Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LS483352 | Streptococcus pyogenes strain NCTC12052 chromosome 1 | 2 crisprs | DinG,csm6,cas9,cas1,cas2,csn2,cas3,DEDDh,csa3 | 0 | 2 | 9 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LS483352_1 | 830171-830338 | TypeII |
II-A
Consensus repeat of NZ_LS483352_1
|
2 spacers
spacers of NZ_LS483352_1
>1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder TCAAGAGTGAGTCCAGAACCACCAGCGAAT >1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder CACTAGACATCTCAACATCTGGAACGGGAT |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483352_1
The CRISPR arrays of NZ_LS483352_1 >merge|NZ_LS483352|1|830171-830338|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACTCAAGAGTGAGTCCAGAACCACCAGCGAATGTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACCACTAGACATCTCAACATCTGGAACGGGATGTTTTAGAGCTATGCTATTTTGAATGGTCTCCATTC >NZ_LS483352|1|1|830171-830338|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC TCAAGAGTGAGTCCAGAACCACCAGCGAAT GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC CACTAGACATCTCAACATCTGGAACGGGAT GTTTTAGAGCTATGCTATTTTGAATGGTCTCCATTC
>NZ_LS483352.1|WP_002989949.1|829405_830068_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNLNFSLLDEPIPLRGGTILVLEDVCVFSKIVQYCYKYEEDSELKFFDRKMKTIKESEIMLVTDILGFDVNSSTILKLIHADLESQFNEKPEVKSMIDKLVATITELIVFECLENELDLEYDEITILELIKSLGVKVETQSDTIFEKCLEILQIFKYLTKKKLLIFVNSGAFLTKDEVASLQEYISLTNLTVLFLEPRELYDFPQYILDEDYFLITKNMV >NZ_LS483352.1|WP_002989951.1|829074_829416_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSYRYMRMILMFDMPTDTAEERKAYRKFRKFLLSEGFIMHQFSIYSKLLLNNTANNAMIGRLREHNPNKGNITLLTVTEKQFARMIYLHGERNNCIANSDERLVFLGEAFDES >NZ_LS483352.1|WP_032460891.1|828208_829078_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAGWRTVVVNTHSKLSYKNNHLIFKDAYKTELIHLSEIDILLLETTDIVLSTMLVKRLVDENVLVIFCDDKRLPTAMLMPFYGRHDSSLQLGKQMSWSETVKSQVWTTIIAQKILNQSCYLGACSYFEKSQSIMDLYHGLENFDPSNREGHAARIYFNTLFGNDFSRDLEHPINAGLDYGYTLLLSMFAREVVVSGCMTQFGLKHANQFNQFNFASDIMEPFRPLVDKIVYENRNQPFPKIKRELFTLFSDTFVYNGKEMYLTNIVSDYTKKVVKALNNEGKGVPEFRI >NZ_LS483352.1|WP_023080005.1|824105_828209_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MDKKYSIGLDIGTNSVGWAVITDDYKVPSKKLKVLGNTDRHGIKKNLIGALLFDSGETAEATRLKRTARRRYTRRKNRICYLQEIFSNEMAKVDDSFFHRLEESFLVEEDKKHERHPIFGNIVDEVAYHEKYPTIYHLRKKLADSTDKVDLRLIYLALAHMIKFRGHFLIEGDLNPDNSDVDKLFIQLVQTYNQLFEENPINASRVDAKAILSARLSKSRRLENLIAQLPGEKKNGLFGNLIALSLGLTPNFKSNFDLAEDAKLQLSKDTYDDDLDNLLAQIGDQYADLFLAAKNLSDAILLSDILRVNSEITKAPLSASMIKRYDEHHQDLTLLKALVRQQLPEKYKEIFFDQSKNGYAGYIDGGASQEEFYKFIKPILEKMDGTEELLAKLNREDLLRKQRTFDNGSIPYQIHLGELHAILRRQEDFYPFLKDNREKIEKILTFRIPYYVGPLARGNSRFAWMTRKSEETITPWNFEEVVDKGASAQSFIERMTNFDKNLPNEKVLPKHSLLYEYFTVYNELTKVKYVTEGMRKPAFLSGEQKKAIVDLLFKTNRKVTVKQLKEDYFKKIECFDSVEISGVEDRFNTSLGTYHDLLKIIKDKDFLDNEENEDILEDIVLTLTLFEDKEMIEERLKKYANLFDDKVMKQLKRRHYTGWGRLSRKLINGIRDKQSGKTILDFLKSDGFANRNFMQLINDDSLTFKEAIQKAQVSGQGHSLHEQIANLAGSPAIKKGILQTVKIVDELVKVMGHKPENIVIEMARENQTTQKGQKNSRERMKRIEEGIKELGSQILKEHPVENTQLQNEKLYLYYLQNGRDMYVDQELDINRLSDYDVDHIVPQSFLKDDSIDNKVLTRSDKNRGKSDNVPSEEVVKKMKNYWRQLLNAKLITQRKFDNLTKAERGGLSELDKAGFIKRQLVETRQITKHVAQILDSRMNTKYDENDKLIREVKVITLKSKLVSDFRKDFQFYKVREINNYHHAHDAYLNAVVGTALIKKYPKLESEFVYGDYKVYDVRKMIAKSEQEIGKATAKYFFYSNIMNFFKTEITLANGEIRKRPLIETNGETGEIVWDKGRDFATVRKVLSMPQVNIVKKTEVQTGGFSKESILPKRNSDKLIARKKDWDPKKYGGFDSPTVAYSVLVVAKVEKGKSKKLKSVKELLGITIMERSSFEKNPIDFLEAKGYKEVRKDLIIKLPKYSLFELENGRKRMLASAGELQKGNELALPSKYVNFLYLASHYEKLKGSPEDNEQKQLFVEQHKHYLDEIIEQISEFSKRVILADANLDKVLSAYNKHRDKPIREQAKNIIHLFTLTNLGAPAAFKYFDTTIERNRYKSIKEVLDATLIHQSITGLYETRIDLSQLGGD >NZ_LS483352.1|WP_023610292.1|822994_823627_+|TIGR01906-family-membrane-protein MVENTKLLCSWVWLLALAILITIYSTWLWYPLEVDHLKLEQVVFMSKDAILHNYNGLLNYLTNPFVTRLEFADFHSSADGLKHFADVKWLFHLTQVVFLGLLYPTLKTFTQRLKTKRFWLLQKPLILAALFPLMIGLMASFIGFEHFFTLFHQVLFVGDSSWLFDPLKDPVIWILPEVFFLHCFLFFMIVYEIILWSLVGLARWQRLNVE >NZ_LS483352.1|WP_023079997.1|822230_822995_+|TIGR01457-family-HAD-type-hydrolase MPYKGYLIDLDGTIYQGKNRIPAGERFIKRLQERGIPYLLVTNNTTRTPEMVQSMLANQFNVETGIETIYTATMATVDYMNDMNRGKTAYVIGETGLKSAIAAAGYVEELENPAYVVVGLDSQVTYETLAIATLAIQKGALFIGTNPDLNIPTERGLMPGAGALNALLEAATRVKPVFIGKPNAIIMNKSLEVLGIQRSEAVMVGDNYLTDIMAGIQNDIATILVTTGFTRPEEVPTLPIQPDHVLSSLDEWRL >NZ_LS483352.1|WP_023080001.1|821478_822231_+|acyl-[acyl-carrier-protein]-thioesterase MGLSYQEELTLPFELCDVKSDIKLPLLLDYCLMVSGRQSAQLGRSNNNILVDYKLVWIVTDYEITIHRLPHFQETITIETKALSYNKFFCYRQFYIYDQEGCLLVDILAYFALLNPDTRKVATIPEDLVAPFKTDFVKKLHRVPKMPLLEQSIDRDYYVRYFDIDMNGHVNNSKYLDWMYDVLGCAFLKTHQPLKMTLKYVKEVSPGGQITSSYHLDQLTSYHQIISDGQLNAQAMIEWRAIKPIESETD >NZ_LS483352.1|WP_023080002.1|820338_821469_+|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MSKKPTSAYVHIPFCTQICYYCDFSKVFIQNQPVDAYLKALIQEFYSYGIRDLKTLYIGGGTPTAITAKQLEYLLNHLERNLNLDDLEEFTIEANPGDLTPEKIAVLQRSAVNRISLGVQTFNNKQLKQIGRSHNEEQIYSTITNLKAAGFHNISIDLIYALPGQTLDQVKENVAKALALDIPHLSLYSLILEHHTVFMNKMRRGKLNLPTEDLEAEMFEYIISEMEANGFEHYEISNFTKPGFESRHNLMYWDNVEYFGCGAGASGYLNGIRYQNRVPIQHYLKAVEAGNARLNEEVLRKEEMMEEELFLGLRKKTGVSIQRFQEKFGVSFEERYGNIVRELQNQGLLVKDDAFVRMTKKGLFLGDSVAERFILD >NZ_LS483352.1|WP_023080006.1|819634_820276_+|hypothetical-protein MTKQQIEKLADLLPPFAATLYLDMIPEFQEGYASYVYQTPKQDIQKRRIKQLTKNFERLLDTPSFYVMPVTRKTAEQLLADKGLAYHLLSTVAANQVFAAAVNEDQTLFQVLRNGARVAFVILQEKGEFLEMTLGILETVTENEVPAAIVEAVQTYLLADMQEKLPSLSIMVSQESSKLFYQEQGFVLLAKGCKPGNENDSDVCQLVKYFSKP >NZ_LS483352.1|WP_011106808.1|818155_819511_+|phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGEANVELTPELAFQLGRFGGYVLSQHETERPKVFVARDTRISGEMLESALIAGLLSVGIEVYKLGVLATPGVSYLVRTEKASAGVMISASHNPALDNGIKFFGNDGFKLADDQELEIEALLDAPEDTLPRPSAEGLGTLVDYPEGLRKYEKFLVTTGTDLSGMTVALDTANGAASVSARDVFLDLNAEIAVIGEKPNGLNINDGVGSTHPEQLQELVKETGADLGLAFDGDSDRLIAVDETGEIVDGDRIMFIIGKYLSEKGLLAHNTIVTTVMSNLGFHKALDKQGINKAITAVGDRYVVEEMRSSGYNLGGEQSGHVIIMDYNTTGDGQLTAIQLAKVMKETGKSLSELAAEVTIYPQKLVNIRVENSMKERAMEVPAIANIIAKMEDEMAGNGRILVRPSGTEPLLRVMAEAPTDAEVDYYVDTIADVVRTEIGCDN >NZ_LS483352.1|WP_111685728.1|830981_832814_+|elongation-factor-4 MNSQDFKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRHEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGDVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGIVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYVAASIKTVADTRVGDTVTLANNPAKEALHGYKQMNPMVFAGIYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVHTTDEDMIEVSNPSEFPDPTRVAFIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELSQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYDMSEYRRSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKIIVEKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKSIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDTKK >NZ_LS483352.1|WP_111685874.1|833319_834600_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MNEYIKQHKEHDQEWKRELTRGIQQKLLDGKDGRDGAQGLAGERGATGPVGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGDRGKDGKDGQPGKPAPKTPEVPQKPDTAPHTPKTPQIPDHSKDVTPAPQNPSNRGLNKPQTQGGNQFAKTPAAHDTHRQLPATGETTNPFFTAAAVAIMTTAGVVAVAKRQENN >NZ_LS483352.1|WP_111685729.1|834785_835223_+|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB METSEELKQRIGDLSYEVTQHAATESPFTGEYDHFFEKGIYVDIVSGEVLFSSLDKFNSGCGWPAFSKPIENRMVTNHDDSSYGMRRVEVKSREAGSHLGHVFSDGPKEAGGLRYCINSAALKFIPYDQMEKEGYAQWLTLFDET >NZ_LS483352.1|WP_111685730.1|835352_836372_+|YeiH-family-putative-sulfate-export-transporter MSTNLRKLPGLLLCLLLALPAWCLGRLFLIIGAPVFAILLGMLLALFYEHRDKTKEGISFTSKYILQTAVVLLGFGLNLTQVMAVGMQSLPIIVSTIATALLVAYGSQKWLRLDVNTATLVGVGSSICGGSAIAATAPVIKAKDDEVAKAISVIFLFNMLAALLFPSLGQLLGLSNEGFAIFAGTAVNDTSSVTATATAWDAIHHSNTLDGATIVKLTRTLAILPITLGLSLYRAKKEHDIVTEENFSLRKSFPRFILFFLLASLITTLMTSFGVSADVFHSLKTLSKFFIVMAMAAIGLNTNLVKLIKTGGQAILLGAICWVAITLVSLAMQLSLGIW >NZ_LS483352.1|WP_021733386.1|836578_837004_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MKRKFLIGSHGRLASGLQSSIDILAGMGQALETIDAYVDDSDYTSQIDDFIAGVAADEQGLIFTDLLGGSVNQKMVTAVMNSGKDNIFLITNSNLATLLSLVFLKPGEALTKDDIVTVINESQVQLVDLVPETNSEDDFFD >NZ_LS483352.1|WP_002989934.1|837022_837514_+|PTS-system-mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-transporter-subunit-IIB MITQIRVDDRLIHGQVAVVWTKELNAPLLVVANDEAAKNEITQMTLKMAVPNGMKLLIRSVEDSIKLFNDPRATDKRIFVIVNSVKDACAIAKEVPDLEAVNVANVGRFDKSDPASKVKVTPSLLLNPEEMAAAKELVSLPELDVFNQVLPSNTKVHLSQLVN >NZ_LS483352.1|WP_011528593.1|837530_838340_+|PTS-mannose/fructose/sorbose/N-acetylgalactosamine-transporter-subunit-IIC MLVPATMAALAVLICFGGNYLTGQSMMERPLVVGLVTGLLLGDMKVGILMGASLEALFLGNVNIGGVIAAEPVTATAMATTFTIISHIDQKAAMTLAVPIGMLAAFVVMFLKNVFMNIFAPMVDKAAAANHQGKLVMLHYGTWIIYYLIIASISFIGILVGSGPVNAFVEHIPQNLMNGLSAAGGLLPAVGFAMLMKLLWTNKLAVFYLLGFVLTAYLKLPAVAVAALGAVICVISSQRDLELDAITRGAINKQTTFDSKESEEEDFFA >NZ_LS483352.1|WP_002989931.1|838336_839164_+|PTS-mannose/fructose/sorbose-transporter-family-subunit-IID MTSQDNLTKEDRKMLRSVFWRSWTMNASRTGATQYHAVGVIYTLLPVINRFYKTDKDKAEALVRHTTWFNATMHINNFIMGLVASMEKKNSEDPDFDASAITAVKASLMGPISGVGDSFFWGILRVIAAGIGISLASAGSAMGAVVFLLLYNIPAFIIHYYSLYGGYSVGAGFIKKLYESGGIKIVTKTSSMLGLMMVGSMTASNVKFKTILTVAAKGAKEAASIQDYLDQLFIGIVPLMVTLAAFWLLRKKVNINWIMFGIMFLGIILGLLGIC >NZ_LS483352.1|WP_111685731.1|839299_840949_+|sensor-histidine-kinase MRGEQVEEHFKKQLQDDISRHFSYQSLMLSLLLIGLFIIFSLAPQQLGLYRDINATATRYHRLISKQEALLDDLGKNSLLPFLNKNLSTADLSKHYFHLRHSSQTSPELLLFSPSQDLLFASNPHLGNAFSKSVYIQEVLRAAHPPKTLFKVAMDSEDGHYLMIIKPMIDQNQLMGYAFLVMSGKDFIHPTKTLTSELVIADKLDNTFTFSNREFIASSLDKINSQYLHHYFVFQDNRAFITRKVALQGGLWLYMYRPLIPMVSVMLFSLISSAVIFVILQRKSSGLANRIAAKNSRAINQMVRDMSAISRQEKRRIDLESQDEFQYLSDQINQMVERLQQLHDKTLDLETQKLLFEKRMLEAQFNPHFLYNTLETILITSHYDSALTEKIVIQLTKLLRYSLTDSSKPVLLKDDLSVIESYLVINQVRFEELQYSINLSPDLDSLAVPKLFLLPLIENAIKYGLKERHDVKINIACYYQDDHIIFSVRDNGSGIDAHHQKVIREQLEAGESHHGLINSYRRLKYHFSEVSLVFDQGDKQFNVSYHVKE >NZ_LS483352.1|WP_002984836.1|840952_841741_+|response-regulator-transcription-factor MYKLVIIEDEHIIRKWLRYAIDYKALDILVIGEAKDGKEGAVLIKESQPDIVLTDINMPIMTAFDMFEATKDQTYAKIILSGYADFPNARSAIHYGVLEFLTKPIEKAALWECLQTIIAKIEKQKGSNQKTDACVYIPLPQMTDQIPEVVKDILEWVHAHFQDKISTSRLAHDLGYSESYIYQNIKKHLQMPLSDYINQYRINQAIQLMQQEPDLMVYEIAQAVGIYDYRYFDRVFKKYLGQTVKAFKEEHFMKDTDRSKPC |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LS483352_2 | 1008992-1009093 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483352_2
|
1 spacers
spacers of NZ_LS483352_2
>2.1|1009016|54|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder CCGATAAAAACAGTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483352_2
The CRISPR arrays of NZ_LS483352_2 >merge|NZ_LS483352|2|1008992-1009093|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATACCGATAAAAACAGTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACATAAAATTGGTATAGTCTAATTATA >NZ_LS483352|2|2|1008992-1009093|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATA CCGATAAAAACAGTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA TAAAATTGGTATAGTCTAATTATA
>NZ_LS483352.1|WP_002984451.1|1007126_1008941_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGVVGNRNATDILMQGLEKLEYRGYDSAGIFVANANQTNLIKSVGRIADLRAKIGIDVAGSTGIGHTRWATHGQSTEDNAHPHTSQTGRFVLVHNGVIENYLHIKTEFLAGHDFKGQTDTEIAVHLIGKFVEEDKLSVLEAFKKALSIIEGSYAFALMDSQATDTIYVAKNKSPLLIGLGEGYNMVCSDAMAMIRETSEFMEIHDKELVILTKDKVTVTDYDGKELIRDSYTAELDLSDIGKGTYPFYMLKEIDEQPTVMRQLISTYADETGNVQVDPAIITSIQEADRLYILAAGTSYHAGFATKNMLEQLTDTPVELGVASEWGYHMPLLSKKPMFILLSQSGETADSRQVLVKANAMGIPSLTVTNVPGSTLSRESTYTMLIHAGPEIAVASTKAYTAQIAALAFLAKAVGEANGKQEALDFNLVHELSLVAQSIEATLSEKDLVAEKVQALLTTTRNAFYIGRGNDYYVAMEAALKLKEISYIQCEGFAAGELKHGTISLIEEDTPVIALISSSQLVASHTRGNIQEVAARGAHVLTVVEEGLDREGDDIIVNKVHPFLAPIAMVIPTQLIAYYASLQRGLDVDKPRNLAKAVTVE >NZ_LS483352.1|WP_111685758.1|1006595_1006931_-|alkylphosphonate-utilization-protein MSLPNCLQCQSEYIYEDGLLLICPMCAFEWTPGEEATEEEGLVVLDSNGVRLSDGDTITVVKDLKVKGAPKDLKQGTRVKNIRLVEGDHNIDCKIDGFGAMKLKSEFVKKI >NZ_LS483352.1|WP_002992417.1|1005847_1006489_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MTYIQQVLPSLLDGALVTLQVFFIVIILSIPLGAILAFLMKIPFKPLQWFLTLYVWMMRGTPLLLQLIFFYYVLPSVGISFDRMPAAILAFTLNYAAYFAEIFRGGIEAIPKGQYEAAKVLKLKPLQTIRYIILPQVFKIVLPSVFNEVINLVKDSSLVYVLGVGDLLLASKTAANRDATLAPMFIAGLIYLLLIGLVTIISKQVEKRFNYYQ >NZ_LS483352.1|WP_002992415.1|1005208_1005838_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLELKNISKQFGQKTIFDGFNLTVQDGEVLSLVGPSGGGKTTLLRMLAGLESIDSGQVFYNGEDVGIDHLENRNLLGFVFQDFQLFPHLTVLDNLTLSPTITMGKQKSDAKEKALDLLARLGLKEHAQVYPYSLSGGQKQRVALARAMMIDPQIIGYDEPTSALDPELRQTVEALIVQNREMGITQIVVTHDLVFAEAISDRIIRVNPK >NZ_LS483352.1|WP_014635494.1|1004356_1005193_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MIIKKRTVAILAIASSFFLVACQATKGLKSGDAWGVYQKQKSITVGFDNTFVPMGYKDESGKCKGFDIDLAKEVFHQYGLKVNFQAINWDMKEAELNNGKIDVIWNGYSITKDRQEKVAFTDSYMRNEQIIVVKKRSDIKTISDMKHKVLGAQSASSGYDSLLRTPKLLKDFIKNKDANQYETFTQAFIDLKSDRIDGILIDKVYANYYLAKEGQLENYRMIPTTFENEAFSVGLRKEDKTLQAKINRAFRVLYQNGKFQAISEKWFGDDVATANIKS >NZ_LS483352.1|WP_009880829.1|1003213_1003987_-|CAMP-factor-pore-forming-toxin-Cfa MKPKHLLCLSTVVAGLALFSTMTHSVLADDASNPDTILMNNNQANLQRDALVQKLDEGHQQLEAIKHEAKGTDIEATVNKAIDAVDHMKSSIRFNTETIYDFSSIGARVEALSDAIKAIVFSTTQLTHKVEKAHTDMGFAITKLVIRIIDPFASVDAIKAQVQEIKALEEKVINYPDLQPTDRATIYTKAKLNKAIWNTRLERDKKVLGIKPFDVYNRLNKAITHAVGVQLNPTTTVQQVDDEVIAVQNALETALKS >NZ_LS483352.1|WP_014635492.1|1001608_1002844_+|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MTQDPIANLKLARKGPIVSIIVYLLLSVAKLLAGYLLNASSLIADGFNNLSDIVGNVALLIGLHLASQPADANHKFGHWKIEDLSSLVTSFIMFLVGFQVLIHTIKSIFSGQQVDIDPLGAIVGIVSAFVMLGVYVFNKRLSKRVKSSALVAASKDNLADAVTSIGTSIAIIAASLHLPVIDHIAAMIITFFILKTAFDIFMESSFSLSDGFDSRHLKKYEKAILEIPKIVSVKSQRARTYGSNVYLDIVLEMNPDLSVYESHSITEKVEQLLSDQFSIYDIDIHVEPAMIPEEEIFDNVAKKLYRYEKLILSKVPDYDHYIAKSFQLIDANGQTVNYEQFLNQEIYYPSNFNHFQIESISQKTMLVTYQLNGNQRTSIWRRHESWSLLFHQITPIAKKQLHHTHYRIVKM >NZ_LS483352.1|WP_038432363.1|1000166_1001489_+|sodium:alanine-symporter-family-protein MIALVKLIDNLVWGPPLLILLVGTGIYLTSRLGLIQILKLPRAFKLIFSDDEGHGDISSFAALATALAATVGTGNIVGVATAIKSGGPGALFWMWVAAFFGMATKYAEGVLAIKYRTKDANGHISGGPMYYIVNGMGTKWKPLAILFAGSGILVALFGIGTFAQVNSITSSLGHSFGLSPQIVSIVLAIFVAAIIFGGIHSISKVAEKVVPFMAIFYILSSLAVIFSHYQQLLPVIRLVFQSAFTPTAAIGGFAGSLMKDAIQKGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTNEPVEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGLSILVTGQWTGQLEGAPLTQSAFATVFGNLGTFGLTFSLVLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGITHLTYFRIVFVLMVGLGGFLKLELIWVLADIVNGLMALPNLIALLALSPVVILETKHYFIK >NZ_LS483352.1|WP_002989648.1|997318_999637_-|DNA-helicase-PcrA MNPLLNGMNDRQAQAVQTTEGPLLIMAGAGSGKTRVLTHRIAYLIDEKFVNPWNILAITFTNKAAREMKERALALNPATKDTLIATFHSMCVRILRREADHIGYNRNFTIVDPGEQRTLMKRILKQLNIDPKKWNERSILGTISNAKNDLLDEKGYEAQAADMYSQIVARCYKAYQEELRRSEALDFDDLIMMTLRLFDANPDVLAYYQQRYQYIHVDEYQDTNHAQYQLIKLLASRFKNICVVGDADQSIYGWRGADMQNILDFEKDYPDAKVVLLEENYRSTKKILQAANDVINNNRNRRPKKLWTQNADGEQLVYYRANDERDEAVFVASTISNMSQELGKNFKDFAVLYRTNAQSRTIEEALLKSNIPYTMVGGTKFYSRKEIRDLIAYLTIVANPADNISFERIVNEPKRGVGPGTLDKLRQFAYESDQSLLEAASNLLMSPLKGKAAQAIMDLANILGQLRQDLDQMSITDLAEALLEKTGYLDSLRLQNTLESQARIENIEEFLSVTKNFDESSASQEEDETGVDRLGRFLNDLALIADTDDSQAEAAEVTLMTLHAAKGLEFPVVFLIGMEEGVFPLSRASEDPDELEEERRLAYVGITRAEEVLFMTNANTRTLFGKSSYNRPTRFLKEISEELLSYKGLARPAQSSFGVRFSTETHTQFGQGMSLSEALQARKAQAQVRQSAQPMQAHTIPSASTSSVLPFGSNSSVEEVTWQIGDIAHHKKWGDGTVLEVSGSGKTMELKIKFPEVGLKKLLASVAPIEKK >NZ_LS483352.1|WP_002984469.1|996707_996956_-|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MGLIWTLIVGALIGVIAGALTKKGGSMGWIANIAAGLVGSSVGQALLGSWGPSLAGMSLIPSVIGAVIVVMITSFVLNKTNN >NZ_LS483352.1|WP_002984449.1|1009116_1009674_-|signal-peptidase-I MVKRDFIRNILLLLIVIIGAILLRIFVFSTFKVSPETANTYLKSGDLVTIKKNIQPKYKDFVVYRVGKKDYVSRVIAVEGDSVTYMDDIFYLNNMVESQAYLEKMKAHYLNHAPFGTLYTDDFTVATITADKYQKVPKGKYLLLNDNRKNTNDSRRFGLINASQIKGLVTFRVLPLSDFGFVEVE >NZ_LS483352.1|WP_002984447.1|1009891_1011394_-|pyruvate-kinase MNKRVKIVATLGPAVEIRGGKKYGEDGYWAGQLDVEESAKKIAELIEAGANVFRFNFSHGDHKEQGDRMATVRLAEEIARQKVGFLLDTKGPEMRTELFADDAKEFSYVTGEKIRVATTQGIQSTRDVIALNVAGSLDIYDEVEVGHTILIDDGKLGLKVIDKDIATRQFIVEVENDGIIAKQKGVNIPNTKIPFPALAERDNADIRFGLEQGLNFIAISFVRTAKDVEEVREICRETGNDHVQLFAKIENQQGIDNLDEIIEAADGIMIARGDMGIEVPFEMVPVFQKMIITKVNAAGKAVITATNMLETMTEKPRATRSEVSDVFNAVIDGTDATMLSGESANGKYPVESVRTMATIDRNAQTLLNEYGRLDSSAFPRTNKTDVIASAVKDATHSMDIKLVVTITETGNTARAISKFRPDADILAVTFDEKVQRALMINWGVIPVLAEKPASTDDMFEVAERVAVEAGLVQSGDNIVIVAGVPVGTGGTNTMRVRTVK >NZ_LS483352.1|WP_002984444.1|1011456_1012470_-|6-phosphofructokinase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NZ_LS483352_1 | 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830207-830236 | 30 | MK448763 | Streptococcus phage Javan451, complete genome | 13647-13676 | 0 | 1.0 |
NZ_LS483352_1 | 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830207-830236 | 30 | MK448777 | Streptococcus phage Javan491, complete genome | 13529-13558 | 0 | 1.0 |
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NZ_LS483352_1 | 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830273-830302 | 30 | MK448672 | Streptococcus phage Javan117, complete genome | 7933-7962 | 1 | 0.967 |
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NZ_LS483352_1 | 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830273-830302 | 30 | MK448673 | Streptococcus phage Javan119, complete genome | 11438-11467 | 2 | 0.933 |
NZ_LS483352_1 | 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830273-830302 | 30 | MK448845 | Streptococcus phage Javan118, complete genome | 9816-9845 | 3 | 0.9 |
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NZ_LS483352_1 | 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830273-830302 | 30 | MK448763 | Streptococcus phage Javan451, complete genome | 9206-9235 | 4 | 0.867 |
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NZ_LS483352_1 | 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830273-830302 | 30 | MK448773 | Streptococcus phage Javan485, complete genome | 10959-10988 | 4 | 0.867 |
NZ_LS483352_1 | 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830273-830302 | 30 | MK448958 | Streptococcus phage Javan486, complete genome | 10313-10342 | 4 | 0.867 |
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NZ_LS483352_1 | 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830273-830302 | 30 | MK449010 | Streptococcus phage Javan90, complete genome | 10522-10551 | 4 | 0.867 |
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NZ_LS483352_1 | 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830273-830302 | 30 | NZ_CP010870 | Confluentimicrobium sp. EMB200-NS6 strain EMBL200_NS6 plasmid pNS6001, complete sequence | 108515-108544 | 6 | 0.8 |
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NZ_LS483352_1 | 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830207-830236 | 30 | MN215888 | Vibrio phage vB_VpaS_HCMJ, complete genome | 39192-39221 | 8 | 0.733 |
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NZ_LS483352_1 | 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830207-830236 | 30 | MF754115 | Vibrio phage vB_VpaS_KF5, complete genome | 39198-39227 | 8 | 0.733 |
NZ_LS483352_1 | 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830207-830236 | 30 | MG602476 | Vibrio phage VVP001, complete genome | 35844-35873 | 8 | 0.733 |
NZ_LS483352_1 | 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830207-830236 | 30 | MH925090 | UNVERIFIED: Vibrio phage ValLY_3, complete genome | 32119-32148 | 8 | 0.733 |
NZ_LS483352_1 | 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder | 830207-830236 | 30 | NZ_LN868946 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Senftenberg strain NCTC10384 plasmid 4, complete sequence | 116915-116944 | 10 | 0.667 |
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cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgttagacatctcaacatctggaacagggt Protospacer *..**********************.**.*
14. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK448775 (Streptococcus phage Javan489, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgttagacatctcaacatctggaacagggt Protospacer *..**********************.**.*
15. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK448969 (Streptococcus phage Javan514, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgttagacatctcaacatctggaacagggt Protospacer *..**********************.**.*
16. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK448794 (Streptococcus phage Javan525, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgttagacatctcaacatctggaacagggt Protospacer *..**********************.**.*
17. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK448972 (Streptococcus phage Javan520, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgttagacatctcaacatctggaacagggt Protospacer *..**********************.**.*
18. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK448763 (Streptococcus phage Javan451, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgttagacatctcaacatctggaacagggt Protospacer *..**********************.**.*
19. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK448774 (Streptococcus phage Javan487, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgttagacatctcaacatctggaacagggt Protospacer *..**********************.**.*
20. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgttagacatctcaacatctggaacagggt Protospacer *..**********************.**.*
21. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK448773 (Streptococcus phage Javan485, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgttagacatctcaacatctggaacagggt Protospacer *..**********************.**.*
22. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK448958 (Streptococcus phage Javan486, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgttagacatctcaacatctggaacagggt Protospacer *..**********************.**.*
23. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK448777 (Streptococcus phage Javan491, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgttagacatctcaacatctggaacaggtt Protospacer *..**********************.** *
24. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK448765 (Streptococcus phage Javan459, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgttagacatctcaacatctggaacagggt Protospacer *..**********************.**.*
25. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK449010 (Streptococcus phage Javan90, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgctagacatctcaacatctggtacaggtt Protospacer *.******************** **.** *
26. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MK448833 (Streptococcus phage Javan87, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer cgctagacatctcaacatctggtacaggtt Protospacer *.******************** **.** *
27. spacer 1.2|830273|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010870 (Confluentimicrobium sp. EMB200-NS6 strain EMBL200_NS6 plasmid pNS6001, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cactaga----catctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer ----agagttccatctcaagatctggcacgggat Protospacer *** ******** ****** *******
28. spacer 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to NC_014389 (Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY360, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaagagtgagtccagaaccaccagcgaat CRISPR spacer tcaagagtcattccagaaccaccaaatgcc Protospacer ******** * *************. . .
29. spacer 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to JQ692107 (Vibrio vulnificus phage SSP002, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaagagtgagtccagaaccaccagcgaat CRISPR spacer gtaagggtgagtccagaacaaccagacgac Protospacer .***.************* ***** .*.
30. spacer 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MN215888 (Vibrio phage vB_VpaS_HCMJ, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaagagtgagtccagaaccaccagcgaat CRISPR spacer gtaagggtgagtccagaacaaccagacgac Protospacer .***.************* ***** .*.
31. spacer 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MF754116 (Vibrio phage vB_VpaS_KF6, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaagagtgagtccagaaccaccagcgaat CRISPR spacer gtaagggtgagtccagaacaaccagacgac Protospacer .***.************* ***** .*.
32. spacer 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MF754115 (Vibrio phage vB_VpaS_KF5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaagagtgagtccagaaccaccagcgaat CRISPR spacer gtaagggtgagtccagaacaaccagacgac Protospacer .***.************* ***** .*.
33. spacer 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MG602476 (Vibrio phage VVP001, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaagagtgagtccagaaccaccagcgaat CRISPR spacer gtaagggtgagtccagaacaaccagacgac Protospacer .***.************* ***** .*.
34. spacer 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to MH925090 (UNVERIFIED: Vibrio phage ValLY_3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaagagtgagtccagaaccaccagcgaat CRISPR spacer gtaagggtgagtccagaacaaccagacgac Protospacer .***.************* ***** .*.
35. spacer 1.1|830207|30|NZ_LS483352|CRISPRCasFinder matches to NZ_LN868946 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Senftenberg strain NCTC10384 plasmid 4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
tcaagagtgagtccagaaccaccagcgaat CRISPR spacer gttcagccgaatccagaaccaccagcgaag Protospacer . .. .**.******************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
36638 : 48952
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LS483352|36638:48952|DBSCAN-SWA TATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGCCTTGTGAAAGAGTTGACACATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGACTTGCGTATTGTGCAGGTCTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTACTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACCGTCTTTTGACGGAAGCTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCAGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTATTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCCCAGCTATACTTGGTCAATAAGGATATTACAGAAGCAGAGCTTGAAGCCGTTAAGAACTATCTTTTGAACCCTGTTGATTCGCGTTTCAAGGACATTACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTGTCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAAATTATAAAGCTGACGATTTTGCGGCCTATAAGGCAGAGCAGGACTTGGCTATGGAGGTCGATGACCTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGACGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACTTACTGGTCAGACCACTGCCGTCACACAACCTTTGAAACTGAATTGAAGAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAAAAACAATTGCAGACGACTTATGACAAATATATCGCCATGCGTGATGAGCTTGGCCGTTCTGAAAAGCCACAAACACTTATGGATATGGCGACTATCTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAACGGTCGTCTAGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGATGTGAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAACGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTCGGTGGAGCGGCGACTTGTATCGGTGGTGCTATTCGTGACCCATTGTCAGGACGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATCACGACTCCGATTGCGGAAACACGTGCTGGTAAATTGCCACAACAAGTTATTTCTAAAACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGGCTTGCGACAACTTATGTGCGCGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGTATGGAGCTTGGAGCTGTGGTTGGTGCTGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGCGATGTGGTCATCTTGCTCGGTGGTAAAACAGGTCGTGATGGTGTCGGTGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAATCTGTGGAAACAGCTGGCGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATTGAAGAACGTAAGATTCAACGTCTTTTCCGTGATGGCAATGTCACTCGTCTTATTAAGAAATCAAATGACTTCGGTGCAGGTGGTGTCTGTGTTGCCATCGGTGAATTGGCTGACGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTGCCTCTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAGTCGTTGTTCGTCCAAATGATGTGGATGCCTTCATCGCAGCCTGCAACAAGGAAAATATCGATGCAGTCGTTGTTGCGACCGTTACTGAAAAACCAAATCTTGTCATGACTTGGAATGGCGAAATCATCGTTGATTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAATGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGCTAAAGTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGACCTCAACCACGCTAGTCAAAAAGGTCTTCAAACTATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGTTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGTTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCTGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAACAACTGCATCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCAGAGTGGTCACCTTATCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGGTAGCAACGGGTGCTGACTGGTCTCGTGCACGTTTCTCTTACCAAGAGTACTTTGAGCGTATGGATAAACAAGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTATTGAGGCTCAGATTCAACTTGGTTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCTATGTCTGGTACTTTCGAAGACTTGACAGTACCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGCGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGCGAAAACATTTACTATATCCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGATAACTTTAGCCAGTTTGAAGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACAGCTGCCTCAGCCGCTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGTTTTGTCTTTACATCAGCTGAGGAAATTGCTGACGCGGTGAAAATCGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTTGCTGGCGCTAGCCTTCTAGCAGCCTTCGAAGGCAAATTGGAAGAGGTTTACCCAACAGAATTTGAACAGACAGATGTTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACTGTTATCAAGGCTAAGGAAACAATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCAGTCTTCCCTGGTACCAACTCAGAATACGATTCAGCTAAGGCCTTTGAACAGGTTGGAGCTAGTGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGGTTGCTATTGCTGAGTCAGTTGACACTATGGTTGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGTTTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACGAGAAGGTCCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAGGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCTAATCAGCATGTTGCCAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATTCCAGTTTCACATGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACGGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGACACTCAGAACGCTGGGAAGACGGACTCTTCCAAAATATCCCTGGTAACAAAGACCAAACCCTCTTTGCAAGTGCTGTAAAATACTTTACAGGGAAGTAAAAAGGTTCAGTGAACCTTTTTAGCCCTCGCCTTGAATTAGTGAAGGGCGAGGTTAGAAAGAATCTCGCTTAATTTTTGAGAAATAGTAAACACGGGCGATAAGTTGTGCGAAAAACTTTCTATTTTCGCTTTACTTGACAGCCTTTGTATCGAGGTAAAAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGAGTCTTTGGTATCTGGGGACATCCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCATAGCCTTCAACATCGCGGTCAAGAAGGAGCTGGTATTGTTTCAAATGACAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGACTTCTTTCTGAAGTTTTTAAAAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCCTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCGATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCATTTGATTCGTCGAAGCCATAACTCAAGTTTCATGGGAAAGGTAAAAGAAGCTCTAAATACAGTAAAGGGTGGCTTTGCCTATCTACTGATGACAGAAGATAAATTAATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTTCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATAGTGGTATTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAACTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCAACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGAGATGGGTCTTGTAAAAAATCAGTATACGCAGCGAACCTTTATTCAACCGACACAAGAATTAAGGGAACAAGGTGTTCGAATGAAACTATCAGCGGTATCCGGTGTTGTCAAAGGAAAGCGCGTTGTTATGATTGATGACTCAATTGTAAGAGGAACGACTTCTAGAAGGATTGTCGGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LS483352|36638:48952|43196_43751_+|WP_002986700.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLLAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGVERKVI >NZ_LS483352|36638:48952|36638_40364_+|WP_109828667.1|DBSCAN-SWA MNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDRLLTEAEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLFGSDSQVKVNTAQLYLVNKDITEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFENYKADDFAAYKAEQDLAMEVDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDDVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPNDVDAFIAACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGEIIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTTTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEDLTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKDNFSQFEAIQAQHKITAASAAKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLAAFEGKLEEVYPTEFEQTDVLEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEVAIAESVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQTLFASAVKYFTGK >NZ_LS483352|36638:48952|48460_48952_+|WP_002987716.1|DBSCAN-SWA MKTPIISIIMGSKSDWATMQKTAEVLDNFGIAYEKKVVSAHRTPDLMFKHAEEARGRGIKIIIAGAGGAAHLPGMVAAKTTLPVIGVPVKSRALSGLDSLYSIVQMPGGVPVATMAIGEAGATNAALTALRILSIEDQNLADALAHFHEEQGKIAEESSGELI >NZ_LS483352|36638:48952|43934_45482_+|WP_023610065.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKSGIVDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDNAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDITYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTTQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDSPTVVVLKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAKKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >NZ_LS483352|36638:48952|40524_41979_+|WP_023080049.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNSSFMGKVKEALNTVKGGFAYLLMTEDKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVISSETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDSGIQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIGSPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHTVDEVCEIIGADSLTYLSLDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >NZ_LS483352|36638:48952|46917_48183_+|WP_023080273.1|DBSCAN-SWA MKLLVVGSGGREHAIAKKLLASKGVDQVFVAPGNDGMTLDGLDLVNIVVSEHSRLIAFAKENEISWAFIGPDDALAAGIVDDFNSAGLRAFGPTKAAAELEWSKDFAKEIMVKYNVPTGAYGTFSDFEKAKAYIEEQGAPIVVKADGLALGKGVVVAETVEQAVEAAQEMLLDNKFGDSGARVVIEEFLDGEEFSLFAFVNGDKFYIMPTAQDHKRAFDGDKGLNTGGMGAYAPVPHLPQSVIDTAVETIVRPVLEGMVAEGRPYLGVLYVGLILTADGPKVIEFNSRFGDPETQIILPRLTSDFAQNIDDIMMGIEPYITWQKDGVTLGVVVASEGYPLDYEKGVPLPEKTDGDIITYYAGVKFAENSELLLSNGGRVYMLVTTEDSVKAGQDKIYTQLAQQDPTGLFYRNDIGSKAIRE >NZ_LS483352|36638:48952|42006_43029_+|WP_111685626.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGVLGGFGGMFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYVATGKNNSVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVQAALPLIKEELVNGIGHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADASVVIK >NZ_LS483352|36638:48952|45540_46665_-|WP_002987712.1|DBSCAN-SWA MKKFHRFLVSGVILLGFNGLVPTMPSTLISQQENLVHAAVLGDNYPSKWKKGNGIDSWNMYIRQCTSFAAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKNQGYPVNKTPSIGAIAWFDKNAYQSNAAYGHVAWVADIRGDTVTIEEYNYNAGQGPERYHKRQIPKSQVSGYIHFKDLSSQTSHSYPRQLKHISQASFDPSGTYHFTTRLPVKGQTSIDSPDLAYYEAGQSVYYDKVVTAGGYTWLSYLSFSGNRRYIPIKEPAQSVVQNDNTKPSIKVGDTVTFPGVFRVDQLVNNLIVNKELAGGDPTPLNWIDPTPLDETDNQGKVLGDQILRVGEYFTVTGSYKVLKIDQPSNGIYVQIGSRGTWVNADKANKL |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
88112 : 104598
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LS483352|88112:104598|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LS483352|88112:104598|88112_88832_+|WP_010921791.1|DBSCAN-SWA MRYISVKNLSFQYESEPVLEGITYHLDSGEFVTMTGENGAAKSTLIKATLGILQPKAGRVTIAKKNKDGKQLRIAYLPQQVASFNAGFPSTVYEFVKSGRYPRSGWFRHLNKHDEEHVQASLEAVGMWENRHKRIGSLSGGQKQRVVIARMFASDPDIFVLDEPTTGMDSGTTDTFYELMHHSAHQHGKSVLMITHDPEEVKAYADRNIHLVRNQKLPWRCFNIHEAETDDEKGGHGHA >NZ_LS483352|88112:104598|96384_96657_+|WP_001100459.1|DBSCAN-SWA MNVFSQDYEAKLLEQNLTAFNRFLEAYQKPKPRVLGLITAEQVKEELNIKGKTLKRWENAGLRRYQPPLEDTRKHYYKVSDILIFLGVNV >NZ_LS483352|88112:104598|90226_91372_-|WP_032465792.1|integrase|DBSCAN-SWA MKITEHKKKNGTIVYRASIYLGIDQMTGKRVKTSVTGRTQTEVKQKAKHAQFDFLSNGSTIHKEAQIRNYQELAELWLKSYQLTVKPQTYESTKLLLKNHILPVFGNMKLERITPSFVQQFANKLAHTLVNFKVACSINRRILQYAVLLQLIPYNPAREIIIPKKQKKSADRVKFINPQNLKALLDYMETLAPTKYQYYYDNVLYCFLLATGCRFGEAVALEWSDIDLEAGTVSISKTYNRQINQISTPKTKSGKRIISIDNKLALLLKQYRNRQRLIFIEIGARAPKVIFASPTLTYASSDVRSKALAHRCKEVGIPRFTFHAFRHTHASLLLNAGISYKELQHRLGHSNIKMTLDTYGHISKEKEKEAVSYFEKAINNL 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MLDILSYDFMQRAVMAVVAISIFAPILGIFLILRRQSLMSDTLSHVSLAGVALGVVIGISPTITTIIVVVLAAILLEYLRVVYKHYMEISTAILMSLGLALSLIIMSKSHSSSSMSLEQYLFGSIITISMEQVVALFAIAAIILILTVLFIRPMYILTFDEDTAFVDGLPVRLMSVLFNIVTGVAIALTIPAAGALLVSTIMVLPASIAMRLGKNFKTVILLGIVIGFSGMLSGIFLSYFFETPASATITMIFISIFLLVSLGGMLKKRLF >NZ_LS483352|88112:104598|102816_103068_+|WP_111685641.1|DBSCAN-SWA MLTQIESQKKLVDEQRTPDTSSVKDSGYINGNSEHSSTSSQEESILTKQQTWTQRAKERIKKVWSGFKYYCNPKNWFKSWWKG >NZ_LS483352|88112:104598|93792_93993_+|WP_111685631.1|DBSCAN-SWA MTVGDKIKTIRLNLGETMEEFGKRFGTYKSTVNNWEKGRNLPNRNSLLRIAQLANQTVSDFLAITH >NZ_LS483352|88112:104598|100395_100884_+|WP_014407946.1|DBSCAN-SWA MLELSIENIIKSMKTQGKTRVTGSIGDQAIRIDLDGLVIHYNGQGLLLETIPGTYGGKRYFFVCPDCERRCRKLFKASHAFACGSCQKVHQATLNRSKTDCCYYWQLAFKECLKVNPEARHIHGYYSRDDFPKRPKYMRLTKYLYHWRRFHYYMDKGDRYWL >NZ_LS483352|88112:104598|99458_99632_+|WP_023610068.1|DBSCAN-SWA MKIKLFYQKHNESLDDFEYRVNLFTLSVSVIDIKFQEATYGNYEDMDTRTGLLVLYR >NZ_LS483352|88112:104598|101289_101652_+|WP_111685638.1|DBSCAN-SWA MSAKEQLKGLKPLFALITLFEEQRDKDIKLINAFHNPEAIRHIEKGTAKQLLYLAKERDKRLAMIATLQDERQIAVIKARYVDDLSWDEILDKLGYSRNTVFKLHREALEVLDEQEERYS >NZ_LS483352|88112:104598|99637_99811_+|WP_003058787.1|DBSCAN-SWA MKLKLHTRGGNTITIQGDRTLYDELIKYLLSGQQPNWVACPSAIINLSDIIAITKEK >NZ_LS483352|88112:104598|89679_90063_-|WP_020833194.1|DBSCAN-SWA MTECIFCHQLKANQLLTQSQYFKVVFDIDPIQKGHLLLISKDHYTSLTQLPKEVRYDLIDLQAALVAKLEQHLPISGVTSVSNDKELMEEGTHFHLHLIPRLTNDSFWEGITINQENWDLAPFLKHL >NZ_LS483352|88112:104598|96657_97515_+|WP_111685636.1|DBSCAN-SWA MAIYEARGFSSYLYPYKGPLEPFDYIAQFRPLKPPEDIDIEEYKRTQAPYCLSGKVTVEKNGSYKRNNASLVYRDLIFLDYDEIETGVNLPKIVSQTLWEYSYIIYPTIKHTPEKPRYRLVMKPSDVMTEATYQQVVKEIADKIGLPFDLASLTWSQLQGLPVTTGDPEDYQRYVNRGLNYPVPKNGSTPNRQVVTTYTPRPRSQRSITMRVIDTLFNGFGDEGGRNVALTKFVGLLFNKWVDCDLETAYELVQIANSVTTKPLPIDEIDRTFTSIAKAEYRKRG >NZ_LS483352|88112:104598|96052_96382_+|WP_000174505.1|DBSCAN-SWA MTLPENYRRVLNLIKVGADNPITGAEISLILKLEERSVQSIISSLITRYNIPIIGIRHGFNRGYFIPANKEELLDGAKAFYNQVQKEQERLSVLLNADLTSYKELLKGG >NZ_LS483352|88112:104598|95296_95629_+|WP_111685634.1|DBSCAN-SWA MKYRVETNPFSKDRYTPEQLEMFKNRQLSKDKAEAFFTRLYNQHIAWVIIANVMTEYVIKFRKSATSFEEAWDALDYQRTTEIIFRAVNGLPCSEKDSGELETYLSEVSA >NZ_LS483352|88112:104598|91626_91770_+|WP_111685629.1|holin|DBSCAN-SWA MSGGCAYVCKSQKPKERRRQGLSVYETLTLMIAFGTLIVAIMNNKNK >NZ_LS483352|88112:104598|95849_96041_+|WP_111685635.1|DBSCAN-SWA MQELNLTPTQTLILFFVLSLLGLLLSLSKSLIDIDLPEDTQVPKPRQNANYGAYIQSQNHYYN >NZ_LS483352|88112:104598|103338_104598_-|WP_023610094.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIFEELKARGLVFQTTDEQALVKALTEGQVSYYTGYDPTADSLHLGHLVAILTSRRLQLAGHKPYALVGGATGLIGDPSFKDAERSLQTKETVLEWSDKIKGQLSTFLDFENGDNKAELVNNYDWFSQISFIDFLRDIGKYFTVNYMMSKDSVKKRIETGISYTEFAYQIMQGYDFYELNDKHNVTLQIGGSDQWGNMTAGTELLRKKADKTGHVMTVPLITDSTGKKFGKSEGNAVWLDADKTSPYEMYQFWLNVMDNDAVRFLKIFTFLSLDEIAEIETQFNAARHERLAQKTLAREVVTLVHGEKAYKQALNITEQLFAGNIKNLSANELKQGLSNVPNYHVQSEDSLNLVDMLVTAGISPSKRQAREDVQNGAIYINGDRVQDLDYQLSNDDKIDDQLTVIRRGKKKYAVLKFN >NZ_LS483352|88112:104598|94013_94421_+|WP_111685632.1|DBSCAN-SWA MARTPFTQELLHQIFDDTGTMSLELIAERLPDWSEKEIKLRLAAWRYRNNIDYTMANGEIDTFEIINNRKAILEEVSAGRQLKLEEYFKQVQATAEIINKPTASDTNRLKAIQLQQVAMDEIPDQYFKELTELYG >NZ_LS483352|88112:104598|102218_102854_+|WP_111685640.1|DBSCAN-SWA MKKKLMLAAALLTVGVATNVKAEEAETTESQEEIKYELEGKQQEIKDENGNKIFVENFYSGAEKITVHMPKGWAVRLYRQPNSDLEGNDKGTLVEVPYLCENVVIDTETDKHTGLKKNITQARYKDGYRMNYDGWNYQIPLQKNLTEEQKEEKKLKDKDLLNSDKCPNPEEREKEPLTKDERLTFEFRRDGNFYAGSLVYVNPNRVTKKIS >NZ_LS483352|88112:104598|97483_99172_+|WP_111685637.1|DBSCAN-SWA MLKQNTEREGRTIEQEDLKNLENEITEARENEDKYFSTFKGVRGQLIKECQEMKDEAFKIAYDGVMADSKHLENVKAGRLTEVQHEELAKEKGQEASEKALPKTPLGVAIMLKHYLRFIRVKPEAQGQKAPLYFFHPDHGVWLEDNEFLQDLISVIFPNATEKQAFDTLYKIARQSQLKEIQREYTVIGNRLYNYKTGRFEELTPDITVTRKIKTGYNKKAKEPTIKGWKPTAWLLELFDGDAELYNLAIQIIKASITGQSLQKIFWLFGEGGTGKGTFQQLLINLVGMDNVASLKITELAKSRFTTSILLGKSIVIGDDIQKDAVIKDTSDIFSLATGDIMTIEDKGKRPYSIRLNMTVVQSSNGLPRMNGDKSAIDRRFRILPFTKVFKGKPNKAIRNDYINRKEVLEYLLKLAIETPITDINPKASIEILEEHHKEMNPVIDFVSKFFTDELTSEFIPNSFVYHVWKGFLEYYDIKQIKSERGLHKEIKSNLPEGFEAGQKVIPVGRQLHTGFYPKEDLPLFASASYANGRASPEKQKKPKNERGYYNHWPTHKKQKKT >NZ_LS483352|88112:104598|101626_102010_+|WP_111685639.1|DBSCAN-SWA MSKKNAIRKLKEFHRWQRIANSLDLTYTELYQFDIDYHPTRRKHLEISRECALEELDAIRYAINQLSKIEYRKILIECYLISEEKTQQDIMEELNRSQSWYYETKKRALLEFSENYRGGALKNSIHL >NZ_LS483352|88112:104598|95625_95847_+|WP_003058793.1|DBSCAN-SWA MKNIKELNEIANDILVDYEGLCGQLMDILDVLDLAAQEYSKETTSAIINTSCSALKCLISDHDKTTRKYRKEL >NZ_LS483352|88112:104598|99812_100322_+|WP_111674798.1|DBSCAN-SWA MRTFSDTPKTFTFHYTFKDFDTAQVACHAILGYMTGTYEQPVIDATYHNDDQGGHANQLVLKYAEDRKLNKVFKRICDSFKDYYNQPEDMTDEELDHQRVVSLSKSTQGKVNNRDTLIAFISDHNQLAEHLSMNYKEMTPEDLGAILESISQAFNHLYDMVVEGQLLVK |
26 | Streptococcus_phage(62.5%) | holin,integrase,tRNA | attL 83484:83498|attR 99475:99489 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
336592 : 433522
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LS483352|336592:433522|DBSCAN-SWA TATGATTCCTGTTGTTATTGAACAAACTAGCCGTGGAGAACGTTCTTATGACATTTATTCACGTTTATTAAAAGACCGTATTATCATGTTAACAGGGCCTGTCGAAGACAACATGGCCAACTCTGTCATAGCGCAGCTCTTATTCCTTGACGCGCAAGACAACACGAAAGATATCTACCTATATGTCAACACACCAGGTGGCTCTGTCTCAGCAGGCTTGGCTATTGTCGATACCATGAACTTTATCAAGGTCGATGTGCAAACTATTGTCATGGGTATGGCAGCTTCTATGGGGACAGTCATTGCTTCATCAGGAACAAAAGGCAAACGCTTTATGTTACCAAATGCAGAGTATATGATCCACCAGCCAATGGGTGGCACAGGCGGTGGCACGCAACAAACGGATATGGCTATCGCAGCAGAACATCTCTTAAAAACACGTCACCGTTTAGAAAAAATCTTAGCGCAAAATGCTGGGAAAACGATTAAACAAATTCATAAAGATGCTGAGCGTGATTATTGGATGAGTGCTGAAGAAACCTTGGCTTACGGTTTCATTGATGAAATCATGGAAAACAACGAACTAAAATAAAGAGGATCTCTGCAAAAGTATTCTAGAAACTTCTAGGATGCTTTTTCTCTTAGAAAGGAAAATAATGATACAGCCTACTGCATTAAAACAGCTTCAAGAGTTAAAACGTCAGTTCAGATCCCTTTGCAACCAATTATGAGATAGTTTGAGGATGATCCTTAGCAGCTGTGTGCAAGAAGTTATGACGATTTCATAAAGGATGACCTAGCCAGTCTTTCTTCGTCTCTTTTACTTAAAGTGTGGTATAATCAGATTATGCTAGCCAAAATTAAAAAAGGCATTGCCACTAAAGGTGTTGTAGATCGGCTTATCCTAGATCTCATAACAATGCTGTAGTACCACCCTTACCTTGCTACTAAAGGCGCTGTTGAAGCACAAATTGACTTGCAAAGGATCTTGACTGATAATATGTCCGGTGGAATCGCCAAAGCAGCAAAAAGACCAAGACCCTTATTTGGTCTCTACCAAAATATAATAGAAAAGGATTTAGAATGTTTCAAAAACAAGAACGTATTGGACTCGTCGTTTACCTGTATTATAACCGAGATGCCAGAAAGTTATCAAAATTTGGTGATTTATATTACCATTCCAAGCGCTCTCGTTACCTCATTATTTATATTAATAAAAATGATTTAGACACAAAATTAGAAGAAATGAGACGTTTGAAATGTGTTAAAGACATTAGACCATCAGCTTTTGATGATATTGACCGCCAATTTGTAGGTAACCTTCATCGCGACGAAACAAACAACCATCAAAAGGGTTAACAACCCCCTAGTTACTGATTAGCGTTTCAGATTTAGTTAGCTTATTAAAGTAAGAAGGTTTTGACAGATGCTCACACTACTTCAAGACAATGAGACAACTAGAGCATTAGTGAATAACTGAGTTGACTGTCACTTCTTTAATAAGAACGGATAGGATTGGTCCTAAAATAGAGCACTGCAAAGATATGCCAGTGCTTTTTAGCTCATTTTTTGATAAAATAGAACTACTAAAAAGTGAAGGAAATAAGATGATCACAGGAAAACTCATAACCGTTGAAGGTCCAGATGGCGCAGGGAAAACGACTGTTTTAGAGCAACTCATTCCACTGTTAAAACAAAAAGTGGCTCAGGATATCTTGACAACAAGAGAGCCTGGAGGTGTTGCCATTTCAGAACACATTAGAGAACTTATTTTAGACATCAACCATACTGCTATGGACCCTAAAACAGAACTCTTACTTTATATTGCGGCTCGAAGGCAGCATTTGGTGGAAAAGGTACTACCAGCTCTTGAAGCAGGCCAGTTGGTTTTTATTGATCGTTTCATCGATAGTTCAGTAGCTTATCAAGGTGCGGGACGCGGTTTGATCAAAGCAGACATTCAGTGGCTCAACGAGTTCGCAACAGATGGTTTAGAGCCTGACTTGACCCTTTATTTTGATGTTCCTTCTGAAATTGGTTTAGCACGGATTAACGCGAACCAACAAAGAGAAGTCAATCGTTTAGATTTGGAAACAATAGAGATACATCAACGAGTACGAAAAGGATACCTAGCCTTAGCTAAGGAGCATCCAAAACGTATTGTCACAATTGATGCGACTAAACCATTGAAAGAAGTTGTCTCTGTCGCTTTGGAACATGTCTTAGCCTTGCTTTTAGCCTAGGATAAGGGAGGGTAGGAATGGATTTAGCGCAAAAAGCTCCTAACGTTTATCAAGCTTTTCAGACAATTTTAAAGAAAGACCGTCTGAATCATGCTTATCTTTTTTCGGGTGATTTTGCTAATGAAGAAATGGCTCTTTTTTTAGCTAAGGTCATCTTTTGTGAACAGAAAAAGGATCAGACGCCCTGCGGGCATTGTCGCTCTTGTCAATTGATTGAACAAGGAGATTTTGCCGATGTGACGATATTGGAACCAACAGGGCAAGTGATTAAAACGGATGTGGTCAAAGAAGTGATGGCTAACTTTTCTCAGACAGGATATGAAAACAAACGACAAGTTTTTATTATCAAAGATTGTGACAAAATGCATATCAATGCCGCTAATAGCTTGCTAAAATACATTGAGGAGCCTCAGGGAGAAGCTTACATATTTTTATTGACCAATGATGATAACAAAGTGCTTCCGACCATTAAAAGTCGGACACAGGTTTTTCAGTTTCCTAAAAACGAAGCCTATCTTTACCAATTGGCACAAGAAAAGGGATTATTAAACCATCAGGCTAAGTTAGTAGCCAAACTTGCCACAAATACCAGTCATCTAGAACGTCTGTTGCAAACGAGCAAGCTTTTAGAACTGATAACTCAAACAGAGCGTTTTGTATCTATTTGGCTGAAAGATCAGTTGCAGGCATATTTAGCGTTGAACCGTCTGGTACAGTTAGCAACTGAAAAAGAAGAACAAGATTTAGTTTTGACCCTTTTGACCTTGCTCTTGGCAAGAGAGCGTGCGCAAACGCCTTTGACACAATTGGAGGCTGTCTATCAGGCTAGGCTCATGTGGCAGAGCAATGTTAATTTTCAAAACACATTAGAATATATGGTGATGTCAAAATAAGTGCAATTGGAATTCGTTATGGGGAAACGAAGCTTGTCAAAAGACTTGCCCGTAGCGACCAAAGTAGCGGCGCATAGGGGCAAAAAAGCTTTTGAAGAAAATACTGCCCTTGCAACAGATTTGATGAAAGAAGTATCACGATTAATAACACAAAATCAACTTGAAATAACGTTTATTAATAGTGTCTTTCCCTTAGATCAGCATGTTGTCCTAATTCCCTTTTCAACAGAAGAGCACATGGATTTTTACAACTGTTAAAAGATTTAGCGGCCGATTTTAGGTCAAGAAGTGAGCTGCCCCAGATTAACAGCCAAGAAGATTTCATTTTCTATGGAGGCTATGGACCGTGTGGCAGGCCACTGTGCTGCTTTCGTTTTTGGGAAAATTTCTGACAGTATCTATTAAAATACTAAAAAATCAAGGGTTATCATTGATTTTGGGTAAAGCAACAAGCCCTTATGGCCGTTTGCTTTGCTGTCTCTATGATGAAGGTGGCTTTTACCAATAAAGCAAGAAAAAATTCCCTGAATATGGTACCATAGTAGAGACAAGTGATGGCCCTGCAACAGTAGCAGCCGTTGATATATTTACAGATCCCATTAAGGTGCGGTTAAAAGACCAGTTGACCTTAGTCACTTATGCTTTAGAGGAGGTTAAAGTAGGTGAATAAAAAAGAATTATTCGATGCTTTTGATGGATTTTCCCAAAATTTAATGGTTACTTTAGCTGAAATTGAAGCCATGAAAAAACAAGTCCAATCACTAGTAGAAGAAAACACGATTCTTCGCCTAGAAAATACAAAACTACGGGAACGTTTGAGTCACCTAGAACATGAAACGGTAGCTAAAAATCCTTCCAAACAAAGGAAGGATCACTTAGAGGGAATTTATGATGAAGGGTTTCATATCTGCAATTTTTTCTATGGACAACGTCGTGAAAATGATGAAGAATGTATGTTTTGCAGAGAATTATTAGATAGAAAGTAAGGGCATGCAGGTTCAAAAAAGTTTTAAAGACAAAAAAACAAGCGGAACCTTGTATTTGGTTCCAACCCCAATTGGCAATCTGCAGGACATGACCTTTAGAGCAGTGGCAACGTTAAAAGAGGTTGATTTTATTTGTGCAGAAGACACAAGAAACACAGGTCTTTTGCTAAAACACTTTGACATTGCTACCAAGCAAATCAGCTTTCATGAGCACAACGCCTATGAGAAGATTCCTGATTTAATTGATTTATTAATATCAGGACGGTCACTAGCTCAGGTGTCTGATGCAGGAATGCCATCGATTTCTGATCCTGGGCATGATTTGGTCAAGGCTGCTATTGATAGTGATATCGCAGTCGTTGCTTTACCAGGTGCCTCAGCTGGGATTACAGCTTTGATTGCTAGTGGACTGGCTCCTCAACCCCATGTTTTTTATGGGTTTTTACCCAGAAAAGCAGGGCAACAAAAGGCTTTCTTTGAGGACAAACACCATTACCCAGAGACACAAATGTTTTATGAATCGCCCTATCGCATCAAAGATACCCTGACCAATATGTTGGCTTGTTATGGTGATCGTCAAGTGGTGCTTGTCAGAGAATTAACCAAGCTTTTTGAGGAGTACCAACGGGGGGCGATTTCAGAAATCTTGTCCTACCTTGAGGAAACATCCCTAAAAGGGGAGTGTCTGCTGATTGTGGCTGGAGCCCAAGTAGACAGTGAGGTTGAGCTGACAGCTGATGTTGACTTAGTGTCTCTAGTGCAAAAAGAAATCCAAGCAGGAGCCAAGCCAAATCAGGCTATTAAAACAATTGCTAAAGCTTACCAGGTAAATCGCCAAGAGCTTTACCAACAATTTCATGACTTATAAGTCATCGTAG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99 | Streptococcus_phage(20.0%) | bacteriocin,tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
534507 : 608686
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LS483352|534507:608686|DBSCAN-SWA TATGACTATTAAGGCAGAAATTAAGGCACTCGCCAAAGAAATTGGTATCTCTAAAATTGGTTTTACGACGGCAGATAACTTTGATTATTTGGAAAAGTCATTGCGTGCTTCTGTGGAAGAGGGGCGCAATTCAGGATTTGAACATAAAGTCATAGAGGATCGTATCTCCCCTGAAAGGCTTTTAGAATCGGCTAAAACGATTATTTCAATTGGCGTTGCTTATCCTCACAAACTTCCTCAGCAACCTCAAAAAACACCTTATAAACGTGGCAAAATTACACCTAGTTCGTGGGGGCTTGATTATCATTATGTGGTCGGCGAAAAGTTAGACAGACTATCAAAAGGCATTGAAGAGCTCTGTCGAGATTTTCCTTTGCAACAAAAAGCAATGGTCGATACTGGAGCTTTAGTTGATACTGCAGTTGCCCAAAGAGCGGGTATTGGTTTTATAGGAAAAAATGGTCTAGTTATTTCTAAAGAATATGGCTCTTATATGTTTTTGGGAGAATTAATTACCAATTTAGAGATCGAGCCAGACAAGCCTGTCGATTATGATTGTGGTGACTGTCGTCGTTGTCTAGATGCCTGTCCAACTTCTTGTTTAATTGGTGATGGCTCAATGAATGCCAAGCGTTGTCTATCATTTCAAACCCAAGATAAGGGAATGATGGACATAGAGTTTCGAAAAAAGATTAAAACAGTTATCTATGGTTGTGATATTTGCCAAATTTGCTGTCCTTATAACAAAGGTATAAATAATCCACCAGCTACAGAGATTGATCCTGAGTTGGCCCAACCAGAATTAATACCATTTTTGAGTTTATCAAATGGAAAATTTAAAGAAAAATTTGGTATGATTGCTGGAAGTTGGCGAGGTAAAAATATTTTACAGCGTAATGCCATTATTGCGCTAGCAAAAGCTCATGATAAAACTGCAGTGGTCAAATTAATAGAGATTATTGATAAAAATAATAACTCTATTCATACTGCAACAGCTATATGGGCATTGGGAGAAATTGTCAAAAAACCAAACGATGAGATACTGGCGTTTATGAGTCATTTAACCTTAAAAGATGAAGATAGCCGAAAAGAGTTGGAATTAATCCGTCATAAATGGCAATTTTAAGCCTTTTATGGTATTTTTAAGAACCTTATGATAAAATAAAACAGATTAACAAAGATTGGAGAAATCTCATGGAAGTGGCTGAAATTCGCCAAAAAATAGTAGAAAATAAAGAGAAGTTGACTAGCTTCAGGAGGTCTCTTTGACTTAGATCGTTTGGAAGAGGAGATTGCTCTTCTTGAAAATCACATGACTGATCCAGACTTTTGGAATGACAATATTGCAGCGCAAAAGACATCTCAAGAACTAAATGAGTTAAAAGGTAAGTATGATACTTTCCATAATATGCAAGAATTATCTGACGAAACAGAACTCTTACTTGAGATGCTTGACGAAGATGATTCTTTGAAAGAAGAATTAGAAAAAAATCTAATGCAGCTAGATAAGATAATGGGTGCTTATGAAATGACGCTTCTCTTATCTGAACCCTATGACCACAATAATGCTATCTTAGAAATCCATCCTGGTTCAGGAGGAACCGAAGCGCAAGATTGGGGAGATTTACTCTTACGAATGTATACCCGTTTTGGCAATGCTAATGGTTTTAAAGTAGAAGTATTGGATTATCAAGCAGGGGATGAAGCTGGTATTAAATCGGTTACCCTCTCTTTTGAAGGTCCTAATGCTTATGGTTTGTTGAAATCAGAAATGGGAGTTCATCGCCTCGTTCGTATATCACCTTTTGATTCGGCTAAACGTCGTCATACCTCATTTGCTTCAGTTGAAGTGATGCCAGAGTTAGATGATACGATTGAAGTAGAAGTACGTGATGATGACATTAAAATGGATACTTTCCGTTCCGGAGGAGCTGGTGGTCAGAATGTCAATAAAGTATCAACAGGTGTTCGTTTGACGCATATTCCAACTGGAATTGTGGTATCGTCTACCGTTGACCGTACTCAATATGGGAACCGCGATCGCGCTATGAAGATGTTGCAGGCTAAGCTATATCAGTTAGAACAAGAAAAGAAAGCACAAGAAGTAGATGCTCTCAAGGGTGATAAAAAAGAAATCACTTGGGGAAGTCAGATTCGTTCTTATGTTTTCACCCCTTATACGATGGTGAAGGATCATCGTACTAACTTTGAGCTTGCTCAGGTAGATAAGGTTATGGATGGAGAAATCAATGGCTTTATTGATGCCTACCTTAAGTGGCGCATTGAAGACTAAAAATAATAAAGGAGAAACATGGCACTAATAGAAATGTCTGGTGTTACTAAAAAATACCGCCGCTCAACGACCGCCCTCAGAGACGTCAATGTTTCTGTTAACCAAGGTGAGTTTGTTTATCTCGTAGGCCCATCAGGTGCTGGTAAATCAACTTTTATCAAACTCCTTTACCGTGAAGAACAACTGACAACTGGTAAGCTATATGTGGGTGAATTCAATTTAACTAAACTAAAAGCACGTGATGTTCCGATTCTTCGTCGTCACATCGGAGTAGTTTTTCAAGATTACAAACTGCTACCAAGAAAAACAGTCTTTGAAAATGTAGCTTACGCCATGGAAGTTATTGGTGAAAAGCGCCGTCACATTAAAAAACGCGTGCCAGAGGTACTCGATTTAGTTGGCTTGAAACATAAGATGCGTTCTTTTCCAAGTCAGCTATCAGGAGGGGAGCAGCAACGTGTGGCCATTGCGCGTGCGATTGTTAACAACCCTAAATTATTGATTGCAGATGAACCGACAGGGAATTTAGATCCTGAGATTTCATGGGAAATTATGCAGTTACTTGAACGTATTAATGTTCAGGGAACAACTATCTTAATGGCGACACACAACAGTCATATTGTGAATACATTCCGTCATCGTGTTGTTGCTATTGAAGATGGTCGCATAGTACGTGATGAAGAAAAAGGAGATTATGGTTACGATGATTAGATACTTTTTCCGTCATATTTGGGAATCCATTAAAAATCTTAAACGCAACTTTTGGATGACATTTGCTTCAGTTAGTATGGTGGCTGTTACATTGACTTTAGTTGGTGTTTTTGCGGCGACATTGTTGAATATACAGCGTGTTGCTTTGGGTGTTGAAAATAATGTCCATATCAATACTTACTTACAAGTTGATTCAACTGATGCTGCAAAAGTTATTCAAAATACTGCCGGTGAACCTGTTAATAACGATAACTACCACAGTGTTTACGACAAAATTGCTCAGATAAAAGGTGTCAAAAAGATTACATTTTCTAGCAAGGATGAACAATTGAAAAAATTGCAAGAAACCTTAGGTGATGTTTGGAATATGTATGACCAAGACACTAATCCGCTCCAAGATATCTATCTTATTGAGACCCAGACGCCTAAACAAGTTAAGGCGATCACTAAAAAGATCAGAACGATTGAAGGCGTAGAAGCCGCAGATTATGGAGGGATTAACTCCGATAAACTATTTAAGTTTTCAACATTAATTCAAACTTGGGGGCTGATCGGAACAGCAATGCTATTATTTGTAGCTGTCTTTCTCATTTCAAACACTATTCGTATGACTATTATGTCTCGTAAACGCGACATTGAAATTATGCGGTTAGTTGGTGCTAAAAATTCTTATATTCGAGGGCCTTTCTTTTTTGAAGGGGCTTGGGTTGGCTTGTTAGGAGCTGTTTTACCATCTCTTCTGATTTATTATGGATATGATCTTGTTTATAAGCATTTTGCACAAGAATTACAACGTAATAATCTCTCGATGTATCCGCTTGATCCTTATGTATATTACCTGATTGGTGCTTTGTTTGTCATAGGTATTATGATTGGTTCGCTTGGTTCAGTGCTTTCTATGAGACGTTATTTAAAATTCTAAAAAAAGCGCTGCTGACGAAACGTAGCGACCCTCAAAAGTTGGACCTCTTATGTTATTCCAAGGACCTCGTTTTGTATTGCACAGGACTGGTCCTTTTCATTTTGTTTTGATTCATTTGTTTATTTGTAATAGGCAATACAGTTTAAAATAGCAGTTTCTAAGGTTTCAAGAGAAGAAAAGCACCCCAAAAGTTAGATGTTTGATGTATCTAACTTTTGGGGTGTCATTCAAAATTTAGTGGCTCTTTTTTAGTAAAATACTATGATTTCAGTTTTAGGATAACCTCAAACAGTATCTAAAATAGCTATGTCAATGAAAAAAGGGGTTAGCATTTTTTTCGTGACAAATGGTAGTAGAAGGACCATGCCCAGGATAAACTCGGTAATGATTAGGTAAGGTGAATAGTTCTTGGCGAATACCAGTAATGAGGTCCTCAAAGTTACTGGTAGGTAAGTCAGTACGACCGATAGTTTCACGAAATAGAGCATCGCCAGTAACGACTAATTCATCTGAGTGGAAAACAAATGAGACTCCTCCCCAAGAATGACCAGGTGTTGGTAAAACTGTGAATTCAAAACCATTTAGTTGATAGGGTTGCTTTAATTTAAAAAAGTTCTCTGCCGGTCTTGCTATAACAGTAATGATATCATCATGACGGCCTAAGCCAGATAAATTATCATCTGGGGAAGATAGCCAAGCGGCTTCTTTTTCTGAAACATAAACAGGTGGATGATCAAAAGCATCTCTGACCAAATCTAAACTAAAAATATGATCATAGTGAGTATGCGTTAAGAGGATAGCCACTAAAGGTTTTTCAAAGGATTTAATTTTAGCAATGATTTCTTGGCCGTTACTTCCTGGATCAATGAGGATAACAGCTTGATCATTAACGAGGTAATAAGTATTTTCACCAGCAATGTGGTTTATTGTTTTATAGATTTTCATAAGGATAGTGTACCAAAAAATCAAGGCTTTGTTAAAAAAAGAGTGGCGGAAAATAAATGACAATTAGTTTCAGAAAATATGAGATCTCACAGCAATTTCTTGACACCGTTTTCATAAAGGTGTATCATA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82 | Temperate_phage(43.86%) | integrase,terminase,tail,tRNA,holin,capsid,portal | attL 541212:541229|attR 612722:612739 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
673697 : 684301
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LS483352|673697:684301|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LS483352|673697:684301|682483_682924_-|WP_014407485.1|DBSCAN-SWA MSSRYSRQQKPRKSGGVPTEHIKTGFTAFQKSIALIGSILSIIVATITITRALQPVPDKTSNDTPKESSNTIVKIIEKESSQGNQNHTGTSETTDDNKTTLPSSSTTPSHNETTPTAPETPSATEGTQLPNATGAEDANTGLPTNS >NZ_LS483352|673697:684301|677955_679122_+|WP_002990262.1|DBSCAN-SWA MRYLTAGESHGPSLTAIIEGIPAGLTLHPADIDHELQRRQGGYGRGARMSIETDRVQISSGVRHGKTTGAPITLTVINKDHQKWLDVMAVGDIEETLKLKRRVKHPRPGHADLVGGIKYHFNDLRDALERSSARETTMRVAVGAVAKRILAELGIDMLHHILIFGGITITIPSKLSFRELQERALHSELSIVNPKQEEEIKTYIDKIKKEGDTIGGIIETIVQGVPAGLGSYVQWDKKLDAKLAQAVLSINAFKGVEFGVGFDMGFQKGSQVMDEITWTPTQGYGRQTNHLGGFEGGMTTGQPLVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDIDSHEPYKATVERSDPTALPAAGVIMENVVATVLAKEILETFSSTTMSELQKAFSDYRAYVKQF >NZ_LS483352|673697:684301|676015_677179_+|WP_023609837.1|DBSCAN-SWA MNKLYIDSFVEKKLTAGVQLLDEKDFSNIKEKNQLVQLVTKSNRPIGTAYISKQNKGIGWYLGPEKIDLSISYFVSLFSVAKVKRQDFAQSDETNAYRLFNQEGDGFGGVTIDLYKDFAVFSWYNAFVYDKKEMIMEAFQQVFPEVKGAYEKCRFKGPDTETAHLYGELAQETFSILENGIAYQVFLNEGLMTGIFLDQHDVRRALVDGLAMGKSLLNLFSYTAAFSVAAAMGGAIETTSVDLAKRSRELSLAHFEHNQLNLASHHFVVMDVFEYFKYAKRKKLIFDVIVIDPPSFARNKKQTFSVSRDYHKLITEALDILSPKGTIIASTNAANMTVSQFKKQIIKGFGSRRPESMTLQQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIKVRE >NZ_LS483352|673697:684301|679744_681097_+|WP_002992646.1|DBSCAN-SWA MVIPYDYIVIGGGSAGIASANRAAMHGAKVLLAEGKEIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVADILGTYAKDYGFDFKEKAFDFKQLKANRQAYIDRIHASYERGFEQNGVDRIYDYAVFKDAHTVEIAGQLYTAPHILIATGGHPVFPDIEGAQYGISSDGFFALDEVPKRTAVVGAGYIAVELAGVLHALGSKTDLFIRHDRPLRSFDKAIVDVLVEEMAVGGPCLHPHSEVAKVVKNTDESLTLYLKDGQEVEVDQLIWAIGRKPNLEGFGLDKTGVTLNDKGYIETDAYENTSVKGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLSERLFNNKTDEKLDYQNVATVIFSHPVIGSVGLSEEAAVKKYGQEAVKTYQSRFTSMFTAITNHRQPCLMKLVTVGDTEKIVGLHGIGYGVDEMIQGFAVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGSEEFVTMR >NZ_LS483352|673697:684301|673697_675908_-|WP_050580611.1|DBSCAN-SWA MTSLGKNDKEVATVKKFKTLITGFINTRLGFIITLLFCYWIKTLWAYHTDFSLDLGNIYQVFLTIINPIPLAFLLLGVALYVKNTRAFYICSWVVYIILNILLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIIYILDFIILISLSITKKIKNDQRPFNKRAAFAITALSSLLLSINLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFTLYSGNQTYQAQKERNGATAEELIDVKTYVKGHYAAPDPQYFGIGKGKNIIVLHLESFQQFLIDYKLKEGDKEYEVTPFINSLYHSNATLAFPNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQKGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYNYFFDSSYFSKQNSKNSFQYGLNDKYMFKDSIKYLEQMQQPFYTKFITVSNHYPYTSLKGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDAALKSFFDYLKATGLYENSIFVLYGDHYGISNSRNSSLAPLLGKDSETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGSIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSQFIQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYMTPEYTNYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTIAKTKEIRSAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTQNGLKAIDPSQFIYTKQLKQLKDISAKLGSESTSLYSKNGHKSTQKLFKAPSYLELNPVEADAATSELKEDNPKNKE >NZ_LS483352|673697:684301|677175_677862_+|WP_002985140.1|DBSCAN-SWA MRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLDHVSGPGQVTLNDMKRIIEVLEMDISN >NZ_LS483352|673697:684301|679182_679524_+|WP_002992643.1|DBSCAN-SWA MSQEIYDYANQLERAVRALPEYQKVLEVKEAVQADASASQLFDEFVAMQEKIQGMMQSGQMPTAEEQTSIQELSQKIEANDQLKAYFEAQQALSVYMSDIERIVFAPLKDLVK >NZ_LS483352|673697:684301|681176_682454_-|WP_002992648.1|DBSCAN-SWA MTTYDSISWIHTFKANGRKTDLARMAWLLEALGRPQDKFPAIHVVGTNGKGSVTAYLQHILSTSGYQVGTFTSPFIISFHDRICLNGQPISDLELAQCVSVIRPILTKMSLETNWDRPTEFELVTLIMFCYFANLKPVDIAIIEAGIGGKTDATNVFHALAVVCPSISFDHQERLGYSLAEIAHQKAEVIKAKEPVIIGQLEQEASQVFQQVTQKAGSRLYQLGKDFLLNPSEKTFSFQHDNLNLTKLRLKLLGQHQKANACLAIMTAQLLRKSFPKISPKTIQKGIEATTWPGRSEFIQPNLLLDGAHNPDSIAKLKSLLQEEFPKRPIHILFAGLKRKPLADLLAQLDTFEVSVTTFDFPEANLLEDYPDKYPQVKDYRDWLQGSVTSDELFVVTGSLYFISEVRQYCLSNANIFKNIFPLIT >NZ_LS483352|673697:684301|683158_684301_+|WP_002985123.1|DBSCAN-SWA MIYFDNAATTIPYGEALKTYQEVATKIYGNPSSLHQLGTNASRILEASRKQIAGLLGVKSEEIFFTSGGTESANWAIKGIAFEKTAFGKHIIISAIEHPAVSESVKWLLTQGFEVSYAPVTTQGVVDVNALAELIRPDTILISIMAVNNEMGAIQPIRAISNLLANQPTITFHVDAVQAIGKIPLCDYMTNRVDLASFSGHKFHSVRGVGFLYKKAGKRLNPLLSGGGQEQELRSTTENVAGIASMAKALRIVTEKQVSVLPKLTAMRDVIYKALSVYPDVTVFSAQEGFAPNILTFGIRGVRGEVIVHAFEKYEIYISTTSACSSKAGKPAGSLVAMGIPVKTAQTAVRISLDDDNDMGQVEQFLTIFKQIYDKTQKVR |
9 | Streptococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
985508 : 1064285
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LS483352|985508:1064285|DBSCAN-SWA 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88 | Streptococcus_phage(60.71%) | integrase,protease,head,terminase,tail,tRNA,holin,capsid,portal | attL 1018875:1018934|attR 1060824:1060919 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1093670 : 1153043
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LS483352|1093670:1153043|DBSCAN-SWA 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50 | Enterococcus_phage(25.0%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1177556 : 1217567
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LS483352|1177556:1217567|DBSCAN-SWA 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59 | Streptococcus_phage(68.0%) | integrase,terminase,tail,holin,capsid,portal | attL 1179761:1179780|attR 1214940:1214959 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1686145 : 1798885
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LS483352|1686145:1798885|DBSCAN-SWA 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>NZ_LS483352|1686145:1798885|1728322_1728640_+|WP_111685856.1|DBSCAN-SWA MTFKNPKHSDWFRAWQIKFYNSKPWRTLRNKVRHHKRMRCDMCGRLIHGKSIVDHIIEIDESNYQDESITLNEDNLQLLCLECHNTKTFQNKINLNLENRKISLF |
113 | Streptococcus_phage(63.93%) | integrase,protease,head,terminase,tail,tRNA,holin,capsid,portal,bacteriocin | attL 1716475:1716500|attR 1748157:1748182 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
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NZ_LS483352.1|WP_111685759.1|1021514_1022108_-|GNAT-family-N-acetyltransferase |
1021514_1022108_-
Protein sequences of NZ_LS483352.1|WP_111685759.1|1021514_1022108_-|GNAT-family-N-acetyltransferase>NZ_LS483352.1|WP_111685759.1|1021514_1022108_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNYRTISLDEIMKYLEKEEIQQLLKSFKGFNDGTSTPHDVEVFLHQKAVEFERSAIASTYLVFSTDSCELVGFFSLANRPLYFSKQNYQTLTKSQRKKISRSGRTLKGSGSFLMNSFLIGQLGKNYKSNTSISGKELLTLACDKVKKASKIINTKYIWLECDNNPKLIQFYQNFGFTPIDNFESENGLKVFVMKIQK |
197 aa aa |
89
gnl|BL_ORD_ID|89 information
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NA | NA | 985508-1064285 | NA |