Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LS483476 | Bacillus lentus strain NCTC4824 chromosome 1 | 0 crisprs | DEDDh,DinG,csa3,cas3,WYL,Cas14u_CAS-V | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1246880 : 1254707
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LS483476|1246880:1254707|DBSCAN-SWA AATGAAGCCTGATTTCACGAAAGGTCTCATCCCTGCAATTGTGATAGATGACCAGAATGGTGAAGTCTTAATGCTCGCCTATATGGATGAGACAGCTTTTCAACGCACATTAGAAACGAAGGAAACTTGGTTTTATTCACGTTCGCGAGAAGAGTATTGGAATAAAGGCGCAACATCAGGCAATAAACAATTAGTGAAATCTATTCAATTAGACTGTGATGCAGATACGTTGTTAGTAAGAGTGGAGCCGCTTGGTCCCGCATGTCATACTGGTGCCAATTCTTGTTTTTTCGCCACACTCGATGGGGAAGTAGCAGAGTCAACCTCTATATATGCAGATTTGATGGATGAGATTGAAGAACGAAAAAAGGCACCTGTCGCTGGCTCTTACACGAACTATTTATTTGAAAAGGGCACAGATAAAATTGCTAAAAAGCTGATTGAAGAAGCGGGAGAAGTGATTATTGCAGCTAAGAATAATGATAAAGAGGAACTTATCAATGAATGTAGTGACTTGCTTTATCATACGCTCGTTCTTTTAGCAGAAAAAGGTGTCTCGCTTAAGTCGGTAGAAGATGAGCTACGAAAACGCTCTTCGAAAAAAGCTAATGCGAAAGAAGAGCGTCCTGAAATAAAAAATTGGTAGTATAGCTTAAAGTTCATGCCAAATGGAGTGGTGCCTCCCTTTGGCATGAGCTTTTTTCTTTGTTTTATGTGATCAAGTTTTTAGTACCACCTTAATGCAGTCATCTTCATGATTATTAAAAATTCGATACGCATGACTTGCTTCGTCAAGTGCTATCTTATGGGTAATAATTTCCTTAGGATCAAACTCATTATTGACTATTTTTTCATATAGCTCCGGCATGTAATGAACAACTGGTGCCTGTCCCATTTTTAAAGTGATGTTTCTTGAAAAAAAATCCCCAAGTGGAAATAGATTATAATTGGCTCCATACACACCAGTTAATTGGACAGTTCCGTATTTCCGAACAGCTTTTGTGGCTATTTGAATGGCACTAAGTGTCCCGCCTTGAAGTTTTAGTTTTTGTTCCATTTTTTCAACCGCTGACTTTTTACCATCCATACCGACGCAATCAATGACAACATCAGCTCCACCATTGGTAATTTCTTTCAAGTACGCACCCATATCATCTTGTTTGGTAAAATCATAAGTTTCAACTTTGTTTATTCTCTTTGCATGTAACAAGCGGTATTCCAAATAATCGACTGCGATAACTCTTCTTGCTCCTTTCATCCAGGCAAATTTTTGTGTCATTAGTCCAACCGGCCCACATCCTAGAACAATAACAGTATCTCCTTTTTTTACAGCTGCATTCTCCACGCTCCAATACGCTGTTGGAAGGACATCTGATAAAAAAAGTAAGGACTCATCCTCTAATTCACTCGATTCTGGAACTACAAAAGGAAGAAAATTACCAAAAGGAACTTTTAAAAACTCAGCTTGCCCGCCTGGATGATTTCCGAACATCTCCGTATAACCAAAATAGCCACCTGTATCTTGATGAGGATTGGCATTATCACATTGGCTTTCCATATCGTGCTCACAATAAAAACATCTTCCGCAGGCAACATTAAAAGGAATAATAACCCTGTCCCCTTTTTTTACTTTTGTTACATCAGGACCGACTTCTTCAACAATACCCATCGGCTCATGCCCAATGATATAGTCTTCTCGTATTTTCATATTACCTTGATAAAGATGTAAATCTGAGCCACAAATGGCTGTGGAAGTAATATGGACAATAATGTCATCCCTTTTTTTTATTGTAGGGTCGTCTACATTTTTTACTTCAACTTTTTTCGGTCCTTGATAAGTGACGGCTTTCATATTTACCACTCCCATCATCGAATTATCTCTTTGGTATGATGCCCTTTTATAAATAAAAAAAACATAGGTTGGTTTTTGACAATTTGTATAATTGTGAGTATAATCACAATTATTGAATTTCATTTTTAACGCTTGGCTCTTTCTAAAAAATTGATGTTTTTAAAATAAAACTGTTGAAGGTTACATACATAGGAGTGACATAAATAATGAGTGATGTTTCATTTGATACACTTGCTGTACATCAATCACAAAAACAAAACAATAACTTCAAAACAAAAGCTTCGCCTATTTATCAAACGTCATCTTTTTCTTTTAATGATCTTGATGATTTGGAAGGGTATTTTAAAGGAGATACACCATATTTATATTCTAGATATGGAAATCCGAATACAGATGAACTAGGGGCCGCAGTGGCCGCATTAGAAGGTACAGAGGCTGGCGTAGCAACTTCATCTGGAATGTCAGCTATTATGTCTGGAATTCTCGCCATCGTCAAACAAGGAGACCATATTATAGCTTGTGAGGATTTATATGGAGGAACATACCACCTTCTTGATGATGAGTTGAAAAACTTTGGTATCGAGGTTACATTCGTATCCTTCTCTAATGAAAAAGAAGTACGGGCAGCCATTCGCCCAAATACAAAGCTGTTTTATACAGAGAGTATTACAAATCCCTTTTTAAGGGCTGAGAATATTCCTTTATTCGTAAAAGTTGCTAAGGAACACAACTTGTTTACGATCGTTGATAATACATTTGCTACTCCATACTTGCTACAACCATATAAAGATGGCGTAGATCTTGTTGTTCACAGTGCAACAAAATACCTTGGTGGCCACAGTGATGTATCAGCGGGCGTAATTGTCGGCAACAAAAACCTTATTGGGAAAGTCCGTCAAAAAGTAGTTAGTTTGGGCGGGAATTTAAGTCCATTTGAGGCATGGCTTACATGCAGAGGGATTAAAACGCTTGCCCTACGTATGGAAAAGCAATCAGCAAATGCACAATTAGTTGCAGAATCATTAGTGGATAATGAAAATGTGTCAAAAGTATTTTATCCGAAATCTGTGTCTGAACAAGGAAATGGAGCGGTTGTAACTGTCGAAATTGCACCTCATTGTGATGTCCATTCCTTTTTTTCTTCACTTGGTTGGATTAAAATTGTGCCATCTTTAGGTGGAGTGGAAACAACTGTTTCTTATCCACTTGGATCATCACACCGTAACTTACCTCCTGAAACACAAGAAAAACTTGGGATAAATGAGAGGGTAGTACGTATTTCAATTGGTATCGAAAAAGATCAGGATATTATTAATCAGCTTCAGTACGCTATATCGAAAGCGTTGAAGAATTAGTATTGCATTAATATTCTAAAAAGGGTTTGACAGTTACAAAATCGTAGTTTATACTGCATACATAGGTAATAGTTAAAATTTTATAACAATTAAATCGTAATCTCTTATCGAGAGTGGCGGAGGGAATAGGCCCTGTGAAGCCCGGCAACCTGCAAACAAATTGTGTTTGAGAAGGTGCTACATCCTACAGATCATAATGATCTGGAAGATAAGAGGAGGAATCGTCCACACGCCCTCTTCTTATGAAGAGGGCTTTTTATTTTTTTATAGAAAATGTGGGTTGATTTGTAATAGTTTAATTTTAAAACCAAGTAAATATATGAGTTTAATTATTAATAGGGGGAAATATCAATGAAATCATGGATTATTAAAACATTAATATTAATCATCGCTGTAATGGCAATTGCAGGCTGTTCAAGCAATGCAAGTGGAGAGGCGAGTAAACCGAAAAAAATTATCTTAGACTATGCACATTATTCACCAACAAGTCTTGTGTTAAAGGAAAAAGGATTTGCTGAAAAATTGTTTGAAAAAGAAGGGATTGAAGTTGAATTTGTTTTAAGCCAGGGAAGTAATAAGGCACTCGAGTTTTTAAATTCTAAAAGCGTAGATTTCGGCTCATCTGCTGGGGCGGCAGCGTTAATGGCAAAAGCTAAAAATTCTCCAATTGAATCTGTATATATATATTCTAAACCCGAATGGACAGCACTTGTTTCTACAGATGAGACAATCAAGTCAGTAGAAGATTTAAAGGGGAAAAAAGTAGCAGCTACACTGGGAACAGATCCATATATATTTTTACTGAGAGCAATAGAAGAAAGCGGGCTATCTGCTAAAGATGTTGAAATCATCAACTTGCAACATGGTGATGGAGCGGCTGCACTTCTTTCTGGAGAGGTAGATGCTTGGGCAGGACTTGATCCTCACATGGCGCGTGTAGAAAAGGAAGTTGGTGCTAATCTTTTCTTTAGAAATCCAGACTTTAACACTTATGGGGTATTAAATGTCCGTCAAGATTTTGCTGAAAAGTATCCTAAATATGTAAATAAGGTAATTGAGGTATATGAAGAGGCTCGTCAATGGTCCATTGAAAATCCTGAAGAAACAGCAGAAATATTAGCAAAAGAAGCTCAAATTGATTTAGATGTAGCCAAAATCCAATTGGAGCGTAATGATTTTTCTGCATCTGTACCTGGAGACGAGCAGATAGCAATAATTCAAGCTGCAGGTGACGTACTTAAATCAGAAGGAGTTATTGATTCGAAAACAAATATCGAAGAGGTCGTTGATAACTTAATCAATCCAGACTTTTTCGAGTGAAGGAAGGTAATAAATATGAGTGGAAGAAGTGATTCAATACGAGTGCAAATAAATAAGTCGAAAACACGTTTTACCACAAATTTACTATGGAAGAATAATGAAAAGTGGGTATTAGGAAGCATCATTCCTCTTGTATTGCTAATTATTTGGGAAGCTGCTGCGAGAGTTGGACTAATCGAAGCACATCTCCTTCCAGCACCTACAAGGATCATTCAAGAGATTTTTGAAATGGGAGCAGGGGGTACTTTATTCAGTCATGTAGGGGCAACGGTGTTTAGAGTTGCGACAGGCTTTTTCCTAGGTACGATTGCGGCAGTCCTACTTGGATCGGCGGTAGGGTATTTTACAGTATTAGAAAAGTTGATGGATCCACTTATTCAGGCGTTTCGATCAATTCCATCCCTTGCGTGGGTACCACTGTTTATTCTCTGGATGGGGATTGGTGAGCCATCCAAAGTGACATTAATTGCGGTCGGTGTGTTTTTTCCAGTTTATTTAAATATTGTATCTGGCATTCAAGGTGTAGATAGAAAGTTAATCGAAGTAGGGAAAATTTACGGGTTCACCTCAACTGAAACATTAAGGAAAATCATCCTTCCAGCTTCTTTACCATCTTTCATGGTCGGTTTACGAAGCGGAATGGGACTTGGTTGGATGTTTGTTGTAGCAGCAGAGATTATGGGAGCAAGTCAAGGGTTAGGTTACTTGCTGGTGGTTGGTCAAAATACGTATTCACCTGAATTGATCATTGCAAGTATTTGCTTATTTGCAGGCATTGGAAAAATAACTGATGCATTGTTGAAAATATTGGCAGAAAGGTCACTTCGCTGGCAAGATAGTTTGTCCAATCAGCGGTAAAGGAGGTCATGAAATTGCTCGCAGTTCAAAATGTAAGTCGTACATTTAATAATGGAAAAGCCGGTTTTCAAAATGTGACTTTTTCGATGACAGAAGGAGAAATCATTGGGGTCCTCGGTACAAGCGGCAGTGGAAAAAGTACTTTGCTGCGGGTTCTCTCAGGACTTGATGAAGAATATGAAGGATCATTTACTCTCTCTAATCGCAAAGTTGGGATGATGTTTCAAGAACCCCGCTTAATGCCTTGGTTATCTGTACAAGACAATATTTGTTTCGGTATTCAATCGGTAGCAGAGCAGAAGCTTGCAAAAGACTTACTAGAACTTGTCGGTCTTAATGGTTTCGAAAGACACTATCCGAAAGATTTATCAGGAGGTATGGCACAGCGAACTGCCATTGCACGCTCCCTCATTACAGAACCAGATGTCTTACTATTAGATGAACCATTTAGTGCGCTTGATGCCTTTACAAAAATGCAACTGCAAGATTTGCTACTTTCCATTTGGAGAAGGCGGAAAACAACGATGGTACTTGTCACACATGATATAGATGAAGCTCTCTATTTATGTGATCGGATTTTTATTTTGCGGGGCCAGCCAGGTGAGTTATATGCGGAAATTACGATTAATCAAAAAAAGCCGCGATTAAGAGGCGATGTAGGCCTTGCGGAGAAAAAGGCTGAAATTTTAAGTCTTCTTAATTTATACAACGAGATAAAGGAGAATGGAAAATGAGCAGACAAGAAATAATCCAACCATTTGCAGGTACACATAATGTGCAATCTGATCTTGCCGGTCGTAACTCGATTGCGTGGGAAGAGATCGAAAAAAGCTTTAGCTGGCATGAGACAGGTAAAGTAAATATGGCATACGAAAGCGTGGATCGGCATGTGGCCGACGGTTTTGGCGATAAAATAGCTCTTCATTATGTGGAGGAGGGTAGGGAATGGAAGATAACTTATAAAGAGTTAAAAGAAAAGACAGATAGCTGGGCACAAGTGTTAAAAAAGAACGGTGTGAAAAAAGATGATTTTCTTTTCGTCTTTTTACCGAAGCATCCGGAATGTCATATTGCAATTTTAGCAGCAATTAAGCTTGGCGTTATTGTCGGACCACTTTTTGAGGCATTTATGGAGGAAGCTGTCCGTGACCGGATTGCAGATTGTGAAGGGAAATATATAATTACAAATGAAGAATACTTACAGCGTGTGCCACTTAAAGATTTATCAAGCCTTGAAACGATATTTTTGACAGATGAAAATCCTGATTATTTAGAAGCGATATCGATTCCGAAAGAATTGGAAAAGATCGACACAAATGAAAGTATCATCGAATGGGTGGATCTTGATGATGGGTTGAACATTCATTATACAAGTGGTTCAACAGGCAAACCCAAAGGGATTATTCATGCGCATAGGGCGATGATTCAGCAATACATAACTGGTCGTTGGGTGTTAGATATAAAAGAAGAAGATGTTTATTGGTGTACGGCACATCCAGGCTGGGTAACAGGCTGTGTCTATGGGATTTTCGCACCACTTCTGAATAGGGCAACAGTCGTTATTCATGGAGGTCGCTTTAATGCTGATAGCTGGTATGAAACGATTGAAAAAACAGGAGTCACTGTCTGGTATAGTGCGCCGACTGCTTTCCGTATGCTGATGGCAGAAGGAAATGAAGCACTTGGCCGCCATGACCTCAGTAAGTTGCGTCATATTTTAAGCGTAGGGGAACCGCTTAATCCAGAAGTCATTTACTGGGGTGTGGAAAATCTGAACTTACGTATCCACGATACATGGTGGATGACTGAAACAGGTGCGCAGTTAATTGTAAATTTACCGACTGAAGCGATTAAACCAGGATCGATGGGAAAACCACTACCGAATATTGAAACGGCTATTTTTGATGACGATGGGAATATTCTACCGTTAGGTGAAGTAGGCCATTTGGCAATTAAAGGACCGTGGCCTGCGATTATGAAGGGAGTTTGGAAGGACGAGGCAAAATATGCATCATATTTTCCATTTGGGCCAGAATGGTATCTCGCTGGGGATTTAGCTTCCAAGGATGAAGAAGGTTATATCTTTTTTCAAGGAAGAAGTGACGATATGATTAATTCTTCTGGTGAACGAATTGGACCATTCGAAGTCGAAAGTAAGTTAATTGAGCACCCAGCAGTAGCCGAAGCAGGTGTTATTGGCAAACCTGACCCAATTCGTGGGGAAATCGTAAAGGCATTTATTGTATTAAACAAAAATTATTACACGAGTCCCACACTGCTTGAGAACATACGTCTTTTTGTCAGAGGCAGACTTGCGGCCCACTCCGCACCTCGTGAGATTGAAGTAGTCGAGGAACTACCAAAAACAAAAATTAGCGGAAAAATATTACGTCGTGAGCTTAAAGCGAAGGAAATAGAGAAATTAAAGTTAATTCATGTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LS483476|1246880:1254707|1247597_1248731_-|WP_066140743.1|DBSCAN-SWA MKAVTYQGPKKVEVKNVDDPTIKKRDDIIVHITSTAICGSDLHLYQGNMKIREDYIIGHEPMGIVEEVGPDVTKVKKGDRVIIPFNVACGRCFYCEHDMESQCDNANPHQDTGGYFGYTEMFGNHPGGQAEFLKVPFGNFLPFVVPESSELEDESLLFLSDVLPTAYWSVENAAVKKGDTVIVLGCGPVGLMTQKFAWMKGARRVIAVDYLEYRLLHAKRINKVETYDFTKQDDMGAYLKEITNGGADVVIDCVGMDGKKSAVEKMEQKLKLQGGTLSAIQIATKAVRKYGTVQLTGVYGANYNLFPLGDFFSRNITLKMGQAPVVHYMPELYEKIVNNEFDPKEIITHKIALDEASHAYRIFNNHEDDCIKVVLKT >NZ_LS483476|1246880:1254707|1252278_1252998_+|WP_066136572.1|DBSCAN-SWA MLAVQNVSRTFNNGKAGFQNVTFSMTEGEIIGVLGTSGSGKSTLLRVLSGLDEEYEGSFTLSNRKVGMMFQEPRLMPWLSVQDNICFGIQSVAEQKLAKDLLELVGLNGFERHYPKDLSGGMAQRTAIARSLITEPDVLLLDEPFSALDAFTKMQLQDLLLSIWRRRKTTMVLVTHDIDEALYLCDRIFILRGQPGELYAEITINQKKPRLRGDVGLAEKKAEILSLLNLYNEIKENGK >NZ_LS483476|1246880:1254707|1250437_1251406_+|WP_066136569.1|DBSCAN-SWA MKSWIIKTLILIIAVMAIAGCSSNASGEASKPKKIILDYAHYSPTSLVLKEKGFAEKLFEKEGIEVEFVLSQGSNKALEFLNSKSVDFGSSAGAAALMAKAKNSPIESVYIYSKPEWTALVSTDETIKSVEDLKGKKVAATLGTDPYIFLLRAIEESGLSAKDVEIINLQHGDGAAALLSGEVDAWAGLDPHMARVEKEVGANLFFRNPDFNTYGVLNVRQDFAEKYPKYVNKVIEVYEEARQWSIENPEETAEILAKEAQIDLDVAKIQLERNDFSASVPGDEQIAIIQAAGDVLKSEGVIDSKTNIEEVVDNLINPDFFE >NZ_LS483476|1246880:1254707|1246880_1247525_+|WP_066136562.1|DBSCAN-SWA MKPDFTKGLIPAIVIDDQNGEVLMLAYMDETAFQRTLETKETWFYSRSREEYWNKGATSGNKQLVKSIQLDCDADTLLVRVEPLGPACHTGANSCFFATLDGEVAESTSIYADLMDEIEERKKAPVAGSYTNYLFEKGTDKIAKKLIEEAGEVIIAAKNNDKEELINECSDLLYHTLVLLAEKGVSLKSVEDELRKRSSKKANAKEERPEIKNW >NZ_LS483476|1246880:1254707|1251421_1252264_+|WP_082788544.1|DBSCAN-SWA MSGRSDSIRVQINKSKTRFTTNLLWKNNEKWVLGSIIPLVLLIIWEAAARVGLIEAHLLPAPTRIIQEIFEMGAGGTLFSHVGATVFRVATGFFLGTIAAVLLGSAVGYFTVLEKLMDPLIQAFRSIPSLAWVPLFILWMGIGEPSKVTLIAVGVFFPVYLNIVSGIQGVDRKLIEVGKIYGFTSTETLRKIILPASLPSFMVGLRSGMGLGWMFVVAAEIMGASQGLGYLLVVGQNTYSPELIIASICLFAGIGKITDALLKILAERSLRWQDSLSNQR >NZ_LS483476|1246880:1254707|1252994_1254707_+|WP_066136575.1|DBSCAN-SWA MSRQEIIQPFAGTHNVQSDLAGRNSIAWEEIEKSFSWHETGKVNMAYESVDRHVADGFGDKIALHYVEEGREWKITYKELKEKTDSWAQVLKKNGVKKDDFLFVFLPKHPECHIAILAAIKLGVIVGPLFEAFMEEAVRDRIADCEGKYIITNEEYLQRVPLKDLSSLETIFLTDENPDYLEAISIPKELEKIDTNESIIEWVDLDDGLNIHYTSGSTGKPKGIIHAHRAMIQQYITGRWVLDIKEEDVYWCTAHPGWVTGCVYGIFAPLLNRATVVIHGGRFNADSWYETIEKTGVTVWYSAPTAFRMLMAEGNEALGRHDLSKLRHILSVGEPLNPEVIYWGVENLNLRIHDTWWMTETGAQLIVNLPTEAIKPGSMGKPLPNIETAIFDDDGNILPLGEVGHLAIKGPWPAIMKGVWKDEAKYASYFPFGPEWYLAGDLASKDEEGYIFFQGRSDDMINSSGERIGPFEVESKLIEHPAVAEAGVIGKPDPIRGEIVKAFIVLNKNYYTSPTLLENIRLFVRGRLAAHSAPREIEVVEELPKTKISGKILRRELKAKEIEKLKLIHV >NZ_LS483476|1246880:1254707|1248937_1250086_+|WP_111703418.1|DBSCAN-SWA MSDVSFDTLAVHQSQKQNNNFKTKASPIYQTSSFSFNDLDDLEGYFKGDTPYLYSRYGNPNTDELGAAVAALEGTEAGVATSSGMSAIMSGILAIVKQGDHIIACEDLYGGTYHLLDDELKNFGIEVTFVSFSNEKEVRAAIRPNTKLFYTESITNPFLRAENIPLFVKVAKEHNLFTIVDNTFATPYLLQPYKDGVDLVVHSATKYLGGHSDVSAGVIVGNKNLIGKVRQKVVSLGGNLSPFEAWLTCRGIKTLALRMEKQSANAQLVAESLVDNENVSKVFYPKSVSEQGNGAVVTVEIAPHCDVHSFFSSLGWIKIVPSLGGVETTVSYPLGSSHRNLPPETQEKLGINERVVRISIGIEKDQDIINQLQYAISKALKN |
7 | Bacillus_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2505248 : 2565479
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LS483476|2505248:2565479|DBSCAN-SWA 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59 | Bacillus_phage(29.41%) | integrase,coat,transposase,tRNA | attL 2496776:2496791|attR 2510700:2510715 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
3364939 : 3372434
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LS483476|3364939:3372434|DBSCAN-SWA CATGTATTACTATAGAGAGGGAGTGAATTTTATGAAAAATAAAAAAATACTCATTATTACATTTGGAGCTGTTCTTTTTGCTATCGTTACATATCTCACTTTCACTTTGTTAAACAATGACAAAAACGATGTCACTGTTAAAGAAAAAACCGCGATTACAAAATCTGGAGGAAATACTCAAGTTGAAACATCGGTAATTGAAATTGATGAACAAAGAGAGGAAACGATTGAAGAAGAGTTTCCTAATGATACAAGTGAATATGCTATTCAAGACGCTATACATGGAATGTCACATCAAAAAGTGATAGCGGAAGAAAAATGGGGTTTTCTTCCTTTAACTCAAGAGCGTGTAAAACGTTTAATAGAAGTAGTTGAAATGAATGAAAGCAAATACATACATGCTAGTACATACTTACGCATTCTTGAGCGTTGGGAGAATAATGATTTCACACAAGCAGACAAAGACCACAACGCTGTTTGGAAATTGCAAGGTGGTACGATTGGAAAGGCCTCTGGCGTTCTGTCTCTTGATGAGGAAAAAGCATTTATTAAAAAACATTTTAATATTAAAGCGAAGGCGGTAACATCAGAATCGAATTGATGTTACCGTTTTTCTTTTTATCTTAGAATGAGCATTTTACCCAATATTAACTGTTAAAAGTCAAATAATTAACCATTGCAAGCATTTTTTGTTTAAAATGAAAGCTGATGGTTAATATGATATGGTATAAACTTTATTTATACACTCTAAATTCATTCGTTTGACCTTTACTGACCATCGTTGTATGATATTATTACATCATATGTAAAAGAGCAAAGAGCTTAAGTTAAACCATCTGATTTTTTATAAGGAGGAGAAACATTATGAATTTAATTCCAACAGTTATTGAACAAACAAGTCGTGGAGAGCGGGCCTATGATATTTATTCACGGTTATTAAAAGATCGTATCATCATGCTCGGTAGCGCTATTGACGATAATGTCGCTAACTCGATCGTATCACAATTGTTATTCTTGGAAGCTGAAAATCCCGAGAAAGACATTTCTATTTATATAAATAGCCCAGGCGGAAGCATCACTGCAGGAATGGCTATTTATGACACAATGCAATTTATCAAACCAAATATCCAAACAATTTGTATCGGTATGGCTGCATCTATGGGGTCGTTCCTACTTGCTGCAGGTACAAAAGGAAAACGTTACGCTTTACCGAACAGCGAAGTAATGATTCACCAACCACTCGGTGGTGCGCAAGGTCAAGCAACGGAAATTGAAATTGCTGCGAAACGTATTCTTTTCTTACGTGAAAAACTTAATCAAATTCTGTCTGAACGTACAGGGCAGCCAATTGAAGTAATTCAACGTGATACAGATCGCGACAACTTTATGACAGCTGAAAGAGCAAAGGAATATGGATTAATCGATCATATCCTGCAACGCCATGAAGAAATCGAGAAAAAATAACCTTTTTTTCTCATCAAAAACGCTTGAGATAATGTCTCAAGCGTTTTTCAATATAAAAAATTGATTCATACTTCTTGAAATTGGATATGGTGCAAATTAGCAAAGATGCCACCTTGATTTACTAAATCGGAGTAAGTGCCATCCTCTGCAATTCCATCTTCTGTTACAACTAGGACTCTATCAGCATCACGGATTGTTGCTAAACGATGTGCAATCACTAAAGTTGTACGATTTTCTGCAAGTTCATTCAATGCTTGTTGAATTATTTTCTCTGTTTCTGTATCTAACGCAGATGTCGCTTCATCTAGAATAAGTATTGGTGGATTTTTTAAAAACATACGCGCAATGGCCAATCTCTGCTTTTGCCCCCCAGATAATTTTAAACCACGTTCCCCAATTTGTGTTTCATAACCATCCGGTAATGAAGCAATAAAGTCTTCCAAATGTGCCTTTCGTGCGGCGCTGTAAATTTCTGCATCACTTGCATTTCTGTTTCCATATGCAATGTTTTCCCAGATCGTTCCAGTGAATAAAAAGACATCCTGCTGAACTATTCCAATATGTGAGCGTAGTGAATGCTTTGTCATATCGCGAATATCGATACCATCGATGGAGATTGAACCCGCATTTACATCATAAAACCTCGGTATCAACGAACATATAGTTGTTTTTCCCGCACCAGATGGACCGACAAAGGCTACAGTTTCCCCGGATTGTATATTTAAGTTAATTCCCTTTAATACCGCTTGATGTTCATCATATTTGAAATACACATCATTAAATTGAATATCACCAACTAATCCGTGCACCTCCTCGGCATGTGGCCGATCCTGGATCTCCGGTTCTTGCTCGATTAAATCTCGAAACCGTTTGAATCCAGCCATTCCTTTAGGGTACAATTCCAGCAATGCGCTGATTTTATCAATTGGTTTAATCAAGACATTAACGTACAAAACAAAACTAACAAGCTCACCATATGTAAGCTTTCCATTAAAACTAAACCAGGCTCCAACAACCAGAACTAATAGAGTCACAAGACGAGTCATCATATAGATACTAGAATGCGTCCAAGCCATCACCTTATATGCAACAAGTTTTGCTAAGCGAAAATTGCCGTTATCTTCTTTAAAACGAGAGATTTCAAACTCTTCATTTGTAAATGATTGAACTACTCTAGCGCCCGACACACTATCCTCAACACGTCCATTCACATCTGCAATTTTCCCATACATATTCTTCCACGCTTGATTCATTTTTACATTACAAAATGTCACAAGCCAAATAAGGAACGGAACCATAATAATAGCGATAATAGCTAGCTGTGGATTAATATTGAACATGATTGCAAAGGCACCAACAAAGGTCATGATCGCAATAAAGAAATCCTCTGGTCCATGATGGGCAAGCTCACCAATATCGAATAAATCATTTGTAATTCTACTCATGACATGTCCTGTTTTCGTATTATCAAAAAAGCGAAACGATTGCCTTTGCACATGGGTAAATAACTCTTCCCGCATATCCGTTTCTATATTAATTCCTAGCTTGTGTCCCAAGTAACTCACGATAAACTGAAGACCTGTACTTAGAACATAAACAAGTAACAATAATAAACCTACTGTTACAATTGTGCTCCAATTCCCCTCAGGTAAAAGTTTATCTATAAACCACTGGACTGCAACTGGGAATGCAAGCTCTAGAATGGCTACTATTACGGCACTAGTAAAGTCAATAATAAACAGTCGCTTATGGGGTTTATAATAGGAAAAAAATTGTTTTAGCATCACGCTTCTCCTTCAGTAACCATTTCATTCTTTTATTTTTTTGGAGCCGAAGCAAATGATTCATCGCCCGCTCTTAATTTCTCCGCGATTTCATCAATTTTACGTAAACGGTGATTAATTCCTGATTTACTAATCGAACCACTCGAGAGCATCTCACCTAATTCTTTTAACGTAACATCTTGATGTTCTACTCTCAAGACAGCTATTTCTCGTAGCTTATCAGGTAGAATATCGAGCCCGACAGACTGTTCAATATAGCGAATATTTTCTACTTGCCTAAGAGCTGCACCAATTGTTTTATTTAGATTAGCTGTTTCGCAATTAACCAGTCTATTTACTGAATTTCTCATATCACGGACAATTCTAACATCCTCAAATCTTAGCAATGCTCCATGCGCCCCAATCACACTAAGAAACTCAGTAATTTTTTCTGCTTCTTTTAAGTACGTTATAAAACCATTTTTGCGTTCTAATGTTTTACTATTTAATTGAAAGTCATTCATTAATTCACAAAGGGAATCATTATGTTCTTTGTATAGCGAAAACACTTCAAGGTGATAAGAGGAAGTTTCTGGGTTATTTACTGAGCCACCAGCGAGAAAAGAACCTCGTAAATAAGACCTTTTACAGCATTTCTTTTTAATCAAATCCTTAGATATGTCATGAACAAAAGTGATTCCTTCTCCAAGAATTTTTAAGTCTCTAAGCATTTTTTCTGCATTTTTTTTCAGGCGCACGATATATACATTGTTTTTTTTCAAACGCATTTTCTTTCTGACGAGCAATTCAACATCTGCATCGTACAATTTCTTTAATAATGTATAAATTCTCCGTGCAATAGCCGCATTCTCCGTTTGAACGTTCACAATTAGTAATCGATTAGAAAATGATAAAGAACCATTCATTCGAATCAATGCTGATAATTCAGCTTTTGCACAGCAGTCTTTCACATCTAAGTTTGTAAGTTCTTTTTTCGTTTCCGAGGCAAACGACATCTTCCTACCTCCTAACAACTATTATGTCTGAGCGATATGATCTGTATCTCGCCCCAAAAGTGAATAGAGGATATTTGCCACTTTTTCAGTATCATGTCGAATGAAACCATGATCAAAACTAATAATTTCATCATGGATCACTTCCATTCCAAGTGCGACCAATCGGTCCACATCAAACAATACCGGTTGGGCTTGCTCTTCTTGATAGCGATTTTGTATTTCAACAGGAACAGCTTCATTATTGACTAGAATGATATCAATAAACGGACATAGCATGTGGTTATACAATGCGTCAACATGTTGACTTGCTGTGAATCCAAGTGTTTCCCCTGCCTGTGTCATTAAATTACATATATATACTTTCTTTGCTTTTGCCTTACACACCTCTTCTCCCAGTCCGGGTACAAGTAAATTAGGCAAGATGCTCGTATAGAGGCTCCCAGGCCCCACAACAATTAAATCAGCCTCACGGATTGCTCTAATTGTTTCAGATAAAGGTTTGATAACCTCTGGTGTTAAAAAAACACGTTTGATTTTTTTACCCGATTCGGGAATTTTTGATTCTCCTGACACGATTGTTCCATCATTCATCTCGGCATGCAAAACAACACTTTGATTTGCCGCTGGCAAGACTTTCCCATGTACATTAAGCACTCGACTCATCTCATGGACCGCATGAACAAAATCACCAGTAATAGATGTTAATGCTGCGATAATTAAATTACCTAAAGAATGTCCCGATAGTTCATTGGCTGTTTGAAAACGATGCTGAAACATTTCTTCAACGAGCGGTTCTACATCAGACAATGCCGCTAACACATTTCTAATATCACCTGGTGGTGGGATTTCCATTTCAGATCTAATTCTGCCAGAACTTCCACCATCATCAGCAACGGTTACAATCGCGCTAATATCTACTGGATATTTTTTTAATCCACGTAATAGAACAGGTAAACCTGTTCCACCGCCAATTACTACAATTTTCGGCTTTTGGTCTTGTTTCATCGCTGCAATTCCTTTCTTTTCTGAATATCTCGGTGTGTTACTTGAATATGGTATTCTTTTTCGTAAAATTTTCCGATATATTCAGCAAGTGCGACTGAGCGATGCTGACCTCCTGTACATCCAATTGCGACAACAAGTTGACTTTTTCCTTCACGTTTATAATGAGGTAACATAAAGGTTAATAAATCTGTTATTTTCGATAGAAATTTTTGTGTATCATTCCACTTCAAAACATAATTAGATACTTCTTCTTCAAGACCTGTCTTTGGTCTCATATGATCTATATAATGGGGATTAGGTAAAAAGCGAACATCAAAAACTAAATCTGCGTCAATCGGAATACCATGTTTAAATCCGAATGACATCATGTTCACTGTAAATATTGCTTGCTTATTTGCCGAGAATTCTACAAGTATCTTTTCCCTTAATTCTTTAGGCTTCATATTCGATGTATTGTAAATAAGCTGTGCTCGTCCTTTCAGATCTTCGAGCAAGCTTCTCTCTTGAGTAATTCCGTCGAGTGGCAATCCAACAGGTGCTAATGGGTGAGAACGTCTAGTTTCTTTATATCTACGAACAAGCGCTGCGTCATCAGCATCTAGATATAAGATTTGTGGGGTTACCCATGTTGAATCACCAAGCTCATCGATCACACGTAAAAGTGTATCGAAAAACTCTCTACCTCGTAAATCCATAACAAGCGCAACTTTATTCATTTTATTTCCTGATTCTTTCATTAGCTCAAGGAACTTTGGCATAAGCGCAGGAGGTAAATTATCAACGCAAAAGAAACCCAAATCCTCAAAACTATGGACGGCTACCGTTTTACCCGCACCAGACATCCCTGTAATGATCACTAATTGCACGTCATCTACTAAACCAGCATTCATTTCCTACACCCCTATTCCTATATATAATATATACATTTCATTTATCAATAAAAGTACGTTCTTACCATTATACTATTTCTATCAACATTAAAACAGATCTACTTTTTTACAGAAAAGCGGAAGCATCCGTAGATTCCATACAAACCATGCACAAAAATGTAGATACAGACTTGCAACAAAAAAAAGCACAGGCTAGGCCTGTGCACAAAGAAAGGGATATTGTATAAAAAGGGGGTCAATATCTCATGTTTATACTATAGCCGAAAAACATTTCAGCACTGTTACAGTAGCATTAAAACACGGTTACTTTTAAATCAGCATATTCATTGGACTTAGCCTGTGATCTTACACTAACGGTAATCCCCTGCTTAGCCAGTGTGTTTTCACATCAAGAGCAACCTAATAATATTTTATTGTGTTTGTAATTGTTCCATTAAATTTTCAATATATATTTGCGCACTTTGAGCAGCAATACTGCCGTCTCCAGTTGCAGTGACAATTTGTCTCAACAACTTATCACGTACATCCCCTGCAGCAAAAATGCCTGGAGCTTTTGTTTCCATATTGTCGTTTGTTTCAATATAGCCTTCTGCATTAGTGATTCCAAGATGTGCGAATGGCTCTGTTAAAGGATCCATCCCAATGTAAATGAATGCTCCATCTGCACTAAATTCTTTTTCTTCACCGGTTTCAGTTGAAACAAGTGTTGCAGAACCTAGCTTGCCGTCTTTTCCATTGAATTCTTTTACTGTATGGTTCCAGATAAAATTAACTTTTTCATTTGCAAAAGCACGATCTTGTAGAATTTTTTGAGCTCGAAGTTCATCTCTCCGGTGAACAATTGTAACTTTATCGGCAAATCTAGTTAGAAAGACACCCTCTTCAACTGCTGAGTCACCGCCACCAACAACGATAAGTTCTTTACCTTTAAAGAAAGCACCATCACAAACAGCACAATATGATACACCGCGCCCTGTCAGTTCTTGTTCTCCTGGAATCCCCATTTTGCGGTATTCTGCACCAGTTGTGATAATAACTGTTCGAGTTTTATATTCTTTTGATCCTGCTTTTACAGTTTTAAACTCTTTGCCATCAACTACTTCTTTAATATCACCATAAGCATATTCTGCACCGAATTTTTTTGCATGTTCAAACATTTTTGTAGATAAATCAGGACCCAAAATATGTTCAAAACCTGGGTAGTTTTCTACATCTGCTGTGTTTGCCATCTGTCCACCCGGCATACCTCTTTCGATCATTAAAGTAGATAAATTGGCACGTGACGCATAGACTGCTGCAGTCATACCAGCTGGACCAGCACCAACAATAATCACATCATAAATTTTTTCTTCTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LS483476|3364939:3372434|3370182_3371076_-|WP_066141824.1|DBSCAN-SWA MNAGLVDDVQLVIITGMSGAGKTVAVHSFEDLGFFCVDNLPPALMPKFLELMKESGNKMNKVALVMDLRGREFFDTLLRVIDELGDSTWVTPQILYLDADDAALVRRYKETRRSHPLAPVGLPLDGITQERSLLEDLKGRAQLIYNTSNMKPKELREKILVEFSANKQAIFTVNMMSFGFKHGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDHMRPKTGLEEEVSNYVLKWNDTQKFLSKITDLLTFMLPHYKREGKSQLVVAIGCTGGQHRSVALAEYIGKFYEKEYHIQVTHRDIQKRKELQR >NZ_LS483476|3364939:3372434|3366467_3368186_-|WP_066141832.1|DBSCAN-SWA MLKQFFSYYKPHKRLFIIDFTSAVIVAILELAFPVAVQWFIDKLLPEGNWSTIVTVGLLLLLVYVLSTGLQFIVSYLGHKLGINIETDMREELFTHVQRQSFRFFDNTKTGHVMSRITNDLFDIGELAHHGPEDFFIAIMTFVGAFAIMFNINPQLAIIAIIMVPFLIWLVTFCNVKMNQAWKNMYGKIADVNGRVEDSVSGARVVQSFTNEEFEISRFKEDNGNFRLAKLVAYKVMAWTHSSIYMMTRLVTLLVLVVGAWFSFNGKLTYGELVSFVLYVNVLIKPIDKISALLELYPKGMAGFKRFRDLIEQEPEIQDRPHAEEVHGLVGDIQFNDVYFKYDEHQAVLKGINLNIQSGETVAFVGPSGAGKTTICSLIPRFYDVNAGSISIDGIDIRDMTKHSLRSHIGIVQQDVFLFTGTIWENIAYGNRNASDAEIYSAARKAHLEDFIASLPDGYETQIGERGLKLSGGQKQRLAIARMFLKNPPILILDEATSALDTETEKIIQQALNELAENRTTLVIAHRLATIRDADRVLVVTEDGIAEDGTYSDLVNQGGIFANLHHIQFQEV >NZ_LS483476|3364939:3372434|3368218_3369181_-|WP_066141830.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTNLDVKDCCAKAELSALIRMNGSLSFSNRLLIVNVQTENAAIARRIYTLLKKLYDADVELLVRKKMRLKKNNVYIVRLKKNAEKMLRDLKILGEGITFVHDISKDLIKKKCCKRSYLRGSFLAGGSVNNPETSSYHLEVFSLYKEHNDSLCELMNDFQLNSKTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSVIGAHGALLRFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTIGAALRQVENIRYIEQSVGLDILPDKLREIAVLRVEHQDVTLKELGEMLSSGSISKSGINHRLRKIDEIAEKLRAGDESFASAPKK >NZ_LS483476|3364939:3372434|3371486_3372434_-|WP_066141821.1|DBSCAN-SWA MAEEKIYDVIIVGAGPAGMTAAVYASRANLSTLMIERGMPGGQMANTADVENYPGFEHILGPDLSTKMFEHAKKFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVKAGSKEYKTRTVIITTGAEYRKMGIPGEQELTGRGVSYCAVCDGAFFKGKELIVVGGGDSAVEEGVFLTRFADKVTIVHRRDELRAQKILQDRAFANEKVNFIWNHTVKEFNGKDGKLGSATLVSTETGEEKEFSADGAFIYIGMDPLTEPFAHLGITNAEGYIETNDNMETKAPGIFAAGDVRDKLLRQIVTATGDGSIAAQSAQIYIENLMEQLQTQ >NZ_LS483476|3364939:3372434|3364939_3365539_+|WP_082788709.1|DBSCAN-SWA MYYYREGVNFMKNKKILIITFGAVLFAIVTYLTFTLLNNDKNDVTVKEKTAITKSGGNTQVETSVIEIDEQREETIEEEFPNDTSEYAIQDAIHGMSHQKVIAEEKWGFLPLTQERVKRLIEVVEMNESKYIHASTYLRILERWENNDFTQADKDHNAVWKLQGGTIGKASGVLSLDEEKAFIKKHFNIKAKAVTSESN >NZ_LS483476|3364939:3372434|3369202_3370186_-|WP_066141827.1|DBSCAN-SWA MKQDQKPKIVVIGGGTGLPVLLRGLKKYPVDISAIVTVADDGGSSGRIRSEMEIPPPGDIRNVLAALSDVEPLVEEMFQHRFQTANELSGHSLGNLIIAALTSITGDFVHAVHEMSRVLNVHGKVLPAANQSVVLHAEMNDGTIVSGESKIPESGKKIKRVFLTPEVIKPLSETIRAIREADLIVVGPGSLYTSILPNLLVPGLGEEVCKAKAKKVYICNLMTQAGETLGFTASQHVDALYNHMLCPFIDIILVNNEAVPVEIQNRYQEEQAQPVLFDVDRLVALGMEVIHDEIISFDHGFIRHDTEKVANILYSLLGRDTDHIAQT >NZ_LS483476|3364939:3372434|3365802_3366402_+|WP_066141835.1|DBSCAN-SWA MNLIPTVIEQTSRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSAIDDNVANSIVSQLLFLEAENPEKDISIYINSPGGSITAGMAIYDTMQFIKPNIQTICIGMAASMGSFLLAAGTKGKRYALPNSEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAAKRILFLREKLNQILSERTGQPIEVIQRDTDRDNFMTAERAKEYGLIDHILQRHEEIEKK |
7 | Streptococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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