Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483458 | Haemophilus haemolyticus strain NCTC10839 chromosome 1 | 4 crisprs | cas3,WYL,DEDDh,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,cas6,csx16,csx1,cas2,cas1 | 0 | 14 | 4 | 0 |
1. NZ_LS483458
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483458_1 | 989604-990698 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483458_1
|
15 spacers
spacers of NZ_LS483458_1
>1.1|989641|34|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT ATCAATGCGACAAGATGCCAGAAGCGGTGGCTTA >1.2|989712|34|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT TTAAACACACAGACGAAAAAAATGCTTACAACTA >1.3|989783|34|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT CGGGTTCATCTGAAAAGATTACCCGTCACGGTTA >1.4|989854|35|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT AGCCTATTAAGAAATAATCTTCCTTTTTACATTTC >1.5|989926|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT CAAGCCTGGGCGAAGATGAAAAAAGAATAATGG >1.6|989996|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT ACAAACCTGAGATTGATTGCACGACCGTGCG >1.7|990064|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT GTGATGTTACGCCTAATAAAACAGGCGTAAGAG >1.8|990134|36|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT GAAGAACACTAAGAGTTTAAAACCTAATGCGTATAT >1.9|990207|37|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT TTACAGAATAAACGGCACAAATGCCGTGATTCTAGAT >1.10|990281|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT ACTGGACCATTAATCGTTAACATGTGCTTACAA >1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT GCGGATTTATTAAAAAATGATCGCTTTTTTA >1.12|990419|35|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT ATAGAAGAACACGGCAATTATAGATCCCGTGTTAG >1.13|990491|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT AAGGCGGTAGCGGTAAAAGTACCATTTCTATTA >1.14|990561|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT CTACAAGTTTTGATGAATTTGATGCCTACAAGG >1.15|990631|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT AAAGAAAATCAGAACGTATATCGCCTATTGT >1.16|989642|34|NZ_LS483458|PILER-CR ATCAATGCGACAAGATGCCAGAAGCGGTGGCTTA >1.17|989713|34|NZ_LS483458|PILER-CR TTAAACACACAGACGAAAAAAATGCTTACAACTA >1.18|989784|34|NZ_LS483458|PILER-CR CGGGTTCATCTGAAAAGATTACCCGTCACGGTTA >1.19|989855|35|NZ_LS483458|PILER-CR AGCCTATTAAGAAATAATCTTCCTTTTTACATTTC >1.20|989927|33|NZ_LS483458|PILER-CR CAAGCCTGGGCGAAGATGAAAAAAGAATAATGG >1.21|989997|31|NZ_LS483458|PILER-CR ACAAACCTGAGATTGATTGCACGACCGTGCG >1.22|990065|33|NZ_LS483458|PILER-CR GTGATGTTACGCCTAATAAAACAGGCGTAAGAG >1.23|990135|36|NZ_LS483458|PILER-CR GAAGAACACTAAGAGTTTAAAACCTAATGCGTATAT >1.24|990208|37|NZ_LS483458|PILER-CR TTACAGAATAAACGGCACAAATGCCGTGATTCTAGAT >1.25|990282|33|NZ_LS483458|PILER-CR ACTGGACCATTAATCGTTAACATGTGCTTACAA >1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR GCGGATTTATTAAAAAATGATCGCTTTTTTA >1.27|990420|35|NZ_LS483458|PILER-CR ATAGAAGAACACGGCAATTATAGATCCCGTGTTAG >1.28|990492|33|NZ_LS483458|PILER-CR AAGGCGGTAGCGGTAAAAGTACCATTTCTATTA >1.29|990562|33|NZ_LS483458|PILER-CR CTACAAGTTTTGATGAATTTGATGCCTACAAGG >1.30|990632|31|NZ_LS483458|PILER-CR AAAGAAAATCAGAACGTATATCGCCTATTGT |
cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,cas6,csx16,csx1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483458_1
The CRISPR arrays of NZ_LS483458_1 >merge|NZ_LS483458|1|989604-990698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACATCAATGCGACAAGATGCCAGAAGCGGTGGCTTAGTCTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACTTAAACACACAGACGAAAAAAATGCTTACAACTAGTCTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACCGGGTTCATCTGAAAAGATTACCCGTCACGGTTAGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACAGCCTATTAAGAAATAATCTTCCTTTTTACATTTCGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACCAAGCCTGGGCGAAGATGAAAAAAGAATAATGGGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACACAAACCTGAGATTGATTGCACGACCGTGCGGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACGTGATGTTACGCCTAATAAAACAGGCGTAAGAGGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACGAAGAACACTAAGAGTTTAAAACCTAATGCGTATATGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACTTACAGAATAAACGGCACAAATGCCGTGATTCTAGATGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACACTGGACCATTAATCGTTAACATGTGCTTACAAGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACGCGGATTTATTAAAAAATGATCGCTTTTTTAGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACATAGAAGAACACGGCAATTATAGATCCCGTGTTAGGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACAAGGCGGTAGCGGTAAAAGTACCATTTCTATTAGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACCTACAAGTTTTGATGAATTTGATGCCTACAAGGGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACAAAGAAAATCAGAACGTATATCGCCTATTGTGTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC >NZ_LS483458|1|1|989604-990698|CRISPRCasFinder ATTTTAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC ATCAATGCGACAAGATGCCAGAAGCGGTGGCTTA GTCTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC TTAAACACACAGACGAAAAAAATGCTTACAACTA GTCTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC CGGGTTCATCTGAAAAGATTACCCGTCACGGTTA GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC AGCCTATTAAGAAATAATCTTCCTTTTTACATTTC GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC CAAGCCTGGGCGAAGATGAAAAAAGAATAATGG GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC ACAAACCTGAGATTGATTGCACGACCGTGCG GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC GTGATGTTACGCCTAATAAAACAGGCGTAAGAG GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC GAAGAACACTAAGAGTTTAAAACCTAATGCGTATAT GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC TTACAGAATAAACGGCACAAATGCCGTGATTCTAGAT GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC ACTGGACCATTAATCGTTAACATGTGCTTACAA GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC GCGGATTTATTAAAAAATGATCGCTTTTTTA GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC ATAGAAGAACACGGCAATTATAGATCCCGTGTTAG GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC AAGGCGGTAGCGGTAAAAGTACCATTTCTATTA GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC CTACAAGTTTTGATGAATTTGATGCCTACAAGG GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC AAAGAAAATCAGAACGTATATCGCCTATTGT GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC >NZ_LS483458|1|1|989604-990698|CRT ATTTTAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC ATCAATGCGACAAGATGCCAGAAGCGGTGGCTTA GTCTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC TTAAACACACAGACGAAAAAAATGCTTACAACTA GTCTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC CGGGTTCATCTGAAAAGATTACCCGTCACGGTTA GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC AGCCTATTAAGAAATAATCTTCCTTTTTACATTTC GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC CAAGCCTGGGCGAAGATGAAAAAAGAATAATGG GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC ACAAACCTGAGATTGATTGCACGACCGTGCG GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC GTGATGTTACGCCTAATAAAACAGGCGTAAGAG GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC GAAGAACACTAAGAGTTTAAAACCTAATGCGTATAT GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC TTACAGAATAAACGGCACAAATGCCGTGATTCTAGAT GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC ACTGGACCATTAATCGTTAACATGTGCTTACAA GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC GCGGATTTATTAAAAAATGATCGCTTTTTTA GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC ATAGAAGAACACGGCAATTATAGATCCCGTGTTAG GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC AAGGCGGTAGCGGTAAAAGTACCATTTCTATTA GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC CTACAAGTTTTGATGAATTTGATGCCTACAAGG GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC AAAGAAAATCAGAACGTATATCGCCTATTGT GTTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC >NZ_LS483458|1|1|989605-990698|PILER-CR TTTTAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACA TCAATGCGACAAGATGCCAGAAGCGGTGGCTTAG TCTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACT TAAACACACAGACGAAAAAAATGCTTACAACTAG TCTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACC GGGTTCATCTGAAAAGATTACCCGTCACGGTTAG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACA GCCTATTAAGAAATAATCTTCCTTTTTACATTTCG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACC AAGCCTGGGCGAAGATGAAAAAAGAATAATGGG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACA CAAACCTGAGATTGATTGCACGACCGTGCGG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACG TGATGTTACGCCTAATAAAACAGGCGTAAGAGG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACG AAGAACACTAAGAGTTTAAAACCTAATGCGTATATG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACT TACAGAATAAACGGCACAAATGCCGTGATTCTAGATG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACA CTGGACCATTAATCGTTAACATGTGCTTACAAG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACG CGGATTTATTAAAAAATGATCGCTTTTTTAG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACA TAGAAGAACACGGCAATTATAGATCCCGTGTTAGG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACA AGGCGGTAGCGGTAAAAGTACCATTTCTATTAG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACC TACAAGTTTTGATGAATTTGATGCCTACAAGGG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGACA AAGAAAATCAGAACGTATATCGCCTATTGTG TTTCAATCCCTTTGGAACAGGGCAATGTCTTTCGAC
>NZ_LS483458.1|WP_111696514.1|988643_989504_-|acyl-CoA-thioesterase-II MSDILNNLIHLLKLEKIDDLIFRGESQDLGFRQVFGGQVVAQALSATMQVAPEDRILHSCHAYFLAPGDSQYPIIYDVETLREGRNFSALRVKAIQHKNTICHVTASFQVPEKGFEHQNTMQNVGTPEDFTDENMMLQKVAQALPEPLNEKFAAERPFEVRTKYLNNPFNGTKLPAEQYSWFKTNGETPLDIKIQQCLLAYFSDFHCILTALHPHEKGFLQKGMKVATIDHSIWFHRPFDLNHWHLHAIESNNAFGGRGLARGQIFSQDGQLIATTQQEGLIRFNE >NZ_LS483458.1|WP_111696513.1|987766_988633_-|ferritin-like-domain-containing-protein MTALITQFWQQVETALKTANPQEKCSLVNDLYDNLLPQIQLIKLEDFPEVVPQDNIAAFPEKPLLVAPKDVPKRSFATEEGYTATLHAIAHIEFNAINLGLDAAWRFGRNAQEELGEGLAFVKDWLRVAREESTHFSLINEHLKTLGYQYGDFEAHAGLWEMAQATAHDIWERMALVPRVLEARGLDATPVLQEKIAQRKDFAAVNILDIILRDEIGHVYIGNHWYHTLSKKRGLDAMKCFTELLHKYRIVIFKGVINTDARIQAGFTQHELDWIYEVEQTLKSYIKK >NZ_LS483458.1|WP_111696512.1|986311_987691_+|cysteine--tRNA-ligase MLKIFNTLTREKEIFKPIHENKVGMYVCGVTVYDLCHIGHGRTFVCFDVIARYLRSLGYDLTYVRNITDVDDKIIKRALENKETCDQLVDRMVQEMYKDFDALNVLRPDFEPRATHHIPEIIEIVEKLIKRGHAYVADNGDVMFDVESFKEYGKLSRQDLEQLQAGARIEINEIKKNPMDFVLWKMSKENEPSWSSPWGAGRPGWHIECSAMNCKQLGEHFDIHGGGSDLMFPHHENEIAQSCCAHGGQYVNYWIHSGMIMVDKEKMSKSLGNFFTIRDVLNHYNAEAVRYFLLTAHYRSQLNYSEENLNLAQGALERLYTALRGTDQSAVAFGGENFVATFREAMDDDFNTPNALSVLFEMAREINKLKTEDVEKANGLAARLRELGAILGLLQQEPEKFLQAGSNDDEVAKIEALIKQRNEARAAKDWSAADAARNELTAMGIVLEDGANGTTWRKQ >NZ_LS483458.1|WP_005634038.1|985699_986209_-|peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase MVTLHTNFGDIKIKLDFDKAPVTAENFLNYCKDGFYNNTIFHRVIDGFMIQGGGMESGMREKATKAPIQNEANNRLSNKRGTIAMARTSDPHSATAQFFINVADNDFLNYRSKEMFGREVVQEWGYAVFGEVVEGMDVVDKIKKVKTGNKGFHQDVPTEDVVITSVSVE >NZ_LS483458.1|WP_111696511.1|984856_985645_-|TatD-family-hydrolase MPFFDTHTHLDYLQQFTGEPLSQLVDNAKQADVQKILIVAVKEADFKIIKNMTALFPNNLCYGLGLHPLYIKEHAENDLILLEQALKNRDANCTAVAEIGLERAIPDLLTDELWAKQCHFFESQLYLAKQFNLPVNIHSRKTHDQIFTFLKRIPLSKLGVVHGFSGSYDQAKRFVDLGYKIGIGGTITYERANKTRQAIAKLPLDALVLETDSPDMPVFGFQGQPNRPERIVESFKALCALRNEPAELIKKVTWENACQIFS >NZ_LS483458.1|WP_111696510.1|983617_984745_-|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MSQIYTQVRKLAEQFIEPYADELDQKKEFPVQAFKELGKAGWFSLLIPKEYGGMGLTLKEHAEVCMALAESSASAGLCYMMSNVAVNCLNLFGSNQLKQKIFSDIVQNQTFAALAYSELGTGTHFYITDATAQFNAEHAVFNGLKSMVTSGNYASYYLALLPSENGETIDNWVLPLGTQGLTFEADSWNGLGMRSNVSCFMRMTDMPLDRSWRIGEVGAGAEQVFGGIAPAFICGLAAVYSGVCKAVLTEAIKHSTHRKYTSGTALAEIETVQIHLAKIYANTNAAVCATRDAARAATEGDADALAKLLAARILASENAITLAQIGMRIGGGKAYNKMGPMERYLRDALASQVMAPSVDVLNIWLGKAITGQQIP >NZ_LS483458.1|WP_111696509.1|982797_983604_-|PhnD/SsuA/transferrin-family-substrate-binding-protein MSEKLKIGAVIYAPQVTVIWDIIADFFEKEGFPIEPVYFKDYKGQVDALLNNEIDVAWNSPLAWLDGYLRSGGKTLNGAMRDTDQDRQSYLVVNDPTIQSIEDLKNKTIAFGAIDSPQARLIPIEFLHQHGLEFGQDYVEKRFDVGVGLHGDHVGGELDAANALKDRQVAATWMLDFNFERWTKDGTLDPATVQVLAKTPSFDHCIFSGRVGLDETKFNAFTETLFKMDYNNPEHKEMMDLEGLKRWVEGRTKGFAQLQAANEYLKFF >NZ_LS483458.1|WP_111696508.1|981565_982744_-|cobalamin-independent-methionine-synthase-II-family-protein MKPFTTSLLGSMPRSQALLMARKKHALGKITTAELEQIVVQETKQIVELQQRTGIDIITSGELLRDNYLSFIAQKIQGATLMSMSEMLDHIKEKQIFESMLETLDVPALSIKNAICVGKISYKQSLVADEMLLLKNLTKQPIKATLPGPYLMARSMWLSPVSGQHYSSKEEMAKDVVTILKQEIDHLCELGVSVVQFDEPVLTEVIFSHHQTRSFMCAALSEKQDFAAELQFAKSLITQIFEYARNKNIKTALHVCRGNWSKDERVLLRGPYTSLVDLFESALPDILMLEFSTPRAGELSSLLESEILRQKCILGLGVINPRSDEVETVEQIVQRAEKALNYLPPEQIWLNPDCGFATFSNRPLNGFDIIEAKLKVLNEAKSILRERYVSRT >NZ_LS483458.1|WP_111696507.1|981117_981582_-|peroxiredoxin MYHVPESECFTAKYRAVLRGEEIKLFTPNDSISLYSQVNFDNQSLQKSAVDYFAVSILGGILSSIKAHFAQQRADIVEMEGKIWLNLANPLTLLGVRGYSEQPVINDGKIKIFISSDLTDDIFTQLTQNALRCCFIYNTITKAFPLNIEFEQVL >NZ_LS483458.1|WP_005627940.1|980693_981017_+|thioredoxin MSEVLHINDADFESVVVNSDIPVLLDFWAPWCGPCKMIAPVLDELAPEFAGKVKIVKMNVDDNQATPAQFGVRSIPTLLLIKNGQVVATQVGALPKTQLANFINQHI >NZ_LS483458.1|WP_111696516.1|992388_994638_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MSEHTISLAFSVWHHYLKQLAEKHHLSLPNFPIQTVDISHFLQKAEEIVLGKQPDTQEPPEKLASLFESINRQLEKPEYFYEFKPLSPKAIFPKLLKKEEKTPALSELLTDFVKAVNNIPHSHRDNTALWLDHFDTAMQCFTCNLPSPYSNEISFYDFTKAVAAFAVALADEKADKENPFLLIQGDFFGIQDFIFSGGSESNKGAAKILRGRSFQVSLFTELAALKILNACKLPTTSQMMNAAGKFLIVAPNTEEVKNAINQVQTELNQWFIKETYGLIGLGIAVQPAKSSEFEQANYEKLVKKLFENLEEQKLKRLDLTEISQNVLDVDYSNGICEMNSFFPSQKKEDCPTIDGKKVNYSVISEDQINIGKWLSKKDRIIITDNESKIHGDSDTKILKLPIFGFNVIFTKKEEETGKFGLHVDRIHRFWDFSLPKDTKDTKDTKDTKDTKDTKDTNAQIWNGYARRYINAYVPFDEKGEIVTFEDIQTKDEGQKALMTLKGDVDNLGTIFQKGIQPANIAKMAALSRQMNLFFSLWLPAYCAKNNPNMYTVFAGGDDFFLIGPWYSTQEVAYKMQQKFAQYVAENPEIHFSVGMVMSKSGIPVPRLGDLAEEALEKSKGIDKGEEVSTAEGKNAVTIFNRSVKWVDWKQLCDLEEEIHRLADTYKISTSYLYSLIRLCEQAEDENNIESAMWRSRFYYRTARYVTDKLPKENRNKALSEMSISLGDKGIGTYKLNFAIPLTNYFYQKR >NZ_LS483458.1|WP_111696517.1|994647_995115_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MFNYEDIDLNDDNNLIIFSKIAEDAAKHIYYENNKLAKSNKSTQIRKFYDELCMWENKVNSVNLNSINKEEKEQKRKDSFQQYAPFIYMMKAKVAYSQARKSGGATLVNENFSKVFNQCIDQIKDHKTLRRAKLFMEAVIGFYKLEESKKGKQND >NZ_LS483458.1|WP_111696518.1|995107_995809_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MTKLNNILEIKAKLELQTGLHIGAGDSEMHIGGIDNSVIKHPITQSPYIPGSSLKGKIRTLLEWRSGEVKKAPLSLDDLKEAKNKEDVKNILRLFGISGDVKNTDDIVKEIGVSRLAFWDCALDVDWEKAIRDDNQLLTEAKSENTIDRITSTAGNPRQTERVPAGAKFDFKLMLRQFEGDKPELLDLVLKGLKLLELDSLGGSGSRGYGKVKFIELTVDGKTRNLDDIKPFE >NZ_LS483458.1|WP_111696519.1|995818_996802_+|CRISPR-associated-protein-Csm4 MKLYRFIVTPQSAMGTPLVGDTLFGQLCWAVRNRFGEARLTALLEGYTEQRPFMVVSDAFPQDFFPLPSLPSRFWKKLEHDRKQLKKAQFIKIDDAQKNNVISWQEYALSEYLKLQEKIKNDKTAEEKKKWGKTTQDQFHNTIDRQTNTTGEGQFAPYSTELTWFGTAQKFDLYIVLDEVRFSLEELQQVLNDVGSFGFGRDASIGLGKFQCINPQAVNFLQQNANCYLTLANCAPQNLGLNKEYCYYQITTRFGRHGDIQALSSNPFKKPIILAKTAAIFTPEKYEPRLFLGNGLNGISYAQPNAVHQGYAPVLNLFVDFKYKDDK >NZ_LS483458.1|WP_111696520.1|996798_998349_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MKKFMQTHKVYLTPLSPIHIGCGEDFEPTNYVIKDNKLYSFEASKLGLSEPQRARLMRILKEVDSNSLQDVQIFFSESDVIELAIENSYLTTSVSTEIANEWKNKLGKTAQIKGNGQKEFNALEIERNSYIPYSYFPYIPGSSVKGAIITAVLDNKNHQDENTYTTPNYKNKSNYNLEASKLNASLVKFYIGDIDSIDKSNEKIFSQRLKFSDFIPLSKDQELSRVMYALNIKKRMGKNKKILTGIKVRRECIQPMKYKAFYSSLTILNENHKDKIEINQLIKILNEYNFPILEKEYQILLDNKVCNNVNYIENIKVLLESGNLALIRLGRSGSEAKMYSNHELRGILVNNEQAKESNTLWIASDSTDESSVMQPFGWAIIEFSDNEEDNTLLQKWCENGKISLRSYQKNLETEQKAKEEQQAKEQALNALPKNHRKVIELKDKFNSSNEKQIDSSSALLKEVKSLIESEAINWSKEDKQFMAHHITKELITKRVELKKKNADKDLNKLLNKLVVE >NZ_LS483458.1|WP_111696521.1|998348_999269_+|CRISPR-system-precrRNA-processing-endoribonuclease-RAMP-protein-Cas6 MLSSLPIVRYQFTLTVTEPIQLPEYAGSTLRGAFGRALRKIACMTKQTECKGCPLYRTCPYTNIFETPAPTEHELQKFSQVPNGYMIEPADWGEKVYISDEKLQFSLVLFGRLIEQLPLIAFAFKRAFEYNVGRGKAHLLDISVFNESAEKFEPVLVNGNIIEHNKAVVIPENFANNSVIEISTPLRLQENGKPLNEKEINVERFFISLAKRIALLSEFHFKPFDLDFESLKNQIVLIEDKKYLKWQDWTRYSSRQDQKMKLGGVVGKWQFKNLSPELSKLLYIGQWLHCGKNATFGLGKYKITNL >NZ_LS483458.1|WP_111696522.1|999326_999617_+|CRISPR-associated-protein-Csx16 MTTWFISRHLGAIEWIKKQNIQIDHFESHLDTSLIQADDVVIGTLPIHLAAEICQKGAKFYFLSVNVSRGQRGTELTCEQLTEQQCSIQPFWIEKL >NZ_LS483458.1|WP_111696523.1|999626_1000769_+|DUF1887-family-protein MPKYDIHVCLVSAQAAPNLLPILDNEFKPKKAVFVVSTKNEIKEKANALQQVFKQNRVDVEILELSNEFDFQSMEAELFDLLSKYEKEDIALNVTGGTKLMAIAAQNVFSGEKPIFYINTDKEEIIFISKENDQYIPSLKLHTKTLINTYLSSYNVSILKNKDDFNFHKLGVFTERFAMKPANYKYIISQLNSLSLNADNKNLEANFSDYSYDLKLILEDLSDAGLIEIKGDIVDFKNEATRSFLNGNWLEYFTYKQASSIPDVIDVDWNVEVVNSKYEKNKIGVNNELDVVFMARNKCHIIECKTVNFENEENKAKLQGYLDKLKSLKDYAGSLTKVCLVSFYPIPDTTKSRAEKDNIEIIDDYRIKNLKERIQNWILK >NZ_LS483458.1|WP_111696524.1|1000768_1001977_+|TIGR02584-family-CRISPR-associated-protein MNTYNKRILLSVTGMSPAVVTETLYALVTEKGFIPTEIQVITTVQGKNKLLDVLLGIEGGRKKSKGALQEFIEDYGEKYGFSSIRFDESCVHIIEDASGQNLPDIRTPEENEQAANSIVQLVGKLCQDEESQLHVSIAGGRKTMGFFMGYALSLYGREQDSLSHVLVDAQYENLPSFYYPKPYSYLINNRDGKEIDTKDSKVMLAEIPWVRLGLGVPEDLKQQTISYSDSVKNAQLLLDKPQIKFFIRERKGLSEIINKKVSFGTLEIDIPPKGIALLLSILYARKHNFEISTNYRKESIYTFLTIYSALGKDNEEIEKRFTFYEKANLTEGDKFIKNNEAFDDVFSEAAYQYNKKIRSAFSIGKNAHCDYLISKSGIYDIPIESANFIIDDIKDFLKFNVE >NZ_LS483458.1|WP_065246905.1|1002559_1002844_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MQTTRHKYLIAYDIADQKRLHQAHKKVEAFAIGGQKSFYECWLTEHEMSKFKSEVNNLIEPFDDRVFIFRVPDNVEPMLFGKAELQSISPFMLV |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483458_2 | 1004412-1005362 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483458_2
|
13 spacers
spacers of NZ_LS483458_2
>2.1|1004449|33|NZ_LS483458|PILER-CR AATTTTGTTGATTAAACTTAACATTTTTCATTT >2.2|1004519|35|NZ_LS483458|PILER-CR ATAAGCTGAAGAAGTCATCTGTTACGAATACACGT >2.3|1004591|35|NZ_LS483458|PILER-CR CGGTTGTTTCTTAACATACTTTTGATGATAAATGC >2.4|1004663|33|NZ_LS483458|PILER-CR TTCGAAGCATGTACCAATAGCTCTTTTGGTAAT >2.5|1004733|34|NZ_LS483458|PILER-CR TCAGCAGCTACTTTGAATTGGCTATCTAAACCAA >2.6|1004804|32|NZ_LS483458|PILER-CR ACCTGCATCAAATACTTTGTAACCCTGTAAAT >2.7|1004873|34|NZ_LS483458|PILER-CR TTTTTATCTGGATGGTATTTGATAGCCATTTTTT >2.8|1004944|35|NZ_LS483458|PILER-CR TTACGGTAACCACGTTCAATAGTTTGGCTCATGTT >2.9|1005016|35|NZ_LS483458|PILER-CR TGCATAGACGCATTGCAATGACGAGAAATATCAAA >2.10|1005088|34|NZ_LS483458|PILER-CR TTAAGACCAAGAACATAGTTAGCTTGTGTGGTTA >2.11|1005159|32|NZ_LS483458|PILER-CR TCCATATAACCACAATCAATATAACGCTGATA >2.12|1005228|35|NZ_LS483458|PILER-CR ACGTTGAACAATTGGCTTGAATTCCTCATAAAACT >2.13|1004448|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder AATTTTGTTGATTAAACTTAACATTTTTCATTT >2.14|1004517|35|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder ATAAGCTGAAGAAGTCATCTGTTACGAATACACGT >2.15|1004588|35|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder CGGTTGTTTCTTAACATACTTTTGATGATAAATGC >2.16|1004659|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder TTCGAAGCATGTACCAATAGCTCTTTTGGTAAT >2.17|1004728|34|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder TCAGCAGCTACTTTGAATTGGCTATCTAAACCAA >2.18|1004798|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder ACCTGCATCAAATACTTTGTAACCCTGTAAATG >2.19|1004867|35|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder TTTTTATCTGGATGGTATTTGATAGCCATTTTTTG >2.20|1004938|36|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder TTACGGTAACCACGTTCAATAGTTTGGCTCATGTTG >2.21|1005010|36|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder TGCATAGACGCATTGCAATGACGAGAAATATCAAAG >2.22|1005082|35|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder TTAAGACCAAGAACATAGTTAGCTTGTGTGGTTAG >2.23|1005153|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder TCCATATAACCACAATCAATATAACGCTGATAG >2.24|1005222|36|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder ACGTTGAACAATTGGCTTGAATTCCTCATAAAACTG >2.25|1004448|37|NZ_LS483458|CRT AATTTTGTTGATTAAACTTAACATTTTTCATTTGTCG >2.26|1004517|39|NZ_LS483458|CRT ATAAGCTGAAGAAGTCATCTGTTACGAATACACGTGTCG >2.27|1004588|39|NZ_LS483458|CRT CGGTTGTTTCTTAACATACTTTTGATGATAAATGCGTCG >2.28|1004659|37|NZ_LS483458|CRT TTCGAAGCATGTACCAATAGCTCTTTTGGTAATGTCG >2.29|1004728|38|NZ_LS483458|CRT TCAGCAGCTACTTTGAATTGGCTATCTAAACCAAGTCG >2.30|1004798|37|NZ_LS483458|CRT ACCTGCATCAAATACTTTGTAACCCTGTAAATGTCGA >2.31|1004867|39|NZ_LS483458|CRT TTTTTATCTGGATGGTATTTGATAGCCATTTTTTGTCGA >2.32|1004938|40|NZ_LS483458|CRT TTACGGTAACCACGTTCAATAGTTTGGCTCATGTTGTCGA >2.33|1005010|40|NZ_LS483458|CRT TGCATAGACGCATTGCAATGACGAGAAATATCAAAGTCGA >2.34|1005082|39|NZ_LS483458|CRT TTAAGACCAAGAACATAGTTAGCTTGTGTGGTTAGTCGA >2.35|1005153|37|NZ_LS483458|CRT TCCATATAACCACAATCAATATAACGCTGATAGTCGA >2.36|1005222|40|NZ_LS483458|CRT ACGTTGAACAATTGGCTTGAATTCCTCATAAAACTGTCGA >2.37|1005294|37|NZ_LS483458|CRT ATTTTATAGTTCACTTTATCCTTAACCATTAAGTCGA |
cas2,cas1,csx1,csx16,cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483458_2
The CRISPR arrays of NZ_LS483458_2 >merge|NZ_LS483458|2|1004412-1005362|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACAATTTTGTTGATTAAACTTAACATTTTTCATTTGTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACATAAGCTGAAGAAGTCATCTGTTACGAATACACGTGTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACCGGTTGTTTCTTAACATACTTTTGATGATAAATGCGTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTTCGAAGCATGTACCAATAGCTCTTTTGGTAATGTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTCAGCAGCTACTTTGAATTGGCTATCTAAACCAAGTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACACCTGCATCAAATACTTTGTAACCCTGTAAATGTCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTTTTTATCTGGATGGTATTTGATAGCCATTTTTTGTCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTTACGGTAACCACGTTCAATAGTTTGGCTCATGTTGTCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTGCATAGACGCATTGCAATGACGAGAAATATCAAAGTCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTTAAGACCAAGAACATAGTTAGCTTGTGTGGTTAGTCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTCCATATAACCACAATCAATATAACGCTGATAGTCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACACGTTGAACAATTGGCTTGAATTCCTCATAAAACTGTCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACATTTTATAGTTCACTTTATCCTTAACCATTAAGTCGAAAGACATTGCCCTGTTCGAAAGGGATTGTGAG >NZ_LS483458|2|2|1004412-1005293|PILER-CR GTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACA ATTTTGTTGATTAAACTTAACATTTTTCATTTG TCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACAT AAGCTGAAGAAGTCATCTGTTACGAATACACGTGT CGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACCGG TTGTTTCTTAACATACTTTTGATGATAAATGCGTC GAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTTCG AAGCATGTACCAATAGCTCTTTTGGTAATGTCG AAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTCAGC AGCTACTTTGAATTGGCTATCTAAACCAAGTCGA AAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACACCTGC ATCAAATACTTTGTAACCCTGTAAATGTCGAA AGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTTTTTA TCTGGATGGTATTTGATAGCCATTTTTTGTCGAA AGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTTACGG TAACCACGTTCAATAGTTTGGCTCATGTTGTCGAA AGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTGCATA GACGCATTGCAATGACGAGAAATATCAAAGTCGAA AGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTTAAGA CCAAGAACATAGTTAGCTTGTGTGGTTAGTCGAA AGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACTCCATA TAACCACAATCAATATAACGCTGATAGTCGAA AGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGACACGTTG AACAATTGGCTTGAATTCCTCATAAAACTGTCGAA AGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC >NZ_LS483458|2|2|1004412-1005293|CRISPRCasFinder GTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC AATTTTGTTGATTAAACTTAACATTTTTCATTT GTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC ATAAGCTGAAGAAGTCATCTGTTACGAATACACGT GTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC CGGTTGTTTCTTAACATACTTTTGATGATAAATGC GTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TTCGAAGCATGTACCAATAGCTCTTTTGGTAAT GTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TCAGCAGCTACTTTGAATTGGCTATCTAAACCAA GTCGAAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC ACCTGCATCAAATACTTTGTAACCCTGTAAATG TCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TTTTTATCTGGATGGTATTTGATAGCCATTTTTTG TCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TTACGGTAACCACGTTCAATAGTTTGGCTCATGTTG TCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TGCATAGACGCATTGCAATGACGAGAAATATCAAAG TCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TTAAGACCAAGAACATAGTTAGCTTGTGTGGTTAG TCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TCCATATAACCACAATCAATATAACGCTGATAG TCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC ACGTTGAACAATTGGCTTGAATTCCTCATAAAACTG TCGAAAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC >NZ_LS483458|2|2|1004416-1005362|CRT AAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC AATTTTGTTGATTAAACTTAACATTTTTCATTTGTCG AAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC ATAAGCTGAAGAAGTCATCTGTTACGAATACACGTGTCG AAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC CGGTTGTTTCTTAACATACTTTTGATGATAAATGCGTCG AAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TTCGAAGCATGTACCAATAGCTCTTTTGGTAATGTCG AAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TCAGCAGCTACTTTGAATTGGCTATCTAAACCAAGTCG AAAGACATGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC ACCTGCATCAAATACTTTGTAACCCTGTAAATGTCGA AAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TTTTTATCTGGATGGTATTTGATAGCCATTTTTTGTCGA AAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TTACGGTAACCACGTTCAATAGTTTGGCTCATGTTGTCGA AAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TGCATAGACGCATTGCAATGACGAGAAATATCAAAGTCGA AAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TTAAGACCAAGAACATAGTTAGCTTGTGTGGTTAGTCGA AAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC TCCATATAACCACAATCAATATAACGCTGATAGTCGA AAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC ACGTTGAACAATTGGCTTGAATTCCTCATAAAACTGTCGA AAGACATTGCCCTGTTCCAAAGGGATTGAGAC ATTTTATAGTTCACTTTATCCTTAACCATTAAGTCGA AAGACATTGCCCTGTTCGAAAGGGATTGTGAG
>NZ_LS483458.1|WP_046942426.1|1003932_1004223_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MAQYLIGYDIADPKRLQRIYRRMTNYATPIQYSVFILDGTEKLLKQCLAEVMLIFHKKEDDLRVYPLPANAAQWRLGKSSLPDGIYWTALPTALTL >NZ_LS483458.1|WP_111696525.1|1002852_1003923_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSSLYIDRKGTEIKLSGEALVCYENGERVGTIPLAPIERIYLKSDVTVQASLLAKLGERGIGIIFLSGRKNIPTLFLSQPHNDAFRRINQYELAKNEVFCLAFAKKLMLLKLVTQKTWLWQASNARPDKKSQLTEKATELDGLIHKIQEQTNLASLRGIEGKSAAVYFTALSIYLPLALRFQGRNRRPPRDPFNAVLSLTYTLIHSEAVLAVYGAGLDPYIGFYHALDFGRESLACDLIEPLRPLIDNWCLGLFRQEVLREEHFSSTQEGCFLGKTGRVQFYKAYESAVGNWRKMLTENSIDVVSLIKQADFISSPQRRESQVQQFSGLYEKQWQQLLEQYYFNQQSMLQDIEFKF >NZ_LS483458.1|WP_065246905.1|1002559_1002844_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MQTTRHKYLIAYDIADQKRLHQAHKKVEAFAIGGQKSFYECWLTEHEMSKFKSEVNNLIEPFDDRVFIFRVPDNVEPMLFGKAELQSISPFMLV >NZ_LS483458.1|WP_111696524.1|1000768_1001977_+|TIGR02584-family-CRISPR-associated-protein MNTYNKRILLSVTGMSPAVVTETLYALVTEKGFIPTEIQVITTVQGKNKLLDVLLGIEGGRKKSKGALQEFIEDYGEKYGFSSIRFDESCVHIIEDASGQNLPDIRTPEENEQAANSIVQLVGKLCQDEESQLHVSIAGGRKTMGFFMGYALSLYGREQDSLSHVLVDAQYENLPSFYYPKPYSYLINNRDGKEIDTKDSKVMLAEIPWVRLGLGVPEDLKQQTISYSDSVKNAQLLLDKPQIKFFIRERKGLSEIINKKVSFGTLEIDIPPKGIALLLSILYARKHNFEISTNYRKESIYTFLTIYSALGKDNEEIEKRFTFYEKANLTEGDKFIKNNEAFDDVFSEAAYQYNKKIRSAFSIGKNAHCDYLISKSGIYDIPIESANFIIDDIKDFLKFNVE >NZ_LS483458.1|WP_111696523.1|999626_1000769_+|DUF1887-family-protein MPKYDIHVCLVSAQAAPNLLPILDNEFKPKKAVFVVSTKNEIKEKANALQQVFKQNRVDVEILELSNEFDFQSMEAELFDLLSKYEKEDIALNVTGGTKLMAIAAQNVFSGEKPIFYINTDKEEIIFISKENDQYIPSLKLHTKTLINTYLSSYNVSILKNKDDFNFHKLGVFTERFAMKPANYKYIISQLNSLSLNADNKNLEANFSDYSYDLKLILEDLSDAGLIEIKGDIVDFKNEATRSFLNGNWLEYFTYKQASSIPDVIDVDWNVEVVNSKYEKNKIGVNNELDVVFMARNKCHIIECKTVNFENEENKAKLQGYLDKLKSLKDYAGSLTKVCLVSFYPIPDTTKSRAEKDNIEIIDDYRIKNLKERIQNWILK >NZ_LS483458.1|WP_111696522.1|999326_999617_+|CRISPR-associated-protein-Csx16 MTTWFISRHLGAIEWIKKQNIQIDHFESHLDTSLIQADDVVIGTLPIHLAAEICQKGAKFYFLSVNVSRGQRGTELTCEQLTEQQCSIQPFWIEKL >NZ_LS483458.1|WP_111696521.1|998348_999269_+|CRISPR-system-precrRNA-processing-endoribonuclease-RAMP-protein-Cas6 MLSSLPIVRYQFTLTVTEPIQLPEYAGSTLRGAFGRALRKIACMTKQTECKGCPLYRTCPYTNIFETPAPTEHELQKFSQVPNGYMIEPADWGEKVYISDEKLQFSLVLFGRLIEQLPLIAFAFKRAFEYNVGRGKAHLLDISVFNESAEKFEPVLVNGNIIEHNKAVVIPENFANNSVIEISTPLRLQENGKPLNEKEINVERFFISLAKRIALLSEFHFKPFDLDFESLKNQIVLIEDKKYLKWQDWTRYSSRQDQKMKLGGVVGKWQFKNLSPELSKLLYIGQWLHCGKNATFGLGKYKITNL >NZ_LS483458.1|WP_111696520.1|996798_998349_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MKKFMQTHKVYLTPLSPIHIGCGEDFEPTNYVIKDNKLYSFEASKLGLSEPQRARLMRILKEVDSNSLQDVQIFFSESDVIELAIENSYLTTSVSTEIANEWKNKLGKTAQIKGNGQKEFNALEIERNSYIPYSYFPYIPGSSVKGAIITAVLDNKNHQDENTYTTPNYKNKSNYNLEASKLNASLVKFYIGDIDSIDKSNEKIFSQRLKFSDFIPLSKDQELSRVMYALNIKKRMGKNKKILTGIKVRRECIQPMKYKAFYSSLTILNENHKDKIEINQLIKILNEYNFPILEKEYQILLDNKVCNNVNYIENIKVLLESGNLALIRLGRSGSEAKMYSNHELRGILVNNEQAKESNTLWIASDSTDESSVMQPFGWAIIEFSDNEEDNTLLQKWCENGKISLRSYQKNLETEQKAKEEQQAKEQALNALPKNHRKVIELKDKFNSSNEKQIDSSSALLKEVKSLIESEAINWSKEDKQFMAHHITKELITKRVELKKKNADKDLNKLLNKLVVE >NZ_LS483458.1|WP_111696519.1|995818_996802_+|CRISPR-associated-protein-Csm4 MKLYRFIVTPQSAMGTPLVGDTLFGQLCWAVRNRFGEARLTALLEGYTEQRPFMVVSDAFPQDFFPLPSLPSRFWKKLEHDRKQLKKAQFIKIDDAQKNNVISWQEYALSEYLKLQEKIKNDKTAEEKKKWGKTTQDQFHNTIDRQTNTTGEGQFAPYSTELTWFGTAQKFDLYIVLDEVRFSLEELQQVLNDVGSFGFGRDASIGLGKFQCINPQAVNFLQQNANCYLTLANCAPQNLGLNKEYCYYQITTRFGRHGDIQALSSNPFKKPIILAKTAAIFTPEKYEPRLFLGNGLNGISYAQPNAVHQGYAPVLNLFVDFKYKDDK >NZ_LS483458.1|WP_111696518.1|995107_995809_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MTKLNNILEIKAKLELQTGLHIGAGDSEMHIGGIDNSVIKHPITQSPYIPGSSLKGKIRTLLEWRSGEVKKAPLSLDDLKEAKNKEDVKNILRLFGISGDVKNTDDIVKEIGVSRLAFWDCALDVDWEKAIRDDNQLLTEAKSENTIDRITSTAGNPRQTERVPAGAKFDFKLMLRQFEGDKPELLDLVLKGLKLLELDSLGGSGSRGYGKVKFIELTVDGKTRNLDDIKPFE >NZ_LS483458.1|WP_111696526.1|1005485_1007609_-|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MSNFGVIKRDGSRAEFEIQRIINAIKKAASAVNISDEFYCHQIGQEVGNKIFTHHQGEIDINQIQKIVEDKLMASRYPEVARAYIEYRHDRDLAREKRSQLTKEIEGLIEQSNVELLNENANKDAKVIPTQRDLLAGIVAKHYAKHHILPRDVVEAHEKGEIHYHDLDYAPFFPMFNCMLVDLEGMLSRGFKMGNAEIEPPKSIGTATAVTAQIIAQVASHIYGGTTINRIDEVLSPYVQISYEKHLKHAQEWNVPDVEGYAKALIEKECFDAFQSLEYEVNTLHTSNGQTPFVTFGFGLGTSWQSRLIQQAILKNRIRGLGKNHKTPVFPKLVFTIKKGLNQTQGDPNYDIKQLALECASKRMYPDILNYEQVVKVTGSFKAPMGCRSFLGAYEEKGHEIHDGRNNLGVVSLNLPRIALESKNEEDFYRTLDERLAIAKKALMTRIARLENTKARVAPILYMEGACGVRLKSDENVAQIFKNGRASISLGYIGIHETINALYNKGHIFDDEQLREKGIAIVRHLSEAVKRWQKETGYAFSLYSTPSENLCDRFCRLDTKKFGVIEGVTDKGYYTNSYHLDVEKKVNPYDKLDFEMAYPPLASGGFICYGEYPNIQHNLKALEDVWDYSYDRVPYYGTNTPIDECYECGFTGEFECTSKGFVCPKCGNHDSTKVSVTRRVCGYLGSPDARPFNAGKQEEVKRRVKHL >NZ_LS483458.1|WP_111696527.1|1007833_1008127_-|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MLIISSQELEIIKAILQRYVPEHSVWAFGSRVKGTTKPYSDLDLAIITNTPLNLQTHADLVDAFSESDLPWRVDLVDWSLTSEKFKQIILNCYEVIQ >NZ_LS483458.1|WP_111696528.1|1008110_1008530_-|nucleotidyltransferase-substrate-binding-protein MVDFDLTPLKKAILRLEEGLIRYQEDISDIQIRDGLVQRFEFTYEISHKILKRYLEKTSANPDEFDEMTFQNIIRLGNEKNLLMRDWTHWRKFRDMRSRTNHTYDKETAIQVVSGIPEFLQEAKFLQKALQEKLDAYHF >NZ_LS483458.1|WP_111696529.1|1008598_1009192_-|nucleotide-exchange-factor-GrpE MSEQEQKIETPEVEKEEAVVQETQQTEPSQELDPLEEAIARVQELEEQLKTQIEEAANKEQDILLRSRAEIENLRRRTEQDVEKAHKFALEKFSKDILNTIDNLERALATPANKEDESVKALFDGVELTLKELVSTVGRFGVEAVGVVGEAFNPDLHQAISMQPAEGFESNQISVVLQKGYTLNGRVIRPAMVMVAA >NZ_LS483458.1|WP_032825633.1|1009292_1010183_+|NAD(+)-kinase MNNLYRSFKTIGLVGKPRNDINLQMHKNLFHWLTERGYQVMMEKDVAEKLGLPAENLATLDEIGCQAQLVIVIGGDGNMLGRARVLAKYDIPLIGINRGNLGFLTDIDPKNAYAQLEACLERGEFFVEERFLLEAKIERAGEIVSTGNAVNEAVIHPAKIAHMIDFHVYINDKFAFSQRSDGLIVSTPTGSTAYSLSAGGPILTPNLNAIALVPMFPHTLTSRPLVIDGDSKISIRFAEHNTSQLEVGCDSQIALPFTPDDVVHIQKSEHKLRLLHLKNYNYYNVLSTKLGWLKSF >NZ_LS483458.1|WP_111696530.1|1010294_1011971_+|DNA-repair-protein-RecN MLTQLTINNFAIVRQLDIELAKGMSVITGETGAGKSIAIDALGLCFGQRVETSMVREGQERAEICATFQLESQNPAYQWLNDQELQDPDNPTECILRRVINADGRSKAFINSTPVSASQLKEIGQYLVHINGQHASQLLIKNDYQLQLVDNFAAHPELLVKMREDYQEWKNLQNQVKTFQQKVAEDEARKQLLQYQVDELDEFNLRPNEYLELEDEQRRLSSSEQLTQLSQSALQILSENDTVNIDSLLYRATQYIDELAELDPQYAEVQSMLNDALIQVQEATSEVRNLSSNIEQDPQLLQEIEQRISQALQLARKHQVKPEDLVEHHKKLKAELTALLDFSESEEMLIEQEKLAFEQMQATATSLTVSRQQSAARLAQNVTQSIKQLAMENAEFYVELNTDLNKVGANGTDNVIFTLRSNLGQQPQPLAKIASGGELSRISLAIQVLTSDQSAIPTLIFDEVDVGISGKTASVVGKLLRQLSERCQVLCVTHLPQVACHGHHQFNVEKFTVDNKTETQMTALSQAERIPALARLLGGSEITELALANAQEMLDLVH >NZ_LS483458.1|WP_111696531.1|1011991_1014937_-|bifunctional-[glutamate--ammonia-ligase]-adenylyl-L-tyrosine-phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase]-adenylyltransferase MTALSALIEQKLQSLGTILCQSFPELSPEKIHDAIQKNLNHPELPIYQLGYAMAMSDFVEKVLQKYPHLVKQWWYNVPCFADCSAYTERLNRELTNVHDETTLYQTLRQFRNIEMAKLSFCQSLNLATVEEIFVQLSQLAESLIIAARGWLYHQACAEMGTPMDEQGNPQLLYILGMGKLGGFELNFSSDIDLIFTYPSQGKTSIENTNARRSVDNGKFFTRLGQRLISALDKFTSDGFVYRTDMRLRPFGDSGALVLSFAAMEQYYQDQGRDWERYAMIKGRVLGAQTKDPNVSKLQKMLRPFVYRRYIDFSVIQSLREMKGKIEREVRRRGLKDNIKLGAGGIREVEFIVQVFQLIRGGREINLQQHSLLKILPEITKLGLITEQQFHDLRESYIFLRRVENILQAINDQQTQTLPTDEIDQIRLVEACKTFTCLNENNQTIEKHYPIENWDDFYRTLQQKQEKVRAVFTQLIGDEQDEPSQTDSQWQDFLESDFEDIEQTLLESGISENNIDEVLEKLAQFKDSLNHRVIGSRGRDVLSHLMPIVLALIFEQENYRTLLPRILNIIEKISSRTTYLELLLENPRALQQVIELCAQSQLISEQLARHPILLDELLNTEALRHPLPFTLYPAELHQYLLRLPPDDEEQLIDALRQFKQATLLKVAAADILGALPVMKVSDHLTYLAEAIIEVVVNLAWKQVSSRFGVPEHLQNDEKGFLVIGYGKLGGIELGYKSDLDLVFLYDAVESQTTGGKKVIDSNQFYLRLAQKIVSIFSINTSAGILYEADMRLRPSGDAGLIGCSLSAFAHYQLNEAWTWEKQALVRARPVFGEASLKAKFEHIRQQVLSASRDIEQLKRDVVEMRKKMFTHLSHSKDGEFNLKTDRGGITDIEFIAQYLMLANAPQNPQLTKWSDNVRIFDDMAEAQIISQADCDALKQCYIDLRNAIHHLNLIGKSPVVDKTEFVKERSFIQAFWDKLFSS >NZ_LS483458.1|WP_111696532.1|1014942_1015878_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MKPTAIFLMGPTASGKTDLAIQLRSQLPVEVISVDSALIYKGMDIGTAKPSKEELDLVPHRLIDILDPSESYSAMNFRDDALREMADITAQGKIPLLVGGTMLYYKALIEGLSPLPSADENIRAELEQKAAQQGWTALHTELAKIDPISAARINPSDSQRINRALEVFYITGKSLTELTEEKGEGLPYDFVQFAIAPQDRHILHDRIEQRFHKMIKLGFQAEVEKLYARGDLNINLPSIRCVGYRQMWEYLQGDYDHEEMIFRGICATRQLAKRQLTWLRGWKTPIQWLDSLQPQQAKETILRHLDSYQKG >NZ_LS483458.1|WP_111696533.1|1015885_1017775_-|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL MPIKILSPQLANQIAAGEVVERPASVVKELVENSLDAGANKIQIDIENGGANLIRIHDNGCGIPKEELSLALARHATSKIADLDDLEAILSLGFRGEALASISSVSRLTLTSRTEAQTEAWQVYAQGRDMETTIKPASHPIGTTVEVANLFFNTPARRKFLRTDKTEFAHIDEVIRRIALTKFNTAFTLTHNGKIIRQYRPAEALNQQLKRVAAICGDDFVKNALRIDWKHDDLHLSGWVATPNFIRTQNDLSYCYINGRMVRDKVVSHAIRQAYAQYLPTDAYPAFVLFIDLNPHDVDVNVHPTKHEVRFHQQRLIHDFIYEGISHALNNQEQLNWHTDQSAVENHEENTVREPRPNYNIRPNRAAAGQNIFAPQYHEKPQQNQAHFSNTPVLSNHVSTGYRDYRSDAPSKTEQRLYGELLRTLPPTEQKDISNTAQQNISDTAKIISTEIIECSSHLRGLSLIENRALLLQQKQDFFLLSLEKLQRLQWKLALQQIHIEQQPLLIPIVFRLIESQFQAWQQYSDDFKKIGFEFIENQAQLRLTLNKVPSVLRTQNLQKCVMAMLTRDENSSPFLTALCAQLECKTFNALADALNLLSETERLLTQMNRSAFTQLLKPVNWQPLLDEI >NZ_LS483458.1|WP_111696534.1|1017775_1019146_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKTKILFFLFFSTFSFSLFAAPITIAIDPGHGGKDPGAISRNLGIYEKNVTLSIAKELKALLDKDPNFRGVLTRSGDYYISVPERSEIARKFKANYLISIHADSSESPERRGASVWVLSNRRANDEMGQWLEDDEKRSELLGGAGKVLSHNNDKYLDQTVLDLQFGHSQRTGYELGKHILSHFSKVTTLSRSVPQHASLGVLRSPDIPSVLVETGFLSNSDEEQKLNSPAYRRRIAYMIYEGLVVFRGGKAKSFISDDIVQNSKQSDTKNTEKNDRTSDKNTNENSVKDSGLRHTVKNGESLGSLANKYDVKVADIVALNKLKREALWIGEIIKIPDNGKTQKAQDDKVNSSKNKENAVKKTEKTTEKTNTLKVEKSENKTDKNKSSNKTKKEETSSTKKSDEKNEIPLYHVIQKDQTIYAVSREYNISVNQILKLNPKLKDGKALSGQKIKLREK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483458_3 | 1180600-1180748 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483458_3
|
1 spacers
spacers of NZ_LS483458_3
>3.1|1180649|51|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder CGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAATAATGCTTTTATAATGTGAAA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483458_3
The CRISPR arrays of NZ_LS483458_3 >merge|NZ_LS483458|3|1180600-1180748|CRISPRCasFinder TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAATAATGCTTTTATAATGTGAAATTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGT >NZ_LS483458|3|3|1180600-1180748|CRISPRCasFinder TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGT CGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAATAATGCTTTTATAATGTGAAA TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGT
>NZ_LS483458.1|WP_005644695.1|1179404_1180472_+|UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminephosphotransferase MLSIFVTFLGAFLTLIVMRPVANWIGLVDKPNYRKRHQGAIPLIGGVSLFVGNLCYYLMEWDQLRLPYLYLFSIFVLLAIGILDDRFDISPFLRAGIQAILAILMIDLGNVYLDHLGQILGPFQLTLGSIGLIITVFATIAIINAFNMIDGIDGLLGGLSCVSFAAIGFLMYRDGQMDMAHWSFALIVSILPYLMLNLGIPFGPKYKVFMGDAGSTLIGFTIIWILLLSTQGKGHPMNPVTALWIIAIPLIDMVAIIYRRVRKGKSPFRPDRLHVHHLMVRAGLTSRQAFLLITFVSAVCATIGILGEVYYVNEWAMFVGFFILFFLYVYSITRAWRITRWVRRMKRRAKRLKKA >NZ_LS483458.1|WP_111696624.1|1176738_1179330_+|bifunctional-uridylyltransferase/uridylyl-removing-protein-GlnD MLFFPTLSSPLTPSAVKIERENLKQFELENFSRYSIFELIENRSDFYDVLLIQLWQEMGLSEQQGISLIAVGGYGRREMFPLSDLDFLILVEQTPSPEIEEKITQFIQFLWDCGFEVGNSVRTLAQCESEGKQDITIATNLLEARFLAGNRPHFNALNELLKRDDFWSKEDFFNAKVQEQIERYQRYHNTAYNLEPDIKYSPGGLRDLHLLYWVALRHSGALTLEAILQSGFIYPQEYQQLQESRAFLFKVRFALHLILKRYDNRLLFDRQIKVSELLGFRGEGNQAVEKMMKCFFQALHRISLISNLLIQHYRENVLSSNQDSVIYQLDDDFQLINQSLCLRNSFVFQEKPERILDLFFYLTQYEHANIHSDTLRQLQISLDQLSQKLCEIPAAREKFLRLFNQPNAIKRAFMPMHQYGVLTAYLSQWQAIEGLMQFDLFHIYTVDEHTLRVMLKLESFLSQESAQEHPIAHRIFSQLSDRSLLYIAALFHDIAKGRGGDHAELGAEDVADFAQLHGLDRREIDTLAWLVKSHLLMSITAQRRDIHDPEVIMNFAETVQNQVRLDYLTCLTVADICATNGNLWNSWKRSLFASLYEFTEQQFAQGMKELLDYSEKSEENRKLAQQILTQDYSNITPISIDQLWARCPEDYFVRNTPKQISWHTSLLVDFAESLLVKISNRFSLGGTEVFIYCQDQPHLFNKVVSTIGAKKFSIHDAQIITTQDGYVFDSFIITELNGELVEFDRRRELEQALTVALQSEKLPVLSITPNRQLQHFTVQTDVRFLHENKKEHTEMELIALDKPGLLAQVSQIFSELNLNLLNAKITTVGEKAEDFFILTNQLGQALDSQQREILRNVLYRNIG >NZ_LS483458.1|WP_005632605.1|1175838_1176645_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MAIPIRTEKEIVKLREACKLASDVLVMIEPYVKAGVTTGELDRICHEYMVNEQKVIPACLNYHGFPKATCISINEVVCHGIPSDDKVLKNGDIVNIDVTVIKDGYFGDNSKMYIVGGETNIRSKKLVEAAQEALYVGLRTVKPGIRLNEVGKAVQKYTESQTFSVVREYCGHGVGTEFHCEPQVLHYYADDGGVILKPGMVFTIEPMINAGKKEVRVMGDGWTVKTKDRSHSAQYEHQLVVTETGCEVMTIRDEEIAEGRISRIMVNV >NZ_LS483458.1|WP_009500973.1|1175357_1175702_-|iron-sulfur-cluster-insertion-protein-ErpA MTDNIAVPLTFTDAAANKVKNLISEEENTNLKLRVYITGGGCSGFQYGFTFDEKVNEGDLTIEKSGVQLVIDPMSLQYLIGGTVDYTEGLEGSRFTVNNPNATSTCGCGSSFSI >NZ_LS483458.1|WP_009500972.1|1175002_1175356_-|YacL-family-protein MDFQFTHYQGNVSVKCSMEHIALANWFNTEVRSNPKAILTALSTAQSLSENQEKILIGAEYTLFLDTDEVMVRANNLAIETDEILEDDFHYYDEESIAFCGTQDFIHFLEAYVDFIS >NZ_LS483458.1|WP_111696623.1|1172638_1174996_-|penicillin-binding-protein-1B MTTENVQKNPEEKTPKKRSSFKSFLLKVAFTGAVLTVFYGGYLDWQIRSKMDGQIWRLPAEVYSRIESVKISDNLAFDEVIQILLDNEYRQTTMVAAPGDFKLEDDTIVVLRRAFPFPDKPEPQRVLRLRFVDNKLNRIEDLVAVKAIDEFRLAPKLIAMLESDNEDRLAIPLQNYPRLLIDALILTEDRRFYDHHGINPVGIIRALITNIRAGQTVQGGSTLTQQLVKNLFLSSERTITRKANEALMSLVLDWRYDKNRILETYLNEIYLGQNGDTQIHGFELASQFYFGHSIREISLDQIALLVGMVKGPSLYNPWRNPQNALERRNIVLKLMLEHKMIGDELYQLLSQRPLGVQQKGQISRKYPSFIQTLQADLRRELGEHKISSLLGARIFTTMDLKQQAQAENAVVNTVSQLQLKTKNPYLEGAMIVADYRVGEIRAVVGGLQTQYAGFNRALMAKRQIGSLVKPSIYLTALSNPEQFRLNTPINNQPITINVKGSPPWQPRNYDKKYSGSVMLMDALARSLNIPTVNIGMKVGLSKVIDTQKAMGWDNVEIPKVPAMLLGAYTISPYDVTKLYQTIANQGGRIELTTVDTITDRQGNIIYQHDKTAKQVVPQEAAFQTLFAMQQTVERGTARSLQNDYADLRLAGKTGTTNDARDTWFVGIDGKNISTVWLGRDDNGETKLTGASGALQIYKDYLSHTYIDKLKLNKPANMKWVGITQHGSWDCDSNRVIPVWVNNGQNFCGGTSNASPSPATPPAETEISPRQESVWDVLDNPNPPAQ >NZ_LS483458.1|WP_111696622.1|1171598_1172471_-|phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide-synthase MTQQLPTLSLKKIYSGKVRDLYEIDDKRMLMVASDRLSAFDVILDDPIPRKGEILTQISNFWFNKLAHIMPNHFTGESVYDVLPKEEADLIKDRAVVCKRLNPIKIESIVRGYLTGSGLKDYKQTGTICGLKLPEGLVEASKLPEPIFTPSSKEAVGSHDINISYAECEKLIGADLAAQVKEKAIALYTAAAEYALTKGIIICDTKFEFGLDENGTLTLMDEVLTPDSSRFWSIDTYQEGINPPSFDKQFVRDWLENSGWNKQAPAPKVPENIIQKTVDKYQEALDLLTK >NZ_LS483458.1|WP_111696621.1|1170087_1171422_-|argininosuccinate-synthase MSNTILQHLPEGQKVGIAFSGGLDTSAALLWMRQKGAVPYAYTANLGQPDEDDYSAIPKKAMAYGAENARLIDCRSQLAHEGIAAIQCGAFHISTGGIPYFNTTPLGRAVTGTMLVAAMKEDDVNIWGDGSTFKGNDIERFYRYGLLTNPNLKIYKPWLDAQFIEELGGRFEMSQFLIEHGFDYKMSVEKAYSTDSNMLGATHEAKDLEQLSTGMKIVKPIMGVAFWDEKVEIKPETVTVTFEEGVPVALNGKRFDNAVDIILEANRIGGHHGLGMSDQIENRIIEAKSRGIYEAPGMALLHIAYERLITGIHNEDTIEQYRINGIRLGRLLYQGRWFDPQALMLRETAQRWVAKAITGTVTLELRRGNDFTILNTESPNLTYEAERLSMEKVEDAPFDPIDRIGQLTMRNLDVSDTRGKLDIYAQTGLLSAIKDSVLPQLGKK >NZ_LS483458.1|WP_111696620.1|1169634_1170018_+|hypothetical-protein MKLSELIQAPPSETYIKNSSRLVSGLFVIGGLLYYPTNGYGTIIALALALIVLIGQKMLLTQANKDFADMYQAQALFEKTQNYDYLRFIMARSEQMLKDNKVLSDKAKNEIYKLQEFSQGELEKMGE >NZ_LS483458.1|WP_005635877.1|1168739_1169573_+|PTS-mannose-transporter-subunit-IID MSEQKVTLTKGDILSTYFRSTFLLGSFNFERMQSMGFCVSMIPTIKRLYSKKEDQAAALKRHLEFFNTQPWVGSAIMGVTAAMEQERANGAKDVDDAAISGVKVGLMGPLAGVGDPIFWGTLRPVLAALGAGIALTGSILGPLLFFILINVIRAVTRWYGFKYGYEKGTEIVSDMGGGRLQKITQGASILGLFVMGSLVSKWTSINVPLELTRYKNQLGEEVVVTLQGVLNDLLPGLLALLLTFLCMYLLRKKVNAMVIIFGLFGVGILGYWAGILA >NZ_LS483458.1|WP_050838466.1|1180869_1181418_-|oligoribonuclease MPFDKQNLIWIDLEMTGLDPEKERIIEIATIVTDKNLNILAEGPVLAVHQSDELLNKMNDWCQKTHSENGLIERVKASKLTERAAELQTLDFLKKWVPKGASPICGNSIAQDKRFLVKYMPDLADYFHYRHLDVSTLKELAARWKPEILEGFKKENTHLALDDIRESIKELAYYREHFIKLD >NZ_LS483458.1|WP_111696625.1|1181488_1182529_+|small-ribosomal-subunit-biogenesis-GTPase-RsgA MAKRKLTQNQTRRIQSNNAKTLHRHKKKEIEWSDEMLGESQEGVVVTRYSIHADVENEQGEIYRCNLRRTLSSLVVGDKVVWRKGNEQLQGVSGVIEAIHPRENEISRPDYYDGLKPIAANIDRIIIVSAVLPTLSLNIIDRYLVVCEIAGITPLIVLNKVDLLSQEQRQEVEEQLKIYQDIDYQILMISAKSGENMEKLTALLAQGTAIFVGQSGVGKSSLINHILPSVNAQVGDVSETSGLGQHTTTSSRLYHLPQGGNLIDSPGIREFGLWHLDAEQITKGYREFQYVLGTCKFRDCKHLSDPGCALREAVEQGKISPVRYDNYHRLIESLSETKSQRHFSAV >NZ_LS483458.1|WP_005628404.1|1182689_1182947_+|phosphocarrier-protein-Hpr MYSKDVEITAPNGLHTRPAAQFVKEAKAFSSDITVTSAGKSASAKSLFKLQTLGLTQGTVITISAEGEDEQQAVEHLVALIPTLE >NZ_LS483458.1|WP_111696626.1|1183025_1184753_+|phosphoenolpyruvate-protein-phosphotransferase-PtsI MISGILASPGIAFGKALVLKEEKIVLDTQKITDDQIDAEVARFYEGRALAVEQLNSIRERALISLGEEKAAIFEGHLMILEDEELEEEILDYLRSNKVNAAVAASKIIDQQVTMLSEIDDEYLKERAGDIRDIGNRLIKNILGMYIVDLGDIQEESILVAYDLTPSETAQLNLEKVLGVVTDIGGRTSHTSIMARSLELPAIVGTNNVTELVNTGDYLILDAINNQVYINPTQSQIDELKTLEAKISQEKAELAKLKDLPAITLDGHKVDVVANIGTIRDCEGADRNGAEGIGLYRTEFLFMDREQLPTEEEQFIAYKEVVEAMNGRLTVLRTMDIGGDKELPYLDLPKEMNPFLGWRAIRIALDRREILNAQLRAVLRASAFGKLAVMFPMIISVEEIRELKAVIETLKAELRAEGKAFDENIQVGVMVETPSAAVNAKFLAKEVDFFSIGTNDLTQYTLAVDRGNELISHLYNPMQPSVLGLIKQVIDASHAEGKWTGMCGELAGDERATLLLLGMGLDEFSMSAISVPRIKKLIRNVNFQDAKALANAALQKPTASEIEQLIEEFLAENALN >NZ_LS483458.1|WP_005638822.1|1184813_1185314_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MGLFDKLFGSKENKSVEVEIYAPISGEIVNIEDVPDVVFSEKIVGDGVAIRPTGNKIVAPVDGVIGKIFETNHAFSMESKEGVELFVHFGIDTVELKGEGFTRIAQEGQSVKRGDTVIEFDLPLLESKAKSVLTPIVISNMDEISCIVKKSGEVVAGESVVLSLTK >NZ_LS483458.1|WP_111696627.1|1185407_1186607_+|mannose-6-phosphate-isomerase,-class-I MIYKLTGSLQNYVWGGHQYIPQLLNIPAEENQYYAEWWLGAHHSAPSTIEVDGKHVLLTEFLQKNPTALGAQSRASFGDELPYLLKILDVAQPLSIQLHPTKTQAEIGFAEENAKGIELKASTRTYKDNNHKPEMMISLSDFWLLHGFKNKSDIIKTLEARLSLAPLAKKLHKQDLHAFYADIMQAEQDQLHQWLSPILLENQAAYEANNLDLTNPDYWVLYTIDAMNISLDKLDAGLICFYLFNIVHLKKGEGIYQDAGIPHAYLRGQNIELMACSDNVIRGGLTPKYVDIPELLKIVDCREVEPKIIPSAPQDARIFTYATPAQDFALKNIQYECGETHHLKAQSASILLVMNGQLNLRSETTELSFKQGEAAFITANASYEVEGLIEGYTVVAKLP >NZ_LS483458.1|WP_005628412.1|1186686_1187604_+|SPFH/Band-7/PHB-domain-protein MLDGFAISTLIFVILVALILFSTVKTVPQGYNWTIERFGRYTRTLMPGLNLVVPFVDRIGRKINMMEQVLDIPSQEVISKDNANVSIDAVCFVQVIDARSAAYEVNHLEQAIINLTMTNIRTVLGSMELDEMLSQRDSINSRLLAIVDEATNPWGIKVTRIEIRDVRPPRELIDSMNAQMKAERNKRAEVLEAEGIRQAQILRAEGEKQARILKAEGERQEAFLQAEARERAAEAEAKATQMVSEAITSGDTKAINYFIAQKYTEALKEIGSSGNSKVVLMPLEAGNLIGSVAGIAELLKGDKKS >NZ_LS483458.1|WP_111696628.1|1187687_1188143_+|NfeD-family-protein MADWLINWTLWHWLILGFILLIGEVLTPGIFLLWWGFAALVTAFVQFLFPSLSLASLAIFYALLACILSVIWWKYQHGKDRHDQSHSTLNQRDHALLGKQGIVQELGANGIGRGAFGDTTWRIQGDNLTVGALIEVERVDGITLIVKNISN >NZ_LS483458.1|WP_111696629.1|1188237_1189005_-|TOBE-domain-containing-protein MKNTEILLTIKLQQELFIDPKRVRLLKEIQQCGSINQAAKNAKVSYKSAWDHLEAMNKISPRPLLERNTGGKNGGGTALTTYAERLLQLYDLLERTQEHAFHILQDESVPLDSLLTATARFSLQSSARNQFFGQVAQQRIIDSRCVVDVNVQGLPTPLQVSITTKSSARLKLITEKEVMLMFKAPWVKISEKPLKNQSNQFTVNIKSLNEEEAILQFAESDIEFCATVHYPNQWQIGQQVWIHIDQEQIILATLG >NZ_LS483458.1|WP_111696630.1|1189128_1189893_+|molybdate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLTKISTALLIAGLGFSFAASAKVTVFAAASMTDALQQVAKDYAKQNPKNEVVFSFASSSTLAKQIEEGAPADIFLSASNKWMKYLSEKDLTVKETEKVLVGNDLVLIAPAKSAVNSLDIAKGEWINALKDSYLSVGDPAHVPAGQYAEEALTKLNLWDKVQDRLARAKDVRGALALVERAEAPYGIVYSTDAKISQQVKTVAVFPADSHKPVVYPVSILKDHDNMDSRDFLKYLESDAAKKVLVGYGFSAK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NA
Consensus repeat of NZ_LS483458_4
|
2 spacers
spacers of NZ_LS483458_4
>4.1|1653602|49|NZ_LS483458|PILER-CR ATTTGATGCTTGGAAAGATGCAAATAACAAACCAAATGCTACCGAAGCG >4.2|1653710|49|NZ_LS483458|PILER-CR ATTTGATGCTTGGAAAGATGCAAATAACAAACCAAATGCTACCGAAGCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483458_4
The CRISPR arrays of NZ_LS483458_4 >merge|NZ_LS483458|4|1653543-1653817|PILER-CR GATTTCTTAACCGCACTTAAAGGTGAAAAAGGTGAGAACGGTACTAACGGTAAATCTGCATTTGATGCTTGGAAAGATGCAAATAACAAACCAAATGCTACCGAAGCGGAATTCTTAACCGCACTTAAAGGTGAAAAAGGTGAGAACGGTACTAACGGTAAATCTGCATTTGATGCTTGGAAAGATGCAAATAACAAACCAAATGCTACCGAAGCGGAATTCTTAACCGCACTTAAAGGTGAAAAAGGTGAGAACGGTACTAACGGTAAATCTGC >NZ_LS483458|4|3|1653543-1653817|PILER-CR GATTTCTTAACCGCACTTAAAGGTGAAAAAGGTGAGAACGGTACTAACGGTAAATCTGC ATTTGATGCTTGGAAAGATGCAAATAACAAACCAAATGCTACCGAAGCG GAATTCTTAACCGCACTTAAAGGTGAAAAAGGTGAGAACGGTACTAACGGTAAATCTGC ATTTGATGCTTGGAAAGATGCAAATAACAAACCAAATGCTACCGAAGCG GAATTCTTAACCGCACTTAAAGGTGAAAAAGGTGAGAACGGTACTAACGGTAAATCTGC
>NZ_LS483458.1|WP_005635955.1|1649898_1650210_+|c-type-cytochrome MKRIYTTLLSLSLLTASQFVLADMNAEQAENFYKRTCATCHGKSADKSALGQSQIINTLNSEEIYTALSDRKSGKIQGAGNMVKSRLSEEEIKMLSEFVPTLK >NZ_LS483458.1|WP_005635957.1|1649412_1649895_+|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MRTNKLLKLFAISAVILGAVSCKDEVASVGQKAPDIAAYDLQGNPANLENWKGTRLLIFWSETCGRCIAELKEFEKLAEENPGKVSLIAINVDSDKMDTKAVVAKRELHLPVIKDQMKITAERYQLIGTPTSFVISPEGNIQAKYEGKIPEDDLTKLFKG >NZ_LS483458.1|WP_005635959.1|1648751_1649426_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTNFVIETQHLYKRFGQVTALEDINIQIKQGEFVAIMGASGSGKTTLMNILTGLDTASEGKVILDGVDAAQLDEVGRQRFRAEKIGLVFQQFHLIPYLTALENVMLAQHYHSVIDEASAKAVLEQVGLSHRIDHRPSQLSGGEQQRVCIARALVNQPPVIFADEPTGNLDEQNESLVLDLLTKLNQQGRTIVMVTHNPELGELTDRVIYLHHGKFVKEENHANK >NZ_LS483458.1|WP_111696936.1|1647556_1648711_+|ABC-transporter-permease MAEHKSANTQSMFWRLIFRALRLRLQRVFIIFTALTVGASIVTAMAAVYFDINTKMSQELRTFGANFYIGSADGGMMNQAELNAILQKAPDGFITAASPYLYGVARSDLEKIVLMGVNFDAMRILAPYWQITGSAINVNFDDRNAMIGKTLAERLHVKVGDSLQLSKNAVEKHSFNIKGIVEAGDATDNMLIVNVEFAQNWLDKEGVVNNALLNVQNEQGVNTVDQFAEKIMQQYPDLTARPIRKVSASEGQILEKIKGLMGLISLVILVLATLCVNTTLIAIVGERSKEFALQKALGARKLDIIRQISTEILIIAFCAIIIGLGLGYLLAQVLGITVFKSYIDMRLPVLPITIVLSLLVAFVAVIIPTRRALSINVANVLKGE >NZ_LS483458.1|WP_111696935.1|1646229_1647570_+|ABC-transporter-permease MLARMLFQSWRFGIKRKLLAIITIFLAAGLVSALLAVSIDIGDKMAKELKSYGANILVEPASNAALPDELSHSASLSSQDFLDEKELPNIKDIFWRNNIVGFAPLLSANVQVTKSSQNSTALSAPKTINVLGTFFDHNIAVPDEENYHTGQRIISPYWKVEGEWVDDLNNDFGEIVPALAGEQLAKSNGWKIGDKLSLSYTNDNGENQQSAVEIKGILSTGGTEDNQLVMPLSAVQNLLGLEGKVQSVRVSALTVPENDLSRKARANIDTLDAEAYDRWYCTAYVSSISHQLEEAISGAMVRPIWQVAASEGVVIGKIQLLLAVVTFAALIAAAMGIASLMSAGIIERSKEIGLMKALGAYQWQITLLFYCEAVLSALVGGIFGCLAGWGLAKFIGAALFGAPLDFAWIVVPCVLVLSILIAVIGTWFPAHKIAKLYPVEVLYGRA >NZ_LS483458.1|WP_111696934.1|1644811_1646227_+|DUF2318-domain-containing-protein MTYFFIFVLQSLLPISLLLGASWAIKKGNISPKTLIWLSLIGLALGVVLRLNIPNGQTSNLILTIGFLIIFLLFAISQWSKSSNLAAFWQFALMLIAGATWAKDPNITALTNTDVINTDFILNISAVIFGVIFSLASSAWLYFLLKQQQKTQGKSTALFALSFLLFIALILPLVAELLLTLMKLQLIELTKVRLSFVAKSGEISAWLNIICVVLMLVVLCIFTIQTHSKRLKEAKAEKDLIEKRKKLAFVQTSKRTIYWGILGILFVAASQLYWEKVASQPPQLSEAVPVQLNNKNEVHLALEPLKDGKLHRFVWIADDGKAVRFFIINRQPNKVSMAAVFDACLLCGDQGYVMQGNQVVCVGCGVHLFIPSIGKPGGCNPVPIENWQQTENEIVISRKSLEDGLNLFSTIVEIEVQDPISGTKLKNTKTEYKYSHEGHTYFFENEKNLDLFRDNPDNYLGINKNENPKGE >NZ_LS483458.1|WP_005626197.1|1644193_1644715_+|iron-transporter MKKALLSASLLAGMFAATSAYAFQEYPIGEAVTMNDMEIAAVYLKPVDMEPRGMGLPAAKSDIHLEADIHAVKGNKNGFGEGEWMPYLTINYTLVNTDTGAKQEGTFMPMVAGDGPHYGANIKMMGVGNYKLTYHIDPPPKAGMHRHTDEETGVGRWWKPFDVNYEFKFTGLK >NZ_LS483458.1|WP_172454050.1|1642258_1644166_+|FTR1-family-iron-permease MPCLLRYISISLLFLFSQAVFADNYQKWVDDITQRLNHTEQLLKENKIDDAKTEVQMAYFEVFENLEGPIRINFSAQKSYQMEATFGEIRKMIGESKPMNEVQAKINGLKNELQQVLPSLVEGHQLNADSQHGVYDNQAIKPYWQQSFKTIDDFIAQAITAYESGDFANAKKAFQQAQYDGYKNSEMEMSVRTNRSSEISAAINQQFYNLIRLSEQPDQMTEIAYQSTQLLQDIEEQLPNLPTTRDEQNAQATQSQAQTSDNVAEQDWAKITTEINQRIQQAIALYEQGDAKKAMLAVQDTYFDVFESSGMENKVGSRDSNFKAELEGYFTRLVSLMKAGNGDKLQEQAAGLSQNLAKAVQILQGGEQSDWSMFLYSLLIILREGLEALLIVAAIVAYMVKNNHHDKLPVIRQSIYVALGASVVTAFIFQLIFENSGQNRELLEGFTMIIAVFMLFSMSYWLLSKVEAQNWKRYLEGKLSTALTAGSLFGLWLTSFLAVYREGAETVLFYYALVGDAKSAVSLVYLFAGFICGVILLAICYFIMRYTVVKLPLKPFFMFTGSFMYLMAFVFAGKSVLELIEGKLFEPTLINGVPEISWLGVYPYVETLVPQAILILAAIFALFVMKYQSKRAVSN >NZ_LS483458.1|WP_111696933.1|1641189_1642077_-|Dyp-type-peroxidase MTAQTGILLDGCKAGVFLEANISDYSQIPAAARQFLTRLEQLQQTYPEARLGAVVAFGDKAWKTLGGQDASELKPFVTLGKGDLTAPSTQTDLLVHIQSLRPDVNFSVAQAAVNVFAQAIDVQQEIHGFRWVEERDLTGFIDGTENPKDAQRAEVALISNGNDKDGSYVFTQRYEHNLAKWEKLNTAKQENVFGRTKTDSVEMEDKADTSHVGRTDLKENGKGLKILRQSLPYGTASGTHGLFFIAYCATLYNIEQQLLNMFGEKDGKTDRILGFTKAVTGAYYYAPSIEQLNKL >NZ_LS483458.1|WP_005636761.1|1640692_1641058_-|YgiW/YdeI-family-stress-tolerance-OB-fold-protein MKKFALATIFALATTSAFAGFNGGNTQGGFQQATPSAISVKQALSAADNSMITLVGNITQQIDDDEFWFSDGTGQIKVEIERHVWNGLNVDPSDKVKVYGKLDNEAFEKADLEVLRIEKVK >NZ_LS483458.1|WP_111696938.1|1654706_1655801_-|lytic-murein-transglycosylase MKLNILFKISALSTALLLVGCSSSSDIKPVVNSSSYTKQRTPENFNDYVQFLKGKAAAEGVSLSVLNAQNNILYMQKAVDLDREQAGKIRKRDPNSPPVANPNGTSNYLNRVLTQNKVNVAAERYWEVQAPLQKASQKYGVQQEYLLALWGMESSFGHYQGKYDVLSAVATLAFEGRREKLFTKEFISAMKMLEKDHIQRERMLGSWAGAMGQTQFMPSTFLRYAADGNNDGVKDIWKNQFDTFASIANYLHTVGWDNSLPWGVEVMLTQPIDLSYSGTESNKARSLKDWQAMGLILKSANPQEQAKLSTLENAQLWLVRPDREAGRAFLVSNNFRTILDWNKSNYFALSIGMFAERIKDNVGL >NZ_LS483458.1|WP_172454051.1|1655809_1656613_-|lipooligosaccharide-biosynthesis-galactosyltransferase-LsgF MKFSVLMSLYIKENPQFLRECFESLVAQTRQADEIVLVFDGAVTPELESVVTEFETKLPLKLVKLPQNRGLGKALNEGLLHCAYDWVFRMDTDDICVPDRFEKQVAFIEQHPETIIFGGQIAEFGENVNDIVAYRNVPTSAQEIIKFTQKRCPFNHMTVAYQKSAVINCGGYEDLQEDYYLWIKLVAQGLHVANLPDILVYARVGNGMVSRRRGVNQAKAEWRLFKLKYRLGIQGLLSGLFTFALRFASRLLPTSLLKNLYQTFLRK >NZ_LS483458.1|WP_111696939.1|1656622_1657504_-|lipooligosaccharide-biosynthesis-N-acetyl-glucosamine-transferase-LsgE MLSIIVPSYNRKAEVPALLESLTQQISTHFDVIIVDDCSKEKVVVEQRYSFPVTVIRNETNQGAAESRNIGARASKGDWLLFLDDDDRFMPEKCEKVLQVIEQNPDINFIYHPAKCKMVNEGFTYVTQPIEPQEISTERILLANKIGGMPMVAIKKEIFLKIGGLSTALRSLEDYDFLLKLLQEPSFTPYKINEPLTYCTFHTKRSSVSTDTTNTQKAIDYIREHYVKTVEQAHNFDINASYILAYPHIMNLSRKAAKYYFDLFKKTKNIKQFIITLVILISPKLAINLKRFM >NZ_LS483458.1|WP_111696940.1|1657515_1658289_-|lipooligosaccharide-biosynthesis-galactosyltransferase-LsgD MLKKYLISLDKDIQRRELFFSQKNTEDFQIFSAINTMQKDWNELAAIFNIEQFRAHYGRNVTKGEIGCTLSHLSVYQKIVEDNDIAEDSYALVCEDDALFHPDFQQNLTALLSEKLESEIILVGQSKINDFNDADLEINYPTTFSFLCKKTGNVNYAFPYKSYFAGTVGYLIKKSAARRFIQQISQNKPFWLADDFLLFEQDFNIRNKVVRPLMVIENPVLISNLESVRGSLSNNLFKKLMKYPLKKIFAIKKNLAN >NZ_LS483458.1|WP_111696941.1|1658300_1659362_-|lipooligosaccharide-biosynthesis-family-4-glycosyltransferase-LsgC MKKIGFFIMNIESAGGTERVSINVANALAKQGYDVSFISIGGNKPFFQVDEKINIYAMNKLPYSLKKDYFSITKKLRELVKELQLDTLIVVDGAIMLFSALALVNLHVKHILWEHYSFNFTGNRLVRTLGKYLASTRCDKVVTLTESEKTLWQEKFKTNNIISIANPNTLLPKNKLAKWENKTILSVGHLFSYKGFDYLLKAWQVLAKNHPDWNLKIVGSGEEEENLKNLAKALDIEDSVNFIPRTNDVAFYYESSSIYCLPSQTEGLPLVVIEAMAFGLPIVAFNCSPGVKQLVEHKENGFLCEKNNIEEMVNSLDLLMNNPELYQQMSEKSRVMSEDYGIEKIIEEWKAIL >NZ_LS483458.1|WP_111696942.1|1659363_1660278_-|lipooligosaccharide-biosynthesis-sialyltransferase-LsgB MNLILCCTPLQVLIARKIIELHPNEQFFGVMFGGVWDKKRTLYASKLAEVCSYSVNIDTGKDLKGFDSLKLMRQLKNKITHKGFDKVFLANLNSLWLQTYLSHVSFKELYTFDDGSDNIFPHPNLLREPDTFKYKLIKAFIGDKYSVNKLFNKIKKHYTVYPNYKNIVSNVEPISLWDNKVDGDIDGEVSFFIGQPLLNTKEENISLIKKLKDQIPFDYYFPHPAEDYRVDGVNYVESELIFEDYVFKNLSDKKVIIYTFFSSVAFNLLSHPNVEIRFIRTSIPRWQFCYDSFPGLGLTIYKEI >NZ_LS483458.1|WP_111696943.1|1660274_1661480_-|lipooligosaccharide-flippase-LsgA MKVFKDSVIYLVGELSSKLVPFLLLPYLSRKLGVEGYGSLSYYQTFLSLFLIVVSLTQEGAISRYFYFYGKRSLNLVVNTGYAYTTIIGCIILIGCWIAQSEILFYAALSSIFQSFLNVQLSVRQCQKKAWSYAFIQFSLTVTGAVFTVALLEYYQNDLVEKRILAILLSNLVVWFFSYFLYRKNATSKKYQFKHYQSALFYILGFGLPLILHHASFFLKGQLDRIFIYHKFSETDLGLYAMGAQLALVVSIAIQALNKAIIPYFYEALKQKKLVIQQLHKWAQFSFLLIPIPALVMWIIPEDVLVWILGSQFLGTKYYFILFLISTTLSIPYLILVNYLFYYGKNKLISQCSVLSTIIYVASLVALTFTEIKYIPYAGIIGSLSIIPILYFMTSKVSKTL >NZ_LS483458.1|WP_111696944.1|1661613_1662357_+|YdcF-family-protein MLELGKLLTALIAPPLNTFVLLIIAAILYLVHFKKLAKFIALISFTWLYVMSAPFTGLLLTDNDDIPALNLDDYKQAQAIVILGGGSYPTKELYAEMASGAPQLERLRYAAFLQKETGLPILTTGYSLIGISEGNLMAKELNQFFSVPTQWIENKARNTEENASFTKNILVKDHIQKIILVTNQWHMKRAKYLFEKQGFDVLPAAAASYGSKGNLSAKSFVPDLGALNSNMVLLKEWIGYWKAHYAQ >NZ_LS483458.1|WP_111696945.1|1662456_1664727_+|carbamoyltransferase-HypF MNGIELRIKGKVQGVGFRPFVWLLANEYGLKGDVNNDGQGVLIRFVNPEKDPLTHFLKDLQEKLPPLALITDIQQCEKHWENLPHFAEFVIRESENNAMDTQIVPDAATCPACVEDLFNPENRRYHYPFTNCTHCGPRFTIIKKIPYDRKNTSMSDFPFCPDCEHEYKNPADRRFHAQPNACPVCGPHIWLQDTEHQLATHQTALKQTALLLKEGKILAIKGIGGFHLACDAQNFDAVQLLRDRKHRPSKPLAVMVPSLDFLQNLTETEIKLLTSTAAPIVLLPKNKVSNLAENIAPNLNEIGVMLPSNPLQHLLLREINQPLVMTSANPSGEPPVLDNESAVKKLNNLADFYLCHNRDILQRADDSLVRASFDGVETLRRARGYVPDEMLLKTENTKNILALGSDLKNTFCLLKQNKAVVSQHIGDTANELVQQQLENNIDLFCQIYQFKPDLIAVDAHSGYFSSKTGKNLAQKLSAPYVEVLHHHSHIAGVLAEHHCDEKVIGIALDGIGIGANGQLWGGECLLVDSEQSQHLGGLPAVALPGGDLAAAQPWRNWLAHLQKFVPNWRDIATKTCSELPWEPLSNAIERNLNSPLISSAGRLFDAVAYGLGIVGDKLSWEGEAACYLEALATKSDFIKDEKSAVNIQVKMPIKNNQLDLATFWQSWLAYDDSKENKAFIFHYALAKGFAELARQQAKRHNCKTIVLSGGVMHNQLLRRLLKQALAEFNVLSAHQYPMGDGGLSLGQAMIASRLSS >NZ_LS483458.1|WP_111696946.1|1664814_1665273_-|hydrogenase-maturation-peptidase-HycI MNENVILTVGNTMMGDDGAGPYLAQLCSENPLPNWTAFDGGSAPENLVHQIRAMKPKRLIIFDATEMELPVGKIRIIDKELIAEMFFVSTHNLPLNFLIEQLEEDIPEVIFIGIQPDLVSFGFPMSGAVKSAVEFFYGFLKDGGDLSEITQL |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483458_1 | 1.5|989926|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 989926-989958 | 33 | NZ_CP007453 | Peptoclostridium acidaminophilum DSM 3953 strain al-2 plasmid EAL2_808p, complete sequence | 322544-322576 | 7 | 0.788 |
| NZ_LS483458_1 | 1.20|989927|33|NZ_LS483458|PILER-CR | 989927-989959 | 33 | NZ_CP007453 | Peptoclostridium acidaminophilum DSM 3953 strain al-2 plasmid EAL2_808p, complete sequence | 322544-322576 | 7 | 0.788 |
| NZ_LS483458_2 | 2.6|1004804|32|NZ_LS483458|PILER-CR | 1004804-1004835 | 32 | MN698244 | Pelagibacter phage HTVC106P, complete genome | 7570-7601 | 7 | 0.781 |
| NZ_LS483458_2 | 2.6|1004804|32|NZ_LS483458|PILER-CR | 1004804-1004835 | 32 | AP014127 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C44-MedDCM-OCT-S31-C46, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 22389-22420 | 7 | 0.781 |
| NZ_LS483458_1 | 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990351-990381 | 31 | NZ_CP017109 | Lactobacillus salivarius strain CICC23174 plasmid pLS_2 sequence | 7679-7709 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990351-990381 | 31 | MG765278 | Lactobacillus phage Silenus, complete genome | 32723-32753 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990351-990381 | 31 | MH809528 | Lactobacillus phage Sabazios, complete genome | 32303-32333 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990351-990381 | 31 | NC_007930 | Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118, complete sequence | 99079-99109 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990351-990381 | 31 | NZ_CP017108 | Lactobacillus salivarius strain CICC23174 plasmid pLS_1 sequence | 233895-233925 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990351-990381 | 31 | NZ_LT604075 | Lactobacillus salivarius isolate LPM01 plasmid II | 7585-7615 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990351-990381 | 31 | CP002037 | Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3, complete sequence | 99307-99337 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990351-990381 | 31 | NZ_CP011513 | Paenibacillus peoriae strain HS311 plasmid unnamed, complete sequence | 23469-23499 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR | 990352-990382 | 31 | NZ_CP017109 | Lactobacillus salivarius strain CICC23174 plasmid pLS_2 sequence | 7679-7709 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR | 990352-990382 | 31 | MG765278 | Lactobacillus phage Silenus, complete genome | 32723-32753 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR | 990352-990382 | 31 | MH809528 | Lactobacillus phage Sabazios, complete genome | 32303-32333 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR | 990352-990382 | 31 | NC_007930 | Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118, complete sequence | 99079-99109 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR | 990352-990382 | 31 | NZ_CP017108 | Lactobacillus salivarius strain CICC23174 plasmid pLS_1 sequence | 233895-233925 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR | 990352-990382 | 31 | NZ_LT604075 | Lactobacillus salivarius isolate LPM01 plasmid II | 7585-7615 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR | 990352-990382 | 31 | CP002037 | Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3, complete sequence | 99307-99337 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_1 | 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR | 990352-990382 | 31 | NZ_CP011513 | Paenibacillus peoriae strain HS311 plasmid unnamed, complete sequence | 23469-23499 | 8 | 0.742 |
| NZ_LS483458_2 | 2.11|1005159|32|NZ_LS483458|PILER-CR | 1005159-1005190 | 32 | NZ_CP016597 | Bacillus cereus strain K8 plasmid pBCK802, complete sequence | 56618-56649 | 8 | 0.75 |
| NZ_LS483458_2 | 2.11|1005159|32|NZ_LS483458|PILER-CR | 1005159-1005190 | 32 | NC_020451 | Vibrio coralliilyticus strain ATCC BAA-450 plasmid, complete sequence | 15778-15809 | 8 | 0.75 |
| NZ_LS483458_2 | 2.11|1005159|32|NZ_LS483458|PILER-CR | 1005159-1005190 | 32 | NZ_CP010109 | Bacillus thuringiensis serovar indiana strain HD521 plasmid pBTHD521-3, complete sequence | 512-543 | 8 | 0.75 |
| NZ_LS483458_1 | 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990351-990381 | 31 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 776477-776507 | 9 | 0.71 |
| NZ_LS483458_1 | 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990351-990381 | 31 | NC_019690 | Pseudanabaena sp. PCC 7367 plasmid pPSE7367.01, complete sequence | 250429-250459 | 9 | 0.71 |
| NZ_LS483458_1 | 1.13|990491|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990491-990523 | 33 | NC_048677 | Lactobacillus phage LpeD, complete genome | 26362-26394 | 9 | 0.727 |
| NZ_LS483458_1 | 1.14|990561|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990561-990593 | 33 | NZ_CP026605 | Catenovulum sp. CCB-QB4 plasmid unnamed1, complete sequence | 146189-146221 | 9 | 0.727 |
| NZ_LS483458_1 | 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR | 990352-990382 | 31 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 776477-776507 | 9 | 0.71 |
| NZ_LS483458_1 | 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR | 990352-990382 | 31 | NC_019690 | Pseudanabaena sp. PCC 7367 plasmid pPSE7367.01, complete sequence | 250429-250459 | 9 | 0.71 |
| NZ_LS483458_1 | 1.28|990492|33|NZ_LS483458|PILER-CR | 990492-990524 | 33 | NC_048677 | Lactobacillus phage LpeD, complete genome | 26362-26394 | 9 | 0.727 |
| NZ_LS483458_1 | 1.29|990562|33|NZ_LS483458|PILER-CR | 990562-990594 | 33 | NZ_CP026605 | Catenovulum sp. CCB-QB4 plasmid unnamed1, complete sequence | 146189-146221 | 9 | 0.727 |
| NZ_LS483458_2 | 2.1|1004449|33|NZ_LS483458|PILER-CR | 1004449-1004481 | 33 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 92347-92379 | 9 | 0.727 |
| NZ_LS483458_2 | 2.6|1004804|32|NZ_LS483458|PILER-CR | 1004804-1004835 | 32 | NZ_CP031075 | Bacillus mycoides strain BPN401 plasmid pl37, complete sequence | 25079-25110 | 9 | 0.719 |
| NZ_LS483458_2 | 2.13|1004448|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder | 1004448-1004480 | 33 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 92347-92379 | 9 | 0.727 |
| NZ_LS483458_1 | 1.1|989641|34|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 989641-989674 | 34 | NZ_CP032196 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0097 plasmid unnamed2, complete sequence | 97979-98012 | 10 | 0.706 |
| NZ_LS483458_1 | 1.1|989641|34|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 989641-989674 | 34 | NZ_CP027615 | Klebsiella pneumoniae subsp. ozaenae strain AR_0096 plasmid unnamed3, complete sequence | 103660-103693 | 10 | 0.706 |
| NZ_LS483458_1 | 1.13|990491|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT | 990491-990523 | 33 | NZ_CP048637 | Rhizobium oryzihabitans strain M15 plasmid p5, complete sequence | 247226-247258 | 10 | 0.697 |
| NZ_LS483458_1 | 1.16|989642|34|NZ_LS483458|PILER-CR | 989642-989675 | 34 | NZ_CP032196 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0097 plasmid unnamed2, complete sequence | 97979-98012 | 10 | 0.706 |
| NZ_LS483458_1 | 1.16|989642|34|NZ_LS483458|PILER-CR | 989642-989675 | 34 | NZ_CP027615 | Klebsiella pneumoniae subsp. ozaenae strain AR_0096 plasmid unnamed3, complete sequence | 103660-103693 | 10 | 0.706 |
| NZ_LS483458_1 | 1.28|990492|33|NZ_LS483458|PILER-CR | 990492-990524 | 33 | NZ_CP048637 | Rhizobium oryzihabitans strain M15 plasmid p5, complete sequence | 247226-247258 | 10 | 0.697 |
1. spacer 1.5|989926|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007453 (Peptoclostridium acidaminophilum DSM 3953 strain al-2 plasmid EAL2_808p, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
caagcctgggcgaagatgaaaaaagaataatgg CRISPR spacer gattcgtgggcggagatgaaaaaagagtaattg Protospacer * * ******.*************.**** *
2. spacer 1.20|989927|33|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_CP007453 (Peptoclostridium acidaminophilum DSM 3953 strain al-2 plasmid EAL2_808p, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
caagcctgggcgaagatgaaaaaagaataatgg CRISPR spacer gattcgtgggcggagatgaaaaaagagtaattg Protospacer * * ******.*************.**** *
3. spacer 2.6|1004804|32|NZ_LS483458|PILER-CR matches to MN698244 (Pelagibacter phage HTVC106P, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
acctgcatcaaatactttgtaaccctgtaaat CRISPR spacer acctgcatgaaatactttgaaactttcttcat Protospacer ******** ********** ***..* * **
4. spacer 2.6|1004804|32|NZ_LS483458|PILER-CR matches to AP014127 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C44-MedDCM-OCT-S31-C46, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
acctgcatcaaatactttgtaaccctgtaaat CRISPR spacer acctgcatgaaatactttgaaactttcttcat Protospacer ******** ********** ***..* * **
5. spacer 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017109 (Lactobacillus salivarius strain CICC23174 plasmid pLS_2 sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatt----tattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer
----cttttagtattaaaaaatgatcactattttg Protospacer
** ***************.** ****.
6. spacer 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG765278 (Lactobacillus phage Silenus, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatttattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer ttagcattactaaaaactgatcgctttttaa Protospacer ..* ***.****** ************ *
7. spacer 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH809528 (Lactobacillus phage Sabazios, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatttattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer ttagcattactaaaaactgatcgctttttaa Protospacer ..* ***.****** ************ *
8. spacer 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007930 (Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatt----tattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer
----cttttagtattaaaaaatgatcactattttg Protospacer
** ***************.** ****.
9. spacer 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017108 (Lactobacillus salivarius strain CICC23174 plasmid pLS_1 sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatt----tattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer
----cttttagtattaaaaaatgatcactattttg Protospacer
** ***************.** ****.
10. spacer 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LT604075 (Lactobacillus salivarius isolate LPM01 plasmid II) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatt----tattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer
----cttttagtattaaaaaatgatcactattttg Protospacer
** ***************.** ****.
11. spacer 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP002037 (Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatt----tattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer
----cttttagtattaaaaaatgatcactattttg Protospacer
** ***************.** ****.
12. spacer 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011513 (Paenibacillus peoriae strain HS311 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatttattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer tatgacgaattaaaaaacgatggctttttta Protospacer **. *********.*** *********
13. spacer 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_CP017109 (Lactobacillus salivarius strain CICC23174 plasmid pLS_2 sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatt----tattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer
----cttttagtattaaaaaatgatcactattttg Protospacer
** ***************.** ****.
14. spacer 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR matches to MG765278 (Lactobacillus phage Silenus, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatttattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer ttagcattactaaaaactgatcgctttttaa Protospacer ..* ***.****** ************ *
15. spacer 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR matches to MH809528 (Lactobacillus phage Sabazios, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatttattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer ttagcattactaaaaactgatcgctttttaa Protospacer ..* ***.****** ************ *
16. spacer 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NC_007930 (Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatt----tattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer
----cttttagtattaaaaaatgatcactattttg Protospacer
** ***************.** ****.
17. spacer 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_CP017108 (Lactobacillus salivarius strain CICC23174 plasmid pLS_1 sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatt----tattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer
----cttttagtattaaaaaatgatcactattttg Protospacer
** ***************.** ****.
18. spacer 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_LT604075 (Lactobacillus salivarius isolate LPM01 plasmid II) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatt----tattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer
----cttttagtattaaaaaatgatcactattttg Protospacer
** ***************.** ****.
19. spacer 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR matches to CP002037 (Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatt----tattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer
----cttttagtattaaaaaatgatcactattttg Protospacer
** ***************.** ****.
20. spacer 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_CP011513 (Paenibacillus peoriae strain HS311 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gcggatttattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer tatgacgaattaaaaaacgatggctttttta Protospacer **. *********.*** *********
21. spacer 2.11|1005159|32|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_CP016597 (Bacillus cereus strain K8 plasmid pBCK802, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tccatataaccacaatcaatataacgctgata CRISPR spacer tcaaaataaccacaatcaatatatttttgtaa Protospacer ** * ****************** . .** *
22. spacer 2.11|1005159|32|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NC_020451 (Vibrio coralliilyticus strain ATCC BAA-450 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tccatataaccacaatcaatataacgctgata CRISPR spacer actaaataaccacaatatatataacgctaaac Protospacer *.* *********** **********.*
23. spacer 2.11|1005159|32|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_CP010109 (Bacillus thuringiensis serovar indiana strain HD521 plasmid pBTHD521-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tccatataaccacaatcaatataacgctgata CRISPR spacer tcaaaataaccacaatcaatatatttttgtaa Protospacer ** * ****************** . .** *
24. spacer 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcggatttattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer aagttaatattaaaaaatgttagcttttttt Protospacer . * ************ * ********
25. spacer 1.11|990351|31|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019690 (Pseudanabaena sp. PCC 7367 plasmid pPSE7367.01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcggatttattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer taagatttattaataaatgatcgtttctcct Protospacer .********** *********.**.*..
26. spacer 1.13|990491|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048677 (Lactobacillus phage LpeD, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
aaggcggtagcggtaaaagtaccatttctatta CRISPR spacer ttagcgtcagcggtaaaagtaccatttaagttg Protospacer .*** .******************* .**.
27. spacer 1.14|990561|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026605 (Catenovulum sp. CCB-QB4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
ctacaagttttgatgaatttgatgcctacaagg CRISPR spacer ctccaagttttgatgaacttgatgagttatttg Protospacer ** **************.****** * *
28. spacer 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcggatttattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer aagttaatattaaaaaatgttagcttttttt Protospacer . * ************ * ********
29. spacer 1.26|990352|31|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NC_019690 (Pseudanabaena sp. PCC 7367 plasmid pPSE7367.01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcggatttattaaaaaatgatcgctttttta CRISPR spacer taagatttattaataaatgatcgtttctcct Protospacer .********** *********.**.*..
30. spacer 1.28|990492|33|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NC_048677 (Lactobacillus phage LpeD, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
aaggcggtagcggtaaaagtaccatttctatta CRISPR spacer ttagcgtcagcggtaaaagtaccatttaagttg Protospacer .*** .******************* .**.
31. spacer 1.29|990562|33|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_CP026605 (Catenovulum sp. CCB-QB4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
ctacaagttttgatgaatttgatgcctacaagg CRISPR spacer ctccaagttttgatgaacttgatgagttatttg Protospacer ** **************.****** * *
32. spacer 2.1|1004449|33|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
aattttgttgattaaacttaacatttttcattt CRISPR spacer ttccatactgattaaatttaacatttttcagtt Protospacer .. *..********.************* **
33. spacer 2.6|1004804|32|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_CP031075 (Bacillus mycoides strain BPN401 plasmid pl37, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
acctgcatcaaatactttgtaaccctgtaaat CRISPR spacer aaaaatacaaaatacttcctaaccctgtaaat Protospacer * ..*. ********. *************
34. spacer 2.13|1004448|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
aattttgttgattaaacttaacatttttcattt CRISPR spacer ttccatactgattaaatttaacatttttcagtt Protospacer .. *..********.************* **
35. spacer 1.1|989641|34|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032196 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0097 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
atcaatgcgacaagatgccagaagcggtggctta CRISPR spacer tgcaatgccacaagatgccaaaagcgccgtgatg Protospacer ****** ***********.***** .* *.
36. spacer 1.1|989641|34|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027615 (Klebsiella pneumoniae subsp. ozaenae strain AR_0096 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
atcaatgcgacaagatgccagaagcggtggctta CRISPR spacer tgcaatgccacaagatgccaaaagcgccgtgatg Protospacer ****** ***********.***** .* *.
37. spacer 1.13|990491|33|NZ_LS483458|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP048637 (Rhizobium oryzihabitans strain M15 plasmid p5, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
aaggcggtagcggtaaaagtaccatttctatta CRISPR spacer aaggcggtagcggcaaaactaccacggcggcgc Protospacer *************.**** *****. * ..
38. spacer 1.16|989642|34|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_CP032196 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0097 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
atcaatgcgacaagatgccagaagcggtggctta CRISPR spacer tgcaatgccacaagatgccaaaagcgccgtgatg Protospacer ****** ***********.***** .* *.
39. spacer 1.16|989642|34|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_CP027615 (Klebsiella pneumoniae subsp. ozaenae strain AR_0096 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
atcaatgcgacaagatgccagaagcggtggctta CRISPR spacer tgcaatgccacaagatgccaaaagcgccgtgatg Protospacer ****** ***********.***** .* *.
40. spacer 1.28|990492|33|NZ_LS483458|PILER-CR matches to NZ_CP048637 (Rhizobium oryzihabitans strain M15 plasmid p5, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
aaggcggtagcggtaaaagtaccatttctatta CRISPR spacer aaggcggtagcggcaaaactaccacggcggcgc Protospacer *************.**** *****. * ..
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
458293 : 519818
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LS483458|458293:519818|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(15.38%) | transposase,integrase,tRNA | attL 469690:469727|attR 476534:476571 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
616869 : 679258
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LS483458|616869:679258|DBSCAN-SWA 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51 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | tRNA,tail,head,portal,protease,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1319677 : 1381223
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LS483458|1319677:1381223|DBSCAN-SWA AATGTCTCGTTCAAGCTTTTACTATAAAGAGATTAAGCGAACTTATCACGAAGTAAAAGAGGTTATCTTATTGCTGTATAAAAAGAACAGAAAACGAGATGGTTATCGCCCCATGACGTTTAAATTACGCCAAATGGGTTTTAATTTGAATCATAAAACGGTGTTAAAGCTAATGAACGAGTTAGGTATTCATTCCATTTTGCGCAAGAAAAGACATTGAAAACGAGGAAAAACATCGCATATTGCCCCGAATTTGCTGAATCGTGATTTTACAGCAACGGCACTCAATCAAAAATGGGTAATGGATGTAACGGAATTTCAGGTTGGGCAAGAAAAGCTTTATTTTTCAGCGTTGATGGACTTTGCTAACCGAGAAGTGATTGCCTATAACTTTTCAACACGCCCCAAATTTTCATTGGTGAAAAAGATGTTAGCACAAGGACTTATTCGGCTTAAACCGACAGAATGCCCGATTATTCATAGCGACCAAGGCGTATTGTATGGCTCGGCGGAATGGGTAAAGATGTTGGAGGGTAAAGCGGTGCAAAGTATGAGTCGCCGAGGAAATTGCTACGATAATGCGGTGATTGAAAGCTTTTTTGTAATATTAAAATCAGAGTGCTTTTACTCACAGACTTATCATTCAATCGCTGAATTACAGGCTGAAATTGAAGAATATTTAAGTTAACTAACCTGTCCAACTTTTTTTTGGGGGGGGGCAGATCGCTTTTTCCGCTAATTTTTACTTTATCCAACAGCGCTGTATAATGTCACGCATTTGAATATAAACGATATGAGGCGGAAGCTCATGATTAAAATCGATACCTTACCGCAATTTTTGCGTAAAAAAGTGGCGGAAAACGATGCCTTTGGTCTCGTGGAGGGCTTGTGCCAATTATTACGTAGCAGCCCCACAGAAAAAATTGCTCCGACCTTGCATTTGTTTAAGTTTATCTTAAAGAACGATAAAGAATTAGGCTGTTCTGTTTCGAAATTATTATGTGGTTGGTTATGTGGTTTACGCCTTTACCCCTTGTTTATTAGTAGCGGTATCCTTACACGTGGCGGTTTTGGACAGGAGATGAAAACGCGTATTTATGAGCGTTTTAACCCCTCTTTTAAAGATATTAATGATTTACGTGATATTTTTTATTTATTATTTAGCGATAAAAATGATGCACGCTGGATTGATGCCGTTCCTTTAAAAACGTGGCGAGTCGTATTTGGCGTCTTAACCCGTTGTACAGAACAAAAAGATCGTGAGCGTTTAAAAAATCATATTGAAAGTGAAGGGCTATTTGCCATTGAGATGCTTTCAATTTGGATTGCTGCTGAAGATATGGATCCTGAGCTGATGCGAATGGAGCCTTCTCTGTTGAATGCAGATTCCCCTTTTGTGGCATTGCACCATGAAGTGGTGAATTGGTTACAGGCGCACCGCCAATCAACCGTTTTTGATGATAGCCATTTACAGGTAATGTTTAGCCAATGTAAAAAATTGGTTGAGCGTTTGCAAAAACGTGGAGCAGTGGTGGGCTCTTCTTTAAATACGGCTTATTTATTGGAGCGTCTTTCTCAGACCTTAGAACGATTAGAAATCTTGATGGCGATTTTTGTTTCAAATCGCTATTTACCACGCCGAATATTGTTATTAACTGGCTGTTTTGCCCGCACAGCAGCAGAAAAACATAGCATTACCCGATTATGGAAACAAAGCTCTAGATTAATTTCACGTAGCATTACCCAAAATGCGGGAGATCACGGCGAGCATTACATTACTCGAGATAAAAAAGAGTATTGGGCAATGTTTTATTCTGCGGCAGGTGGTGGTGTATTAATTGCACTGATGGCGCTATTTAAAATCTATCTAGGCAGCATTATTGATGACAAAGTCTGGAAAGGGGTTGCCGAAGGCTTAAATTACGGCTTAGGTTTTATGGTGATCTTTATGTTGCATTTTACGGTAGCGACGAAACAGCCTGCCATGACTGCAGCCCGTTTTGCTGAGGCTGTTGAGAAAACGCCTCAAGGTAAAAGCGTCAATATGAAATTAGCTCAATTATTAGTGAATGTATTTCGCTCTCAAAGTATTGCGGTGCTAGGTAATGTCCTCATTGCGATGGGCTTAGCCGCATTGATTGCGTTTGGTTACCAATATAAAACAGGTGAGCTATTGACGAATGCTGATCAAATTGCTTATCAGTTGCATAGCATTGATCCTTTTGCGGGAACCTTATGGTTTGCAGCCATTGCGGGGGTGTGGTTATTCTGCTCAGGGATTATTTCAGGCTATTTTGATAACCGCAGCAATTATTTGAATATGCGTATGCGTTTAACCCAACATCCGTTATTGAAAAAATTAATGTCTGAGAAATCTCGCGTTAAATTTGCTAATTATATGCATGAGAATTATGGCTCGCTTATCGGTAACCTTTGCTTTGGTATGCTGCTTGGTATTACGGGTGTGGTAGGTTACTTAACGCACCTTCCGTTAGATATTCGTCATGTGGCATTTTCATCTGCGAATGTAGGCTATATTGCTGTGAGCGGACAATTCACCTATTCATTGCTTTTACAATGCATTGGTTTTGTATTGTTGATTGGTTTAGTTAATTTAATTGTCAGTTTTTCATTAACGCTTTGGGTTGCACTGCGTTCTTTGAATGCGGAAATTGATAGCTGGTGGCCAATTTGGTATGAAGTTTGTCAAATTGTGAAAAAACGTCCATTAAGCTTATTTCTTCCTGTTCAATTAGATAAATAATCGGCTTAATTGATCTGCACCCCACTCTCGGACTTATCACTCAATCGCTGAATTACAGGCTGAAATTGAAGAATATTTAGTGTATTACAACCAAAAACGAATTAAACTTGCTTTCAAAGGATTGAGCCCATTGCAATACCGAGCTCAATATTTAAGTTAACTAACCTGTCCAACTTTTAGGGGGCAGATCACTTTGTATATAAAAGTAGAAATGATGAATATCGTCTTTTTAGATAGTACGGCTATCCCTAAACATATCCCTATTCCTCGTCCAAGTTTTGTGCATACTTGGATTGAATATGAGCATACTTCTTCTGCAGAAACGATTGAACGAGCGAAAGATGCTGATATTGTTATTACGAGCAAAGTCATTTTTGATCGAGAAACGTTAAAACAATTACCTAAGTTAAAGTTAATTGCAATTACTGCAACCGGTACCAATAATGTTGATCTTGTGGCTGCAAAAGAAATGGGCATCGCCGTGCGTAATGTGACAGGTTATTCCAGAACAACCGTGCCAGAACACGTAATCGGTCTGGTTTTTTCTTTAAAACACAGCTTTGCAGGTTGGTTACGCGATCAATCGGAAGCAAAATGGCCTAAAAGCAAACAATTTTGTTATTTTGATTACCCAATTACAGATGTACGCGGTTCCACATTGGGCGTATTTGGTAAAGGTTGCTTAGGGACAGAAGTGGGGCGTTTGGCTAATGCCGTGGGAATGAAAGTGCTTTATGCAGAACACAAAGATGCCACTGTTTGCCGTGAAGGTTATACGCCTTTTGATGAAGTATTAAAAGAAGCGGATATTGTGACGTTGCATTGCCCATTAACTGAAACAACAAAGAATTTAATGAATGCAGAAACCTTATCCAAAATGAAAAAAGGTGCATTTTTGATTAATACAGGGCGTGGGCCTTTGATTGATGAACTTGCATTAGTTGATGCGTTAAAAACGGGACATTTAGGCGGAGCAGCTTTGGATGTAATGGTAAAAGAGCCACCAGAAAAAGATAATCCGTTAATTTTAGCTGCAAAAACTATGCCTAATTTAATTATCACCCCGCATATTGCTTGGGCGAGTGATAATGCAGTGACAACATTAGTTGGCAAAGTAATGCAAAACATCGAAGAATTTGTACAACAATTAAATCAAAAATAATGAATTTTCCTATTTCTCTTTATATTGCGCTACGTTATTGGCGTGCGAAAAGTGCGGATCGTTTTGGGCGATTAGTGACTAATCTTGCAAGCCTGGGGATTGTGCTAGGTGTGATGGCATTGATCATCGTGCTTTCGGTGATGAATGGATTAGAAGGTTACCAAAAACAACAGGTGCTCTCTTCCATTCCTCATGCGATTGTGAGTGAAGAACAGCCTATTTCTACAGAAAAAACATTAGAAAATTTACCGCACTTTGTCCAAAAAGCAGTGCCGATCAATACAACAAATGTGATTTACCAAACAACAAAAGGCGTAAGTGCAGGACAAATTATTGGTATTCAATTATTTTCTGATGATCCTTTGGTTGAATCTTTTGATCAGACTAAATTTAATGAAATTTTACCGACTGGTGAATTTAAATTGGTCATTGGCGATCAATTGGCACAAAAACTGGGCGTGAATATTGGGGATAAAATCCGTTTGATGATTACGGAAAATAGTCAATATACACCATTCGGTCGGGTGCCAATGCAACGTTTATTTACTGTTAGCGATATTTATTATGATTATGGCGAAGCATCGGGTTATGAAGCCTTTGCTAATATTACAGATATTGGTCGCTTAATGCGTATTCAACCGCAGCAAGCGCAGGGCTATCGTTTATTTCTGAATGATCCGTTCCAAATTACAGAACTCCCACAACATTTCTCAACACAAAAAATCACGGATTGGCGCGTACAAAAAGGTGAATTTTTCCAAGCGGTGAGAATGGAAAAAAATATGATGGGATTGCTGATTAGTTTGATTATTGTCGTGGCGATTTCCAATATTGTCACCTCATTAAGTTTAATGGTGGTGGATAAACAAGGGGAAATTGCGATCTTGCAAACTCAGGGCTTAACAAAATCCCAAGTTCGTTCAGTGTTTATTTATCAAGGATTACTGGTGGGATTTGTTGGCACATTGCTCGGTGCTATTTTGGGTGTTTTAGTCACCTTGAACTTAACAGACATTGTAAGTACGGTAAATCCACAAGGTGTTTTTTTACCGACAGAATTATCCTTTGTTCAAA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>NZ_LS483458|1319677:1381223|1364536_1365364_+|WP_111696737.1|DBSCAN-SWA MKLYTNNKCLDLSVPQIMGILNFTPDSFSDSGQFFSLDKALFQVEKMLEEGATIIDIGGESTRPNADEVSEQEELHRVVPVVEAVRSRFDCWISVDSSKAIVMRESASVGMDLINDIRALQEPNALETAVKLALPVCIMHMQGQPRTMQVNPHYENVVQDVLAFLQKRTNECLSAGIKKENLIWDMGFGFGKSVQHNYQLLQNLNEFCQIGYPVLAGLSRKSMIGAVLDKPVDQRVIGSAAGALIAAQKGAKILRVHDVAATSDMLKVWQAIENA >NZ_LS483458|1319677:1381223|1378284_1378443_+|WP_005628875.1|DBSCAN-SWA MFDINLTHEQQQKAVEQIQELMAKGISSGEAIQIVAKALREIHKNDKKTPEN >NZ_LS483458|1319677:1381223|1349824_1351723_-|WP_111696729.1|DBSCAN-SWA 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60 | Vibrio_phage(13.33%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1443241 : 1557161
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LS483458|1443241:1557161|DBSCAN-SWA 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105 | Mannheimia_phage(37.78%) | tRNA,tail,holin,portal,protease,terminase,integrase | attL 1431830:1431849|attR 1502412:1502431 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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