAILGLVPVIPLPFSSVPIVLQNIGIFLAGVILGRKYGTLSVIVFLLLVVAGLPLLSGGRGGIGVFAGPSAGFLLLYPVVAFMIGAIRDRFINEINFWILFVGILVFGVIALDVIGTLIMGMIINIPFTKAISISLAYLPGDILKAIVASLIGTALLNHSQFRQIMGLK >NZ_LS483317.1|WP_111762594.1|2344535_2345306_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MASISMSDIYCNGTIFENDDEQLIYLTPSFPQRYTSNTWIYKKTPTEERWLKDLERQHQLHTNQGSNHYAFSFPENEQLDNHWMAMFKDMNFELGIMELYAIESDALANLPRNSDVEIAIVDESHIDDYLKVAYQFSLPFGKDYADAHEEMVREHYQKDAIKRLVAYLNNEPIGVVDVIESENYIELDGFGVLEQFRHQGIGSTIQSLIGEYAISKNHKPIILVTDGEDTAKDMYAKQGYVYQSFCYQILKEDIGN >NZ_LS483317.1|WP_001030823.1|2343566_2344364_+|formate-dehydrogenase-accessory-sulfurtransferase-FdhD MNKDVSLGQPIVRYEDGKLFNTTDQYVTEFPLTIMVNGEEFATVICSPTNLEELVIGFLASEGAILKRDELKSVLIDDSKGFAHVELNKDLGDRFQYSTKRMIASCCGKSREFYFQNDAAIAKTSMSKITLTPIQIINMMTRLQSASHIYQETGGLHNAAISDGLTFFVHRQDIGRHNALDKLYGFCIQRHITVRDKVLIFSGRISSEILIKAAKIGVGVILSKSAPTTLAVTLANDLNITAVGFIRNGGFNIYSHPERIIDSEQ >NZ_LS483317.1|WP_111762593.1|2342494_2343277_-|molybdate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKMKRLFAIVIAMLLVLAGCSNSNDNNESKKDDADNGKKQEIQVAAAASLTDVTKKLASEFKKEHKNADIKFNYGGSGALRKQIESGAPVDVFMSANTKDVDALKDKNKAHDTYKYAKNSLVLIGDKDSNYTSVKDLKDNDKLALGEVKTVPAGKYAKQYLDNNNLFKEVESKIVYAKDVKQVLNYVEKGNAKQGFVYKTDLYKQNKKIDTVKVIKEVELKKPITYEAGATSDSKLAKEWMEFLKSDKAKEILKEYHFAA >NZ_LS483317.1|WP_001113093.1|2341809_2342481_-|molybdate-ABC-transporter-permease-subunit MPDLTPFWISIRVAVISTIIVTVLGIFISKWLYRRKGSWVKVLESLLILPIVLPPTVLGFILLIIFSPRGPIGQFFANVLHLPVVFTLTGAVIASVIVSFPLMYQHTVQGFRGIDTKMINTARTMGASETKIFLKLILPLAKRSILAGIMMSFARALGEFGATLMVAGYIPNKTNTLPLEIYFLVEQGRENEAWLWVLVLVAFSIVVISTINLLNKDKYKEVD >NZ_LS483317.1|WP_111762592.1|2341203_2341809_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINLKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIE >NZ_LS483317.1|WP_000076924.1|2340030_2341035_-|ThiF-family-adenylyltransferase MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSACTTCGDIPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_LS483317.1|WP_172452305.1|2350172_2351078_-|urea-transporter MKMIDVLLKNISQVVLISNKWTGLFILIGLFVANWTVGLAAMIGSIIAYAFARYINYSEAEINDGLAGFNPVLTAIALTIFLDKSGLDIVITMIATLLTLPVAAAVREVLRPYKVPMLTMPFVIVTWFTILLSGQVKFVDTSLKLMPQNIETVNFSNNDRIHFIQSLFEGFSQVFIEASVIGGVCILIGILIASRKAALLAVIASLLSFIIVALLGGNYDDINQGLFGYNFVLMAIALGYTFKTAINPYISTFLGVLLTVVVQLGTTTLLEPFGLPALTLPFIIVTWILLFAGIKHDKVDA >NZ_LS483317.1|WP_000545928.1|2351337_2351640_+|urease-subunit-gamma MHFTQREQDKLMIVVAAEVARRRKARGLKLNHPEALALISDELLEGARDGKTVAELMSYGRQILNKEDVMDGVEHMITDIEIEATFPDGTKLITVHHPIV >NZ_LS483317.1|WP_111762597.1|2351653_2352064_+|urease-subunit-beta MIPGEIITKSTEVEINNHHPETVIEVENTGDRPIQVGSHFHFYEANAALDFEREMAYGKHLDIPAGAAVRFEPGDKKEVQLVEYAGKRKIFGFRGMVNGPIDESRVYRPTDEDDEYAGVFGDNGDENVNKKGGKRS >NZ_LS483317.1|WP_000008673.1|2352060_2353776_+|urease-subunit-alpha MSFKMTQNQYTSLYGPTVGDSIRLGDTNLFAQIEKDYAVYGEEATFGGGKSIRDGMAQNPRVTRDDVNVADLVISNAVIIDYDKVVKADIGIKNGYIFAIGNAGNPDIMDNVDIIIGSTTDIIAAEGKIVTAGGIDTHVHFINPEQAEVALESGITTHIGGGTGASEGSKATTVTPGPWHIHRMLEAAEGLPINVGFTGKGQATNPTALIEQINAGAIGLKVHEDWGATPSALSHALDVADEFDVQIALHADTLNEAGFMEDTMAAVKDRVLHMYHTEGAGGGHAPDLIKSAAFSNILPSSTNPTLPYTHNTVDEHLDMVMITHHLNAAIPEDIAFADSRIRKETIAAEDVLQDMGVFSMISSDSQAMGRVGEVITRTWQVAHRMKEQRGPLDGDFEHNDNNRIKRYIAKYTINPAITHGISEYVGSIEPGKLADIVLWDPIFFGVKPELVVKGGLINSAVNGDANGSIPTSEPMKYRKMYGQYGGNLTSTSMTFVSKTAYENGINRALNLKRMVRPVKNIRQLSKADMKNNSATPKLDVDPQTYEVYVDGEKITSNAATELPLTQRYFLF >NZ_LS483317.1|WP_000634589.1|2353788_2354241_+|urease-accessory-protein-UreE MIVEEIQGNIANLSNSEKQKHVEKVYLENSDLVKRIQRVVTDHGTEIGIRLKQPIDLQYGDILYADDHNMIIVDVNSEDLLVIQPRTLQEMGDIAHQLGNRHLPAQFTETEMLVQYDYLVEDLLKSLGIPYVREDRKVNKAFRHIGHSHD >NZ_LS483317.1|WP_111762598.1|2354233_2354923_+|urease-accessory-protein-UreF MINHTHLRLFQFCDSQFPTGAFSHSFGLETYIQRNIIHDDRTFIAWLKMFLQEQLTYSDGLAMRLVYDALENDDTQKVLHIDKLMFVQNLPKETRVGAKQMGTRMVKLALELYNSPWIAWYHQQMQDKKAKLNPAICFTMLGHHLGVDIETIIDYYLYQNVSSLTQNAVRAIPLGQTAGQKIVTHMIPYIEETRKQISELKEADFGMTAPGLELNQMAHENVNVRIFIS >NZ_LS483317.1|WP_000002973.1|2354935_2355550_+|urease-accessory-protein-UreG MANPIKIGIGGPVGAGKTQLIEKVVKRLSKEMSIGVITNDIYTKEDEKILVNSGVLPESRIIGVETGGCPHTAIREDASMNFAAIDELLERHDDIELIFIESGGDNLAATFSPELVDFSIYIIDVAQGEKIPRKGGQGMIKSDFFVINKTDLAPYVGASLEQMAEDTKVFRGKRPFTFTNLKTDEGLDEVIDWIERDTLLKGLS >NZ_LS483317.1|WP_111762599.1|2355549_2356386_+|urease-accessory-protein-UreD MDEQQWTGQLDLTVFFDGNRSVSRDIFFEKALKVIRPVYLNQSTIPTFYIVNVGGGYLDGDRYRMNVNVEDNAKVTLTSQGATKIYKTPSDHVEQYQTFNLKDNAYLEYVADPIIAYENAKFYQHNTFNLNNSSSLFYTDILTPGYSKTGEAFKYQYMHLINEIYIEDELVTYDNLLLNPNKQSINEIGYMEHYSHYGSAYFIHEDVNQKLIDSVYETISSYSNTFDCRVAISQLPTHGFAVRIFAYRTQIIEKILETIQSYIAENIYNRKLDFLRKY >NZ_LS483317.1|WP_000036076.1|2356574_2356922_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarR MSKINDINDLVNATFQVKKFFRDTKKKFNLNYEEIYILNHILRSESNEISSKEIAKCSEFKPYYLTKALQKLKDLKLLSKKRSLQDERTVIVYVTDTQKANIQKLISELEEYIKN >NZ_LS483317.1|WP_000599591.1|2357349_2357676_-|PH-domain-containing-protein MILDNVNPNDLFPTEKKGPSVLGIIEYQVQGKNEFEGAFIATNERLIMNVDMNGQFYYRSISYNEIEKIDYDGQTIMFKFNIGNVPMHDIKSDNVEMFVEYVKQHMIV |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483317_4 | 2608924-2609009 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483317_4
|
1 spacers
spacers of NZ_LS483317_4
>4.1|2608954|26|NZ_LS483317|CRISPRCasFinder CCGCCAGCTACTTTGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483317_4
The CRISPR arrays of NZ_LS483317_4 >merge|NZ_LS483317|4|2608924-2609009|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTACTTTGTTGGGGCCCCGCCAACTCGCACATTATTGTAAGCTGACTTT >NZ_LS483317|4|4|2608924-2609009|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT CCGCCAGCTACTTTGTTGGGGCCCCG CCAACTCGCACATTATTGTAAGCTGACTTT
>NZ_LS483317.1|WP_111762708.1|2608176_2608668_+|N-acetyltransferase MIRCSKKEDLNAILAIYNDAIINTTAVYTYEPQTIDERVAWFETKQRKHEPIFVFEENGSVLGFATFGSFRPWPAYLYTIEHSIYVDASARGKGIASQLLHHLIVEAKAKGYRALVAGIDASNKASIQLHQKFAFKHAGTLTNVGFKFNRWLDLAFYELDLQD >NZ_LS483317.1|WP_000759360.1|2607362_2607983_-|class-A-sortase-SrtA MKKWTNRLMTIAGVVLILVAAYLFAKPHIDNYLHDKDKDEKIEQYDKNVKEQASKDKKQQAKPQIPKDKSKVAGYIEIPDADIKEPVYPGPATPEQLNRGVSFAEENESLDDQNISIAGHTFIDRPNYQFTNLKAAKKGSMVYFKVGNETRKYKMTSIRDVKPTDVEVLDEQKGKDKQLTLITCDDYNEKTGVWETRKIFVATEVK >NZ_LS483317.1|WP_078062684.1|2606470_2607202_+|peptide-ABC-transporter-permease MSTLKLEFKKSISNKIIYTLGVLFIFLFLLGYFLPIGIDKVKSLSYSQFFFSSYTVATQLGFLLFSFVFAYFINKEYSNKNILFYKLIGDNIFTFFYKKVAVLFFECLVFIILSITIISIIYSDFSHYLLLIILFSLVILQYILVVGTISMVSPNILISLGISIVYWIGSVILVAINKNIFGIVAPFEASNTMYRAVEKILNNESTFICPTEIINTVSFFVLLFIVNTIVLLLSRKRWLKIGM >NZ_LS483317.1|WP_111762707.1|2605829_2606465_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MKLNNYSLKVKNKQLVDNCDLNFYLGQINHIVGKNGVGKSLLAKDFLLNNSGNIPKSISQNVSLISSSSNIPNDITKDFLLSLLKSKFENNRQTFDKIYNILNIEAIPSNVLLKNLSDGQKQKLKLLSFLLEDHDLIILDEITNALDKKTVNEIYEFLNAFIQSHQTKTIINITHNLSDLSALPGKYFIFKDLQIEEYQSKEEVINDYINL >NZ_LS483317.1|WP_111762706.1|2604708_2605509_-|HAD-family-hydrolase MVKAIAVDMDGTFLDSKKTYDKPRFEAIFTELRNRDITFIAASGNQYAKLKSIFGDRDMYFISENGAVIYKGNELYNYKSFNRQVFQQVVDYLNMNQGIDQLVICGLKSAYILKHTSEAFKEDTRFYYHQLKEIDSLQQLPEDDYVKIAFNINRETHPNVDEEVATQFSNDIKLVSSGHDSIDIIMPNMTKGQALKRLLDKWGMSSSELMAFGDANNDKDMLAFAKHSYVMENSHDEELFNIASAVAPSNDKQGVLTIIEQEVLKK >NZ_LS483317.1|WP_000161536.1|2603469_2604462_+|D-lactate-dehydrogenase MTKIMFFGTRDYEKEMALNWGKKNNVEVTTSKELLSSATVDQLKDYDGVTTMQFGKLENDVYPKLESYGIKQIAQRTAGFDMYDLDLAKKHNIVISNVPSYSPETIAEYSVSIALQLVRRFPDIERRVQAHDFTWQAEIMSKPVKNMTVAIIGTGRIGAATAKIYAGFGATITAYDAYPNKDLDFLTYKDSVKEAIKDADIISLHVPANKESYHLFDKAMFDHVKKGAILVNAARGAVINTPDLIAAVNDGTLLGAAIDTYENEAAYFTNDWTNKDIDDKTLLELIEHERILVTPHIAFFSDEAVQNLVEGGLNAALSVINTGTCETRLN >NZ_LS483317.1|WP_000069090.1|2602528_2603200_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MSNMNQTIMDAFHFRHATKQFDPQKKVSKEDFETILESGRLSPSSLGLEPWKFVVIQDQALRDELKAHSWGAAKQLDTASHFVLIFARKNVTSKSPYVQHMLRDIKKYEAQTIPAVEQKFDAFQADFHISDNDQALYDWSSKQTYIALGNMMTTAALLGIDSCPMEGFSLDTVTDILANKGILDTEQFGLSVMVAFGYRQQDPPKNKTRQAYEDVIEWVGPKE >NZ_LS483317.1|WP_111762705.1|2601603_2602410_+|VOC-family-protein MAFHDKTATQVTNIELNVRDLDLMTTFYKNILGLSVKSSDDNTTVLSVGTGGHTLTLHLLEDVRQTSPREAGLFHIAFLLPTTEDLANFLYFVAQKNMGIGAGDHLVSEALYFNDPEGNGIEVYRDRPSSSWEWQNGKVKMDTLEVDSQTLLTHRTDEGWQGMPAKGMIGHLHLKTHDLDAAYQCYIEQLGFQHVSDFPRALFMSTNHYHHHIAANTWQSNQARQNNAQSYGLTHVDIYQPDASTHTFTAPEGFDITVHSNTDLVPEK >NZ_LS483317.1|WP_000067112.1|2601144_2601429_+|N-acetyltransferase MSNLEIKQGENKFYIGDDENHALAEITYRFVDNNEINIDHTGVSDELGGQGVGKKLVKAVVEHARENHLKIIASCSFAKHMLEKEDSYQDVYLG >NZ_LS483317.1|WP_000376235.1|2600484_2600919_-|MarR-family-transcriptional-regulator MDRTKQSLNVFVGMNRALDTLEQITKEDVKRYGLNITEFAVLELLYNKGPQPIQRIRDRVLIASSSISYVVSQLEDKGWITREKDKDDKRVYMACLTEKGQSQMADIFPKHAETLTKAFDVLTKDELTILQQAFKKLSAQSTEV >NZ_LS483317.1|WP_001549802.1|2609232_2609403_-|hypothetical-protein MLRLSIIFIAFIINTTITYGYTTEGTWVNLLFKSLSLSMIIVFMFYYIRFVIEKKR >NZ_LS483317.1|WP_070004208.1|2609455_2609563_-|hypothetical-protein MIKKKHLSGSFVPDRCFLIIFHKVEKFMGNACSSK >NZ_LS483317.1|WP_000460421.1|2609581_2610481_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFDSIRETIDYAVENNMSFADIMVKEEMELSGKSRDEVRAQMKQNLDVMRDAVIKGTTGDGVESVTGYTGHDAAKLRDYNETHHALSGYEMIDAVKGAIATNEVNAAMGIICATPTAGSSGTIPGALFKLEKTHDLTEEQMIDFLFTSALFGRVVANNASVAGATGGCQAEVGSASAMAAAAAVAIFGGSPEASGHAMALAISNLLGLVCDPVAGLVEIPCVMRNAIGSGNALISADLALAGIESRIPVDEVIEAMDKVGRNLPASLRETGLGGLAGTPTGEAIKRKIFGTAEDMVKNN >NZ_LS483317.1|WP_001140234.1|2610494_2611175_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MAKSYDYQSAFDIIGPVMMGPSSSHTAGAVKIGNSARAILGDIPKNIEIHYYESFAQTHQGHGTDVAIVGGAMGYSTFDNRIKSSLEIAADDGIKIDIIEEEGDSIGQHPNCAYIKSSRNDGRYIEIIGISIGGGTIKIKGIHINGLEVDLNHGLPILVVDGNMTKAQVNHFINDINDMKLDCKDEFIKIDEDKCLVVIPLNKAISESTLNTIKEKYSDVNVSYIN >NZ_LS483317.1|WP_000353634.1|2611177_2612221_-|PTS-fructose-transporter-subunit-IIC MDILLGVGTLVLVLVIMTLFLKYAPYGKQGLQALSGAACATFLPQAFLSYAIGGVFDIKFLQDIGDLAGSLSGIAVGILTCLNLGVAPVFAVIVGLVLHDFKLLPAFIAAYGVAFLIKWIEKKVPEGLDLIVVILFAPAIAFGLASIITPGVLATLKQIGSAVTAVGDNNPYALAVILGLVIPVTGMTPLSSMVLTSLLGLTGVPMAIGALTCTGSSFVNLILFRKLNIGGPSKAFAVCIEPLTQIDLIAQYPVQLYGTNALIGVVNACIVTFSGLVIGVKGMATPIAGAIVLFGFNNAVTSIVTIATVIIVSIVLAYIIGTLINKFNLMNINFKMPSKKNHIKESV >NZ_LS483317.1|WP_001177186.1|2612768_2612972_+|hypothetical-protein MQLSHSVKVAISIYLALIFITFTSYLVIILYTSMTGHDVSHFVLDSQHSHHGSLTQKHLSLPEISFK >NZ_LS483317.1|WP_072460442.1|2613154_2614090_+|EamA-family-transporter MRYLANNHSALRLKGIILAIVGACLWGLGGTVSDFLFKYKNINVDWYVTARLVVSGIFLLIMYKMMQPKRSIFSVFQDRRMLGKLLIFSILGMLVVQYAYMASINTGNAAIATLLQYIAPVYIIIWFVIRGVAKLTLFDVLAIIMTLLGTFLLLTNGSFSNLVVNPASLFWGILAGVALAFYTIYPSDLLNRFGSILIVGWAMLISGVAMNLRHPIWHIDITKWDISIILFLIFGIIGGTALAFYFFIDSLQYISAKETTLFGTVEPVVAVIASSLWLHVAFKPFQIVGIILIMILILLLSLKRQPETLDE >NZ_LS483317.1|WP_111762709.1|2614169_2615138_-|alpha/beta-hydrolase MRKKWSTLAFGFLVAAYAHIRIKEKRSVKSYMLEQGIRLSRAKRRFMYKEEAMKALEKMALQTAGEYEGTNYQFKMPVTVDKHFGSTVYTVNDKQDKHQRVVLYAHGGAWFQDPLKIHFEFIDELAETLNAKVIMPVYPKIPHQDYQATYVLFEKLYHDLLNQVADSKQIVVMGDSAGGQIALSFAQLLKEKHIVQPGHIVLISPVLDATMQHPEIPDYLKKDPMVGVDGSVFLAEQWAGDTPLDNYKVSPINGDLDGLGRITLTVGTKEVLYLDALNLSQLLSAKGIEHDFIPGYYQFHIYPVFPIPERRRFLYQVKNIIN >NZ_LS483317.1|WP_000240662.1|2615270_2615615_-|thioredoxin-family-protein MVKQLNSVEAFREFIHQYPLAVVHVMRDQCSVCHAVLPQIEDLMQSYPNVPLAVINQSQVEAIAGELNIFTVPVDLIFMNGKEMHRQGRFIDMQRFEHHLKQMNDSVNNDVDEH >NZ_LS483317.1|WP_000206033.1|2615656_2616067_-|acyl-CoA-thioesterase MTTEGLLVAEKEIEVNGYDIDAMGVVSNIVYIRWFEDLRTAFINQHMNYSTMINQGISPILMKTEAEYKVPVTIHDKPVGRIYLVKASKMKWVFQFEIVSAHGVHCIGTQTGGFYRLSDKKITSVPQVFQDILATK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483317_5 | 2754718-2754897 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483317_5
|
2 spacers
spacers of NZ_LS483317_5
>5.1|2754742|54|NZ_LS483317|CRISPRCasFinder TGAGTCAGATACACTCGTTGAACCAGATGTACTTAAGGAACTAGACGTACTCGA >5.2|2754820|54|NZ_LS483317|CRISPRCasFinder TGATCCAGACGTACTTAATGATTCTGATGTGCTTGTTGAAGTTGAACCACTTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483317_5
The CRISPR arrays of NZ_LS483317_5 >merge|NZ_LS483317|5|2754718-2754897|CRISPRCasFinder TGAATTAGATTCACTCATTGATGTTGAGTCAGATACACTCGTTGAACCAGATGTACTTAAGGAACTAGACGTACTCGATGAGTCAGATACGCTCGTTGAACCTGATCCAGACGTACTTAATGATTCTGATGTGCTTGTTGAAGTTGAACCACTTGTTGAGCCAGATGTACTCAATGATTC >NZ_LS483317|5|5|2754718-2754897|CRISPRCasFinder TGAATTAGATTCACTCATTGATGT TGAGTCAGATACACTCGTTGAACCAGATGTACTTAAGGAACTAGACGTACTCGA TGAGTCAGATACGCTCGTTGAACC TGATCCAGACGTACTTAATGATTCTGATGTGCTTGTTGAAGTTGAACCACTTGT TGAGCCAGATGTACTCAATGATTC
>NZ_LS483317.1|WP_111762766.1|2752654_2753866_-|accessory-Sec-system-protein-translocase-subunit-SecY2 MLKLLQQYEYKIIYKRILYTCFILFIYILGTNISIVSYNDMQVKHESFFKIAISNMGGDVNTLNIFTLGLGPWLTSMIILMLISYRNMDKYMKQTSLEKHYKERILTLILSVIQSYFVIHEYVSKERVHQDNIYLTILILVTGTMLLVWLADKNSRYGIAGPMPIVMVSIIKSMMHQKMEYIDASHIVIALLIILVIITLFILLFIELVEVRIPYIDLMNVSATNMKSYLSWKVNPAGSITLMMSISAFVFLKSGIHFILSIFNKSISDDMPMLTFDSPVGISVYLVIQMLLGYFLSRFLINTKQKSKDFLKSGNYFSGVKPGRDTERYLNYQARRVCWFGSALVTIIIGIPLYFTLFVPHLSSEIYFSVQLIVLVYISINIAETIRTYLYFDKYKPFLNQYW >NZ_LS483317.1|WP_111762765.1|2751090_2752644_-|accessory-Sec-system-protein-Asp1 MKYFIPAWYDDQRWWQDTTVPYYQTQNKTEFDDMISLMGMHLENNLDYQLIVLNHAPNIRTFLHRYDLYETKYWSVFDEIQGFSHHAPQAINYHHLKWPDDVEFVYTPYLLKCVTSEQTYTNIYFSQEGYSIWFEEFERDQLQRRYIFDDRGYLSAIRYFDDQGEASYQEYLTINGDCVLYENFKNGRVTVSKRYQHHYQQTEYNNMAQLIEEKFQAMIAQQIHEDDHVIVASDARHNRQIADHIPAKSLSYSFFKNRNETVSDEEYQSIIKNAHLIVDSVQLERDLISHQEKYQRENTMIRITPFETRQSPNISSQLMETFIGVWIDGMSDVDLQQMMQRLVDYIAQEDNYRLILLTRRQNDIPMWLRECITSVNEEYQAKQNADVNVSALMTPEDQDDIIAVKTIHAEHDVVEALRTLRLVIDMSKEPDLYLQISAISAGIPQINGQQTDYVSDYDNGRIINTVDELDDALNYYLFYLKNWNYAYAYSLKLIDAYASKNIINQLDELIEGENDAT >NZ_LS483317.1|WP_111762764.1|2749532_2751101_-|accessory-Sec-system-protein-Asp2 MPRKFRVLQIGGDDLEPIFQHKKGVSWDYFDIGLFEFDSGYVEAIEAIVEAEGRFDFIYIQAPYSETLTNLLQMISEPYNTYVDESFWSVEYEQDENIQKYVVQPLHYRNIEERNNKLEAVSFSGQYGDKVSPKLALVHPNFKGDVVYQGNSELTLSGEFGKEFKPIASWQNNLVYDKDKVIQIWPEFDIDGAVELQYTFRLIQTGADGALIEQIILTDDMLDSPLEIPTKPFDAYISVTVKARGNGTVHLGPIHKRWSRLDMGQFLLGGSRFVDSQRQEFIYYFHPGDMKPPLNVYFSGYRTAEGFEGYYMMKRMNAPFLLIGDPRVEGGSFYIGSSEYEQGIINVIDETLEKLNFKSHELILSGLSMGSFGALYYGAQLNPQAIIVGKPLVNIGTIAEHMRLLRPEEFGTALDVLVSNEGDTSQASIQALNQKFWQTFQKKSLSQTVFAIAYMQHDDYDPHAFQELLPVLTAHQARVMNRSIPGRHNDDSPTIASWFVNFYNIILEDKFGRVQHAEKQNI >NZ_LS483317.1|WP_111762763.1|2748595_2749555_-|accessory-Sec-system-protein-Asp3 MLKNKTFKVTWNYISQTTFMYGSKVSFSNGEVTFINPLMPSGLPIHEWLMLKQFSKYKSAPSLPILRRGQHYKLHFDFDATPAGSVYFIIIFYNKNGTKLSTEIVKSNSITIQYPDEAYAYKIKMMNAASTSLIFRCLTITEMTHQDDLEYKNMRVTKIGDDQYGNDRINVIIAEPSDAYPTISNDFLKPFGHVWLVERWMDDNIEVNIKQLKNDLQSQDTIKAINLISYGSKSNVFATYVAQHLDCKVYRTSHEDDDLKDWFKEHVPGNHELKDTNVEVYFKEEQDNHLNYMSRLMNPVRFLDYLDVSKLNGGEVNET >NZ_LS483317.1|WP_111762762.1|2746215_2748606_-|accessory-Sec-system-translocase-SecA2 MKHKLDVTINELRLKSIRKIVKRINTWSDEVKSYSDDVLKQKTIEFKKRLASGVDTLDTLLPEAYAVAREASWRVLGMYPKEVQLIGAIVLHEGNIAEMQTGEGKTLTATMPLYLNALSGKGTYLITTNDYLAKRDFEEMQPLYEWLGLTASLGFVDIVDYEYQKGEKRNIYEHDIIYTTNGRLGFDYLIDNLADSAEGKFLPQLNYGIIDEVDSIILDAAQTPLVISGAPRLQSNLFHIVKEFVDTLIEDVHFKMKKTKKEIWLLNQGIEAAQSYFNVEDLYSEQAMVLVRNINLALRAQYLFESNVDYFVYNGDIVLIDRITGRMLPGTKLQAGLHQAIEAKEGMEVSTDKSVMATITFQNLFKLFESFSGMTATGKLGESEFFDLYSKIVVQVPTDKAIQRIDEPDKVFRSVDEKNIAMIHDIVELHETGRPVLLITRTAEAAEYFSKVLFQMDIPNNLLIAQNVAKEAQMIAEAGQIGSMTVATSMAGRGTDIKLGEGVEALGGLAVIIHEHMENSRVDRQLRGRSGRQGDPGSSCIYISLDDYLVKRWSDSNLAENNQLYSLDAQRLSQSSLFNRKVKQIVVKAQRISEEQGVKAREMANEFEKSISIQRDLVYEERNRVLEIDDAENRDFKALAKDVFEMFVNEEKVLTKSRVVEYIYQNLSFQFNKDVACVNFKDKQAVVTFLLEQFEKQVALNRKNMQSAYYYNIFVQKVFLKAIDSCWLEQVDYLQQLKASVNQRQNGQRNAIFEYHRVALDSFEVMTRNIKKRMVKNICQSMITFDKEGMPVIHFP >NZ_LS483317.1|WP_111762761.1|2744689_2746198_-|accessory-Sec-system-glycosyltransferase-GtfA MTIYNINFGIGWASSGVEYAQAYRAKLLRRTNQDTKFVFLDFIQSENIQTLTKNIGFEDQEVIWLYQYFSDISIAPTTYTLDDIERELGHDISFRERNGKIVRLYFNGKSSFVTCYLQNEQKDIVDRAEFVINSMLVRKDFYSYTRIFSEYYAPADNKAKLYMRQFYNEDGSIAYNEYIDGDSSIYVFEDAMLYNKTEFIAYFLQRLNLTRDDIVILDRASDIGQAVLQHKGDSKVGVVIHADHYSNNMMSEQHILWNNYYEYQFSKAKYIDFFITATDIQNHMVCRQFEQYQGYRPRVYTIPVGSIDALSYPTLSRKPYAMISASRLANEKHIDWLVKAVIVAKRQVPELTFDIYGEGSEKTRLRKIIDTHRAQDYIRLLGHVKLDEIYTDYELFLSASTSEGFGLTLMEAVGSGLGMIGLNVNYGNPTFIRDGENGYLVPFDTDEDSVDDVIAKLAHAIVMYFNNGPHTPHDISYEVAQQFMTQDIILKWETLVKEVLHD >NZ_LS483317.1|WP_111762760.1|2743338_2744697_-|accessory-Sec-system-glycosylation-chaperone-GtfB MIKLFDYFNDHSRKLYESFKASKLEKDLTIVLNDNGFLPDDIISPYQFFADNHNSENMKPRFFNQVTVPAFWEIKGSNNSATINDMGRLRGKIFYQSGERPRIVSRVEWFDDQQRVRFVDYYSKNGIKFAQTVYDLNRKAILKKYMTVEGKEVIYENFVTSDVILDWQGKSYFFPSKLAFVLFFIKQLEITEHHFVINSLALPFSVLYNLPSNGSDVLVWQEQCDGNVPGNMQLMCKGDMKRHCNIIIPDKNEYETMLNIADAKVQSRILQGGYLYNYRSRNRYTKEIVILTNSDQLRNIKVLVETLPDFKFHIAAITEMSDKLMQLDQYANVHLYPSINIDRVNELYQLCDIYLDINEGNEILNAVEQAFDYELLILGYRQTAHHAKVTLSEHLFEHNDEITIESKDQLIQMLESLKDQQQFRDALLAQKAHAHEISREKFEQVFKQALES >NZ_LS483317.1|WP_111762759.1|2741197_2743105_-|cell-wall-anchored-protein-SasF MAKYRGKPFQLYVKLSCSTMMVTSIILTNILPYDAQAASENDTEISKEILSKQDLLDKVDKANRQIEQLKQLSASSKAHYKAQLNEAKTASQIDEIIKRANELDSKDNKGSHIEMNGQSEIDSKLDQLLKDLNEVSSKVDRGQQSGEDDLNAMKNDMSQTATTKHGEKDNKNDEAMVNKALEDLDQLNQQIHKSKDASKDTSEDPAVSTTDNNHEVAKTPNNDGSGHVVLNKFLSNEENQSHSNRLTDKLQGSDKINHAMIEKLAKSNASTQHYTYHKLNTLQSLDQRIANTQLPKNQKSDLMSEVNKTKERIKSQRNIILEELARTDDKKHATQSILESIFNKDEADKILKDIRVDGKTDQQIADQITRHIDQLSLTTSDDLLTSLIDQSQDKSLLISQILQTKLGKAEADKLAKDWTNKGLSNRQIVNQLKKHFASTGDTSSDDILKAILNNAKDKKQAIETILATRIERQKAKLLADLITKIETDQNKIFNLVKSALNGKADDLLNLQKRLNQTKKDIDYILSPIVNRPSLLDRLNKNGKTTDLNKLANLMNQGSNLLDSIPDIPTPKPEKTLTLGKGNGLLSGLLNADGNVSLPKAGETIKEHWLPISVIVGAMGVLMIWLSRRNKLKNKA >NZ_LS483317.1|WP_111762758.1|2740468_2741029_-|cysteine-hydrolase MSRKTALLVLDMQEGIASSVPRIKNIIKANQRAIEAARQHRIPVIFIRLVLDKHFNDVSSSNKVFSTIKAQGYAITESDASTRILEDLAPLEDEPIISKRRFSAFTGSYLEVYLRANDINHLVLTGVSTSGAVLSTALESVDKDYYITVLEDAVGDRSDDKHDFIIEQILSRSCDIESVESWKSSL >NZ_LS483317.1|WP_111762757.1|2738342_2740202_+|amidase-domain-containing-protein MPKNKILIYLLSTTLVLPTLVSPTAYADTPQKDTTAKTTSHDSKKSNDDETSKDTTSKDIDKADNNNTSNQDNNDKKFKTIGDSTSDSNNIIDFIYKNLPQTNINQLLTKNKYDDNYSLTTLIQNLFNLNSDISDYEQPRNGEKSTNDSNKNSDNSIKNDTDTQSSKQDKADNQKAPKSNSTKPNTSNKQPNSPKPTQPNQSNSQPASDDKGNQKSSSKDNQSMSDSALDSILDQYSEDAKKTQKDYASQSKKDKNEKSNTKNPQLPTQDELKHKSKPAQSFNNDVNQKDTRATSLFETDPSISNNDDSGQFNVVDSKDTRQFVKSIAKDAHRIGQDNDIYASVMIAQAILESDSGRSALAKSPNHNLFGIKGAFEGNSVPFNTLEADGNQLYSINAGFRKYPSTKESLKDYSDLIKNGIDGNRTIYKPTWKSEADSYKDATSHLSKTYATDPNYAKKLNSIIKHYQLTQFDDERMPDLDKYERSIKDYDDSSDEFKPFREVSDSMPYPHGQCTWYVYNRMKQFGTSISGDLGDAHNWNNRAQYRDYQVSHTPKRHAAVVFEAGQFGADQHYGHVAFVEKVNSDGSIVISESNVKGLGIISHRTINASAAEELSYITGK >NZ_LS483317.1|WP_001109874.1|2761599_2762292_-|flavin-reductase-family-protein MNYSPKQGVRSHGLPHDPFKSSTVPRPIGWISTVSKDGKDNLAPYSQYQNLTWDPPMVMFAANQSVLGDHERKDTVKNAEETGWFVWNMATYDLREAVNLSSKALPPEEDEFEYAGVTKEACIEAPGYRVKESPVHFECEYVQTIRIPTGDPVSTVDIVIGRVAQVHIDDKVILDNGKLDIKSIKPIARLGYYDYTVVNEIFEMKAPSASKEELAGLEGRNFDNQSDNKK >NZ_LS483317.1|WP_172452310.1|2763630_2764551_+|hypothetical-protein MRKLIGFILCTSIIVSGCSFIPKNQTKDIPKTVSVKDYDGQYIGEHKKRNEVFLKKYKDYVKDTFGYDCKINLVEAYTNKSGFSEKSKVDGISVVGTVNYDVPFQLQLLFVESGNGITISTFTPGHINETSAAVSAMMYKRYEHEIEQARLKLKSEIEKDSYYAMSEKLQVKQEFNGVTRQYLNFRTDSIDDLDKFKKEFKPVMHLKGDAFNQQLQSLINKYPQIQKNMKSEFIAYYDKEKNRETVKNYAWNLQKSINDVMQSYPSTKFVQFYKDDISPSMVDGNGRLKSDTNVISIEGGKYNENK >NZ_LS483317.1|WP_001260040.1|2764537_2764840_+|hypothetical-protein MRTNNHITDLDAIELSSAWNYNSKLVTGKNALLSDSLLRDIKVLSSNAKGDADMLETELHAVINAMSQNEGKSVDALKNSTASLKNNLTKLKEQLDKTTH >NZ_LS483317.1|WP_000603495.1|2764989_2765349_+|hypothetical-protein MILRYVTNLKLAKELYQASKPKLQEDKGMIELFEHTFGLQKELVKYVGIAEATTAALYSASFINKNISRLASLSTIGILSVAAYKHFEAGHGKKGAQHALDLLGLATLSLLDTFSCNKK >NZ_LS483317.1|WP_111762768.1|2765433_2766045_-|flavin-reductase-family-protein MHTFDAQSLTARENNKLLIGSIIPRPIAFVTTLNQDASVNAAPFSFFNIVNNHPPMIAIAVQRAGGKRKDTALNIERTGDFVVHITDEDNVQDINETAAPLAYGDSELSRTKLSLLTSTTIKTPGIKDAKMRFECKLSQMILLGDVLDGADLIIGEIVTYHIDDSIYEGDFKINPHALQAVSRLAGNDYAKLGGLFTIDRPEK >NZ_LS483317.1|WP_111762769.1|2766123_2766600_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase MAVVYVAGGCLWGVEAFFTTIPGIIHTEAGRANGRSSKLDSPYDGYAECVKLHFDDRMLTITDIMNYLFEIIDPYSVNRQGNDIGEKYRTGLYSCVDDHLIEARQFIERRKDRNQIAVEVLPLSNYIKSAEEHQQHLEKYPEDMHMCHISIDLLNKYK >NZ_LS483317.1|WP_000244266.1|2766602_2767103_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MVLRKVIMQDLDQIIALENIGFSPEEAATPEALKLRIEQIQETFIVAEKNDEVIGYINGPVIKERYISDDLFKNVPTNNSEGGYISVLGLVVAPNYQGQGIAGRLLNYFENLAKNQHRHGVTLTCRESLISFYEKYGYRNEGVSESCHGGIKWYNLVKNIKKDDEV >NZ_LS483317.1|WP_000565312.1|2767337_2768105_-|tyrosine-protein-phosphatase MIDIHNHILVDIDDGPKTIEKSIALLKQAKDEGVTSIVATPHHLHPRYDNTFQQVLVKLAELRTHPEVQALDIKLFPGQEIRITDSILQGLDNGSIQGINRSKYLLIEFPTGEVPHYTKQLFFEIQSRGYIPIIAHPERNRSIAKNPEILYELVANGALSQLTSSSLVGGFGKNIQKLSLQFIECNLAHFVASDAHSCDQRPFLMQELFHNHKLKKYSNDIEALLRNASSVINDNFVYLDRPTKPGKVKSFLKWF >NZ_LS483317.1|WP_111762770.1|2768101_2768794_-|polysaccharide-biosynthesis-tyrosine-autokinase 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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
330593 : 372922
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LS483317|330593:372922|DBSCAN-SWA 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>NZ_LS483317|330593:372922|347647_348100_+|WP_000406191.1|DBSCAN-SWA MEISKYQEIATRTHNDELNLNESITCYGLGLTQSTGNVTDLIKQHMFCNVPIDKGIMINELSEALWNIANLTNVLGINLDEIAGHSVNTILMNKPNQTINLDNGIKQGDKVLFQGSKYLVDGSIGNLLLISNDKDDRQVTVQDVKKVDKE |
71 | Staphylococcus_phage(84.06%) | integrase,portal,protease,terminase,tail,head,holin,capsid | attL 330483:330500|attR 373608:373625 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
769425 : 777245
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LS483317|769425:777245|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTCACAGTCATCGTCGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAACCGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAACCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTATAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAGTAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATTTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCACCTAAAGCTAATGTTGTGATAACAGCACCAGCTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGACGGTTTTTTAAGTAAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATTCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTGTGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCTACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCACGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCTAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAATTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGACTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LS483317|769425:777245|776093_777245_+|WP_111762031.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLTDVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQISYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKVIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_LS483317|769425:777245|772676_773261_-|WP_000637683.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_LS483317|769425:777245|774497_775166_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_LS483317|769425:777245|771956_772397_-|WP_001093553.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_LS483317|769425:777245|773359_774073_-|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_LS483317|769425:777245|775516_776110_+|WP_000604508.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDIINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_LS483317|769425:777245|769425_770481_-|WP_111762030.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTVNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_LS483317|769425:777245|771141_771615_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_LS483317|769425:777245|774076_774496_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_LS483317|769425:777245|770480_771167_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
789217 : 803736
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LS483317|789217:803736|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCAGTATTAACGCTAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCATTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGCGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTAAGCATTTCTTACCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGTAAGTGTTGTCACATTGTATAAAAATGTGACAAAATGCAGTGTGAATGATGAGGTGAGAGTATTCAGTGTAAAAAGAAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATCAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGCATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCTCAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATGGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAAGAAAAATAAATCACTTGAAGCCTTTCATATAGCAAATAAAATGCATATACTGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCGAGTTGGCGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGGGCCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTTGCACTCATGCATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGATGTGGCTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTGATTCTTTATCATTTCTGTCCCACTCTCAATAAATGTTAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGGCACATAAACCACTATGATTAAAAGTATAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATATCTGTTTTTGAAACAGGGTAATAGCTTAAAGCTAATAACAGCGAATATAATATACGTTGAATCTTATGATTACGCTTTAAACCTAATATAATATCCCGTTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGATAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCAATTGTTAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATTCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGTCATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACGCCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGACATTGATGTCTATAGTGGAATATGAAAATATAATTACTAATTAGATTGTTTAGTTGTCTATAACGAGCATATTAAGCTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTTGAACTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATAATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCAAAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATAAATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGGATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAAACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAATACGGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTGCCCGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCAAAGTACATGTAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAGAAGAGTACGCCTAGTCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LS483317|789217:803736|792782_794288_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_LS483317|789217:803736|799399_800371_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_LS483317|789217:803736|794628_795129_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_LS483317|789217:803736|802974_803736_+|WP_000616870.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_LS483317|789217:803736|797176_799282_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_LS483317|789217:803736|791582_792500_-|WP_000429016.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLTIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_LS483317|789217:803736|789217_790276_+|WP_111762035.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTLGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSKHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_LS483317|789217:803736|790433_790982_+|WP_111762036.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNGWKDVEQYFLDNIEKEK >NZ_LS483317|789217:803736|800869_801025_+|WP_031901244.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLGSKNATINEKYYQ >NZ_LS483317|789217:803736|802021_802978_+|WP_111762039.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSILVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_LS483317|789217:803736|795148_796015_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_LS483317|789217:803736|796815_797214_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_LS483317|789217:803736|801063_802035_+|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
891957 : 955836
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LS483317|891957:955836|DBSCAN-SWA 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90 | Staphylococcus_phage(53.52%) | plate,integrase,portal,terminase,tail,transposase,head,holin,capsid | attL 894850:894866|attR 936502:936518 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1094517 : 1102990
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LS483317|1094517:1102990|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LS483317|1094517:1102990|1099915_1101400_+|WP_000483727.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_LS483317|1094517:1102990|1101392_1102421_+|WP_111762150.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYMVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_LS483317|1094517:1102990|1097083_1097755_+|WP_111762148.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRDEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_LS483317|1094517:1102990|1102423_1102990_+|WP_000238666.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_LS483317|1094517:1102990|1096114_1096819_+|WP_111762147.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKKLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_LS483317|1094517:1102990|1094986_1096111_+|WP_111762146.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKIAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQLLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_LS483317|1094517:1102990|1094517_1095000_+|WP_000861570.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_LS483317|1094517:1102990|1096818_1097082_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_LS483317|1094517:1102990|1097747_1099937_+|WP_111762149.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTSYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1635616 : 1643928
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LS483317|1635616:1643928|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGGTTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCTCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGATCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCAACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATTCGTGCTAACTCTTCAAACGAACGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCCGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCACGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAATGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTAGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCTATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCGATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCACCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCTATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAAAATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTTATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTTTCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGTAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATAGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTTGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATAGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGCAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAACCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTTGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCATCATTCAAACTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCACTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGACTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAACTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGTAGAATTGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATATTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAGATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATCTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LS483317|1635616:1643928|1636527_1637418_-|WP_111762340.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGREVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_LS483317|1635616:1643928|1640798_1641905_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_LS483317|1635616:1643928|1635616_1636402_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_LS483317|1635616:1643928|1639990_1640668_-|WP_103204988.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDYGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVERIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_LS483317|1635616:1643928|1638887_1639988_-|WP_111762341.1|DBSCAN-SWA MKIADLITLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADFKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_LS483317|1635616:1643928|1637427_1638774_-|WP_001062177.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_LS483317|1635616:1643928|1642128_1643928_-|WP_111762342.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQYLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSSELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1713468 : 1722511
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LS483317|1713468:1722511|DBSCAN-SWA TTTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATTTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTTATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGACCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAACATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAGGGAATTAGACAAATCTTCCATCGACGTAGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCGTTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGCAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGTGCGGCGATATTACTTTCACCAAGCGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTTATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGGTGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCAACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTTAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAGCCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCGAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGAGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCTATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGTTGGTTTAATTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATCATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCAAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAAGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACTCCAGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAAGCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTGGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTATTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGGTCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTTGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAGTAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAATGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACCAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGAACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTGAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCATTTTATAAGCATTCAGAATATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCATCCACTTGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCGACGCTCACAGGTCTAAACGTACCTAATCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGCAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGGGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCGCCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCGATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTTGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGTTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATTCCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTACCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATTCGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGCCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LS483317|1713468:1722511|1714008_1716282_-|WP_111762365.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLIKPTEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMAQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTNDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_LS483317|1713468:1722511|1716484_1718764_-|WP_000749796.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGMMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_LS483317|1713468:1722511|1720479_1721505_-|WP_111762367.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENILNAYKMAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_LS483317|1713468:1722511|1719038_1719299_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_LS483317|1713468:1722511|1719317_1720457_-|WP_111762366.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECSPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_LS483317|1713468:1722511|1721506_1722511_-|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_LS483317|1713468:1722511|1713468_1713987_-|WP_000364543.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATNKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1853645 : 1940788
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LS483317|1853645:1940788|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAATCCATTCCTTCAGAACCTGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGCGCGATTCATGTGTCTCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCTGACTGAATTACTTTTGGTGATACTTTCGTCGCTTCAGCTGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAACAATGAATTGCGTATGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCAATCATTCTATTGCCATCTGCAACATATTGATCAATTAATACTTTTACTTTAGCTAATTGTTCTGGTGTTGCGATCGCTTTGAATTTCGCATATGTTTGTTGAGCAATGTTATCAATGCGCAGTAAGCTATTTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACTGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAATGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCAGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGCACTAAAGCAGTGACGCGTGCAAGATCATCATTAATCGTTTTTTCAGCATCTGGCTTTTTAATAGGATGTACATCTAAATCATGTATTGTTTGTAGATTTAATGATGCTGTTTTATCAACTTGTGCATTGCTACGATCTTGATCAATTTGTCCAATAGCAGTGTCATAAATATTTTGTAACTGTGCTAATATACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAATATTCGCTTCAATTGCTTGTTTCTTGTCATTGAATAATGCTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCCTTTCTGTTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCATTTTTCCCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATTTGTTGTTTAGCTCTAATTAACTCTTGTTCTACTTGTGCTATTGCAGCATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCGTTATTTGCTTTGATTAAATTAATTTTATTTGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAATGCTGTTGCTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATTTATACTATCTTGATTAACTTGGGCAGTCTTATCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAGTCTCTCTTCTTCAGTAGATAAATCACTTTGATCAATCAGTGTATTTTGAGCTTCGGCTTTTGCACCAACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACCTGAACTTTAGGTAAAATCGCTTTGATGTTGTTGTTGCCATCAGTCTCAGTTCGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATATCATTTTTAATTGCATTAACAATTTTATTTAAAGCATCAATAGCAACATTTCGTTCATCTTGCGTAGTATCTAGCGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGGTTATTATTACTTTCATCAATGTTATCCAACGCTGCACGTTTACGTCTAACTTTCGGTTTAATTTGTTCGATTGCCTTAATTGTTTGATTTCTAACATCATTTACAGCTGCATCTTGTGTCGTATTGTCTATATCTTGTTGACCTTGTTTAAGTGTGTCGTTTATTTGTTGGTTTGCTTCATCTAATTCATCAGTCGTAGCATGTGGTGTATCTTTTATAGATTCTACTTGGTTATCTGCGCTCGCTTTTATGGCTTCTTGAGCTTCAGGTTTAACCACAATGTGCGGTTCTACGCCTTTTAACGTAGCAATACCATTTGATTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCAGCTTGCTCTATTTCTTGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCACCAGCCCTAACAATATGTTCAGGTGTTACTAAAGCAATGTTAGCAAGCGCTTGACTAGTCGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTTTATTATTCGTTATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTACTTGTCTTTCTTCTGCTGTCGCTTCTTTATCCTGATTAATCTTCGCACGTAATTCATTCGCCTTTTGATTGATTTTTTCGCGTGCTGCTGGCTTAACTTTTGTTTCAGGTTGAATAATTTTAATTGTTGATACACCATTTGTTGCCGCTTGATTCACCTGATTATTAGTTTGCGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTAGCTAATGCTTGTGAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCGGCTTCAACATTATCTATAGCATTTACCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACAGCAGCCTGCTTTTCTTCATCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACTACGTCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCCACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCCGCATTTGTGTTAGCTTGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAGTATTGATCGCAGCATTTTTCTCATCATTCGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATGCTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTTTGTGCCTAATTGTTGCGCTTGATCTACTTCAGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCTTTGCTAACTCTTGATCCACTTGATTTAAAGCCACTTGCTTTTCTTCAGTTGTTGCATTTGTGTTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAATCATTTAATACACCTGTAGCAGTTTGTTTCTTCGTTACATTCGGTTGAACTGCGCCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAACGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATTTATCGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCACCCGGTGTAGCATTGATATTTGTTATCGCCTCTCGCGCTTTATCATTTACAGCAATGCGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTTGCCGGTTGAATCACAACTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGTAATTGTTGTGCCGCCTGTTGTTCTTCGAGCGTAGCATCATTGTTATTAAAAATCGTATTATGCTGTGTTTCCGCACTTTTATCGATAGCATTTTTTGCATCTGTTTTTACCTTAGTAGCTGGTGTAATCGCTTGTATTCCTTGAATTGCATTTGTCTTTACTTGTTCAACATCAGCATTGGTATTAGCGTTTAAAATGTTTGTGTTTGCTGCAGTTACAGCAGCATTCACTTTGTCAATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTCGCATCAGGATTAGCATTGATCTCTGCGATATGTTGTTGTGCATCATGTGATACGGCATCCCTTGCAGCTTGCTTAATAACAGTTACAGGGGCAATAGGATTAATGGCATTTAGACCATCTCCTTTGGCGTTATCAACATCAGCATTTGTTGTTGCTTGATTGATTTGTTCTAAAGCGTGGTTCGTTGCTTGAGTTAATTCGTTCAATGCCACATTTTTCTCTTCTTGCGTTGCTTCACTATTGCTATTTATTTGTTGTCTTTTCGTTGCTGTTGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCAGCTTGTTTATGTGTCACTTGAGGAACAACTGCTCCAATAGTGTTGATGCCATTATTTTTAGCTGTCTCAACATCAGCGTTTGTTGTAGCATTCGTTATATTATCAATAGCGTCTGTTTCATCCGTAGCTAATTGATTTATTGCATCTTGAATCTCGTCTTCAGTAGCATCTGGTGTTGCATTGATAATTTCCCTTTGTTTCGTTGCTTTATCACGTATTGCTTTTTTAGCATTTGGTTTAACAACCGGTGTTGCAGTATCCCCACTTAATGTCTGTATACCTTGATCTTTGATTCTAGTAACGCCATCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTACCAATTATTTCATTTTTATGTTCCTCGATAACTTGTATTGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAATTCATCATTTTGGTTTACTAAATCTTCCATTTGGTCAACTTTTTTATTAACTGCATTTTCAGCATCCACACTTCGAATTAACGTGTGTTGCATTTGATTAGTTAATGAATCAATATCTGCTTGAGAAACTCTTTTATTTAATGGTACATTGTTACGATTTTCATCTAAAATCGTTTGTGCGCGTCGTTTCAGACCATTAAAAATATCTAATGATGCAAATGTATAATCAGCTTGTTGAATACGTCTATCAACTTCAGCTTGCAATGCGTCTTTATTCATTATGATATCGATTGTATATGGATTAATACTTACAGTATGACTTTCAGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGTATATGTCTTATATGTTAATGTATCGTTAAATGTTACTTTTCTTGGTGTTGGAACATTATTAACACGCAACTTATACTTTAAATCCAATATTTTATCAGGCATTAGTCTTGCTGGGGAGTTCGCTGTACCT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78 | Staphylococcus_phage(92.19%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2074205 : 2088146
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LS483317|2074205:2088146|DBSCAN-SWA 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21 | Staphylococcus_phage(84.21%) | coat,terminase,integrase | attL 2071117:2071136|attR 2086168:2086187 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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