Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LS483480 | Haemophilus influenzae strain NCTC13377 chromosome 1 | 1 crisprs | DinG,DEDDh,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LS483480_1 | 770261-770341 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483480_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LS483480_1
>1.1|770285|33|NZ_LS483480|CRISPRCasFinder CATCGCCATTAAGTACCACGAAATCTTGTGCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483480_1
The CRISPR arrays of NZ_LS483480_1 >merge|NZ_LS483480|1|770261-770341|CRISPRCasFinder TAATGTTCCCTTTATTGATAACTTCATCGCCATTAAGTACCACGAAATCTTGTGCCGTAATGTTCCCTTCATTGATAACTT >NZ_LS483480|1|1|770261-770341|CRISPRCasFinder TAATGTTCCCTTTATTGATAACTT CATCGCCATTAAGTACCACGAAATCTTGTGCCG TAATGTTCCCTTCATTGATAACTT
>NZ_LS483480.1|WP_005668884.1|767610_767967_+|dihydroneopterin-aldolase MDRVFIEELTVFAQIGVYDWEQQIKQKLVFDLEMAWDCKQAAETDDVAYCLNYAEVSQAIIDYVESKPFLLIERVAYEVADLLESRYQLQGLKIKLSKPKAVAQARNVGVLIVRGCLK >NZ_LS483480.1|WP_005653382.1|766928_767528_-|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase-PlsY MSLFALFYMLFAYLLGSISSAILICRIAGLPDPRQNGSHNPGATNVLRIGNRKSALAVLIFDMLKGMIPVWAGYYLGLTQFELGMVALGACLGHIFPIFFQFKGGKGVATAFGAIAPISWAVAGSMFGTWIFVFLVSGYSSLSAVISALLVPFYVWWFKPEFTFPVALVCCLLIYRHHDNIQRLWRGQEDKVWAKFKKK >NZ_LS483480.1|WP_015701487.1|765183_766887_-|nitrate/nitrite-two-component-system-sensor-histidine-kinase-NarQ MYTKGSVSTRIAKYLFIILIVAGVISSLSLAIMSSNKYDAEAINISGSLRMQSYRLLYEMQEQPESVETNLRRYHISLHSSALLEVQNQFFTPNVLKHSYQNILQRWTNMEKYARQQDVKNYSKQLTNYVADVDYFVFELQRFSEQKWILGVSVLFFAMLLILAMVSYVIWYTQREVVKPLHLMTKASMQVQMRQFNHIPLDTRKQNELGTLARVFTQMSTELGQLYSRLEEAVNEKTQKLRQTNRTLSTLYQSAQLLNTNTINDKILNQVLNYIFISNHLNFVKVEVMGAEHWDITLGKQDANNELQIETLSVDNEELGVLSWQAGLPCPDPRIMQNLAQMLARALYFHKNLRQKEQLLLMEERSIIARELHDSLAQVLSFLQIQLTLLKHNLKKEDEQSKEKSLAIIANFEQALSGGYAQLRELLATFRLTIQEANLQLALKQVIDSLRSQTTMQMNVNCQLPSQSLNPQQLVHVLQIVREATTNAIKHSQGTVIEISARINAEGEYEILVEDDGVGIPNLEEPEGHYGLNIMAERCRQLNAQLHIHRREQGGTQVKITLPHTLY >NZ_LS483480.1|WP_015701488.1|764148_765174_-|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase MQNLQPFHTFHIQSNAREIIEAHSIEQLQQVWAHSKSENLPTLFLGQGSNVLFLDDFNGIVILNRLMGITHEQDANFHYLHVNGGENWHKLVEWSINNGIYGLENLALIPGCAGSAPIQNIGAYGVEFKDVCDYVEVLNLNTNETFRLDTEQCEFGYRESIFKHRYQQGYVITAVGLKLKKDWQPILKYGSLVEFDPKTVTAKQIFDEVCHIRQSKLPDPNEVGNAGSFFKNPVVSSEHFEEIKKHHENLPHFPQADGSVKLAAGWLIDQCNLKGFQIGGAAVHKKQALVLINKDNASGQDVIKLAYYVRQSVAEKFGVYLQPEVRFISATGEVNSEQIIT >NZ_LS483480.1|WP_005653377.1|763177_764023_-|RNA-polymerase-sigma-factor-RpoH MDKETQMMLVPQGSIEGYIRAANEYPMLTAEEEKELAERLYYHEDLDAAKKLILSHLRFVIHVARGYSGYGLPQADLIQEGNIGLMKAVKRFNPEVGVRLVSFAVHWIKAEIHEYVLRNWRIVKVATTKAQRKLFFNLRKTKQRLGWFNENEVDMVANELGVSKEDVIEMESRMSGADVGFDLPTDDAETETYSPALYLEDKSSNFAAELENENFESQATEQLSAALQSLDARSQDIIKARWLDDNKATLHDLAAKYNVSAERIRQLETNALKKLKSAVNF >NZ_LS483480.1|WP_015701489.1|762893_763172_+|tRNA-dihydrouridine-synthase MRVILAPMQGVLDPFVRELLTEVNDYDLCITEFVRVVDQLLPEKVFYRLCPELKNQGFTSSGTPVRVQLLGQNPECLGVRFKKPANQQVFFF >NZ_LS483480.1|WP_077643719.1|762027_762894_+|co-chaperone-DjlA MEFIGKIIGVFLGWKVGGFFGAIAGLILGSIADKKLYELGSVSSSFFKKKTTRQDLFMQTSFAVLGHLSKSKGRVTEEDIQLANQLMIQLKLDDAGRKLAQDAFRRGKESDFPIRQVIREFRIGCGQRADLLRMFLQVQVQAAFADSELHENEKEVLYVIAEELGLSRMQFEQMIAMEMAARAFTQGGFYQQYQQGAYQGGYQYQQQNSGGYQHASGPTLNDAYKVLGVTESDEQNTVKRAYRRLMNEHHPDKLVAKGLPPEMMEMAKEKTQQIQAAYDLICKAKGWK >NZ_LS483480.1|WP_015701491.1|761307_761949_+|orotate-phosphoribosyltransferase MEQYKRDFIEFALSRNVLKFGEFTLKSGRKSPYFFNAGLFNTGADLARLGEFYAAAIQASAVDFDVVFGPAYKGIPIGTSVSVALFNRYGIDKPVCFNRKEVKDHGEGGNLIGSPLQGKILLVDDVITAGTAIRESMELISANQAELAAVLIALNRKERGKGELSAIQEVERDYQCQVLSIIDLDDLMQFIEQDPRYSSHLPEMCAYRAEFGV >NZ_LS483480.1|WP_015701492.1|760567_761284_+|ribonuclease-PH MRPNNRENNQPRQIKITRNYTKHAEGSVLVEFGDTKVLCTATVEDAVPRFLKGQGQGWVTAEYGMLPRSTHSRMQREAAKGKQGGRTMEIQRLIARSLRAMVDLKALGERAITLDCDVIQADGGTRTASITGAAVALCDAINGLIENGTLKTNPIKGLVSAISVGIVDGQAVCDLEYVEDSAAETDMNVVMMEDGRMIEVQGTAEGEPFSHEELLTLLDLAKQGCNQIFIAQRKALGL >NZ_LS483480.1|WP_015701545.1|758824_760267_+|glutamate--tRNA-ligase MKLDAPFNLDPNVKVRTRFAPSPTGYLHVGGARTALYSWLYAKHNNGEFVLRIEDTDLERSTPEATAAIIEGMEWLNLPWEHGPYYQTKRFDRYNQVIDEMIEQGLAYRCYCTKEHLEELRHTQEQNKEKPRYDRHCLHDHNHSPDEPHVVRFKNPTEGSVVFDDAVRGRIEISNSELDDLIIRRTDGSPTYNFCVVVDDWDMGITHVVRGEDHINNTPRQINILKAIGAPIPTYAHVSMINGDDGQKLSKRHGAVSVMQYRDDGYLPEALINYLVRLGWGHGDQEIFSREEMINYFELDHVSKSASAFNTEKLQWLNQHYIRELPPEYVAKHLEWHYKDQGIDTSNGPALTEIVTMLAERCKTLKEMASSSRYFFEEFETFDEAAAKKHFKGNAAEALAKVKEKLTALSSWDLHSTHEAIEQTAAELEVGMGKVGMPLRVAVTGSGQSPSMDVTLVGIGRDRVLARIQRAIDFIHTQNA >NZ_LS483480.1|WP_015701485.1|770860_772552_-|ShlB/FhaC/HecB-family-hemolysin-secretion/activation-protein MRPRYSVIASAVSLGFVLSKSVMALGQPDTGSLNRELEQRRIQSEAKPSGELFNQTANSPYTAQYKQGLKFPLTQVQILDRNNQEVVTDELAHILKNYVGKEVSLSDLSNLANEISEFYRHNNYLVAKAILPPQEIEQGTVKILLLKGNVGEIRLQNHSALSNKFVSRLSNTTVNTSEFILKDELEKFALTINDVPGVNAGLQLSAGKKVGEANLLIKINDAKRFSSYVSVDNQGNKYTGRYRLAAGTKVSNLNGWGDELKLDLMSSNQANLKNARIDYSSLIDGYSTRFGVTANYLDYKLGGNFKSLQSQGHSHTLGAYLLHPTIRTPNFRLSTKVSFNHQNLTDKQQAVYAKQKRKINSLTAGIDGSWNLIKDGTTYFSLSTLFGNLANQTSEKKHNAVENFQPKSHFTVYNYRLSHEQILPKSFAFNIGINGQFADKTLESSQKMLLGGLSGVRGHQAGAASVDEGHLIQTEFKHYLPVFSQSVLVSSLFYDYGLGKYYKNSQFLEQGVKNSVKLQSVGAGLSLSDAGSYAINVSVAKPLDNNINNADKHQFWLSMIKTF >NZ_LS483480.1|WP_077643720.1|772632_774795_-|TonB-dependent-hemoglobin/transferrin/lactoferrin-family-receptor MRFSKLSLAIATTLVTANALAQSVELDSINVIATRDPSRFAYTPEKQSKDSLLSKQATSVAAALEDIPNVDIRGGSRSIAQKPNIRGLSDNRVVQVIDGVRQNFDLAHRGSYFLPMSLIQEIEVIKGPSSSLWGSGALGGVVAMRTPNALDLLKNNDKFGVKIRQGYQTANNLSERDVSVFAANDKFDVLISGFYNNADNLRTGKGNKLNNTAYKQFGGLAKFGWQINDANRVELSHRETRFKQTAPSNNEVENELTNEQITDQIREFHKPNNGSPPKAKPSQEEFYSGVKTRFGSVSYLTDQQIPDQSTVFNYYLTPDNPYLNTHIALYNNKTIEKEQRKVSGVKDQTKLTTRGINLRNSSELSHISFVYGVDYMRDKIRTERGTNNTDAKFRAEPYNANSNTTGVYLIAHIPLFGEKLLISPSVRYDHYDTSSKTVKYKDNHLSPATKLTWIVTNWLDFTAKYNEAFRAPSMQERFVSGAHFGANLIGGLDTINRFVANPNLRPETAKNKEITANLHFDSLFKQGDKFKIEATYFRNDVKDFINLKIFNDANTNKNASASANGALLPLPTKSQYQNITNARLSGIELQAQYQTERLTLFTNYGSTKGKDKDSGEALSNIAASKIGVGVNYALVKDKFTVGATVTHYAAQRRVPKDHGVTYPSYILTDLRATYAPLKGEWKNLRLDFALENLFDRKYQPAFSLMEGTGRNAKISAVYSF >NZ_LS483480.1|WP_061659721.1|775119_776163_-|glycosyl-transferase MPLFTEAPKSLCILRLSAVGDVCHALAVVQHIQAYYPQTEMTWIVGKTEIGLLSGIPNITLIPYDKKTGWKGVLSLWKQLKNKQFDALLNMQTAFRASILSLGIKAKFKIGFGEKRSREGQWLFVNRRIRDPFSPHVLDGFMAFAEYIGVPKAEPKWELAISQDDYKFADQFIDFSRKNLLISPCSSKAEKDWLIEGYAEVANIAHQHNINVIFCSSPAKRELEIVEKITALCHFTPTNIAGKTNLKQLTALISKVDLVLSPDSGPAHIATTQGTPVIGLYAYHNPLRTAPYKNLDNVVSVYEENAQKEFGKPSSELPWATKLKGKNLMAEIQVEPVIEQMKKLGLF >NZ_LS483480.1|WP_061659720.1|776239_776965_+|3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid-kinase MHQFQQDNQYFIFNFDRTFEQATEFFQAEFWQKQERVIGSAKGRGTTYFLQTEDWFGVNCALRHYYRGGLWGKLNKDRYRFSALDTTRSFAEFHLLQRLYEAGLPVPKPIAARIQKGKLGICYQADILTEKIENSQDLTALLQTQTLPKETWRQIGRLIRKLHDLQICHTDLNAHNILLQQAEQEQKCWLIDFDKCGKKSGDFWKAQNLNRLKRSFEKEVGRMNIQFTEQNWADLTAAYHQ >NZ_LS483480.1|WP_005668864.1|776976_777564_+|RdgB/HAM1-family-non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase MKQKIVLATGNKGKVKEMADVLSDFGFEVIAQTDLGIESPEETGLTFVENALLKARYASEKSGLPAIADDSGLVVSALNGAPGLYSARYAGEEGNDAKNREKLLAELAHVAQDQRQAKFVSCIVFLQHPTDPSPIIAEGECCGVIGFEEKGENGFGYDSLFFSPEQGCTFAELETVEKKKISHRAKALSVLKSKL >NZ_LS483480.1|WP_061659719.1|777827_778724_+|glycosyltransferase-family-8-protein MNIIFSSDNYYAPYLAVSIFSIIKNTPKKINFYILDMKINQENKTIINNLASEYSCKVFFLPVCESDFQNFPKTIDYISLATYARLNLTKYIKNIEKAIYIDVDTLTNSSLQELWNIDITNYYLAACRDTFIDVKNEAYKKTIGLEGDFYFNAGILLINLNKWKEENIFQKSINWMNKYNNVMKYQDQDILNGICKGKVKFINNRFNFTPTDRDLIKKKNLLYVKMPIVISHYCGPNKFWHKKCSHLNCHIGNLLLKEMDKIIDIPSSWYDHFEKIPFLIKIKRLRKRIRDKLIYGIY >NZ_LS483480.1|WP_005653397.1|779437_779761_-|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MTLNITSKQMDITPAIREHLEERLAKLGKWQTQLISPHFVLNKVPNGFSVEASIGTPLGNLLASATSDDMYKAINEVEEKLERQLNKLQHKSESRRADERLKDSFEN >NZ_LS483480.1|WP_038439193.1|779950_780580_-|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamC MKKIILNLVTAIILAGCSSNPETLKATNDSFQKSETSIPHFSPLATGGVQLPKADDAYSLPNIEVKKGEDIDIRPPLIPLAIIQNSITKFDGERSLIVYPKQQAKLYNLQQVKRLLKDEGISSTTDGSILTTDWAKTERIGDKSIEIKYQIEQVMTADVSALTVSILHMRRDGIIFTPNVSDKQYYTSERLNRIVLTLTTAYNKQLQDL >NZ_LS483480.1|WP_077643721.1|780690_781587_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MSAQNSLFSGSIVALVTPMNHYGEVDFSCLEKLVEHHIEAGSNALVSVGTTGESATLSIEENVKVIEKTVEFAKGRIPIIAGAGANATSEAITMTKLLRDSGVAGCLSVVPYYNKPTQEGMYQHFKAIAECTDLPQILYNVPSRTGSDMKPETVARLAEIENIVGIKEATRDVSRIVKIKQLAGKNFIVLSGDDATGLEAIKLGAEGVISVTNNIAAKDMADMCRYALAGDFDKAEEINARLMRLHHDLFIESNPIPVKWAAYRLGLIKSPHLRLPLTTLSEEIQPKVEDVLKIAGLL >NZ_LS483480.1|WP_005694049.1|781687_782155_+|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MNPLSVGNQAPAFTLLNQQEKFVSLSDFRGKKVLIYFYPKALTPGCTTQACGLRDSKSELDVLGLVVLGISPDAPKKLAQFIEKKELNFTLLSDPDHQVAEQFGVWGEKKFMGRTYDGIHRISFLINESGTIMQVFDKFKIKDHHQMIIDYLRSL |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
541213 : 592501
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LS483480|541213:592501|DBSCAN-SWA CTTAATTCGGTAATTCTTCAATAGTGAAATTGGTATTTGTGAACACGCAAATATCACCAGCAATTCTTAAAGATTTTTCAACAATTTCATGTGCAGAAAGTTCAGTATTTTCCACTAACGCACGTGCCGCAGATAACGCATAGTTACCACCCGATCCGATTGCTAAAATTTGATCTTCTTCGGGCTGAACCACATCGCCAATACCCGTGATGATTAAACTTTCTTTTTCATCCGCAACAATTAGCATCGCTTCTAATTTACGAAGTGCGCGATCTGTACGCCAATCTTTCGCTAATTCCACCGCACTTTTTAGCAAATGCCCTTGATGCATTTCAAGTTTACGTTCAAATAATTCAAAAAGTGTAAATGCATCTGCCGTTCCACCCGCAAAACCAGCAAGCACTTTGCCATTATATAAACGGCGTACTTTACGAGCATTACCTTTCATTACGGTATTGCCTAAAGAAACTTGTCCATCACCGCCTACGACGACTTGCCCATTGCGACGTACGCTTACAATCGTTGTCATTGTTCTGTCCTTTATAAAGTGAAAAGTTGTTCGTTATATGGCGACAAATTGATTAAATTCAAGAGGGAAATTTATATTGTAGATTTATTCTTCACTCATAAATAAAAAATGTGAAGTTGATCATATTTTGAGATGGCAAACGATTGCCAATTATTGAATATAAGCTAAAAAAATGTATGATCTGAGCGGTTTTTAAATCAGCGTTTGTGAGGAAAGGCAATGAAAAACGTCATGAAATTATCTGTAATCGCACTTTTAACTGCAGCTGCAGTTCCAGCGATGGCAGGCAAAACAGAACCTTATACTCAATCTGGCACTAATGCTCGTGAAATGTTACAAGAGCAAGCAATTCATTGGATTAGTGTTGATCAAATCAAACAAAGTTTAGAAGGTAAAGCACCAATTAATGTAAGCTTTGATATTGATGATACCGTGCTTTTCAGTAGCCCTTGCTTTTACCACGGACAACAAAAATTCTCACCAGGTAAACACGATTATTTGAAAAACCAAGATTTCTGGAATGAAGTAAATGCAGGTTGCGATAAATATTCTATTCCTAAACAAATTGCCATAGATTTAATTAATATGCACCAAGCACGTGGCGACCAAGTTTACTTTTTCACTGGCCGTACTACTGGCAAAGTGGATGGTGTAACACCAATTTTAGAAAAAACGTTCAATATTAAGAATATGCACCCAGTTGAATTTATGGGCAGCCGTGAACGTACAACAAAATATAACAAAACGCCTGCAATCATTTCACATAAAGTGAGTATTCACTATGGCGACAGCGATGATGATGTACTAGCAGCTAAAGAAGCAGGTGTTCGTGGTATTCGTTTAATGCGTGCCGCAAACTCTACTTATCAACCAATGCCAACTTTAGGCGGCTATGGCGAAGAAGTGTTAATCAATTCAAGCTATTAATTGACCGCAAGTTGGAATTTATCTTCCCCCAAAAAGTTAGATTGATTTAGTTCAAGGACTGAGTTCTGTCATTCACAGGGCTCAGCCCTTTTAGTTTCCCCTGAATGTGATCATGGTTGTAATAATGAATATACTCATGAGTTGTTTTTTCAGTTGTTTGAACGTCTCAAATCGTTTGTCGTAATAACATTCAGTTTTTAATCGTCCAAAGAAGTTTTCCATCGCATTGTTATCTAAATAATTTCCTTTCCTTGACATATTCTGTTGAATGCTATTCTCTCGTAAAATCGCCTGATAACCGACCATTTGATACAGCCAACCTTGGTCGGAATGTAAAATTGGGTTTTGCGTCTTCAAGTCTTTTTTGCTGGTTGAGTTCTTGCAACTTTTTTAGGATTGCGTTCTCCGCACGTAGTAAATTTTCCAATTCTAGTTCTTCCCCTCATGTTTTCGGTTTAGGTGGCATCTTAGGGTATTTCGGTTTCATGATTGGACGACTTTTAGGTTTGAGGATTAAGCCGTTTATACCTTGTTTTTCAAAGGCTTGCAGCCATTGACTAACAACGCCTGAATTGGTAATGCCAAAATGTAAATATGCGGCTTCTGCAGAAAATTGCCCATTTTTAACCGCTTGTATTATGTTAAGTTTAAATTCAGGTAAGTAATTTTGCTTCTTACTAAGTACGGATAACCTATTGATTTAATTATAATTAATTGGTTAATCCAATGTCGTAATGTTCTGCTAGCAAGTTGAAAATACCTGCGGGTAAGTGAACGATTTTTACCATTTTGAAGATCAAATTCGATGACTTGTTGTTTGAAAAGAGTGTTGTATTTGGTCATAAAAAATCTACACCTTAGTTGGTTATTTAGTCAACTTTTGGGGTAGATCATAAAGTGCGTTTTTTACTACTAACTTTTTTAGGTTAATCAAGCGTCTTCCTATTTTAATAAGGAATTATCGAGTGACAAATCTTCATTTTTATTTACACCTATACCGCGTGCGATAACATTTTTGGCAATTTCGTGTGCATCTTCTAAGGAATGTTCCGTATAGCTTCCGCATTGATAGATATTTAATTCGGGAATAGAAGCTTGATCTTGTACACCTAAAACATCTTGCATTGAAGCTAACCAAGCCTCAGACACTTCCTGTTCATTTGGTGTGCCAATCAAAGACATATAAAATCCCGTGCGACATCCCATCGGAGAAATATCAATAATTTCTATGCTATCGCCATTTAAGTGATCGCGCATAAATCCAGCAAATAAATGTTCAAGTGTATGAATGCCTTTTGGGGAAAGAATTTCTTTGTTTGGAATACAAAAACGTAAATCAAAAACAGTAATATTATCGCCTTTTGGCGTGAGCATCGTTTTTGCAATGCGTACTGCAGGTGCGTTCATTTTTGTGTGATCCACTTTAAAACTATCAAGTAATGGCATAAATTTTCCTTATAAATCAGTTTGTTAAGAAATAATTGAATAAATATTTATTTTTTACAAATTTTAATGAACTTTATAGTAAGGTTCATTGTCTTATAGAATAAGCAACTTGCAGTTGTTTTAATAAAATTGGTTCCTTAGGTTATTGCCCCACATTTATTGTGGGGTTTCTTTTATGCAAAAATTTTTATTTTGAAAATTTTTAAAAAATTTTGAACTTTCTTATAAAGTATTAGTCTTATAGTGTAAGCAACTTGCAGTTGTTTTAATAAAATTGGTTCCTTAGGTTATTTGCCCCACATTTATTGTGGGGTTTTTTCTTGCTCATTTTATAATAAGAATGGTGTACTCAAAAACAATAACGCAACATAACGAACCATTTTTCCTAGAAAGATAAAGAGACTACTCGTTACAAAATTTAATCTTAACCAACCAGCTATGGCACAAAATAAATCGCCAACTACAGGCAGCCAGCTCAAAAGTAAAGCAATCGCCCCATAACGCCGTAGCTGATTTATTGCCCATAAAGTGCGGTAATTTTTGGGATCGAATTTTGGCATCCATCGTCCAATTCCGTAAGTGGTTAAACTTCCTAAGCTATTTCCAGCGGTTGCAATCAATATTAGAGCTAATATATCTGCGTTAAATAAAGAACCTAACATTAATTTAGGTACAGCAAGCGCAACAAATATAACTTCTGAATTACCTGGTAATACTGTTGCACTCAAAAACGCGCTGATAAACATAAAGCATAAGCTATTAGTCTGCCAAAAATCAGCACTAAAAAATGAAAAAATATCCATTATCTTGGCGAAATAATTTCTCGTGTGCGAACATCAAACACATCCATTCCCGCACTTAATCCTGCTTGCACGCCTAAATCCGCATCTTCAAATACGATACAACGACTTGGATTTGCTTGAATTAACTCCGCACAACGTAAAAAAGTTTCTGGGTGTGGTTTATGTTCTTTTACATCATCTGCACTGACAATTGCATTAAAGTAAGGTGCGATAGCCAGTTTATCCATCAACATATCAATAATTTTACGGTGTGAGCCAGAACCTAAAGCAATCGGCTTTTTCTGATGGAAGGATTTAACAATTTCAAAGGTTGGCAATAACTTTGATTGAGTCGGAATAAGTTGATAAGACAACTCACGTTTTGCAGCCAGCACATCCTCAATTCGATCTAGTGGCATATTCGCCGCTTTCATCATTTCCCCCGCGATAGTTCGAACCGTCGCCCCGCCGAAGTTATACATAATTTGAAAATCAAATTCATAGCCAAATTTCTTTCCCACCATTGTCCAAGCCTGCGCATGCACGGGCATGGTATCAATTAAAGTTCCATCCATATCAAAAATCAATCCTTCATATGGATTGAAGATCTCGTAATCTAACATTTTTACATCCTTACAAATTTTTTTACCATTTTGCTACAAAACTGTGATCTATGCACTGTTTTATTTCAGTAAAGTGCGGTAAATTAGCGAACAAATTTTGAACTAACAAAAACAAATGCGGTTATTTAAGCAACTAGAACGTTGGAAAATTCGCAAGCAAATAAATCAATCTATTATTGATGTGATATTTCGTTTACGAAATCGATTAGCTCATTACTGGCAAGCTGATGTGAATACGCCTCAAGTGGATTTTATGCTGCTACACATTGCTTGCAGCTTAGGTCGAATAGAACGAGGAGGTTGTGTTTCTCCGCTTTATTCAGAAATGCTCGAAGAAATGCAAAGTGCGGTCATTTTTCCACAAGTTTTAGCTATTCATCAAGATTTACTCAAGTTAATGCCACTTTCCATTCCTGAAGCAGAACAAACTTATTTTTTAGCGAACATTCATTCTTTGGTTCTTGAACAGAAGCAATTAAAGCCTTTGAAATGAATTATGCGGAGGTGCATTCAATTTATGGTGTAAAACTGGACATTGATTCGGTAAATAATTCATCAAATTACTAAAAACATTAAGGAAATTTACCGCACTTTTAAGTAAAATAGCGTAATTTTTCAAAGAGATAATAAATATGAAAGCCAAATTAGTCAGTTTACTTGCGCAAGCAAATATAAAAATAAGTGATCAACAAA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54 | uncultured_Caudovirales_phage(46.67%) | tail,head,protease,portal,capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
987671 : 996980
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LS483480|987671:996980|DBSCAN-SWA TATGACACAACAATATGCTATTGATACTTTATTAGCTCAAGCAGGCAATCGCAGTGATGAGCGTACGGGCGCGGTTTCTGCACCAATTTTTCTTTCTACGGCTTATGGTCATTGTGGTATCGGTGAAAGTACGGGATTTGATTACACACGTACCAAAAATCCAACTCGCACAGTATTAGAAGAAACGATAGCTAAATTAGAGAATGGAGATCGTGGTTTTGCGTTTTCTTCTGGTATGGCTGCAATTCAAGTTTTGATGACACTTTTTACCGCCCCAGATGAATGGATTGTTTCTAGCGATGTGTATGGTGGTACTTATCGATTATTAGATTTTTCTTATAAAAATAACAATAGTGTAAAACCTGTTTATGTTAATACAGCATCTGCTTCAGAAATTGAGGCTGCCATTAACCCAAATACGAAAGCGATTTTTATTGAAACCCCATCAAATCCTTTAATGGAAGAATGTGATGTAGTTGAAATTGCAAAACTTGCGAAAAAATATAATTTGATGTTGATCGTGGACAATACGTTTCTAACGCCTGTGCTTTCTCGTCCGTTAGATTTAGGCGCTGATGTGGTAATTCACAGCGGAACTAAATATATTGCTGGTCATAATGATGCACTTGTTGGTTTAATCGTTGCAAAAGGGCAAGAACTTTGTGATCGGATTGCTTATATTCAAAATGGTGCAGGTGCGGTGCTTTCTCCTTTTGATTCTTGGCTGACTATTCGTGGTATGAAGACCCTTTCTTTGCGTATGAAACGCCATCAAGAAAATGCACAAGCCATTGCGGAATTTTTAAAAGCTCAACCACAAGTGGAATCGGTGCTTTATCCAAATAAAGGTGGGATGTTGTCTTTCCGTTTGCAAGATGAAGCTTGGGTTAATACATTCTTAAAATCCATCAAATTGATTACTTTTGCAGAAAGTCTAGGCGGCACAGAAAGTTTTATTACTTATCCTGCCACTCAAACTCATATGGATATTCCAGAACCCGAGCGTGTAGCTCGTGGGATTACTAATACCTTGTTGCGTTTTTCAGTCGGTATTGAAGATGTAGAAGATATTAAAGCGGACTTATTACAGGCTTTTGCAAACTTAAAATAATTGGAGCAAACCATGAAAATTGCAATCTATAGCACTAAAAGTTATGACAGAAAATATATTGAGCTCATTAACGCGAAATATAATTTCGATTTAGAATTTTTTGATTTTATGCTGAACGAGAGCACTGTGCGTTTGGCAGAACATTGCGAAGTAGTATGCATTTTCGTGAATGATAATGGTAGCCGAAAAGTATTAGAAAAATTAGCCGCACTTGGTGTGAAAATTGTGGCTTTGCGCTGTGCCGGTTTCAATAATGTTGATTTAAAAGCAGCTCAAGAATTAGGCATCCAAGTTGTCCGCGTTCCAGCTTATTCGCCTGAAGCGGTGGCGGAACATACCATCGGTTTGATGATGACTCTGAACCGTCGAATTCATCGTGCTTATCAGCGTACCCGAGAAGCGAATTTCTCTCTTGAGGGGTTAATTGGTTTCAATATGTACGGACGCACAGTCGGCGTAATCGGAACAGGAAAAATCGGGATCGCAGTGATGCGAATTTTGAAAGGTTTTGGCATGAATATCTTGGCGTACGATCCTTTTAAAAATCCAGTGGTGGAAGAACTGGGGGGACAATATGTTGAATTAGATGAGCTTTATGCTAAATCTCATGTGATTACGCTTCATTGCCCAGCAACGCCAGAAAACTATCATTTATTAAATCGCGAGGCTTTTGCAAAAATGAAAGATGGCGTGATGATCGTTAATACGAGTCGCGGTTCTTTGATTGATACTCAAGCTGCAATTGATGCGTTAAAACAGCGTAAAATCGGTGCGTTAGGTATGGATGTTTACGAGAATGAACGTGATTTATTCTTTGAAGATAAGTCTAACGAAGTGATTCAAGATGATATTTTCCGCCGTTTATCTTCTTGCCATAATGTATTGCTAACAGGTCACCAAGCGTTTTTAACCGAAGAAGCACTAACCAATATTGCAGACGTGACTTTATCAAACATTTATAAATTAAAATCTGGTAAAGTGTGTGAAAATATTGTTTTGCCGTCTTAGCTTTTGGCAATTAAAACGATTAGTTTACATTTTTTAAAACGGTGTTATTCTGCACCGCACTTGTAAGTTTAAAAAAAGCCCTTATATAGGGATTCCATTCACAAAATAAGGAAAACAAAATGAGCGAAGTATTACACATTAATGACGCAGATTTTGAAAGTGTTGTAGTTAATTCAGATATCCCCGTTTTATTAGACTTTTGGGCACCTTGGTGTGGTCCTTGCAAAATGATTGCACCAGTGTTAGATGAACTTGCACCTGAATTTGCAGGTAAAGTTAAAATCGTGAAAATGAATGTGGATGATAACCAAGCAACGCCAGCACAATTTGGTGTTCGTAGTATCCCAACATTATTATTGATTAAAAATGGTCAAGTTGTTGCAACTCAAGTTGGTGCATTACCAAAAACTCAATTAGCTAACTTCATTAACCAACATATTTAATCGTTGTTTAAAGCTAAGTAACTTTAGCGCATTGATAAGATTGCCCCTTAATGGGGCAATTTTTTTGTCTAAAATTTTGATATTTGCTCTGGTGGAAGGTAATTTAAGGCTTTTTCTGTACGCTGAACAATTTGTGTTGCAGTTTCCACTTCATCAGAACGAGGATTGATGACGCCTAAGCCTAAAATACATTTTTGTCTTAAGATTTCACTTTCTAATAACGAACTTAACTCTCCTGCTCTTGGCGTAGAAAATTCGAGCATTAAAATATCAGGTAATGCCGATTCAAATAAATCCACTAATGATGTATAAGGCCCACGCAATAATACGCTTTCATCTTTGCTCCAGTTGCCATGGCATACATGTAATTAGGGGAGAGTTCCACGCTACACGCCAGCTACGATCTAATGGCATATCGGTCATGCGCATAAAGCAAGAAACATTGCTACGCATATCTAAGCCATTCCAGCTATCAGCTTCAAAAGTTAAGCCTTGAGTACCAAGTGGAAGCACCTAGTTATCAATAGTTTCGCCATTTTCGGAAGGCAAAAGCGCTAAATAATAAGAAGCATAATTGCCCGATGTCACCATGGATTTTAAGCCATTGAATACTGCAATTTAATTCAAAATAATTTCAGTAATGTGACGTGGATCAAGAAAAAATCTGGCAAGCATTTTCCCATGTAAGTTTTTTAATCAATTCAGCAGGTTCATTTCTTAAGGTGCAAAGGGCTTTAAAACTTTCCACAATACGTTCTGGTCGATTAGGTTGGCCTTGAAAACCAAATACAGGCATATCTGGACTGTCTGTTTCCAACACTAAGGCATCAAGCGGCAACTTCGCGATTGCTTGACGAGTTTTATTGGCTCGTTCATAAGTGATAGTGCCGCCAACTCCGATTTTATAGCCTAAATCAACAAAGCGTTTTGCTTGATCGTAGCTTCCTGAAAAACCGTGTACCACGCCAAGTTTAGATAATGGAATACGTTTTAAAAAAGTAAAAATTTGATCATGGGTTTTTCGACTGTGAATATTGACGGGTAAATTAAATTGCTTTGCCAAATAAAGTTGGCTTTCAAAAAAATGACATTGCTTTGCCCAAAATTCATCGGTGAGCAAATCAGGAATCGCGCGTTCTAAACCAATTTCTGCCACTGCCGTGCAATTTGCATCACGATTTTTTAAGGCTTGTTCTAACAGAATCAAATCATTTTTGGCGTGTTCTTGAATATAAAGAGGATGGAGCCCAAGCCCATAGCACAAATTATCAGGAAAAAGTGCGGTCATATTTTGGATTGTTTTAAAATCAGCTTCTTTCACCGCCACAATCAGTATTTTTTGCACATCGGCTTGCTTAGCATTATCAATAAGCTGTGACAACGGCTCCCCAGTAAATTGTTGGAGATAATCAAGATGCGTGTGAGTGTCGAAGAAAGGCATGAGCATTTTCCTTTAGGTCGATAAAAAATGGCGGAATTCATCCGCCATTCACCATTATTCTACTGAAACCAATGTAATCACTACATCTTCAGTTGGAACATCTTGATGAAAGCCTTTGTTGCCTGTTTTCACTTTTTTGATTTTATCAACAACATCCATCCCTTCAACCACTTCACCAAATACTGCATAGCCCCATTCTTGAACGACTTCTCGACCAAACATTTCTTTTGAACGATAATTTAAGAAATCATTGTCTGCCACGTTAATGAAAAATTGTGCGGTCGCTGAATGTGGATCTGACGTGCGTGCCATTGCAATGGTTCCACGTTTGTTGCTTAAACGATTGTTCGCTTCATTTTGGATTGGTGCTTTAGTTGCTTTTTCACGCATACCGCTTTCCATACCACCCCCTTGAATCATAAAACCATCAATAACACGGTGAAAAATTGTGTTATTATAAAAACCGTCTTTGCAGTAATTTAAGAAATTTTCTGCCGTAACTGGAGCTTTATCAAAATCCAATTTAATTTTAATGTCGCCAAAATTTGTGTGTAATGTAACCATTTTGTTTTCCCTCTAAAAAATTAAGGGTCGTATTATTCCACAATCGAGGTAAAAGTGCTATAAAAGTGCGGTTTGTTTTTATTTCATTTTACGAGCTTAAAAATGCTAAAAATTTTCAATACCTTAACGAGAGAAAAAGAAATCTTTAAACCTATCCACGAAAATAAAGTGGGAATGTATGTTTGTGGCGTTACTGTTTATGATTTGTGCCATATCGGTCATGGACGCACTTTTGTGTGTTTTGATGTGATTGCCCGTTATTTACGTTCTTTGGGTTACGATTTAACTTATGTGCGCAATATTACGGACGTAGATGACAAAATCATCAAACGTGCATTAGAAAACAAAGAAACCTGCGATCAGCTAGTGGATCGTATGGTACAGGAAATGTATAAAGATTTTGATGCACTTAATGTATTACGCCCTGATTTTGAGCCTCACGCAACCCATCATATTCCTGAAATTATTGAAATTGTGGAAAAATTGATTAAACGTGGACATGCTTATGTTGCGGATAATGGCGATGTGATGTTTGATGTAGAAAGCTTCAAAGAATACGGCAAATTATCCCGTCAAGATCTTGAGCAATTACAAGCTGGTGCACGTATTGAAATCAATGAAATCAAGAAAAATCCAATGGATTTCGTGCTTTGGAAAATGTCGAAAGAAAACGAGCCAAGTTGGTCTTCCCCTTGGGGCGCAGGTCGTCCAGGTTGGCATATTGAATGTTCTGCAATGAACTGCAAACAGCTTGGCGAACATTTTGATATTCACGGCGGTGGCTCTGATTTAATGTTCCCTCATCACGAAAATGAAATTGCGCAATCTTGCTGTGCGCATGGTGGACAATATGTGAATTATTGGATCCATTCCGGCATGATTATGGTGGATAAAGAAAAAATGTCGAAATCTCTCGGCAATTTCTTCACAATTCGTGATGTATTAAATCACTATAATGCAGAGGCGGTACGTTATTTCTTATTAACGGCACATTATCGTAGCCAGCTAAATTACAGCGAAGAAAACTTGAATTTAGCGCAAGGTGCGTTGGAACGTTTATACACGGCTTTACGTGGAACGGATCAAAGTGCGGTTGCTTTTGGCGGAGAAAATTTTGTGGAAACCTTCCGTGAAGCAATGGACGATGATTTTAATACGCCAAATGCACTTTCTGTTTTATTCGAAATGGCGCGTGAAATTAACAAGTTAAAAACAGAGGATGCGGAGAAAGCCAATGGACTTGCCGCGCGTTTGCGTGAATTAGGGGCGATTTTAGGATTACTTCAACAAGATCCAGAAAAATTCTTACAAGCAGGTTCTGACGATGATGAAGTGGCAAAAATTGAAGCACTGATTAAACAACGCAATGAAGCCCGCGCTGCTAAAGATTGGGCTACTGCTGATGCTGCGCGTAATGAGCTTACCGCTATGGGCATCGTATTAGAAGATGGGCCGAATGGAACAACTTGGCGTAAGCAATAAATTTAAACGTTAAATTAATTTCATTAAAAAGACTAAGTTCAGAATGTAATAGAACTTAGTCTTTTTATTTTTTCATCATTTCTTAATGTGGGATTTCAAGGTTTGCGCGGTTTCAACCTGTTGCCAAAATTGTGTAATAAGTGCGGTCATTTTTTCTCTTATTCGTTAAAACGGATCAAACCTTCTTGTTGTGTTGTCGCGATTAATTGACCATCTTGCGAGAAAATTTGCCCGCGCGCCAAACCACGGCCTCCAAAGGCATTATTGCTTTCAATTGCGTGCAAATGCCAGTGATTTAAATCAAACGGACGATGGAACCAAATACTATGATCAATGGTTGCCACTTTCATTCCTTTTTGTAAAAAGCCTTTTTCGTGCGGATGAAGTGCGGTCAAAATACAGTGAAAATCTGAAAAATAAGCCAATAAACATTGCTGAATTTTTATATCAAGCGGCGTTTCACCATTGGTTTTAAACCAAGAATATTGCTCGGCTGGCAATTTTGTCCCGTTAAATGGGTTATTCAAATATTTGGTACGTACCTCAAATGGACGCTCTGCCGCAAATTTTTCATTGAGTGGTTCTGGCAAGGTTTGAGCCACTTTTTGTAGCATCACATTTTCATCTGTAAAGTCTTCAGGCGCGCCAACATTTGGCATTGAATTTTGATGTTCAAAACCTTTTTCTGGCACTTGGAAAGAAGCGGTTACATGACAAATGGTATTTTTATGTTGAATGGCTTTTACGCGTAATGCAGAAAAATTACGCCCTTCACGCAAGGTTTCTATATCGTAAATAATCGGATATTGGCTGTCTCCTGGAGCAAGAAAATAGGCATGACAAGAATGTAAAATGCGATCTTCTGGTGCCACCTGCATTGCTGCAGATAACGCCTGTGCCACTACTTGACCGCCAAATACTTGGCGAAAACCTAAATCTTGGCTTTCACCACGAAAGATTAAATCATCAATTTTTTCAAGTTTAAGAAGATGAATAAGGTTATTGAGAATATCTGACATATTGCTTTCCTAGAAGATAAGAAAAAGTGCGGTTATTTTAGCGGAGATTTTGGGGAATGCCAAAGTTGGTAACAAAAAGCACGCATTAAAAAATGCGTGCTTTTGCTAGGGAGTTAAATCAAAGGTGTTTAACTCTTCTCTTCACTTCTTCCTGTTTTCCCGCATTAAATGGGCGGGCATCAGGGCTGCCTAGATAGCCACAGACGCGGCGAGTGACAGACACTTTTGTGCTGTCGTGATTGCCACATTTAGGGCAGACAAAACCTTTGCTGGTACATTCAAACTCGCCAGTGAAACCACATTCATAACACTCGTCAATCGGTGTGTTTGTGCCGTAGTAAGGTACGCGATCGTAGCTATAATCCCACACATCTTCCAATGCTTTTAAGTTGTGTTGAATATTTGGATATTCGCCGTAGCAAATAAAACCGCCGCTGGCGAGTGGGGGATATGCCATTTCAAAATCCAGTTTGTCGTAAGGATTCACTTTCTTTTCTACATCTAAGTGGTAACTGTTCGTGTAGTAGCCCTTATCCGTGACGCCTTCAATCACGCCAAATTTTTTGGTATCTAGACGGCAGAAGCGGTCGCATAAGTTTTCGCTTGGCGTGGAGTAAAGGCTGAAGGCATAGCCAGTTTCTTTTTGCCAGCGTTTTACTGCCTCGCTAAGGTGGCGAACAATCGCAATGCCTTTTTCGCGTAATTGTTCATCATCAAAAATATGCCCTTTTTTATATAGCGCATTAATGGTTTCATGAATACCGATATAGCCGAGCGAAATAGAGGCTCGTCCATTTTTGAAAATTTGTGCCACATTTTCATCCGCTTTTAACCGCACTCCGCATGCACCTTCCATATAAAGAATGGGAGCAACGCGAGCTTTGGTATTCTCAAGGCGGGCAACACGCGTCATTAATGCTTTTTTCGCAATAGCCAAACGTTCATCTAAAGTGCGGTAGAAATCTTCTTCGTTTTTGGACTCCAACGCAATACGCGGTAAATTCAAACTCACTACGCCAAGATTATTACGCCCATCGTGAATTTCGTGACCTTTTTCTTCGTATGCACCTAAAAAGCTACGACATCCCATAGGGGCTTTAAAAGATCCCGTGACTTTGACAACTTGATCGTAATTGAGAATATCTGGATACATACGTTTTGATGCACATTTCAATGCGAGTTGTTTGATATCGTAATTCGGATCGCCTTGAGTTTGGTTCAAGCCTTTTTTAATGGTGAAAACAAGTTTTGGAAAGACTGGCGTTTTATGATTTTTTCCAAGTCCACGAATACGATTTTTTAAAATAGCTTGCTGAATTAAGCGAGATTGCCAGCTTGTACCTAAACCAAAACCAAAGGTCACAAATGGTGTTTGCCCATTTGAAGTATGTAGTGTATTAACTTCATATTCTAAGGATTGGAAGGCATCGAAACATTCTTTTTCAATCAATGCTTTGGCATAACCTTCAACATCAGGCACGTTCCATTCTTGGGCATGTTTGAGATGTTTTTCGTAACTGATTTGCACATAAGGGGAAAGTACTTCATCAATACGATTAATGGTTGTGCCACCGTAAATATGGCTGGCAACTTGGGCGATAATTTGTGCTGTCACTGCCGTTGCGGTGCCGATAGATTTAGGGGGTTCGATTTCCGCATTGCCCATTTTGAAACCACGAGAAAGCATCCCTTCTAAATCAACTAACATACAGTTAAACATTGGAAAGAACGGCGCGTAATCTAAATCGTGATAATGAATTTCACCTTTTTCGTGAGCCTCTACCACATCGCGTGGAAGAATATGGTGCTTGGCATAATGTTTTGCCACAATCCCAGCAAGCAAATCTCGTTGTGTTGGAATCACTTTCGCGTCTTTATTGGCGTTTTCATTAAGTAATTCTACGTTGCTTTGTTCAATCAAACCTTCAATTTCTTTTGTTAGCTGGCTACGTTTTTCTCGTGCTAAATCACGATCATGACGATATTCGATATACGCACGAGCAATTTCAGGATAACGACTTGCCATCAATTTATCTTCAACGATTTTTTGAATCTGATTAATATCAATCTCGCCTTGATGACGGGTGAAAATTTCATTCCCTACTTCTTGCCCAATTTGGTGGCAATAAAATTCATCGGAAATATTGACCGCACTTGCGGCTTTTTTAATGGCATTAATGATACGTTGAATCTCAAACTCCGCACGAGAACCATCGCGCTTGATGACCCCAAAGTTACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LS483480|987671:996980|987671_988781_+|WP_032824177.1|DBSCAN-SWA MTQQYAIDTLLAQAGNRSDERTGAVSAPIFLSTAYGHCGIGESTGFDYTRTKNPTRTVLEETIAKLENGDRGFAFSSGMAAIQVLMTLFTAPDEWIVSSDVYGGTYRLLDFSYKNNNSVKPVYVNTASASEIEAAINPNTKAIFIETPSNPLMEECDVVEIAKLAKKYNLMLIVDNTFLTPVLSRPLDLGADVVIHSGTKYIAGHNDALVGLIVAKGQELCDRIAYIQNGAGAVLSPFDSWLTIRGMKTLSLRMKRHQENAQAIAEFLKAQPQVESVLYPNKGGMLSFRLQDEAWVNTFLKSIKLITFAESLGGTESFITYPATQTHMDIPEPERVARGITNTLLRFSVGIEDVEDIKADLLQAFANLK >NZ_LS483480|987671:996980|990300_990555_-|WP_014326557.1|DBSCAN-SWA MRGPYTSLVDLFESALPDILMLEFSTPRAGELSSLLESEILRQKCILGLGVINPRSDEVETATQIVQRTEKALNYLPPEQISKF >NZ_LS483480|987671:996980|993877_994738_-|WP_077643838.1|DBSCAN-SWA MSDILNNLIHLLKLEKIDDLIFRGESQDLGFRQVFGGQVVAQALSAAMQVAPEDRILHSCHAYFLAPGDSQYPIIYDIETLREGRNFSALRVKAIQHKNTICHVTASFQVPEKGFEHQNSMPNVGAPEDFTDENVMLQKVAQTLPEPLNEKFAAERPFEVRTKYLNNPFNGTKLPAEQYSWFKTNGETPLDIKIQQCLLAYFSDFHCILTALHPHEKGFLQKGMKVATIDHSIWFHRPFDLNHWHLHAIESNNAFGGRGLARGQIFSQDGQLIATTQQEGLIRFNE >NZ_LS483480|987671:996980|994856_996980_-|WP_077643837.1|DBSCAN-SWA MSNFGVIKRDGSRAEFEIQRIINAIKKAASAVNISDEFYCHQIGQEVGNEIFTRHQGEIDINQIQKIVEDKLMASRYPEIARAYIEYRHDRDLAREKRSQLTKEIEGLIEQSNVELLNENANKDAKVIPTQRDLLAGIVAKHYAKHHILPRDVVEAHEKGEIHYHDLDYAPFFPMFNCMLVDLEGMLSRGFKMGNAEIEPPKSIGTATAVTAQIIAQVASHIYGGTTINRIDEVLSPYVQISYEKHLKHAQEWNVPDVEGYAKALIEKECFDAFQSLEYEVNTLHTSNGQTPFVTFGFGLGTSWQSRLIQQAILKNRIRGLGKNHKTPVFPKLVFTIKKGLNQTQGDPNYDIKQLALKCASKRMYPDILNYDQVVKVTGSFKAPMGCRSFLGAYEEKGHEIHDGRNNLGVVSLNLPRIALESKNEEDFYRTLDERLAIAKKALMTRVARLENTKARVAPILYMEGACGVRLKADENVAQIFKNGRASISLGYIGIHETINALYKKGHIFDDEQLREKGIAIVRHLSEAVKRWQKETGYAFSLYSTPSENLCDRFCRLDTKKFGVIEGVTDKGYYTNSYHLDVEKKVNPYDKLDFEMAYPPLASGGFICYGEYPNIQHNLKALEDVWDYSYDRVPYYGTNTPIDECYECGFTGEFECTSKGFVCPKCGNHDSTKVSVTRRVCGYLGSPDARPFNAGKQEEVKRRVKHL >NZ_LS483480|987671:996980|989908_990232_+|WP_005627940.1|DBSCAN-SWA MSEVLHINDADFESVVVNSDIPVLLDFWAPWCGPCKMIAPVLDELAPEFAGKVKIVKMNVDDNQATPAQFGVRSIPTLLLIKNGQVVATQVGALPKTQLANFINQHI >NZ_LS483480|987671:996980|988793_989789_+|WP_005672300.1|DBSCAN-SWA MKIAIYSTKSYDRKYIELINAKYNFDLEFFDFMLNESTVRLAEHCEVVCIFVNDNGSRKVLEKLAALGVKIVALRCAGFNNVDLKAAQELGIQVVRVPAYSPEAVAEHTIGLMMTLNRRIHRAYQRTREANFSLEGLIGFNMYGRTVGVIGTGKIGIAVMRILKGFGMNILAYDPFKNPVVEELGGQYVELDELYAKSHVITLHCPATPENYHLLNREAFAKMKDGVMIVNTSRGSLIDTQAAIDALKQRKIGALGMDVYENERDLFFEDKSNEVIQDDIFRRLSSCHNVLLTGHQAFLTEEALTNIADVTLSNIYKLKSGKVCENIVLPS >NZ_LS483480|987671:996980|991727_992237_-|WP_011961820.1|DBSCAN-SWA MVTLHTNFGDIKIKLDFDKAPVTAENFLNYCKDGFYNNTIFHRVIDGFMIQGGGMESGMREKATKAPIQNEANNRLSNKRGTIAMARTSDPHSATAQFFINVADNDFLNYRSKEMFGREVVQEWGYAVFGEVVEGMDVVDKIKKVKTGNKGFHQDVPTEDVVITLVSVE >NZ_LS483480|987671:996980|990884_991673_-|WP_014326556.1|DBSCAN-SWA MPFFDTHTHLDYLQQFTGEPLSQLIDNAKQADVQKILIVAVKEADFKTIQNMTALFPDNLCYGLGLHPLYIQEHAKNDLILLEQALKNRDANCTAVAEIGLERAIPDLLTDEFWAKQCHFFESQLYLAKQFNLPVNIHSRKTHDQIFTFLKRIPLSKLGVVHGFSGSYDQAKRFVDLGYKIGVGGTITYERANKTRQAIAKLPLDALVLETDSPDMPVFGFQGQPNRPERIVESFKALCTLRNEPAELIKKLTWENACQIFS >NZ_LS483480|987671:996980|992339_993719_+|WP_077643839.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLKIFNTLTREKEIFKPIHENKVGMYVCGVTVYDLCHIGHGRTFVCFDVIARYLRSLGYDLTYVRNITDVDDKIIKRALENKETCDQLVDRMVQEMYKDFDALNVLRPDFEPHATHHIPEIIEIVEKLIKRGHAYVADNGDVMFDVESFKEYGKLSRQDLEQLQAGARIEINEIKKNPMDFVLWKMSKENEPSWSSPWGAGRPGWHIECSAMNCKQLGEHFDIHGGGSDLMFPHHENEIAQSCCAHGGQYVNYWIHSGMIMVDKEKMSKSLGNFFTIRDVLNHYNAEAVRYFLLTAHYRSQLNYSEENLNLAQGALERLYTALRGTDQSAVAFGGENFVETFREAMDDDFNTPNALSVLFEMAREINKLKTEDAEKANGLAARLRELGAILGLLQQDPEKFLQAGSDDDEVAKIEALIKQRNEARAAKDWATADAARNELTAMGIVLEDGPNGTTWRKQ |
9 | Faustovirus(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1258266 : 1307126
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LS483480|1258266:1307126|DBSCAN-SWA ATTACATTTTTTCTACGGTTTTAATACCGAGTAACGTTAAACCCTGTTTTAAGGTTTTTTCTGTTAATAATGCCAATTTCAGGCGGCTTAATTTTACGGACTCATCTTCAGCATTTAAAATTGGGCAATGTTCGTAGAATGACGAGAAGATGCCAGCAAGTTCATATAAATAAGCACAAAGCACGTGCGGCGTGCCTTCTTTTCCGACAGTTTGCACGGCTTCTTCAAATTGTAGAAGTTTAATAGCAAGCGTTCTTTCTTTATCATCTTTAATAGTTAAAGGTGCAGCCAAAAGTGCGGTTGAATTTATATCTGTTTTATTAAAGATCGAACGAATACGGGTGTAGGCATATTGCATATAAGGTGCCGTGTTACCTTCGAAACTTAACATATTATCCCAATCAAAAACGTAATCAGTAGTACGGTTTTTGGAGAGATCTGCATATTTCACCGCACCAATACCAACGGCTTCAATCACAGCTTCTTTTTCATCATTAGATAAATTGGTATTTTTTTCATTAATTAATACAGTGGCACGTTCAATGGCTTCATCTAATAGATCGGCCAATTTCACTGTGCCACCAGTACGGGTTTTAAATGGCTTGCCATCTTTACCAAGCATCATCCCAAAGTTTTTATGCTCTAACGAGAAACCATCTGGTACATAACCTGCTTTACGAGTAATTAACCAAGCTTGTTGCATATGTTGGCTTTGGCGAGTATCTGAAAAAACAAGGGCGCGATTAGCTTTTAATGTTTCATAACGATATTTTGCTGCAGCAATATCTGTTGTAGTATAAAGGAAACCGCCGTCTTTTTTTTGAACGATTACACCCATTGGGTCGCCATCTTTATTTTTAAATTCATCTAAATAAACAACCAATGCACCATCATTTTCCACAGCTAAACCTTGTTTTTTAAGATCTTCTACGATGCTTGGTAACATAGGATTATAAAGACTTTCGCCCATTACATCTTTTTCGGTTAAAGTCACGTTTAAGCGATTATAGTTGTGCTGATTTTGTTGCATAGTGATATCGACTAAACGTTTCCACATCGTTCGACAATATTCATCTCCACTTTGTAATTTTACGACGTAATTACGCGCTTTTTCTGCGAATATTTCATCTTCATCGTAATGTTTTTTGGCTTCGCGATAAAAGGCTTCAAGATCTTGTAATTCCATTTCACTGGCGTGTTCATGTTGCATTTTTTCAAGATAAGCAATAAGCATTCCGAATTGCGTTCCCCAGTCGCCTACGTGGTTAGCGCGGATGACATTGTGACCTAAAAACTCAAGGGTTCTGGCTACAGCATCGCCGATTATCGTAGAGCGTAAATGACCTACGTGCATTTCTTTTGCTACGTTTGGCGATGAATAATCAATCACAACTGTTTGTTTATTGGTAGCTTGAATACCTAAATTTTTGTGGGAAAGTGCAGCTGAAATTTCAGTTGTTAGCCAAGTTGGATTTAAGAAAATATTGATAAAACCTGGGCCTGCGATTTCTAATTTTTCTGCAATATCAGATAGTTGAGCATTATCTAAAACTTTTTGAGCAAATTCTCGTGGATTTAAACCTAATTTTTTTGCCGCAGCCATAATGCCATTGGCTTGATAATCGCCAAATTGTGGTTTTCCTGATTGACGAATAAGCGCATCGCAAGATTGATCAGCACCTGCAAGAATCATCGCTTGTTTAATTTTATCGGATAGAATAGATTGAATATTCACGTTTTTTCCTATGTTCAAATTGAATAATAAAAATAATCGGTTATGATACCGTTCTTTGTATATTTCTCAAAGGGACAAAATGACAAATTTACAGGAAAATTTAACCGCACTTTCAGCAGATTTAGCAATATTTGAAAGAAAAATTCAGCATTTAGCCAAAGAAATGACAATAGATCTGTCTCACTATGAAATTGATCATCTTGCATTACGGGTAAATAGTGAGCAAAGTGCTAAAAATTGGCTGATACTTTTATTACAGTGCGGTAGAATTTTATCTGATAATATTGTTAATGGTCGTAAGATTTATCTTATTGAATTAGAAAAACCAGTTAAATTTGCCAATCAATTTGTGGATATTATTGAACTTCCACTTCCTAAAAATAAAAAATATCCAATTGAGGGATGGGAACATATTGAGATTGTAATGCCATTTTTACCGAAAGAATCGATAAATGAATGGATTAACCGTGTTAATATGTATTTTTTATGGGACAAATTAACTCAATTAACCATTAAAGTGAGCGAGCCTAAAGTGGATGGGGAAAGATTACCAAATCCATCTATTGCAGTAAGTTTTACGGATAAAACAGTAAATCATACTTGCATTAAGGTTCATCCTTATTCTATAAAAAAAATACTTGAGGTTTAGTAAAAATGAATAAATTATCACTTGCATTCGTTGTTTAGCAACAGTAGACTTGAGTGCTTTTTCTGCTTTTCAAAAGGAGGAGGGGACTTATAAAGGTCAAATTATTTTTAGTCAAATGGAAGGCAAAAATCTAAAATTAACTGTTCGTAAAAATGATTGTTCTGGTAACCAGCAGAAAGGAGAGGAAGTTGTTATTGTGCATAAGTATGATTCAACTTTAGTTGTTGGTGCTTGTGTTTTAGTATCTGACAATGGTAATACTAAAGACATTTCAACTTTTTCTCCAAGAAACCCACTTTAATTCCTTCTAATATAGAGAATATTATATGAAAAAAACAAATATGGCATTAGCACTGTTAGTTGCTTTTAGTGTAACTGGTTGTGCAAATACTGATATTTTCAGCGGTGATGTTTATAGCGCATCTCAAGCAAAGGAAGCACGTTCAATTACTTATGGTACGATTGTTTCTGTACGCCCTGTTAAAATCCAAGCTGATAATCAAGGTGTAGTTGGTACGCTTGGTGGTGGAGCTTTAGGTGGTATTGCTGGTAGTACAATTGGCGGTGGTCGTGGTCAAGCTATTGCAGCAGTAGTTGGTGCAATTGGCGGTGCAATAGCTGGAAGTAAAATCGAAGAAAAAATGAGTCAAGTAAACGGTGCTGAACTTGTAATTAAGAAAGATGATGGTCAAGAGATCGTTGTTGTTCAAAAGGCTGACAGCAGTTTTGTAGCTGGTCGCCGAGTTCGTATTGTTGGTGGCGGCTCAAGCTTAAATGTTTCTGTGCTATAACCAATAGCATTAAAGTCTAATATGATTAATCAGTGTCTTAACTTAGTAAGGTACTGATTTTTTATAATTAAATTCATTTAAAATATATATTTATCGTCTATCTAAGATAAATTTAAAGGACTAAATTAGAATTTAGTCCTTTAGACAAACTTGGAATTATTCAAATCCAAATAATTAACGCCATGCTTTAAATTGATTAATTAATCCATTTGTTGAACTGTCATGACTTGCTACTTTTTCAGAATCTGTTAATTCAGGAAGAATTCTGTTTGCAAGTTGTTTGCCTAGTTCGACACCCCATTGATCGAAGCTAAAGATATTAAAAATCACACCTTGTACGAAGATTTTGTGTTCATACATCGCAATTAATGCACCCAAGGTAAATGGCGTGATTTTTTGAACGAGAATGGAATTAGTTGGCTTATTACCCGTAAATACTTTAAATGGAACAATATTTTTCACATCATCCAAAGATTTCCCCGCTTTTACAAATTCAGCCTCGACTTCCTCTTTTGTTTTTCCGAATGCTAATGCTTCTGTTTGTGCAAAGAAGTTTGAAAGCAATTTATTGTGATGATCTGCCAATGGGTTATGGCTTTGAGCGGGTGCGATAAAATCACAAGGAATTAAAGTAGTGCCTTGATGAATTAATTGATAGAACGCGTGTTGTCCGTTTGTACCAGGTTCTCCCCAAATGATAGGGCCAGTTTGATAATTGTTAATGACATTGCCATCACGATCCACATATTTACCATTTGATTCCATATTACCTTGTTGAAAATAAGCTGCGAAGCGATGTAAATATTGATCATAAGGTAAGATCGCTTCTGTTTGCGCACCAAGAAAATTGGTATTCCATAAACCAACTAATGCTAAAGTGGTTGGGATATTTTGTTCGATTGGAGTAGAGCGGAAATGTTCATCCATTTCATGCGCGCCATTTAATAACGCTTCAAAGTTTTCAAAGCCAATTGATAGCGCAATTGAAAGACCAATGGCTGACCATAAAGAATAACGACCGCCAACCCAATCCCAAAATTCAAACATGTTATTGGTATCAATGCCAAATTTTTCTACATCTTTAGCATTGGTTGATAATGCTGCAAAATGTTTTGCAACCGCACTTTCATCTTTCGCCGCTTTCAGTAACCAATCACGCGCACTTTGCGCATTTGTCATGGTTTCTTGAGTTGTAAAAGTTTTCGATGCTACTAAGAAAAGAGTCGTTTCTGGATTGACTTTTTTTAAGGTTTCTGCAATGTGTGTACCATCGACATTTGAAACAAAGTGCATATTTAGATGATTTTTATACGGGCGAAGTGCTTCGGTTACCATATAAGGCCCTAAGTCAGAGCCACCAATACCAATATTCACTACATCCGTAATGGCTTTGCCTGTATAGCCTTTCCATTCGCCAGAAATAATACGCTGACAGAAATCTTTCATTTTAGCTAACACAGCATTGACTTCAGGCATAACATCTTTGCCATCAACAAGCACTGGTGTATTAGTGCGATTGCGTAGTGCGGTATGTAGTACGGCACGATTTTCTGTACGATTGATTTTTTCGCCAGTAAACATCGCTTCTTTTGCGCTATCAAGCGCGCATTCTTGAGCAAGTTGGCGAAGATGTGAAAGGGTTGTTTGATTGATGTTGTTTTTGGAAAAATCGACAAGAATTTGGTTATTGAATGTTAAAGAATAATCGTCAAAACGATTTTTTTCTTGTTTAAATAAATCTTGGATGGTGGTGTTTGATAATTCAGCTTTATGTGCTTCGAGAGATTTCCACGCTTGGGTGTGAGTTGGGTTAATATTTTTCATG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52 | Mannheimia_phage(22.22%) | integrase,transposase,tRNA,plate | attL 1250909:1250926|attR 1310904:1310921 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1395060 : 1427149
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LS483480|1395060:1427149|DBSCAN-SWA 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43 | Haemophilus_phage(42.11%) | tail,holin,capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1685791 : 1694305
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LS483480|1685791:1694305|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LS483480|1685791:1694305|1692326_1693319_+|WP_005694258.1|DBSCAN-SWA MALLDVKELSVHFGDKKTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTDLLTLESKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKKARKDRTLELLKLVGIPDPESRIDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAAERIIVMYAGQIVEEGTAKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLESLQGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATEYCRQVEPQLHHIGSRKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA >NZ_LS483480|1685791:1694305|1693321_1694305_+|WP_005663823.1|DBSCAN-SWA MTNEVKENTPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEEPTKGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCIEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQYTDGKLIACFHID >NZ_LS483480|1685791:1694305|1690413_1691415_+|WP_005694256.1|DBSCAN-SWA MFKFVFKRILMVIPTFIAITLITFALVHFIPGDPVEIMMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFHYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLTEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLDNEFWIDTPTGFMLIDSWLSGVSGAFENAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLSYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVGQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIIVVNLTVDLLYGVVNPRIRH >NZ_LS483480|1685791:1694305|1686467_1686893_+|WP_005647466.1|DBSCAN-SWA MFKISKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYESGAKKAMVIDFSDLKSIVKKVILDPMDHAFIYDQTNERESQIATLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHDEQLSISSIRLWETPTSFCEYQE >NZ_LS483480|1685791:1694305|1685791_1686475_+|WP_077643778.1|DBSCAN-SWA MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENIEAITFQYGQRHAIELEKARAITQDLGIKQTLIDTSVMKAITHNALMDEQAHIEQKESELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLDYVQKHTHTCYEGIEGGCGKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV >NZ_LS483480|1685791:1694305|1688143_1690324_+|WP_172451702.1|DBSCAN-SWA MDISELLDGLNDKQREAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLFGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQLRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILAGKTGQVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETILLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYAAFNELDEAKFVASQIQDWVENGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGDRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYQQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPDNAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAQKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMTLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLAKLEKVR >NZ_LS483480|1685791:1694305|1686893_1687529_+|WP_005686506.1|DBSCAN-SWA MLMEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYIATSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE >NZ_LS483480|1685791:1694305|1691429_1692317_+|WP_015702107.1|DBSCAN-SWA MSDTPLTFAPKTPLQEFWFYFKQNRGALIGLIFILIVALISILAPYIAPFDPTEQNRTALLLPPAWYEGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFVIVLLSCAFGTSLGLISGYYGGVLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAMMNEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARGFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ |
8 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1824933 : 1834002
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LS483480|1824933:1834002|DBSCAN-SWA TATGTTTAACAAAATTTTTTCGTGGTTTGAAAATCGTTTAAATCCCTATCCAGAAAGCAATCCAACAACACCTAAAAAAGGTTTGTTCCGTTTTATTTGGTCTAGTATTACAGGAATGAAAGGCTGGATTTTTTTGCTCGCAATTTTAACCGTAGGTACAGGTGTAATGGAAGCTGTATTATTCCAATTTATGGGAACGCTTGTAGATTGGTTAGGCACATTTACACCTGAAAGATTATGGCAAGAAAAAAGTCATTTATTAATTGGAATGGCTGCTCTATTACTTATTAGTATTGTGTGGGGATTTTTAGCTTCGGCCGTGCATTTACAAACCTTACAAGGCGTATTTCCAATGCGATTACGTTGGAATTTCCATCGTTTAATGCTTGGACAAAGTTTAAGTTTTTATCAAGACGAATTTGCAGGTAGAGTATCCGCAAAAGTAATGCAAACCGCCCTTGCAGTACGTGACACAGTACTTACACTTGCAAATATGTTCGTTTATGTATTGGTATATTTTATTACCTCTGGCGTAGTGCTAGTGGCATTAGATTCTTGGTTCTTATTACCATTTATTACTTGGATTATACTCTTCGGTTTGATCCTACGAACCCTAATTCCTAAACTATCAAAAACCGCACAACGACAAGCTGATGCTCGTTCTTTAATGACAGGACGCATTACAGATGCTTATTCTAATATTGCTACAGTAAAATTATTTTCTCACGGCTCACGCGAAGCTACTTATGCCAAGCGTTCTATGCAAGATTTTATGGTAACAGTACACGCCCAAATGCGCTTAGCAACATCACTAGATACACTCACTTACGCTACAAATATTCTACTTACGTTAAGTACTGCAATACTTGGTATTATTTTATGGAAAAATGGTCAAGTTGGCGTGGGTGCAATAGCAACGGCAACGGCAATGGCATTACGCGCAAATGGGCTTTCTCGCTGGATTATGTGGGAATCTGCCCGTTTGTTTGAGAATATCGGAACCGTAAACGACGGAATGAATACTTTAACCAAACCTCACACCATTGTGGATAAACCACAAGCGTCACCGTTACAAGTGAAACAAGGGGAAATTAAGTTTAACAATATTACCTTTGCTTACGATCCGACAAAACCATTACTCAATCATTTCAATCTCACTATCAAACCAGGGGAAAAGGTTGGGTTAATCGGTCGTTCTGGTGCAGGAAAATCTACGATTGTGAACTTATTGCTTCGCTTTTATGAAGCACAACAAGGCGAAATTACCATTGATGGACAAAATGTACTCAATGTGCAACAAGAAAGCTTACGTCGCCAAATCGGTTTAGTCACTCAAGACACTTCGTTGCTACATCGTTCTGTACGTGACAATATTATTTATGGTCGCCCAAATGCTACTGATGAAGAAATGGTTTTAGCTGCTGAACGAGCGGAAGCCGCTGATTTCATCCCATTTCTCAGTGATTCTCAAGGTAGAAAAGGCTATGATGCCCATGTGGGAGAACGCGGGGTAAAACTTTCTGGTGGTCAGCGTCAGAGAATTGCCATTGCTCGTGTAATGTTAAAAGACGCACCAATTCTATTGTTAGATGAAGCCACAAGTGCATTGGATTCAGAAGTGGAAGTGGCAATACAAGAAAGTCTCGATAAGATGATGGAAAATAAAACTGTGATTGCCATTGCCCATCGTTTATCCACCATCGCAGCGATGGATCGCCTGATTGTGCTTGATAAAGGACAAATTGTCGAACAAGGTACGCACGCCGAATTACTAGAGCTCAATGGTCTGTACGCTAAACTTTGGAATCATCAAAGTGGCGGATTTTTAAGCGAAAGTGCTGAATAATATTGCGTTTATCATATTTAATTAATTGTACTGTAATCAAACTAATTAAAAAATTAGTCTAATTTAATAGCTAAAGAAAAGTGCGGTGAATTTTTACCGCACTTTTTTGCTAGATATTTAGCGTTTAATTCACGACTTCAGCAGTATATTTCAGCTTGTGAATTGCATCGAATAATTGTTGGTTTGTGACTTTTGGATCTTCCACAACCGTCACTAAACCATCTTTAATAGATGCTTTTGTTGAAATAACGCCATTGATATTACGCAGTTCTTTATTGACTAAGTAAGCACAAAGCTGGCAATTCATTTCCTTTACTTTTAGCACAATTTGTTTGGTTTCATTCGCATGAGCGAAAGAAATTGCAAACAGCGAAAGCAAAAGTGCGGTACATAATTTCTTCATTTTTATTCCTAATTAGCTAATTCTAAAATCCAAGGTAAAATTGTTGGATAGGTTAAGAAAAAAATCATCACGATAAATACAATCCAATATAAAACGATAAGTTTTTTACGGGAAATATATTTGCTACAAATGATTTTTTTGGAAAACATCAACAGCCAAAATCCATAGGCAAAGGCACATAATGAAATGATAAGCATAGGAATGCGCAAATAATCATATTCGCCTAAGCCAATCAACCAAGTGGACGACACACCAAATACTAAATAAATTAATGGTGCGATGCAGCACAAGGTTGATGCCACCGCAGCACTTAGTGCGACGGCTATGGCAACCCAAAAGGATTTATTAGAGTTTTTTAGATACGTAGTCATATTTAAATTCTTTTGGGTCAAAGGAATTTAACGGATCGCCACCTACTTCTGCATATGGATAGCCGAAGTTATTGATTGGAGCCAGTTCTGGTTGTGGATATAAATCGAAGTCACGGGCATGATTAAATCCTACCCAGTTTGCTTCCCAGTTACCAAACAAATATTTTGCTACGGCTTGTGTATCTTTATCTTCAACAGATTTTTTCTCTGCTAAACGCATTTTGGCAACGTCTGCGGAATCAACTGGTACCCATCCAAATCCTGCAAGGTAGAATTCAGCGCGACAGTGCTGACCGCCACTTACGTTTGCGATGCCTTGTTCATTTGCACTACCGAAGGCACCTTTGGAATATTTGCCCATTTTCTCTGCCGCACCTAAGCGAATACCAAAAATTTCACGAGCAGGGATGCCTGCAGCACGAGCAAGTGCCACAAATACAGAATTAATATCGGTACATTTACCTTTTAATACGCCAGTGGTAAGAATTTTTTCTACATCGCCGTCGCCACAACCTAATACAGAATTATCACGTTCCATATTTTTTACGATCCAACGGTGAATAAGTTCTGCTTTTTTCAATGGATTAGTTTCTTTACCTACGATTTTGTCAGCAAATTCTTTCACAATGCCATCAGTTTTAATATGTGGAGTAGCTTTTAAGTATTCTTGTACATCCACGGAATACTGAATATCTTTTGGCGGAGTATAATTCTCTAAAGCACCTTTCACCATCGGTTCACGGTCTTTTGTTTCAATGACCATCGTGACTTTTAAATCACGTTTTTGTGCATCTTTATCCCAAGTGGCAAATAAGGTTTTCGCTCCGTATTTATTGTTTTCTGTTACATAGGCATTCATGTAATTACCTTCAAAGTGAATCAATTTCACTTGTTGGTATTCCCCATTAAATGGTAATGGAACCCATAAATTGGTTTGTCCTTGCGAGCCTTTTGGCACAACTAAATCATAGGTTTGCGTGAATTCGTAAAGATGGGCGTCTGTATTGTAGTTTGGAATATTAGTGTTTGCATGAGCTAACGAGCCACATGCAGAAAGCACCGCAACTGCGATAAGTTTCTTCATGAAGAGATCCTCTAGTTAATAATAGTTAAACTTAACATATTAGATAAACTAATACGCCACTATGCTAACGGGTTTTTAAATCCATAGTCAATTTGTTATTCCAAAATTTATTAAAACATCAATCTACTAAAATACCCTATAAATAATATACCTATTAATGATTAATTGATTTGGCTCAAGTAAAACTTCTATACAAAGATTATAATTAACTCGTTTTAGTTATTTTTCAATCTGACTGTGGGGGAACGATATAATGAGTAACTTTAATCAAATAAGTCGCCGAGATTTTGTCAAGGCGTCATCTGCGGGAGCTGCACTGGCAGTTTCAAATCTTACTTTACCTTTCAATGTAATGGCTAAAGAGACACAACGCCTCAATGAAAATAATCAAGAACGTATTGTTTGGAGTGCTTGTACAGTAAACTGTGGTAGCCGTTGTCCATTACGAATGCACGTAAAAGATAACCGAATCACTTATGTGGAAACCGATAATACGGGGACAGAAACATATAATCTTGATCATCAGGTTCGTGCTTGTCTACGTGGACGTTCTATGCGTCGTCGAGTGTATAACCCAGACCGTTTAAAATATCCAATGAAACGTATAGGTAAACGCGGAGAAGGTAAATTCAAACGAATCAGTTGGGATGAGGCTTTAACTGAAATTGCATACGCATTGAAACGCAATATCAAAAAATATGGCAATGAATCAATTTATTTAAACTATGGTACGGGAACACTCGGTGGCACAATGGCTAAATCTTGGCCACCTGCATCCACTATGATCGCTCGTTTTATGAATTGTATTGGTGGATATTTAAACCATTATGGTGATTACAGCACCGCACAAATTGCAGTCGGTTTAGATTATACCTATGGTGGTGGTTGGGCATTGGGAAATGGAATGGCTGACATTGAAAACACCAAATTAATAGTGTTATTCGGTAATAATCCTGCAGAAACTCGTATGAGTGGAGGTGGTTTAACTTATTGTATTGAACAAGCCAAAGCTCGTTCCAATGCCAAAATGATTATTATCGATCCTCGTTATAATGATACTGGTGCAGGGCGTGAAGATGAGTGGATCCCAATTCGTCCGGGGACTGATGCAGCCCTTGTTGCTGCCCTTGCTTATGTAATGATTCAAGAAAATCTCGTGGATCAACCTTTCTTAGATAAATATTGTGTTGGTTATGATGAAAAAACATTACCTGCGGATGCCCCTAAAAATGGTCATTATAAAGCCTATATTTTAGGTTATGGTAATGATGGTATCGCTAAAACTCCAGAATGGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LS483480|1824933:1834002|1831320_1831938_+|WP_005656008.1|DBSCAN-SWA MEQYGFYFDSERCTGCKTCELACKDYKDLGTEVNFRRIYEYTGGQWNQQADGCWHQNIFAYYMSISCNHCADPACTKVCPTGAMHKNADGFVIVNEEICIGCRYCHMACPYDAPQYDAQKGHMTKCDGCYSRVKSGQKPICVDACPLRALDFAPIDELRTKYGTQASIAPLPPTDITQPNLVVKPNKYARLSGDTSGFLGNPREV >NZ_LS483480|1824933:1834002|1824933_1826778_+|WP_077643746.1|DBSCAN-SWA MFNKIFSWFENRLNPYPESNPTTPKKGLFRFIWSSITGMKGWIFLLAILTVGTGVMEAVLFQFMGTLVDWLGTFTPERLWQEKSHLLIGMAALLLISIVWGFLASAVHLQTLQGVFPMRLRWNFHRLMLGQSLSFYQDEFAGRVSAKVMQTALAVRDTVLTLANMFVYVLVYFITSGVVLVALDSWFLLPFITWIILFGLILRTLIPKLSKTAQRQADARSLMTGRITDAYSNIATVKLFSHGSREATYAKRSMQDFMVTVHAQMRLATSLDTLTYATNILLTLSTAILGIILWKNGQVGVGAIATATAMALRANGLSRWIMWESARLFENIGTVNDGMNTLTKPHTIVDKPQASPLQVKQGEIKFNNITFAYDPTKPLLNHFNLTIKPGEKVGLIGRSGAGKSTIVNLLLRFYEAQQGEITIDGQNVLNVQQESLRRQIGLVTQDTSLLHRSVRDNIIYGRPNATDEEMVLAAERAEAADFIPFLSDSQGRKGYDAHVGERGVKLSGGQRQRIAIARVMLKDAPILLLDEATSALDSEVEVAIQESLDKMMENKTVIAIAHRLSTIAAMDRLIVLDKGQIVEQGTHAELLELNGLYAKLWNHQSGGFLSESAE >NZ_LS483480|1824933:1834002|1827526_1828636_-|WP_077643745.1|DBSCAN-SWA MKKLIAVAVLSACGSLAHANTNIPNYNTDAHLYEFTQTYDLVVPKGSQGQTNLWVPLPFNGEYQQVKLIHFEGNYMNAYVTENNKYGAKTLFATWDKDAQKRDLKVTMVIETKDREPMVKGALENYTPPKDIQYSVDVQEYLKATPHIKTDGIVKEFADKIVGKETNPLKKAELIHRWIVKNMERDNSVLGCGDGDVEKILTTGVLKGKCTDINSVFVALARAAGIPAREIFGIRLGAAEKMGKYSKGAFGSANEQGIANVSGGQHCRAEFYLAGFGWVPVDSADVAKMRLAEKKSVEDKDTQAVAKYLFGNWEANWVGFNHARDFDLYPQPELAPINNFGYPYAEVGGDPLNSFDPKEFKYDYVSKKL >NZ_LS483480|1824933:1834002|1832890_1833502_+|WP_005693380.1|DBSCAN-SWA MQNTLQQISIYGRLLGAVFYYEPNDARLTDILTFFRQPNWMQEWEISFDVKTHKKITALIEKGLQQNITEQYQYLFIGPNELPTPPWGSVYLDPECVIFGNSLLALRDFLQQHQIAFQTQQDEPEDHIGLMLMLAAYLAENRPHLLTKFLREHFLTWAYHFLEQLSKIENSDFYQALALLTIKTLQQWQVDLHINVPTVRFYR >NZ_LS483480|1824933:1834002|1833501_1834002_+|WP_015702035.1|DBSCAN-SWA MKNEAYYQAYLSHHHISRRGLLRHVFPATKSTIEKTQSRPPFSAREDLFSAVCNGCGECASACPNGLIQLKQQQATLEIDHAPCDLCGKCAEVCPTNALHPNFPADTLLRPQFSSACLILQNQTCPDCQTACPQQAISSTLEIDNERCNGCGECKITCFVAAITLK >NZ_LS483480|1824933:1834002|1826902_1827181_-|WP_006996602.1|DBSCAN-SWA MKKLCTALLLSLFAISFAHANETKQIVLKVKEMNCQLCAYLVNKELRNINGVISTKASIKDGLVTVVEDPKVTNQQLFDAIHKLKYTAEVVN >NZ_LS483480|1824933:1834002|1828889_1831310_+|WP_077643744.1|DBSCAN-SWA MSNFNQISRRDFVKASSAGAALAVSNLTLPFNVMAKETQRLNENNQERIVWSACTVNCGSRCPLRMHVKDNRITYVETDNTGTETYNLDHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLKYPMKRIGKRGEGKFKRISWDEALTEIAYALKRNIKKYGNESIYLNYGTGTLGGTMAKSWPPASTMIARFMNCIGGYLNHYGDYSTAQIAVGLDYTYGGGWALGNGMADIENTKLIVLFGNNPAETRMSGGGLTYCIEQAKARSNAKMIIIDPRYNDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVAALAYVMIQENLVDQPFLDKYCVGYDEKTLPADAPKNGHYKAYILGYGNDGIAKTPEWAAKITGIPAERIIKLAREIGSTKPAFISQGWGPQRRSNGELISRAIAMLPILTGNVGIHGGNTGARESAYSIPFVRMPTLKNPMKASIPMFLWTDAIIRGTEMTALTDGIRGVDKLSSPIKVIWNYASNCLINQHAQINRTHDILQDDTQCEMIITIDNHMTSTAKYSDILLPDCTTSEQMDFALDAFVSNMAYVIFADQVIKPSFECRPIYDMLSDLAEKMGVKEKFTEGRTQEEWLRHIYEQSREKLPELPTFEEFRQQGIFKKVDPNGFKVAYKDFRDNPEAHPLKTPSGKIEIYSSRLAEIAKTWKLAEDDVIHPLPIHAQSFEHYGDPLMEKYPLQLSGFHYKARTHSTYGNVDVLKAANPQEVWMNPIDAKPRNIKNGDMIRIFNDRGEVHINVKITPRIIPGVVALSEGAWYAPDKDRIDHSGCINVLTTQRPSPLAKGNPQHSNLVQVERL >NZ_LS483480|1824933:1834002|1831939_1832779_+|WP_005690803.1|DBSCAN-SWA MNTGLYELPLVFFTVLAQSAVGAWLVFTFVLLNEKNTKSRTYIHKVMFVILALLGIGFIASIMHLGLPIRAFNSLNRVGSSMMSNEIAAGAIFFTLAGFYWLIAILGKMPVSLGNVWRIVTALIGILFMYVMNQVYHITSIPTWNNALTSWSFYLTVVLGGLTLSYALLIPNKQREYQLQHLPSLFAIGVSLVAIVAIYQGFNLHNIHSAIQNAADLVPNYAIMTVTRLCLLSIVAFLLFRVKNIGLLGISVLLTLVAEGIGRVLFYGLHMTYGMAIGG >NZ_LS483480|1824933:1834002|1827189_1827552_-|WP_162680722.1|DBSCAN-SWA MTTYLKNSNKSFWVAIAVALSAAVASTLCCIAPLIYLVFGVSSTWLIGLGEYDYLRIPMLIISLCAFAYGFWLLMFSKKIICSKYISRKKLIVLYWIVFIVMIFFLTYPTILPWILELAN |
9 | Escherichia_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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