Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LR594045 | Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis strain NCTC9413 chromosome 1 | 3 crisprs | DinG,csa3,csm6,csn2,cas2,cas1,cas9,cas3,DEDDh | 0 | 8 | 9 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LR594045_1 | 123046-123231 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LR594045_1
|
2 spacers
spacers of NZ_LR594045_1
>1.1|123094|35|NZ_LR594045|PILER-CR CAAGAACCTTCAGACCCAGTTATCCCAACGGTTAT >1.2|123177|26|NZ_LR594045|PILER-CR TGCGCTTCCCCCATTAATGCCAGAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LR594045_1
The CRISPR arrays of NZ_LR594045_1 >merge|NZ_LR594045|1|123046-123231|PILER-CR TTTAGATGGGCATGAAATCCCAGAAGTTCCACAAGAACCTTCAGACCCAGTTATCCCAACGGTTATTTTGGATGGTGAAGAAGTCCCAGAAGTTCCAAGCGAGAGCTTAGAACCTGCGCTTCCCCCATTAATGCCAGAACTAGATGGTCAAGAAGTTCCAGAAGTTCCAAGCGAGAGCTTAGAACC >NZ_LR594045|1|1|123046-123231|PILER-CR TTTAGATGGGCATGAAATCCCAGAAGTTCCACAAGAACCTTCAGACCC AGTTATCCCAACGGTTATTTTGGATGGTGAAGAAG TCCCAGAAGTTCCAAGCGAGAGCTTAGAACCTGCGCTTCCCCCATTAA TGCCAGAACTAGATGGTCAAGAAGTT CCAGAAGTTCCAAGCGAGAGCTTAGAACC
>NZ_LR594045.1|WP_138083662.1|120428_121922_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MIEKYLESSIESKCQLIVLFFKTSYLPITEVAEKTGLTFLQLNHYCEELNAFFPGSLSMTIQKRMISCQFTHPFKETYLYQLYASSNVLQLLAFLIKNGSHSRPLTDFARSHFLSNSSAYRMREALIPLLRNFELKLSKNKIVGEEYRIRYLIALLYSKFGIKVYDLTQQDKNTIHSFLSHSSTHLKTSPWLSESFSFYNILLALSWKRHQFSVTIPQTRIFQQLKKLFVYDSLKKSSRDIIETYCQLNFSAGDLDYLYLIYITANNSFASLQWTPEHIRQCCQLFEENDTFRLLLNPIITLLPNLKEQKASLVKALMFFSKSFLFNLQHFIPETNLFVSPYYKGNQKLYTSLKLIVEEWMAKLPGKRYLNHKHFHLFCHYVEQILRNIQPPLVVVFVASNFINAHLLTDSFPRYFSDKSIDFHSYYLLQDNVYQIPDLKPDLVITHSQLIPFVQHELTKRIAVAEISFDESILSIQELIYQVKEEKFQADLTKQLT >NZ_LR594045.1|WP_014611939.1|119409_120282_-|Hsp33-family-molecular-chaperone-HslO MDKIIKSIAQSGAFRAYVLDSTETVALAQEKHNTLSSSTVALGRTLIANQILAANQKGDSKITVKVIGDSSFGHIISVADTKGHVKGYIQNTGVDIKKTATGEVLVGPFMGNGHFVTIIDYGTGNPYTSTTPLITGEIGEDFAYYLTESEQTPSAIGLNVLLDENDKVKVAGGFMVQVLPGASEEEIARYEKRLQEMPAISQLLTSENHVDALLEAIYGDEPYKRLSEEPLSFQCDCSRERFEAALMTLPKADLQAMIDEDKGAEIVCQFCGTKYQFNENDLEALINDKA >NZ_LR594045.1|WP_065957269.1|118445_119423_-|tRNA-dihydrouridine-synthase-DusB MIKLNSSFRIGDVEIPHRTVLAPMAGVTNSAFRTIAKEFGAGLVVMEMISEKGLLYNNEKTLHMLHIDENEHPMSIQLFGGDAEGLKRAADFIQTNTKADIVDINMGCPVNKVVKNEAGAKWLRDPDKIYHIVKEVTSVLDIPLTVKMRTGWADSSLAVENALAAESGGVSALAMHGRTREQMYTGTCDHETLARVSKAITKIPFIGNGDVRSVQDAKFMIEEIGVDAVMIGRAAMNNPYLFTQINHFFETGQELPDLPFAKKLDIAKDHLKRLINLKGETIAVREFRGLAPHYLRGTAGAAKVRGAVSRAETLAEVEAIFETVR >NZ_LR594045.1|WP_022554132.1|117784_118426_-|deoxynucleoside-kinase MLIVLAGTIGAGKSSLAAALGEHLGTDVFYEAVDNNPVLDLYYQDPKKYAFLLQIYFLNKRFKSIKEAYQADNNILDRSIFEDELFLKLNYKNGNVTKTELDIYQELLANMLEELEGMPKKRPDLLIYIDVSFDKMLERIEKRGRSFEQVDGNPSLEQYYHQVHGEYPTWYEDYKVSPKMKIDGNSLDFVQNPDDLATVLQMVDDKLKELDLL >NZ_LR594045.1|WP_015016554.1|116845_117649_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSTRLSIQAIHKTFEAGTINENHVLRGLSLDVAEGDFISIIGGNGAGKSTLMNTLAGTLPIDQGDILLDGQSIKKLPASKRAKDISRVFQDPKMGTASRLTIEENMAIAHRRGKSRGLSWGVKDKDRQLFKEALKELGLHLENRLKVDTQFLSGGQRQALTLLMASLEKPKVLLLDEHTAALDPKTSAMVMELTQKIVENHGLTTLMITHNMENAIDYGNRLVMLHQGKIVVDVKGDEKKNLTVAQLMELFHQNSGQVLTDDALVLG >NZ_LR594045.1|WP_014612278.1|115312_116542_-|IS110-family-transposase MLKIVYPNCCGIDVHKTFVVAVIAITNNQGITEYHRKRFSTFTNGLTQLRDWLEYYSCFDVCMESTGKYWIPVFNILEEQTNVCLAHPKYVKAIRGKKTDKKDAQWIADLFKHDLVASSFIPPLKIRQLRDLFRYRMKLTQLQVGEKNRYQNCLTWSNLQIASVVSDVFGKSAQAIIKSILDNPQDKPNIEQLVHKRMKNKVQDLEIAMEGALTPEQAEKIRVIKAHYDALAICKEDLEQMIRELGQDYQHQVKLIQTVPGFKEDLSALRIISEIGCDMTVFDSAAKLCSWAGLVPANNESAGKKFSTRISKGGKYLKPFLVQVANAVVKSDKHPELRNKYLKLKKRRGHRKAISAICRRLLVSVYQVLRKQEDYNPVLQGLTEIRNPDKTMSVQDAVRFAQQHGFNVA >NZ_LR594045.1|WP_115282994.1|114334_115219_+|ABC-transporter-permease MSLVLSSLSQGLLWSIMAIGVYLTFRISDIADLTAEGSYPLGAAICATGIVSGLNPLLATMLAFGGGLLAGLVSGLIHTKLKIPALLTGIVTLTGLYSINLKVLGKANVALLRQKTLVTQLHDMGFTKIAAVMIIGTLFAVVVIALLTLLMKTQIGLALRSTGDNIPMSESNGIKTDHMKMLGYMVSNGLIALCGALLCQNNGYADLNAGVGTIVIGLASIIIAEVMIRNLSIGWRLASIVLGSIVYRLIILAILAIPGMDADLVKLFSAILLATVLFVPELQKKLNIRKPKVG >NZ_LR594045.1|WP_015016551.1|113334_114294_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKVYYLVMVALATLTLAACRSTKDPVTNQKDVHVGILQYMEHDSLSAARKGFEAELEAEGYKKGKNLTLDYQNAQGDQSNLQTISEQLISKNDLILAIATPAAQSLATVSTETPVVFTAVTDPLSADLVDSIKKPGGLITGTSDQAPIDKQIDLLGQALPKAKRIGILYTTSERNSEVQVNEAEKLMTKAGYQVVKKGISSSNDVQDAANSLMKDVDAIFVPTDNTVASTMTMLGELSIANQVPIIGGSTDMVDAGGLLTYGTNYESLGKQVGKMAVKILKGQKPANLAVEYPKTVELHINQEMAKALNIDVSQLTAD >NZ_LR594045.1|WP_022554127.1|112342_113305_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MGFKKASLIAFIGLATLSLAACRKEAGQAHQSAKVGIIQYAEHSALDAAREGFIEVLAEGGFKEGKTLTVTTRNAQGDQANLQTMVEQLAGKNDLNFAIATPAAQALLNGDQETPAVFTAVTDPVSAGLVDSLAKPGGNMTGSIDATDVAGQIDLLTKALPQAKTVGIFYNSSEVNSEVQAKAAKKALEKKGLKVLVKTVTTTNDVQQVMTSLANQVDAVYLPTDNTVASTASTIGDILKEAKVPSMGSDDAYLSAVLFTSGVDYKAIGKQAGKEAVAILKGKSPATIKVAKPEKAKIAVNDDMAKALGMDSQAIKALGK >NZ_LR594045.1|WP_003060482.1|111437_111833_+|single-stranded-DNA-binding-protein MYNKVIMIGRLVAKPELVKTATDKHVARLSLAVNRRFKNASGEREADFISVVVWGKLAETLVSYASKGSLMSIDGELRTRKYDKDGQVHYVTEVLCQSFQLLESRAQRAMRENNVANDLVDLVLEEEELPF >NZ_LR594045.1|WP_138083663.1|125085_129204_+|fibrinogen-binding-adhesin-SdrG-C-terminal-domain-containing-protein MYSRLERQLVIVINRKKKYKLIRLMVTLSLIFSQLAPPFDALMSLSGHLGTKSPVTEVKAESVSTSKTGSFKLKKFDEDGRTPIKDVKFQLTSDTSTSSYQTEQTTSGTGDAKFANIPPGTYLLKEVAPPSGYQVMTDYYKITVSPDGYTQYTYVKAGTTTSSPTSSLPSTGGGGTGGTILRSPKTSGVVTVTSYNFTTKNKASGNTDYTKLWATSGEFFDMSFKLKVNEGTQAGDSFTIKLSDYLSPNGIREKFISAPPLMLDQKVVATGIYDEASNSYIYTFNDLINRKQNAEITVNYTFSPEAKKVDRDWYVNTYNITNIIDGQTKDSGNYTIDYGEGQYMAGTLNSGLRLRNNITYLNRTTGEVEYTIYLNNGNKLKDSNYIVKDPTLGVRHYVDLSEHSSDVSFKSEDVSVFRVLLSQKPDKMPYSMSGELDDLEKINATYDANKKGITLDNDSFKDRETNQNTAGILIRVRGTILNLNKYKADVTLSAKWRYTGVSWNTYSEAKASVFELGNISSGVANNIEPTVTIRNYKTKKGSVVFTKQDVETKKALSGVAFKLEKKEENDWQVVEKYKDVQTGTDGKLILSDLDAGEYQLIETKPLDGYLAVSGPVASFTITDQGLETSIKPSDKIIPNTKPGKQKIKVIKKDEQSRVPLAGAKFQLESNKGVVLTGETDGKGEYTFTNLPFGDYILTEIAAPKGYILDKTPRSIAIGDTVDKEPEPTVVEAATPRTVRSVSPSATVSGKDVSRNILVKKVEFTTTNGQTPLQVKPNQGENLIARSEFELKKEIDIKKGDYFAVKLSDNIDPFGVSTGETTTFNITGPYGTLAVGKYDHQSRSIIYTFTDYVEKYDVSNFSTILPYFIDRYAVTSDADINISTSVGSQTNNAQVRVLYTPYYGYTDSKSPVNVGSMLTKLDLKNKTFTNYVYINPKHESIRNGKLYFVGDGAAIINEATHITLYKALNNADMPPSWGVTDDNLTEEVSLPIVKENGRIYIDFGNSLQYRDSFILKIVGHYDADSDAPIKTSATLYQNYYNYYGYYTEKGRWIPQGPYSEYFTYNAGAVLKSGESSADGALRVTVTNRKNNVEFMKTNAAGTPLEASFELRKVKPDKTFTNLKTVKSDKDTGKFAFEGMESGNYEVWETQVPSGYLKPDKAVATFKVDKDGTIKDLTPDNGKIINYPNTAKIIFTKMLASEKGELSPATKEKSATFSLWRRKDSNGKEIDTPTQAYDEQYYEPVLMNGATRTATSDDKGNVLFDNLSPGFYAIKEESAPDGYVKQKGIVRIFQVDATGKVIKYRLLNDKIVTDKLVEIKESDGDLQKEFNEIINHKFVFPMTGGQGITLFMVVGGAIMGIAYLGHRRKQRLND >NZ_LR594045.1|WP_138083664.1|129324_131466_+|isopeptide-forming-domain-containing-fimbrial-protein MKTKIFSRLAAVLLVLGSLLPTVVAVAEAESSHKTDVVIHKIKMTSLKGWPKEKNPDGTYTGENSKIYNGEKINDISQYFGAKSGAEELDGVSFIYWKVDKKEDYEKLVKDPQSYNTVAKVKGLLKDVTEKQTGATAGQAGVKVEHLEDGYYWFVENTGSLIANGETLSSGAAVPFGLELPVYKADGSIIKELHVYPKNTTTKPKIDKNFSNEEKDAKLAGGANYDHYQKDKGHVSRTIGSEVTYHIKTEIPAGAQYQALRWEDTMTKGLTYKVGSLELQITAKSSKGSDNPNLNFKYLEDYSLTENQSGFALLFTPEGLEKVKAVVQATKNDKGQITHDGYPMTIELNYKAIVNSDAVVDQFDQNTVVFDYGNNPKVYKDPRDKSTKPKDKSITVNKTWATQPAPSGVEVTYYLYQKGTTANEDKVVDSVILTKDYHHTFTNLDDSKEYYVKESAIGYIPEYTSAQGGTISIKNTKDDKNPDPLKPTSPAIVTHGKKFVKTSQEDERLQGAAFVVTNQKTGGKYLAIKADNEQNAEEKAYQEAEKKYQEEIKKATTDKPNTLEIEKTKKARDDAFKKARTAYEWVSDKQKAVKFTSNSKGQFEVTGLAAGTYYLEEVAAPTGFAKLQEKVEFTLGFNSYNGHKDQSGQSLEGHTQYEKGTPDFGYGQRVINKKITIPQTGGIGTVIFTVVGLAIMTVTGLMMIRRNKNDKSE >NZ_LR594045.1|WP_115230355.1|131478_132324_+|prealbumin-like-fold-domain-containing-protein MGGTQLKIGRLIRLMLSICACLYFLTSPIFALQKTSSVTIHFEKSDKDTQLALWQLPEGQTLPELETLFEKTDAELTHQYPQVSTVTVPKGETKLVLSNLPVGAIYYVREAEERLGVHSLAPFILKVDTDDDQAVYTKKAKPQKRGSYPFVKVSAQGGSLEGATFEVWKQTQKQLQPVIKGGSRYLLTSSKDGSFMAKDLPFGSYVLKEITAPKGYLLSKKTISFEVTDYSEKQAPVKVVNQPKIPPRIEIPYTGNAIMILVVLLGFALFTLGVYLVRKNG >NZ_LR594045.1|WP_138083665.1|132405_133278_+|class-C-sortase MKQQSKRHRLNQNIALIVVFLIGLTILLYPQISRIYYTIESNNQSKQFDREKSTLHQEDISQRIALAKAFNASLHDVNLKDPYSDDEKTKGRAEYARMLELHEQIGHVEIPKIRVDLPIYAGTSDEIISKGSGHLEGTSLPVGGENTHTVLTSHSGLPSAKLFSDLAKLRKGNIFYIHNIKEILAYQIDQIKIIEPDDFSDLLIVPGKDYATLLTCTPVGINTHRLIVRGHRVPYVSNEHKNNKQKASSGYMCYLFVLLTLLALLFGYWFYRQKKKKSQKVKREEFHAKE >NZ_LR594045.1|WP_046177327.1|133264_134098_+|class-C-sortase MLKNKQSLSLRERLIQVMFPLLFLMGCLIMLYPLVSNYYYRVKQNQAVTSFESAKVIVNKDDIKRRMALARAYNATLDPGRINDPYTDMEKKGVAEYARMLELNEQIGYVEVPRFDINLPIYAGTSDDVLQKAAGHLEGTSLPIGGDSTHTVITAHTGLPQAKLFTNIHKMKKGDLFFIHNIDKTLAYKVDQILVVEPDNFTPVLVKNGFDYATLLTCTPYGINSHRLLVRGYRVPYQKAFEKADAQRPWYTKAIFLVSFLLFVILVIILLINWHRK >NZ_LR594045.1|WP_172600549.1|134117_134975_+|class-C-sortase MSKQKCVGYVLMILGLGLPLFFLTLMSLNQFQEQVAYQKFQTENRSWKNSQKEWVNRHNQEQALTDRATTDPFVDAQNQLKQSPFDDNIIGYIIIPKLRMAQPIRVGASERHLEKGVAQVTGTSLPIGGLGTRSVIAGHRSWYDNERFLRIAELSIGDQIVIDLGVYQLEYSVKSVEIIDAKDWRQLTAKKSQDLITLLTCNPLYPPFNERLLVNAERVSPSLSDLPTKTRNKTDQSQLESPMASHKTSLVKLPLVLPFGIWVCLGWLIESYFIYRLFHQCKGDS >NZ_LR594045.1|WP_138083666.1|135314_135890_-|hypothetical-protein MDEKGKVHLYWQGNYYVDNYVDYTKNLSHDGKSIEWVVAFNKALENWTYPDFSVFLPKGVKAPTQITVQDHWQNGKIDSKTVQNTQWHYDWENQQTNFNQEFDKFPGYTGWSPSLDKFYKLKNEGKFSHVLVDTYGRQSHTYFSHKMVWKFKTELEDNYKDKWNKLPFIAGIKQNNPLAASFPSYKGEFGE >NZ_LR594045.1|WP_138083667.1|136727_137408_-|transcriptional-regulator MDKETLNYWKTVITFLHDVLGDNYEIILHVIDKNDIYIGELVNSHISGRSKNSPLTKFALDLITQKVYQEKDFVTNYKAIVSPLHKEVRGSTFFIKDKEGNLEGMLCINLDISAYQGVASDLLKLANLNLGQLISTAPETTATVALQEEPVEILTSNIQDIISEIIDPSLLRHNVHLSQDVKIDIVAKLYEKGVFQLKGAVSKVADILCISEPSVYRYLKKIEADQ >NZ_LR594045.1|WP_003061669.1|137586_137946_+|RidA-family-protein MNSYPQPMGPYSTYMIEGNLLYTAGQLPLDPVSGQLPDGFEAQCRQVFANLQAILAEQNRELTHICKLTVYLSDLVYFDTLNQVMMELLEEPYPIRTAVQVEALPLQALVEIEAVARVN >NZ_LR594045.1|WP_003060913.1|137983_139003_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIC MDILLGTGLLVLVLAIFSLFNYKAPHGAKAMGALASAACASFLVEAFQDSFFGQVLGFQFLSEVGGANGALSGVAAAILVAIAIGVSPGYAVLIGLSVSGTGIIPGFVAGYLVSFLIKWMEKNIPGGLDLIAIIIVGAPLTRFLAQLITPVINGTLLTIGDILTSSANSNPIIMGMILGGTIVVVATAPLSSMALTAMLGLTGIPMAIGALSVFGSSFMNGVLFHKLKLGERKDNIAFAIEPLTQADVTSANPIPIYLTNFVGGAACGVLIALMKLINDTPGTATPIAGFAVMFAYNSVTKVLMTAAGCIILSLIAGYIGGSVFKNYRLVTKQELQARN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LR594045_2 | 184740-184886 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LR594045_2
|
1 spacers
spacers of NZ_LR594045_2
>2.1|184791|45|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder CAAGTTGAAGAGAAGCTAAAGGAAGCTCGACTTAACTATCAAGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LR594045_2
The CRISPR arrays of NZ_LR594045_2 >merge|NZ_LR594045|2|184740-184886|CRISPRCasFinder CTTGCTGAAGTTCAAACTCATATCCGTGAGAAATTAAAAGCAGAGAAAGCTCAAGTTGAAGAGAAGCTAAAGGAAGCTCGACTTAACTATCAAGACCTTGCTGAAGTTCAAACTCATATCCGTGAGAAATTAGAAGCAGAGAAAGCT >NZ_LR594045|2|1|184740-184886|CRISPRCasFinder CTTGCTGAAGTTCAAACTCATATCCGTGAGAAATTAAAAGCAGAGAAAGCT CAAGTTGAAGAGAAGCTAAAGGAAGCTCGACTTAACTATCAAGAC CTTGCTGAAGTTCAAACTCATATCCGTGAGAAATTAGAAGCAGAGAAAGCT
>NZ_LR594045.1|WP_138083679.1|182562_184095_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MTHASKLFTKQQWRELELIAHLTEHSERMGYKDRELCKVLNSTVSTLQACIANLQFMESIGRITYEDGYLTIGYNDHCGLQEVYQRALRESQSLQLLSALFFKEFDSLEDLADALFISLSTLKRLITRTNGYLKEEFGIKISTRPVMVVGDEHHIRLFYLKYFSEAYTISEWPFAEIINQNNLERLIALMAKQTDVPVNFALFQHLKILSGVNLIRFQKGFTLNRKEKGLEHLFMKVLEDSLEMKDLSALFALKYNQPLDARALAEIFSNYLNPALELGKLLQSDDSAREQTLSSHQIVPWIALLDKIEKSLQLSISNKYELARHLQTTVILAEEDISANFLIYDYKKEYLKFFHKHYRVIYDTFLTYVEDLFALDHQEFNEGIRNHLLYCLFITWENLFLKISQSRRKLKLLVIERSYSNVGNFLKEYFGEFFEIISFDDLGNPKIDLLPLAKEYDVIVTDVILEQNNHSEILFFNQMIPSVVADKLTDFLKVKVGEDKLFESVTLSTS >NZ_LR594045.1|WP_138083678.1|181608_182076_-|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MSDLTIVFISLSGNTLSFVKRLSLYLEEKQGIHTNPINIKNLKHETFPVKDDFVAILPTYLEGGNGIDSGEVEILTNPLGDFIAAHDNYKHCMGIIGSGNKNFNNQYCLTAKQYAKRFGFPMLGDFELRGTQDDIERLAKIILERRDAFRASSEG >NZ_LR594045.1|WP_049520231.1|180347_181328_-|nucleoside-hydrolase MTKQPIIIDCDPGIDDSLALLYALKHPKLEVIAITLVQGNVPVPIGLQNTILLLERVNRLDIPIYLGRGIPLERDYVSAQDTHGIDGLGDSLLQPSVIKEAEALPAADFLAQHFAEPSETAIIALGPLTNVAEALGQNPNMGKHCQRFVSMGGAFKAHGNCSPVAEYNYWCDPHAARLTFQQLGRKLEMVGLDVTRQIVLTPNHLSYMARLNPEETAFIESITRFYFDFHWEYEHLIGCVINDPLAVVYFLAPTICQGFDSYTDVATEGITLGQTVVDQYDFYHKKANSHILTTVNSKAFWSEFIATILEVPLHQVVRDLDHLQLG >NZ_LR594045.1|WP_138083677.1|179792_180344_-|ECF-transporter-S-component MTKIKTQVLTFIAAAIALNYLGANIALFLKLPLYLDMIGTLLIALLFGPWLGAVTAIVSALLSWMTTDIFALFYAPVAIITALTAGVFLRQHNRTKDLIWKALCISFPGTLVASIITVILFKGITSSGSSLLVQILHGLGLDLTVSVIVIQAGTDYLDRLVSLLLVLMISKALRKQLPHLFQI >NZ_LR594045.1|WP_138083676.1|178684_179722_-|M42-family-metallopeptidase MKTTVEYLTKLAKIPSPTGFTRKIMDYVHDELSQFGYEPVRTHKGGIMVSIKGKNDDKHRVVTAHLDTLGAMVRAIKPDGRLKMDLVGGFVYNSIEGENCTVHLANSGKEISGTILLHQTSVHVYKDAGSAERNQANMEVRLDEKVTTADETRALGIEVGDFISFDPRVIVTESGFIKSRHLDDKVSAAILMELLKCYKEEQVELPYTTHFYFSAFEEVGHGANSSLPAQVVEYLAVDMGAMGDDQATDEYTVSICVKDGSGPYHYELRQHLVALCQDHQIPYQLDIYPYYGSDASAAMRAGAEVRHALLGAGIESSHSYERTHTDSIEATERLVDAYLKSTMID >NZ_LR594045.1|WP_015016595.1|178148_178661_-|kinase MTKLILIRGNAASGKTSLANALQSQLGENTLLLSQDKLRREMLLAHDGFDTPTIPLLKHLITFGMANCDYIILEGILKADWYAPVWDFISQQSRLQVFAYYYDIPFEETLKRHSSRSKVEEFGEEALRKWWNEKDYIKIISETSFDKTVTLQEALNYILQDITKRSGLTS >NZ_LR594045.1|WP_003057880.1|177315_178140_+|endonuclease/exonuclease/phosphatase-family-protein MTKLLTLNTHSWMEANALKKLVDLAEHILAEKYDIICLQEINQLIESELAMELPSYQPIPGTPTIHKDHFALLLIHYLKKRGQHYYWSWAYNHIGYDIYHEGVAILSKQPIHVSDILVSAMDDETDYHTRRSLVAKTKLDGKEVAVVNVHLSWFDKGFLGEWEKLEKELLTLNCPLLLMGDFNNPTNQEGYQVIMGSPLNLQDSHKVADHVFGDHSIVADIDGWEDNKEAFKVDHVFTSKDFDIKASHITFEGGDAPVVSDHYGLEVTLDWVEK >NZ_LR594045.1|WP_138083675.1|175050_177237_+|PTS-transporter-subunit-EIIC MKTSFKQLFSFEFWQKFGKCLMVVIAVMPAAGLMISIGNSIPMINHNSAFLASLGNIIAQIGWAIIVNLHLLFALAIGGSWAKERAGGAFASGLAFVLINRITGAFYGVSGAMLADPEAKITSLLGTQMIVKDYFTSVLESPALNTGVFVGIIAGFVGATAYNKYYNYRKLPEVLTFFNGKRFVPFVVILRSILVALVLVVVWPVIQSGINGFGMWIASSQDSAPILAPFLYGTLERLLLPFGLHHMLTIPMNYTALGGTYEVMTGAAAGTKVFGQDPLWLAWVTDLVHLKGSDASAYHQLMDGVTPARFKVGQMIGATGTLMGVALAMYRNVDADKKHKYKMMFISAAAAVFLTGVTEPLEYMFMFAAMPLYLVYALVQGASFAMADLVNLRVHSFGNIELLTRTPMALKAGLGMDLINFVWVSILFAVIMYFIADMMIKKMHLATAGRLGNYEADMLDDNKAKSSGAPMADSNTQVVQIVNLLGGRDNIDDVDACMTRLRVTVKDPAKVGAEDDWKKAGAMGLITKGSGVQAVYGPKADILKSDIQDLLDSGAIIPEVNMAKVADKPMPAKDFRHVTEEVLSVADGTVLQITGVKDQVFAAKMMGDGFAVEPTNGNIYAPVSGLVTSVFPTKHAFGLLTDSGLEVLVHVGLDTVALNGVPFSVKVTEGQRIEAGDLLVVADLAAIQSAERETTIVVAFTNTAEIQDVTLTSLGAQPAKTPVATVEL >NZ_LR594045.1|WP_042357819.1|173773_174781_+|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MVTIKDVAKLAGVSASTASRAINDNHMISQATKERVRKAMETLDYSPNYSAQNLVKRQSNAVGIILPVRVIQDSLGNNPFFMQIIQGIAGVCTDNGYMVSLATGRSDDELLKNVQNMIRSGHIGKLIFLYSKTDDKVFDFVKKQAVDCVVVGQSYATDNGNAKFVDNDNRQAGYDAAAFLLERGFKQITYAYTDMDELVQAERFIGYAEKMTSQGLTAQTINLSSETEQDIGQRIQKFLANHPQPAFVTCDDMLAIHLQRLLKQNHPNQKVPMISFNNSILAELATPSLTSVEIFPYQLGEKAATLVLATDHIQDTIHLISHQIVERESTQPITP >NZ_LR594045.1|WP_003061170.1|172849_173608_+|16S-rRNA-(uracil(1498)-N(3))-methyltransferase MQQYFIKGKAEKEVTITDKDTIKHMFQVMRLTDEAEVVLVFDDGIKYLAKVTNSMAHELEIIEALPDQVELPVKVTIASGFPKGDKLDTIAQKVTELGASALWGYPADWSVVKWDGKKLAKKEDKLAKIVLGAAEQSKRNVVPEVHLFEQKAEFLKSLSSFDHIFIAYEETAKAGQLATLARELKEVKPGAKLLFIFGPEGGISPAEITQFEAAGAIKVGLGPRIMRTETAPLYALSAISYALELQVTSDDN >NZ_LR594045.1|WP_138083681.1|186423_188643_+|bifunctional-(p)ppGpp-synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate)-3'-pyrophosphohydrolase MAKEINLTGEEVVALAAKYMNETDAAFVKKALDYATAAHFYQVRKSGEPYIVHPIQVAGILADLHLDAVTVACGFLHDVVEDTDITLDNIEFDFGKDVRDIVDGVTKLGKVEYKSHEEQLAENHRKMLMAMSKDIRVILVKLADRLHNMRTLKHLRKDKQERISRETMEIYAPLAHRLGISRIKWELEDLAFRYLNETEFYKISHMMNEKRREREALVGDIVTKIKSYTTEQGLFGDVYGRPKHIYSIYRKMRDKKKRFDQIFDLIAIRCVMETQSDVYAMVGYIHELWRPMPGRFKDYIAAPKANGYQSIHTTVYGPKGPIEIQIRTKEMHQVAEYGVAAHWAYKKGVRGKINQAEQKVGMNWIKELVELQDASNGDAVDFVDSVKEDIFSERIYVFTPTGAVQELPKDSGPIDFAYAIHTQVGEKATGAKVNGRMVPLTAKLKTGDVVEIVTNPNSFGPSRDWIKLVKTNKARNKIRQFFKNQDKELSVNKGRDMLVSYFQEQGYVANKYLDKKRIEAILPKVSVKSEESLYAAVGFGDISPVSVFNKLTEKERREEERAKAKAEAEELVNGGEIKHENKDVLKVRSENGVIIQGASGLLMRIAKCCNPVPGDPIEGYITKGRGIAIHRADCNNIKSQDGYQERLIEVEWDLDNSSKDYQAEIDIYGLNRSGLLNDVLQILSNSTKSISTVNAQPTKDMKFANIHVSFGIPNLTHLTTVVEKIKAVPDVYSVKRTNG >NZ_LR594045.1|WP_138083682.1|188656_189100_+|D-tyrosyl-tRNA(Tyr)-deacylase MKIVMQRVKEASVSIDGKIAGAINQGLLLLVGVGPDDAAEDLAYAVRKIVNMRIFSDADGKMNLSIQDIKGSILSVSQFTLYADTKKGNRPAFTGAAKPDLARQLYDSFNEQLADFVPVERGVFGADMQVSLINDGPVTIILDTKCH >NZ_LR594045.1|WP_138084102.1|189197_190496_-|streptokinase MFALLFALTFGTVNSVQAIAGPEWLLDRPSVNNSQLVVSVAGTVEGTNQDISLKFFEIDLTSRPAHGGKTEQGLSPKSKPFATDSGAMPHKLEKADLLKAIQEQLIANVHSNDDYFEVIDFASDATITDRNGKVYFADKDGSVTLPTQPVQEFLLKGHVRVRPYKEKPVQNQAKSVDVEYTVQFTPLNPDDDFRPGLKDTKLLKTLAIGDTVTSQELLAQAQSILNESHPDYTIYERDSSIVTHDKDIFRTILPMDQEFTYHVKNREQAYRINKKSGLNEEINNTDLISEKYYVLKKGEKPYDPFDRSHLKLFTIKYVDVNTNELLKSEQLLTASERNLDFRDLYDPRDKAKLLYNNLDAFGIMDYTLTGKVEDNHDDTNRIITVYMGKRPEGENASYHLAYDKDRYTEEEREVYSYLRYTGTPIPDNPNDK >NZ_LR594045.1|WP_022555211.1|190524_191388_-|IS982-family-transposase MSHLQYTAKSHHLQWSIAQLTQICSQCYRDYCPKSIKHRKNVGLSKVSDASLLVLLLLQAELGITSQRRFYRICHLFFCGNLLERSRFNRRTRQLIGVVQLIRQALNKPISSDTIVIMDSFPMPLCQPIRNHKAKVFKGLADIGYNASKHLWFYGFKVHMLVTLSGVMLNYVVTPASVHDIKVVDELLEGCKQTVVLADLGYLSQELKDKLGHKGYHLWTPLRQNMVGAKQHNNRQLLAWRRTIETRFSELCSLFDIEQTLARGLSGLQLRLEQFILAYNLKYFEIN >NZ_LR594045.1|WP_138084103.1|191817_192666_+|PucR-family-transcriptional-regulator MELKDYFPEMQVGPHPLGDKEWMSIKEGDQYVHFPKSCLSEKERLLLEVGLGQYEVLQPLGSPWQRYLLDHQGNPPQLFETSQFIYLNHQQVLPADLVELLQQMIAGLEVILPISTTQTAFLCRQATSIKVLRSLEGLLPTLESDFGLALTMFVGNAWYQVAAGTLRECFEEECQLLTAYLKQKSGGKLLTFAEVMLWSILSHQSFPALTRQFHQFLNPQSDMADVVHALWSEHGNLVQTAQRLYIHRNSLQYKLDKFAQQSGLHLKQLDDLAFAYLFLLKY >NZ_LR594045.1|WP_003057915.1|192964_194098_+|sn-glycerol-3-phosphate-ABC-transporter-ATP-binding-protein-UgpC MVELNLNHIYKKYPNTTHYAVEDFDLDIKDKEFIVFVGPSGCGKSTTLRMIAGLEDISEGELKIDGEVVNDKSPKDRDIAMVFQNYALYPHMTVYDNMAFGLKLRKYKKDDIDRRVKEAAEILGLTEFLERKPADLSGGQRQRVAMGRAIVRDAKVFLMDEPLSNLDAKLRVSMRAEIAKIHRRIGSTTIYVTHDQTEAMTLADRIVIMSATKNPQGNGTIGKIEQVGSPQELYNLPANKFVAGFIGSPAMNFFEVEVKDGRIVSEDGLDIAIPEGQAKMLETAGYKGKKVTFGIRPEDISSNQIVHDTYPNANVTAEVLVSELLGSETMLYVKLGQTEFASRVDARDFHSPGEQVSLTFNVAKGHFFDLDTEQAIR >NZ_LR594045.1|WP_138083683.1|194179_195793_+|alpha-glucosidase MQKQWWHKATIYQIYPRSFKDTSGNGIGDLKGITSQLDYLQKLGITAIWLSPVYQSPMDDNGYDISDYEAIAEVFGNMDDMDDLLAAANERGIKIIMDLVVNHTSDEHAWFVEARENPNSPERDYYIWRDEPNNLMSIFSGSAWELDEASGQYYLHLFSKKQPDLNWENAQLRQKIYDMMNFWIAKGIGGFRMDVIDLIGKIPDSEITGNGPRLHDYLKEMNQATFGNHDVMTVGETWGATPEIARQYSRPENKELSMVFQFEHVGLQHKPDAPKWDYAEELDVPALKAIFSKWQTELKLGEGWNSLFWNNHDLPRVLSIWGNDSIYREKSAKALAILLHLMRGTPYIYQGEEIGMTNYPFKDLTEVDDIESLNYAKEAMGNGVSAARVMSSIRKVGRDNARTPMQWSKDTHAGFSEAQETWLPVNPNYQEINVADALANQDSIFYTYQQLIALRKEQDWLVEADYHLLPTADKVFAYQRQFGEETYVIVVNVSDQEQVFAKDLAGAEVVITNTDVDKVLETKHLQPWDAFCVKLSV >NZ_LR594045.1|WP_138083684.1|195958_199582_+|pullulanase MIKRVTQGSKQYKYAIKKLSIGVVSVATGASILLYSPQVMAQESSPETGVTQTQVEHEKQATEQADSVVNEAVNASAGLTPESSEKRTEAVGDSSQATEPQLSTNQADASQADKISESAKPLATDAAAKAPAISDNHLRMHFKTLPAGESLGSLGLWVWGDVDQPSKDWPNGAITMTKAKKDDYGYYLDVPLAAKHRQQVSYLINNKAGENLSKDQHISLLTQKMNEVWIDENYHAHAYRPLKKGYLRINYHNQSGHYDNLAVWTFKDVKTPTTDWPNGLDLSHKGPHGAYVDVPLKEGAKEIGFLILDKSKSGDAIKVQPKDYLFKDLDNHTQIFVKDTDPKVYNNPYYIDQVSLKGAEQTTPNEVKAIFTTLDGLDEDTVKQKIKITDKAGKAVAIDELTLDKDKSVMTLKGDFKAQGAVYTVTFGEVSQVARQSWQLKDKLYAYDGELGATLAKDGSVDLALWSPSADSVKVVVYDKQDQTKVVGQADLTKSDKGVWRTHLTSDSIKGISDYTGYYYLYEITRGQEKVMVLDPYAKSLAAWNNATANDQIKTAKAAFVNPSLAGPKDLDFAKINNFKKREDAIIYEAHVRDFTSDPSLDGKLRNEFGTFAAFIEKLDYLKELGVTHVQLLPVLSYFYVNELDKNRSTAYTSSDNNYNWGYDPQHYFALSGIYSANPNDPALRIAELKQLVNEIHKRGMGVIFDVVYNHTARTYLFEDLEPNYYHFMNADGTARESFGGGRLGTTHAMSRRILVDSITYLTREFKVDGFRFDMMGDHDAAAIEQAFKAAKAINPNTIMIGEGWRTYQGDEGKKETAADQDWMKATNTVGVFSDDIRNTLKSGFPNEGTAAFITGGAKNLEGLFKTIKAQPSNFEADAPGDVVQYIAAHDNLTLHDVIAKSINKDPKLAEEEIHKRIRLGNTMILTAQGTAFIHSGQEYGRTKQLLNPDYKTKVSDDKVPNKATLIDAVAQYPYFIHDSYDSSDAVNHFDWAKATDGQANPISYQTQAYTKGLIALRRSSDAFRKASMADVNRDVTLITQAGQGDIQKDDLIIGYQTIASNGDRYAVFVNADSKARTVVLPDRYRHLLGAQVLVDAEQAGVTAIAKPKGVQFTKEGLTIDGLTAIVLKVAAGAVEAPSQTQQARSEQSVRPVSTTVSKASPLMTPDQKPQQASLPQTGEMTSKGLLATGMTMLIAVFGLFTKRQKD >NZ_LR594045.1|WP_012766514.1|199734_200025_-|hypothetical-protein MLAQFRPLINRYAKPYLVLVCLLWLAMFFVRWDTMVLGYNLYFLVMQKGFLILGILTILMGAISKRWGLILFGLLFCGAFWINLFIFFGILPVFGN >NZ_LR594045.1|WP_003057937.1|200180_200531_+|conjugal-transfer-protein-TraF MTFEETIAQFTTVEIGEVKQAIENGKDMIVFLGRSTCPFCRLFAPKLAQVAEDHQKKVFFVNSENPIDAEALQAFRQEYHLATVPALLVIHSGQVRAVCDSSLTESEILDFLTTRE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LR594045_3 | 1246837-1247531 | TypeII |
II-A,II-B
Consensus repeat of NZ_LR594045_3
|
10 spacers
spacers of NZ_LR594045_3
>3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT TATGGAAGAGAAATGACTGAAGCGGAGCGA >3.2|1246939|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTAAAACCTGTCTTATTGTGGTAGGTTTTA >3.3|1247005|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGCCATCTTGATAATCTGACAAGGCCCCTA >3.4|1247071|29|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTCGATCTCCCTTTTTTGTCCCTTCGAC >3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGCCATTGAGGTTAATTGCTGAGACAATC >3.6|1247202|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGATTTGTAGTTATCTGTTGTTACTTTGT >3.7|1247268|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATGCAATCGTGTACGCAGATATTAAAGTC >3.8|1247334|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATCTCGAATGTTATGAGCAGTTCTAACA >3.9|1247400|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCGCAGCAAAAGTTGTGCCTTTAATTTCAA >3.10|1247466|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGTAGGTGAATCCCGCTGCCAAAAAGACT |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LR594045_3
The CRISPR arrays of NZ_LR594045_3 >merge|NZ_LR594045|3|1246837-1247531|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAACTATGGAAGAGAAATGACTGAAGCGGAGCGAGTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAACGTAAAACCTGTCTTATTGTGGTAGGTTTTAGTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAACAGCCATCTTGATAATCTGACAAGGCCCCTAGTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAACTCTCGATCTCCCTTTTTTGTCCCTTCGACGTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAACTGGCCATTGAGGTTAATTGCTGAGACAATCGTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAACCTGATTTGTAGTTATCTGTTGTTACTTTGTGTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAACTATGCAATCGTGTACGCAGATATTAAAGTCGTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAACGAATCTCGAATGTTATGAGCAGTTCTAACAGTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAACCCGCAGCAAAAGTTGTGCCTTTAATTTCAAGTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAACAGGTAGGTGAATCCCGCTGCCAAAAAGACTGTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC >NZ_LR594045|3|2|1246837-1247531|CRISPRCasFinder GAATTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC TATGGAAGAGAAATGACTGAAGCGGAGCGA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC GTAAAACCTGTCTTATTGTGGTAGGTTTTA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC AGCCATCTTGATAATCTGACAAGGCCCCTA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC TCTCGATCTCCCTTTTTTGTCCCTTCGAC GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC TGGCCATTGAGGTTAATTGCTGAGACAATC GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC CTGATTTGTAGTTATCTGTTGTTACTTTGT GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC TATGCAATCGTGTACGCAGATATTAAAGTC GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC GAATCTCGAATGTTATGAGCAGTTCTAACA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC CCGCAGCAAAAGTTGTGCCTTTAATTTCAA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC AGGTAGGTGAATCCCGCTGCCAAAAAGACT GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC >NZ_LR594045|3|1|1246837-1247531|CRT GAATTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC TATGGAAGAGAAATGACTGAAGCGGAGCGA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC GTAAAACCTGTCTTATTGTGGTAGGTTTTA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC AGCCATCTTGATAATCTGACAAGGCCCCTA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC TCTCGATCTCCCTTTTTTGTCCCTTCGAC GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC TGGCCATTGAGGTTAATTGCTGAGACAATC GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC CTGATTTGTAGTTATCTGTTGTTACTTTGT GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC TATGCAATCGTGTACGCAGATATTAAAGTC GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC GAATCTCGAATGTTATGAGCAGTTCTAACA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC CCGCAGCAAAAGTTGTGCCTTTAATTTCAA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC AGGTAGGTGAATCCCGCTGCCAAAAAGACT GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC >NZ_LR594045|3|2|1246903-1247531|PILER-CR GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC GTAAAACCTGTCTTATTGTGGTAGGTTTTA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC AGCCATCTTGATAATCTGACAAGGCCCCTA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC TCTCGATCTCCCTTTTTTGTCCCTTCGAC GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC TGGCCATTGAGGTTAATTGCTGAGACAATC GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC CTGATTTGTAGTTATCTGTTGTTACTTTGT GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC TATGCAATCGTGTACGCAGATATTAAAGTC GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC GAATCTCGAATGTTATGAGCAGTTCTAACA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC CCGCAGCAAAAGTTGTGCCTTTAATTTCAA GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC AGGTAGGTGAATCCCGCTGCCAAAAAGACT GTTTTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAAC
>NZ_LR594045.1|WP_138083892.1|1246262_1246721_-|nucleoside-diphosphate-kinase MEQTFFMIKPDGVERGLVGEVLRRIERRGFTFERLELRQASPELLAKHYEALVTKPFYPELEAYMTSGPVLIGVLSGNRVISSWRTMMGVTNPKDALPGTIRGDVAQAPGDDGGIFNVVHGSDSRDSARREIALWFNQAELDSSAIFPKDNQ >NZ_LR594045.1|WP_015017092.1|1244360_1246193_-|elongation-factor-4 MNSQHLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRHEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGDVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGIVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYVAASIKTVADTRVGDTVTLANNPAKEALHGYKQMNPMVFAGIYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVHTTDGDMIEVSNPSEFPDPTRVASIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELSQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYEISEYRKSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKIIVEKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVSRSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKSIGSVEVPQEAFLSVLSMDEDAKK >NZ_LR594045.1|WP_003062486.1|1243747_1244185_-|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB METKDDLKKRIGDLSYEVTQHAATERPFTGKYDDFFEKGIYVDIVSGEVLFSSLDKFNSGCGWPAFSKPIENRMVTNHDDSSYGMRRVEVKSREAGSHLGHVFSDGPQEAGGLRYCINSAALKFIPYDQMEKEGYAQWLTLFDEK >NZ_LR594045.1|WP_003059696.1|1243084_1243735_-|HD-domain-containing-protein MTEKEVQLLAQAEAWVKEKLAADASGHDFWHVIRVCRLAKIIAQEEEGDVFICQLAALLHDMADDKLNADPKKARQNILAWLAGHDVSQKQSDQVMTIIDTISFKGGHGKPLTNLEAKIVQDADRLDAIGAIGIARCMVYSGHTGRLIHDPDRLPRETMTVEEYRKDGTAIMHFYEKLLTLKERMNTAYGRQLAEHRHQVLVSYLDEFYAEWDGLR >NZ_LR594045.1|WP_003058431.1|1242646_1242877_-|bacteriocin MNTKIFEKFDFMDNEKLAYIDGGAGSGKTVYQGNGLYCNKVKCWVNWAETWTTIANNSVMNVLTGGNAGWHSGGAL >NZ_LR594045.1|WP_003058441.1|1242350_1242647_-|bacteriocin-immunity-protein MSGLNWFSGGNERQQQASLLIKDLVADLKQSGGKEPLQKVLLSFDEELKRGESSIPFILSRMTVAVSTVLKEHQITLSAKESDQLDDLYALLQIRYGY >NZ_LR594045.1|WP_065956884.1|1240991_1242161_-|DUF2974-domain-containing-protein MATLLDYIKTNGHRDYHSLALNELDVAVINEIGYLAFDELVADDNHLEATIKLSQLPLLQTREIKGTPYDFLNTKERLDLFQMMCQSKRFSELTLSHYINDINTEFEKQFAAMVFRLPSIDYTQLVFRGTDDSLIGWKEDFKLTYMREIPAHRSAIDYLKTYHTYYPNQKLVLSGHSKGGNLALYAASFVPKNVQASLKDIYLFDSPGLIKEFLTHPGYQAIRRRLVVIKPQDAIIGVMLYCDVPEKIVQSQSYGLLQHQMVNWQITPNAQFKRAPKRSALSYDLEETFKDWTNQLSKQDLKLLCDTFFDCLASSGITSLNVFSLDDKAFLTLMRVISSLQSIDHEKKKVMVKSLHQLMVTYGSYRRRDISENIHNHLQQLLTLTKGIK >NZ_LR594045.1|WP_138083891.1|1239861_1240881_-|YeiH-family-putative-sulfate-export-transporter MSTYLRKLPGLLLCLLLALPAWYLGRLFPIIGAPVFAILLGMLLALFYHHRDKTKEGISFISKYILQTAVVLLGFGLNLTQIMAVGMQSLPIIVSTVATALLVAYGLQKWLGLDVNTATLVGVGSSICGGSAIAATAPVIKAKDDEIAKAISVIFLFNILAALLFPSLGQLLGLSNEGFAIFAGTAVNDTSSVTATATAWDAIHHSNTLDGATIVKLTRTLAILPITLGLSLYRAKKEHDIVTEEGFSLRKSFPRFILFFLLASLITTLMTSFGVSADVFHSLKTLSKFFIVMAMAAIGLNTNLVKLIKTGGQAILLGAICWVAITLVSLAMQLSLGIW >NZ_LR594045.1|WP_003060515.1|1239229_1239655_-|PTS-mannose-transporter-subunit-IIA MKRKFLIGSHGRLASGLQSSIDILAGMGQTLETIDAYVDDSDYTSRIDDFIAGVAADEQGLIFTDLLGGSVNQKMVTAVMNSGKDNIFLITNSNLATLLSLVFLKPGEALTKDEIVTVINESQVQLVDLVPETNSEDDFFD >NZ_LR594045.1|WP_002989934.1|1238719_1239211_-|PTS-system-mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-transporter-subunit-IIB MITQIRVDDRLIHGQVAVVWTKELNAPLLVVANDEAAKNEITQMTLKMAVPNGMKLLIRSVEDSIKLFNDPRATDKRIFVIVNSVKDACAIAKEVPDLEAVNVANVGRFDKSDPASKVKVTPSLLLNPEEMAAAKELVSLPELDVFNQVLPSNTKVHLSQLVN >NZ_LR594045.1|WP_003058436.1|1247633_1248296_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNLNFPLLDEPIPLRGGTILVLEDVCVFSKIVQHCYQYEEDSELKFFDHKMKAIKESEIMLVTDILGFDVNSPTILKLIHADLESQFNEKPEVKSMIEKLVATITELIVFECLENELDLEYDEITILELIKSLGVKVETQSDTIFEKCLEILQIFKYLTKKKLLIFVNSGAYLTKDEVASLQEYISLTNLTVLFLEPRKLYDFPQYILDKDYFLITKNMV >NZ_LR594045.1|WP_003058414.1|1248285_1248627_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSYRYMRMILMFDMPTDTAEERKVYRKFRKFLLSEGFIMHQFSIYSKLLLNNTANNAMIGRLRENNPHKGNITLLTVTEKQFARMIYLHGERNNCIANSDERLVFLGEAFDES >NZ_LR594045.1|WP_003058425.1|1248623_1249493_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAGWRTVVVNTHSKLSYKNNHLIFKDAYKTELIHLSEIDILLLETTDIVLSTMLVKRLVDENVLVIFCDNKRLPTAMLMPFYGRHDSSLQLGKQMSWSEEVKSEVWTTIIAQKILNQSCYLGACSYFEKSQSIMDLYHGLELFDPSNREGHAARIYFNTLFGNDFSREQDNVINAGLDYGYTLLLSMFAREVVVSGCMTQFGLKHANQFNQFNFASDIMEPFRPLVDKIIFENRNQPFPKIKRELFTLFSDTFLYNGKEMYLTNIVSDYTKKVVKALNNEGKGVPEFRI >NZ_LR594045.1|WP_138083893.1|1249492_1253608_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MDKKYSIGLDIGTNSVGWAVITDDYKVPSKKFKVLGNTDRHSIKKNLIGALLFDSGETAEATRLKRTARRRYTRRKNRIRYLQEIFSSEMSKVDDSFFHRLEESFLVEEDKKHERHPIFGNIVDEVAYHEKYPTIYHLRKKLADSTDKADLRLIYLALAHMIKFRGHFLIEGDLNPDNSDVDKLFIQLVQTYNQLFEENPINASRVDAKAILSARLSKSRRLENLIAQLPGEKRNGLFGNLIALSLGLTPNFKSNFDLAEDAKLQLSKDTYDDDLDNLLAQIGDQYADLFLAAKNLSDAILLSDILRVNSEITKAPLSASMIKRYDEHHQDLTLLKALVRQQLPEKYKEIFFDQSKNGYAGYIDGGASQEEFYKFIKPILEKMDGTEELLAKLNREDLLRKQRTFDNGSIPHQIHLGELHAILRRQEDFYPFLKDNREKIEKILTFRIPYYVGPLARGNSRFAWMTRKSEETITPWNFEEVVDKGASAQSFIERMTNFDKNLPNEKVLPKHSLLYEYFTVYNELTKVKYVTEGMRKPAFLSGEQKKAIVDLLFKTNRKVTVKQLKEDYFKKIECFDSVEISGVEDRFNASLGTYHDLLKIIKDKDFLDNEENEDILEDIVLTLTLFEDKEMIEERLKTYAHLFDDKVMKQLKRRHYTGWGRLSRKLINGIRDKQSGKTILDFLKSDGFANRNFIQLIHDDSLTFKEAIQKAQVSGQGHSLHEQIANLAGSPAIKKGILQSVKVVDELVKVMGHKPENIVIEMARENQTTQKGQKNSRERMKRIEEGIKELGSQILKEHPVENTQLQNEKLYLYYLQNGRDMYVDQELDINRLSDYDVDHIVPQSFIKDDSIDNKVLTRSDKNRGKSDNVPSEEVVKKMKNYWRQLLNAKLITQRKFDNLTKAERGGLSELDKAGFIKRQLVETRQITKHVAQILDSRMNTKYDENDKLIREVKVITLKSKLVSDFRKDFQFYKVREINNYHHAHDAYLNAVVGTALIKKYTKLESEFVYGDYKVYDVRKMIAKSEQEIGKATAKRFFYSNIMNFFKTEITLANGEIRKRPLIETNEETGEIVWDKGRDFATVRKVLSMPQVNIVKKTEVQTGALTNESIYARGSFDKLISRKHRFESSKYGGFGSPTVTYSVLVVAKSKVQDGKVKKIKTGKELIGITLLDKLVFEKNPLKFIEDKGYGNVQIDKCIKLPKYSLFEFENGTRRMLASVMANNNSRGDLQKANEMFLPAKLVTLLYHAHKIESSKELEHEAYILDHYNDLYQLLSYIERFASLYVDVEKNISKVKELFSNIESYSISEICSSVINLLTLTASGAPADFKFLGTTIPRKRYGSPQSILSSTLIHQSITGLYETRIDLSQLGGD >NZ_LR594045.1|WP_138083894.1|1254084_1254714_-|TIGR01906-family-membrane-protein MVENAKLLCSWLWLLALAILMTIYSAWLWYPLEVDHLKLEQVVFMSKDAILHNYNGLLNYLTNPFETSLTFASFRSSTDGLKHFADVKWLFHLTQVVFLGLLYPTVKDFKQRFKTKSFWSIQRPLMIAALFPLMIGLMASVIGFENFFTLFHKVLFVGDSNWLFDPLKDPVIWILPEVFFLHCFLFFMTVYEIILWSLVGLARWQRPKI >NZ_LR594045.1|WP_003054515.1|1254713_1255478_-|TIGR01457-family-HAD-type-hydrolase MPYKGYLIDLDGTIYQGKNRIPAGERFIKRLQEKGLPYLLVTNNTTRTPEMVQDMLSKQFNVETGIETIYTATMATVDYMNDMNRGKTAYVIGETGLKSAIAAAGYVEELENPAYVVVGLDSQVTYDMLATATLAIQKGALFIGTNPDLNIPTERGLMPGAGALNALLEAATRVKPVFIGKPNAIIMNKSLEVLGIQRSEAVMVGDNYLTDIMAGIQNDIATILVTTGFTRPEEVPTLPIQPDHVLSSLDEWRL >NZ_LR594045.1|WP_046177080.1|1255477_1256230_-|acyl-[acyl-carrier-protein]-thioesterase MGLSYREDIKLPFELCDVKSDIKFPLLLDYCLTVSGRQSAQLGRSNDYLLEQYGLIWIVTDYEATIHRLPHFQETITIETKALSYNKFFCYRQFYIYDQEGCLLVDILAYFALLNPDTRKVATIPEDLVAPFETDFVKKLHRVPKMPLLEQSIDRDYYVRYFDIDMNGHVNNSKYLDWMYDVLGYEFLKAHEPLRMTLKYVKEVSPGGQITSSYHLDQLTSYHQITSDGQLNAQAMIEWRAIKQTESEID >NZ_LR594045.1|WP_003060113.1|1256239_1257370_-|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MSKKPTSAYVHIPFCTQICYYCDFSKVFIQNQPVDAYLEALIQEFESYDIHDLKTLYIGGGTPTAITAAQLEYLLSHLERNLNLDDLEEFTIEANPGDLTPDKIEVLKHSAVNRISLGVQTFNNKQLKQIGRSHNEEQIYSTIANLKTAGFHNISIDLIYALPGQTLAQVKENVAKALALDIPHLSLYSLILEHHTVFMNKMRRGKLNLPTEDLEAEMFEYIISEMEANGFEHYEISNFTKPGFESRHNLMYWDNVEYFGCGAGASGYLNGIRYQNRVPIQHYLKAVEAGNARLNEEVLRKEEMMEEELFLGLRKKTGVSIQRFQEKFDISFEERYGTIVRDLQDQGLLVKDDAFVRMTKKGLFLGDSVAERFILD >NZ_LR594045.1|WP_002984855.1|1257431_1258073_-|hypothetical-protein MTKQQIEKLADLLPPFAAKLYLDMIPEFQEGYASYVYQTQKEDTQNRRIKQLTKSFARLLDTPSFYVMPLSVQVGKQLLRNEEIACHSLSSVEAIQAFEAAVEDEKEVLQLLRNGSRLALLVLEEANETVHMDLGILTKVEQKVISPAMLTAIEEYLLATTEGNALQLTVTVEQGAARTFYQAHGFHQKADDLVFKPTDGKLICQMVKDLFKA >NZ_LR594045.1|WP_003056620.1|1258196_1259552_-|phosphoglucosamine-mutase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NZ_LR594045_3 | 3.2|1246939|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1246939-1246968 | 30 | MK448962 | Streptococcus phage Javan496, complete genome | 28684-28713 | 0 | 1.0 |
NZ_LR594045_3 | 3.2|1246939|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1246939-1246968 | 30 | MK448850 | Streptococcus phage Javan132, complete genome | 40080-40109 | 0 | 1.0 |
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NZ_LR594045_3 | 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1247136-1247165 | 30 | MK448688 | Streptococcus phage Javan161, complete genome | 36780-36809 | 0 | 1.0 |
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NZ_LR594045_3 | 3.6|1247202|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1247202-1247231 | 30 | MK448951 | Streptococcus phage Javan470, complete genome | 1516-1545 | 0 | 1.0 |
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NZ_LR594045_3 | 3.7|1247268|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1247268-1247297 | 30 | MK448849 | Streptococcus phage Javan128, complete genome | 35513-35542 | 0 | 1.0 |
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NZ_LR594045_3 | 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT | 1246873-1246902 | 30 | KC139518 | Salmonella phage FSL SP-031, complete genome | 27279-27308 | 6 | 0.8 |
NZ_LR594045_3 | 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT | 1246873-1246902 | 30 | KC139662 | Salmonella phage FSL SP-038 phage structural protein gene, partial cds; and head morphogenesis protein, hypothetical proteins, and coat protein genes, complete cds | 5422-5451 | 6 | 0.8 |
NZ_LR594045_3 | 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT | 1246873-1246902 | 30 | KC139557 | Salmonella phage FSL SP-049 hypothetical proteins, coat protein, hypothetical protein, putative tail protein, and hypothetical proteins genes, complete cds | 2824-2853 | 6 | 0.8 |
NZ_LR594045_3 | 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT | 1246873-1246902 | 30 | MF158037 | Salmonella phage St162, complete genome | 27527-27556 | 6 | 0.8 |
NZ_LR594045_3 | 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT | 1246873-1246902 | 30 | MH424444 | Salmonella virus VSiP, complete genome | 8409-8438 | 6 | 0.8 |
NZ_LR594045_3 | 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT | 1246873-1246902 | 30 | MN070121 | Salmonella phage Shemara, complete genome | 8992-9021 | 6 | 0.8 |
NZ_LR594045_3 | 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT | 1246873-1246902 | 30 | MK479295 | Salmonella phage SEE-1, complete genome | 31362-31391 | 6 | 0.8 |
NZ_LR594045_3 | 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT | 1246873-1246902 | 30 | MF158036 | Salmonella phage St161, complete genome | 16840-16869 | 6 | 0.8 |
NZ_LR594045_3 | 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT | 1246873-1246902 | 30 | MT012729 | Salmonella phage vB_SenTO17, complete genome | 41353-41382 | 6 | 0.8 |
NZ_LR594045_3 | 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT | 1246873-1246902 | 30 | MK214385 | Salmonella phage TS6, complete genome | 28926-28955 | 6 | 0.8 |
NZ_LR594045_3 | 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1247136-1247165 | 30 | MK448682 | Streptococcus phage Javan143, complete genome | 34180-34209 | 7 | 0.767 |
NZ_LR594045_3 | 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1247136-1247165 | 30 | MK448686 | Streptococcus phage Javan157, complete genome | 35396-35425 | 7 | 0.767 |
NZ_LR594045_3 | 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1247136-1247165 | 30 | MK448678 | Streptococcus phage Javan135, complete genome | 34095-34124 | 7 | 0.767 |
NZ_LR594045_3 | 3.9|1247400|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1247400-1247429 | 30 | NZ_CP014235 | Moraxella osloensis strain CCUG 350 plasmid unnamed4, complete sequence | 18945-18974 | 7 | 0.767 |
NZ_LR594045_3 | 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT | 1246873-1246902 | 30 | NZ_AP014802 | Rhodovulum sulfidophilum plasmid Plasmid2 DNA, complete genome, strain: DSM 2351 | 83638-83667 | 8 | 0.733 |
NZ_LR594045_3 | 3.9|1247400|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1247400-1247429 | 30 | MK911750 | Streptococcus phage P738, complete genome | 18160-18189 | 9 | 0.7 |
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3. spacer 3.2|1246939|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448962 (Streptococcus phage Javan496, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 3.2|1246939|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448850 (Streptococcus phage Javan132, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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tatgcaatcgtgtacgcagatattaaagtc CRISPR spacer tatgcaatcgtgtacgcagatattaaagtc Protospacer ******************************
11. spacer 3.7|1247268|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448856 (Streptococcus phage Javan158, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 3.6|1247202|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448791 (Streptococcus phage Javan517, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgatttgtagttatctgttgttactttgt CRISPR spacer ctgatttgtagttatctgttgttactttat Protospacer ****************************.*
25. spacer 3.6|1247202|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_004587 (Streptococcus prophage 315.4, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgatttgtagttatctgttgttactttgt CRISPR spacer ctgatttgtagttatctgttgttactttat Protospacer ****************************.*
26. spacer 3.6|1247202|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_003157 (Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgatttgtagttatctgttgttactttgt CRISPR spacer ctgatttgtagttatctgttgttactttat Protospacer ****************************.*
27. spacer 3.6|1247202|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448977 (Streptococcus phage Javan530, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgatttgtagttatctgttgttactttgt CRISPR spacer ctgatttgtagttatctgttgttactttat Protospacer ****************************.*
28. spacer 3.6|1247202|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448958 (Streptococcus phage Javan486, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgatttgtagttatctgttgttactttgt CRISPR spacer ctgatttgtagttatctgttgttactttat Protospacer ****************************.*
29. spacer 3.6|1247202|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448788 (Streptococcus phage Javan511, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgatttgtagttatctgttgttactttgt CRISPR spacer ctgatttgtagttatctgttgttactttat Protospacer ****************************.*
30. spacer 3.7|1247268|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448798 (Streptococcus phage Javan533, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tatgcaatcgtgtacgcagatattaaagtc CRISPR spacer tatgcaatcgtctacgcagatattaaagtc Protospacer *********** ******************
31. spacer 3.7|1247268|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028700 (Streptococcus phage T12, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tatgcaatcgtgtacgcagatattaaagtc CRISPR spacer tatgcaatcgtctacgcagatattaaagtc Protospacer *********** ******************
32. spacer 3.7|1247268|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448790 (Streptococcus phage Javan515, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tatgcaatcgtgtacgcagatattaaagtc CRISPR spacer tatgcaatcgtctacgcagatattaaagtc Protospacer *********** ******************
33. spacer 3.7|1247268|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tatgcaatcgtgtacgcagatattaaagtc CRISPR spacer tatgcaatcgtctacgcagatattaaagtc Protospacer *********** ******************
34. spacer 3.7|1247268|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448783 (Streptococcus phage Javan503, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tatgcaatcgtgtacgcagatattaaagtc CRISPR spacer tatgcaatcgtctacgcagatattaaagtc Protospacer *********** ******************
35. spacer 3.7|1247268|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448967 (Streptococcus phage Javan510, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tatgcaatcgtgtacgcagatattaaagtc CRISPR spacer tatgcaatcgtctacgcagatattaaagtc Protospacer *********** ******************
36. spacer 3.7|1247268|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_004588 (Streptococcus prophage 315.5, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tatgcaatcgtgtacgcagatattaaagtc CRISPR spacer tatgcaatcgtctacgcagatattaaagtc Protospacer *********** ******************
37. spacer 3.8|1247334|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448895 (Streptococcus phage Javan274, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gaatctcgaatgttatgagcagttctaaca CRISPR spacer gaatctcgaatgttatgagcagttctaacg Protospacer *****************************.
38. spacer 3.8|1247334|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448769 (Streptococcus phage Javan471, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gaatctcgaatgttatgagcagttctaaca CRISPR spacer gagtctcgaatgttatgagcagttctaaca Protospacer **.***************************
39. spacer 3.8|1247334|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448684 (Streptococcus phage Javan151, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gaatctcgaatgttatgagcagttctaaca CRISPR spacer gagtctcgaatgttatgagcagttctaaca Protospacer **.***************************
40. spacer 3.9|1247400|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ccgcagcaaaagttgtgcctttaatttcaa CRISPR spacer ccgcagcaaaagttgtgcctttaacttcaa Protospacer ************************.*****
41. spacer 3.9|1247400|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448849 (Streptococcus phage Javan128, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ccgcagcaaaagttgtgcctttaatttcaa CRISPR spacer ccgcagcaaaagttgtgcctttaacttcaa Protospacer ************************.*****
42. spacer 3.10|1247466|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448673 (Streptococcus phage Javan119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
aggtaggtgaatcccgctgccaaaaagact CRISPR spacer agataggtgaattccgctgccaaaaagact Protospacer **.*********.*****************
43. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer tagccattgaggtttatggctgagacaatc Protospacer *.************ ** ************
44. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448970 (Streptococcus phage Javan516, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer tagccattgaggtttatggctgagacaatc Protospacer *.************ ** ************
45. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448945 (Streptococcus phage Javan454, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer tagccattgaggtttatggctgagacaatc Protospacer *.************ ** ************
46. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448690 (Streptococcus phage Javan169, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taagcattgaggttaattgctgagataata Protospacer *.. *********************.***
47. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448854 (Streptococcus phage Javan146, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taagcattgaggttaattgctgagataata Protospacer *.. *********************.***
48. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448871 (Streptococcus phage Javan196, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
49. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448960 (Streptococcus phage Javan492, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
50. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
51. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448762 (Streptococcus phage Javan447, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
52. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448952 (Streptococcus phage Javan472, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
53. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448779 (Streptococcus phage Javan497, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
54. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448961 (Streptococcus phage Javan494, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
55. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448794 (Streptococcus phage Javan525, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
56. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448697 (Streptococcus phage Javan185, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
57. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448968 (Streptococcus phage Javan512, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
58. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448959 (Streptococcus phage Javan488, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
59. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448693 (Streptococcus phage Javan177, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
60. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448766 (Streptococcus phage Javan465, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
61. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
62. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448941 (Streptococcus phage Javan446, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
63. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448696 (Streptococcus phage Javan183, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
64. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448962 (Streptococcus phage Javan496, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
65. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448797 (Streptococcus phage Javan531, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
66. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448949 (Streptococcus phage Javan460, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
67. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448868 (Streptococcus phage Javan188, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
68. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448866 (Streptococcus phage Javan184, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
69. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448765 (Streptococcus phage Javan459, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
70. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448957 (Streptococcus phage Javan484, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
71. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448975 (Streptococcus phage Javan526, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
72. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448699 (Streptococcus phage Javan189, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
73. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_004589 (Streptococcus prophage 315.6, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
74. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
75. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448867 (Streptococcus phage Javan186, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taggagttgaggttaattgctgagataatc Protospacer *.* .*******************.****
76. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013462 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G18, isolate: uvMED-CGR-C29A-MedDCM-OCT-S33-C24) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatggaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer gcaggcacagaaatgactgaagcggagcgc Protospacer ** * *********************
77. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN393079 (Salmonella virus VSiA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatg-gaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer -atgtttagtgaaatgaccgaagcggagcgc Protospacer *** ** ********.***********
78. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to KC139518 (Salmonella phage FSL SP-031, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatg-gaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer -atgtttagtgaaatgaccgaagcggagcgc Protospacer *** ** ********.***********
79. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to KC139662 (Salmonella phage FSL SP-038 phage structural protein gene, partial cds; and head morphogenesis protein, hypothetical proteins, and coat protein genes, complete cds) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatg-gaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer -atgtttagtgaaatgaccgaagcggagcgc Protospacer *** ** ********.***********
80. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to KC139557 (Salmonella phage FSL SP-049 hypothetical proteins, coat protein, hypothetical protein, putative tail protein, and hypothetical proteins genes, complete cds) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatg-gaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer -atgtttagtgaaatgaccgaagcggagcgc Protospacer *** ** ********.***********
81. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF158037 (Salmonella phage St162, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatg-gaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer -atgtttagtgaaatgaccgaagcggagcgc Protospacer *** ** ********.***********
82. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH424444 (Salmonella virus VSiP, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatg-gaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer -atgtttagtgaaatgaccgaagcggagcgc Protospacer *** ** ********.***********
83. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN070121 (Salmonella phage Shemara, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatg-gaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer -atgtttagtgaaatgaccgaagcggagcgc Protospacer *** ** ********.***********
84. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK479295 (Salmonella phage SEE-1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatg-gaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer -atgtttagtgaaatgaccgaagcggagcgc Protospacer *** ** ********.***********
85. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF158036 (Salmonella phage St161, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatg-gaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer -atgtttagtgaaatgaccgaagcggagcgc Protospacer *** ** ********.***********
86. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT012729 (Salmonella phage vB_SenTO17, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatg-gaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer -atgtttagtgaaatgaccgaagcggagcgc Protospacer *** ** ********.***********
87. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK214385 (Salmonella phage TS6, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatg-gaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer -atgtttagtgaaatgaccgaagcggagcgc Protospacer *** ** ********.***********
88. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448682 (Streptococcus phage Javan143, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taagcgtttaggttaattgctgagataata Protospacer *.. *.** ****************.***
89. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448686 (Streptococcus phage Javan157, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taagcgtttaggttaattgctgagataata Protospacer *.. *.** ****************.***
90. spacer 3.5|1247136|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448678 (Streptococcus phage Javan135, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggccattgaggttaattgctgagacaatc CRISPR spacer taagcgtttaggttaattgctgagataata Protospacer *.. *.** ****************.***
91. spacer 3.9|1247400|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014235 (Moraxella osloensis strain CCUG 350 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ccgcagcaaaagttgtgcctttaatttcaa CRISPR spacer ccgcaccaaatgttgtgcctttatggccga Protospacer ***** **** ************ .*.*
92. spacer 3.1|1246873|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014802 (Rhodovulum sulfidophilum plasmid Plasmid2 DNA, complete genome, strain: DSM 2351) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tatggaagagaaatgactgaagcggagcga CRISPR spacer ggtggaagagaaatgacagaagctgtccct Protospacer .*************** ***** * *
93. spacer 3.9|1247400|30|NZ_LR594045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK911750 (Streptococcus phage P738, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcagcaaaagttgtgcctttaatttcaa CRISPR spacer ggacagcaaaaattgcgcctttaattattg Protospacer .********.***.********** . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
20432 : 30845
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LR594045|20432:30845|DBSCAN-SWA TATGGACAAACGTATTTTCGTTGAGAAGAAGGCTAATTTTCAGATTAAGGCTGAGTCGTTGGTAAAGGAACTGACGCATAATTTGCAGTTATCGACGTTGAAAACACTTCGTATGATTCAAGTTTATGATGTGTTTGGATTAACCGCTGCTTTGTTTCCACGTGCAGAGAAACACATCTTTTCTGAACAGGTTACCGATTGTATCTTGCCTGAGGAAACTATTAACACAGAGCTGACTAATGCCGCTTTTTTTGCAATTGAGAGTTTGCCAGGACAGTTTGATCAAAGAGCAGCATCTGCTCAAGAAGCTTTATTATTGTTAGGGGTTTCCAATGATGTGATGGTTAACACGGCTCAACTATATTTGGTCAATAAAGACATTTTAGAAACAGAGCTTGAAGCTATAAAACGTTATCTTCTCAATCCAGTTGATTCTCGATTTAAAGATATAACAAGAGGCATTGAGCGACATGACTTTTCTGAGTCGGACAAGGTTATCCCAACCTTGGATTTCTTTGAGACTTACACGTCAAATGAGTTTAAGATTTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCAATGGAGGTTGATGACCTTGTTTTCATTCAAGAGTACTTTAAATCAATTGGCCGTGTACCGACAGAAACAGAGTTAAGAGTTTTGGACACTTATTGGTCCGACCACTGTCGTCATACCACTTTTGAAACAGAATTAAAACATATTGATTTTTCCGCTTCTAAATTTCAAAAACAACTACAAGCGACTTATGATAAATATATCGCTATGCGTGAAGAATTGGGACGTTCTGATAAGCCACAGACGCTTATGGATATGGCGACAATTTTCGGTCGCTATGAGCGTGCGAATGGGCGTTTGGATGATATGGAAGTGTCTGATGAAATCAATGCTTGTTCCGTTGAGATTGACGTGGATGTTGATGGTGTTAAAGAGCCATGGCTCTTGATGTTTAAAAATGAGACACACAATCATCCAACAGAAATCGAACCTTTTGGTGGAGCAGCGACTTGTATTGGTGGAGCCATTCGTGATCCATTATCAGGGCGATCATACGTTTATCAAGCGATGCGCATTTCAGGTGCTGGAGACATTACAACACCTATTTCTGATACTCGCGCTGGAAAACTCCCTCAGCAAGTCATTTCAAAAACAGCAGCGCACGGCTATTCTTCATACGGAAACCAAATCGGTCTTGCTACAACTTATGTTAAGGAATACTTCCACCCAGGATTTGTCGCAAAACGTATGGAATTGGGAGCCGTTGTTGGTGCAGCACCTAAAGGAAATGTGATTCGTGAAAAACCAGAAGCTGGTGATGTTGTTATTCTTCTAGGTGGGAAAACAGGTCGTGATGGTATCGGTGGAGCAACGGGTTCCTCTAAAGTACAGACCGTTGAGTCTGTGGAAACGGCTGGTGCTGAAGTCCAAAAAGGGAATGCTATCGAAGAACGGAAAATTCAGCGTCTCTTCCGTAATGGTGAAGTAACACGCCTGATTAAGAAATCAAATGACTTTGGCGCAGGTGGTGTTTGTGTAGCTATTGGGGAATTGGCTGATGGTTTAGTAATTGATTTAAACAAAGTACCACTCAAATACCAAGGGTTAAATGGAACAGAGATTGCTATTTCAGAGTCCCAAGAGCGGATGGCGGTTGTCGTTCGTTCTAAAGATGCTGAGGAGTTTATTACTAAGTGTTCCAAAGAAAATATTAAGGCTGTTACTGTAGCAACGGTTACTGAAAAGCCAAATCTAGTCATGACTTGGAATGGCCAAACTATCGTTGACATTGAACGTTCTTTCCTAGATACCAATGGTGTTCGTGTCGTTGTTGATGCAAAGGTAGTTGACAAGGCTGTCAACTTGCCTGAAAGTCGCATAACATCGGTAGAAACGCTTGAAAAAGATACACTTACTGTGCTTTCAAATCTTAATCATGCTTCTCAGAAAGGTCTTCAAACCCTTTTTGATTCTTCTGTTGGTCGTTCAACAGTTAATCATCCCATCGGGGGTCGTTACCAACTTACCCCAAGCGAGGCTTCTGTCCAAAAACTACCTGTTCAAAATGGTGTCACCACAACAGCCTCAGTTATCGCTCAAGGGTACAATCCCTACATTGCTGAGTGGTCACCATATCATGGTGCAGCTTATGCTGTAATTGAGGCCACAGCACGATTGGTGGCATCTGGTGCTAACTGGTCTAAAGCACGTTTCTCTTATCAAGAGTATTTCGAGCGCATGGATAAACAGGCAGAGCGCTTTGGCCAACCCGTTTCAGCACTACTTGGTTCTATTGAAGCCCAAATTCAACTTGGTCTACCATCCATTGGTGGCAAGGATTCCATGTCTGGAACATTTGAGGAATTGACAGTACCACCAACCTTGGTTGCTTTTGGTGTTACAACTGCACACACACAAGACGTTTTATTTCCGGAATTTAAAGTCGCAGGTGAGACTATTTACTATCTTCCTGGTCAAACTATTTCTGAAGAGATTGATTTTGACCTCATAAAAGCCAATTTTAGTAACTTTGAAAGTATTCAAGCTAACCATACGATTAGTTCTGCATCAGCTATAAAATATGGGGGTATTATAGAGAGTTTGGCTCTAGCTAGTTTTGGTAATCATATTGGAGCATCTGTAACCTTGACAGAGCTTGACAATAGCTTGACAGGACAACTTGGTGGCTTTATATTTACTTCAGCTGAAGAAATCTCAGGTGTAACCAAAATTGGAAAAACACATGCGGACTTTACAGTTACTGTCAACGGAGTTATTCTTTCGGGTGCCAAGTTGCTGACAGCTTTTGAAGGCAAATTGGAAGATATTTATCCAACTACTTTTAGTCAAAGTCAAGATATAGAAGACGTTCCTGTTGTCGTTTCTGATGCAGTTATCACGACTCAAAAAATAATTGACAAACCATTGGTTTATATTCCGGTGTTTCCTGGTACAAACTCTGAATATGACTCAGCTAAGGCTTTTGAACAGGCGGGAGCAGAGGTTCATTTGGTCCCGTTTGTGACCTTGAATGAAGTGGCTATTGCACAGTCGGTTGACACAATGGTTGACAATATCAGTAAGGCCAATATTATCTTCTTTGCTGGTGGATTTTCAGCAGCGGATGAGCCAGATGGTTCTGCCAAATTCATCGTCAACATCCTACTCAATCAAAAGGTCCGCTCTGCTATTGATAATTTTATTGAAAAAGATGGACTTATCATAGGTATCTGTAATGGTTTTCAAGCTCTTGTTAAATCTGGACTCTTACCTTATGGCAATTTTGAAAATGTCAAGGAGAGTTCTCCAACTCTCTTCTACAATGATACTAACCAGCATGTGGCTAAGATGGTCGAGACGCGCATTGCAAATACTAATTCACCATGGCTTTCGGGTGTGGAAGTTGGCGATGTGCATGTGATTCCAGTTTCACATGGTGAAGGGAAGTTTGTTGTCTCTGCAGAGGAATTCGCAGAGTTGCGCGATAATGGTCAAATTTTTAGTCAATACGTAGATTTTGATAGTCATCCAAGTATGGATAGTCGCTACAATCCAAATGGATCGGTTAATGCTATCGAAGGAATTACCAGCAAAAATGGTCAAATTATTGGTAAGATGGGGCACTCAGAACGTTGGGAAGAAGGCCTTTTCCAAAATATTCCAGGGAATAAAGACCAAAAACTCTTTGAATCCGCAGTCCGTTATTTTACTGGTAAGTAAGGTTGCGAACAAGGAGAGCGCGATTCACGGGTGTCATTCTCAAATCATGGTGTTTTAAAAAAGAGCAATAGTGACTTTGGATTTAAAGAGCATTGCTAAAAGAAATTAGGAAAAACAAATGTACGAAGTAAAATCTCTTAATGAAGAATGTGGTGTCTTCGGAATATGGGGACATCCTCAAGCAGCTCAGGTAACCTATTTTGGGCTTCATAGTCTTCAGCATCGAGGTCAAGAAGGTGCCGGTATTATCTCAAATGATGAAGGTAACCTACATCAACACCGAGCCACTGGCCTTTTATCGGATGTTTTTAAAAATCAGAATGACTTGACTAAGTTGACAGGTCATGCAGCAATTGGGCATGTTCGTTATGCCACGGCAGGATCTGCTTCTATTAATAATATTCAACCCTTCTTGTACCAGTTTACAGATGCTCAATTTGGGTTATGTCACAATGGTAATTTAACCAATGCGATTTCCTTAAAGAAAGAACTAGAGAGAGAAGGAGCTATTTTCAATGCTTCGTCAGACACTGAAATTCTGATGCATTTGGTCCGCCGTAGCCACCAGTCTGACTTTATTGGAAAAGTTAAAGAAGCTCTTAATACGGTAAAAGGTGGTTTTGCCTACCTACTTATGACAGAAAAGCAATTAATTGCTGCCCTCGATCCAAATGGTTTTAGACCGCTGTCTATTGGTAAAATGAAAAATGGGGCTTGGGTAGTTTCCTCGGAAACCTGTGCTTTTGAAGTGATTGGAGCTGAATGGATTCGAGATGTGAAGCCGGGAGAATTGATTGTCATTGATGATTCGGGCATTACCTACCATCAGTATACGACGGATACTCAACTAGCCATTTGTTCCATGGAATATGTTTATTTTGCACGTCCAGATTCTACTATTTATGGTGTCAATGTTCATACGGCGCGTAAGGAGATGGGAAAAAGGCTAGCGCAGGAATTTCAACATGAAGCTGATATAGTGGTTGGAGTGCCCAACTCATCACTATCAGCGGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCTGGGTTGCCAAATGAAATGGGTTTGGTCAAAAATCAATACACCCAACGAACCTTCATTCAACCGACACAGGACTTGCGAGAACAGGGTGTTCGCATGAAGTTATCAGCAGTGTCAGGTGTGGTAAAAGGAAAACGTGTGGTAATGGTGGATGATTCTATTGTCAGAGGAACAACGTCACGCCGTATTGTTAGTTTGCTCCGTGAAGCGGGAGCCACTGAAGTTCATGTGGCAATTGGT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AGAATCTCCACGTACTTCGGCTACCCAGGCCACATGGCCATACGTTGCATGAGATTGGAAAGCGTTAGTATCAAACCACGCTACTGCCCCGACTTTAGGGGTCTTATTGACAGTATAACCTTGTTTTTTTGCAATATGTCCCCAAGTGCAGGCATTCCCATAGCCTTTGGGCAACTGAAAACCATTTGCTGAACTCAGACGGAAAGCGACAAATGATGTGCACTGACGAACATACATATTCCAGGAATCAATTCCAGATCCCTTTTTCCATTTGCTAGGATAATTATCCCCAAGGACAGCTGCATGAACAACTCCTGTATGTTCTGCATTCAAAGTGGATGCAACTGAAGATACAGCACCATTAACACTCAAAAGGATTGCTCCTGACACTAACAATTGATGAATTTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LR594045|20432:30845|20432_24158_+|WP_138083645.1|DBSCAN-SWA MDKRIFVEKKANFQIKAESLVKELTHNLQLSTLKTLRMIQVYDVFGLTAALFPRAEKHIFSEQVTDCILPEETINTELTNAAFFAIESLPGQFDQRAASAQEALLLLGVSNDVMVNTAQLYLVNKDILETELEAIKRYLLNPVDSRFKDITRGIERHDFSESDKVIPTLDFFETYTSNEFKIYKAEQGLAMEVDDLVFIQEYFKSIGRVPTETELRVLDTYWSDHCRHTTFETELKHIDFSASKFQKQLQATYDKYIAMREELGRSDKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIDVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPISDTRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVKEYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKGNVIREKPEAGDVVILLGGKTGRDGIGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRNGEVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLVIDLNKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMAVVVRSKDAEEFITKCSKENIKAVTVATVTEKPNLVMTWNGQTIVDIERSFLDTNGVRVVVDAKVVDKAVNLPESRITSVETLEKDTLTVLSNLNHASQKGLQTLFDSSVGRSTVNHPIGGRYQLTPSEASVQKLPVQNGVTTTASVIAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVASGANWSKARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEELTVPPTLVAFGVTTAHTQDVLFPEFKVAGETIYYLPGQTISEEIDFDLIKANFSNFESIQANHTISSASAIKYGGIIESLALASFGNHIGASVTLTELDNSLTGQLGGFIFTSAEEISGVTKIGKTHADFTVTVNGVILSGAKLLTAFEGKLEDIYPTTFSQSQDIEDVPVVVSDAVITTQKIIDKPLVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQAGAEVHLVPFVTLNEVAIAQSVDTMVDNISKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNQKVRSAIDNFIEKDGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFENVKESSPTLFYNDTNQHVAKMVETRIANTNSPWLSGVEVGDVHVIPVSHGEGKFVVSAEEFAELRDNGQIFSQYVDFDSHPSMDSRYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEEGLFQNIPGNKDQKLFESAVRYFTGK >NZ_LR594045|20432:30845|29717_30845_-|WP_003055557.1|DBSCAN-SWA MKKIHQLLVSGAILLSVNGAVSSVASTLNAEHTGVVHAAVLGDNYPSKWKKGSGIDSWNMYVRQCTSFVAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKKQGYTVNKTPKVGAVAWFDTNAFQSHATYGHVAWVAEVRGDSVVIEEYNYNAGQGPEKYHKRQIPKNHVSGYIHFKDLPSGEASKSQTKEQQVSKEAVKQGGTYHFTERTPVKAQAQLTSPDLAYYNPGQSVHYDQAMTVDGHEWISYLSFSGNRRYIPIKKIEQKTQQVSETTSPINIGDRVTFPGVFRVDRIVNNLLVSEELAGGGATSLNWIDPSPLDETDRKGVKAGNQILQAGEFFVIPGNYRVLKVDRPSNGIYVKIGSRGTWLTADKASKLP >NZ_LR594045|20432:30845|28093_29638_+|WP_003060925.1|DBSCAN-SWA MKRALISVSDKAGIVDFAKELKNLGWDIISTGGTKTALDAAGLETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDRDSHLQSARENNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDVTYDLAVENVDIGGPSMLRSAAKNHASVTVIVDPSDYPLVLAELTETGNTTYEMRQRLAAKVFRHTAAYDALIADYFTTQVGENKPEKLTLTYDLKQAMRYGENPQQAADFYQNAIPTEYAIASAKQLNGKELSFNNVRDADAAIRIIRDFKDQPTVVALKHMNPCGIGQADTIETAWDYCYEADPVSIFGGIVVLNREVDAMTAQKMHPVFLEIIIAPSYTEEALAILTHKKKNLRLLELPFGAQDASELEKEYTGVVGGMLVQNQDVVSESPADWQIVTERQPSEQEMTALEFAWKAIKYVKSNGILIANDHMTLGVGPGQTNRVASVRIAVEQSKKHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAASGIKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMVFTGVRHFRH >NZ_LR594045|20432:30845|27562_28075_+|WP_015057184.1|DBSCAN-SWA MLKSKKLTFILFYLYLFLLSWCILFKFETQLQFINCFQQERVVNWVPFTQPVIVNGDIVFAEMGFNLLFFIPFGVCLPILAPNWTYKKIVSLGLLLSLLYETLQFILAIGISDVTDLLFNTLGVCCGILLYQLINNLFNNRITVLINTIGILFVAIPTIGLLALVILGLK >NZ_LR594045|20432:30845|25880_26909_+|WP_003062570.1|DBSCAN-SWA MIEKNAYAQSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERLGVMGALGGFGGMFDLSQTAIKEPVLISGTDGVGTKLMLAIQYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNEPAKLEQVVAGVAEGCVQAGCALIGGETAEMPGMYGEEDYDLAGFTVGIAEKSQILDGSKVAEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGDEVLPELEGQKLKDVLLEPTRIYVKAVLPLIKEGLVNGIAHITGGGFTENIPRMFADDLAAEIDENKVPVLPIFKALEKYGQIKHEEMFDIFNMGIGLVLAVTPENVDRVKKLLNEPVYDIGHIVTKRDASVVISNG >NZ_LR594045|20432:30845|26901_27456_+|WP_003056410.1|DBSCAN-SWA MAKKIAVFASGNGSNFQVIAEQFKVELVFSDRRDAYVLERAQKLGVRAVTFELKEFETKAAYEKEIVQFLDKHDIDLICLAGYMKIVGPTLLDAYEGRMINIHPAYLPEFPGAHGISDAWQAGVDQSGVTVHWVDSGVDTGDIIQQVRVSRLASDTIEDFETRIHKAEYQLYPEVLDRLGVDRK >NZ_LR594045|20432:30845|24276_25728_+|WP_003056405.1|DBSCAN-SWA MYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIISNDEGNLHQHRATGLLSDVFKNQNDLTKLTGHAAIGHVRYATAGSASINNIQPFLYQFTDAQFGLCHNGNLTNAISLKKELEREGAIFNASSDTEILMHLVRRSHQSDFIGKVKEALNTVKGGFAYLLMTEKQLIAALDPNGFRPLSIGKMKNGAWVVSSETCAFEVIGAEWIRDVKPGELIVIDDSGITYHQYTTDTQLAICSMEYVYFARPDSTIYGVNVHTARKEMGKRLAQEFQHEADIVVGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQDLREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVSLLREAGATEVHVAIGSPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHTVEEVCDIIGADSLTYLSLDAMIDAIGLETDAPKGGLCVAYFDGEYPTPLYDYEDEYLRSLEEQTSFYIEKVK |
7 | Microbacterium_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
188656 : 251185
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LR594045|188656:251185|DBSCAN-SWA 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60 | unidentified_phage(18.18%) | tRNA,transposase,integrase,protease | attL 237924:237939|attR 257464:257479 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
386409 : 395974
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LR594045|386409:395974|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LR594045|386409:395974|390197_390998_+|WP_003058683.1|DBSCAN-SWA MISAIGIRYGETELVKYAQTDQEFPKGTLLVVKDDKGSHLAKVCQVKKAFSESSLPKGLPTVVRLATAMDKKAFEDNAKFAAASKAEVVALIAKNGLDMKLIDIVFPLDRHYVLITFSAEERVDFRQLLKDLAAYFKTRIELHQINSREEAKIYGGLGPCGRPLCCSSFLGEFPAVSIKMLKNQGLSLNSGKSTGYCGRLLCCLQYEESFYQESKKKFPDYGTIVETSDGPATVAAIDIFTDTVKVRLKDQLTLVTYALEEVKVSE >NZ_LR594045|386409:395974|389328_390201_+|WP_012766618.1|DBSCAN-SWA MDLAQKAPKVYQAFQDILKKDRLNHAYLFSGDFANAEMALFLAKVIFCEQKKEQTPCGHCRSCQLIEQGDFADVTVLEPTGQVIKTDVVKEMMANFSQTGYEGKRQVFIIKDCEKMHVNAANSLLKYIEEPQGQAYMFLLTNDDNKVLPTIKSRTQVFQFPKNEAYLFQLAQERGLLRSQADLVAKLAKNVDQLEDLAQNSHFLEVMAQTERFVSIWLKDQLQAYLALNHLVLLATEKEEQELILTLLTLLLAREQSQTPFKQLEAVYQARLMWQSNVNFQNTLEYMVMS >NZ_LR594045|386409:395974|390990_391314_+|WP_003058686.1|DBSCAN-SWA MNKKELFDAFDGFSQNLMVTLAEIEAMKKQVQSLVEENTILRLENTKLRERLSQLEHETVAKNPSKQGKDHLEGIYEEGFHICNFFYGQRRENDEECMFCRELLDRK >NZ_LR594045|386409:395974|392648_393278_-|WP_138083717.1|DBSCAN-SWA MIKEFCAENLTLLPTLDAGQVTRVELCDNLAVGGTTPSYGVIKEACQLLHDKNISVATMIRPRGDDFVYNDLELKAMEEDILKAIEAGSDALVLGLLTSENQLDTDAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDRIPTDHQHQALDQLIDYGFVRVLTHGSPEATPITDNVEQLKDLVTYANKRIEIMIGGGVTAENCQSLSQLTGTAIVHGTKII >NZ_LR594045|386409:395974|394511_395063_+|WP_003061315.1|DBSCAN-SWA MEIRLAFPNEVAQVMTVIEDAKAVIAAYGSDQWQNGYPNEEVMIDDILKGHAYVALNDEGTIVAYAAAIYGNEEAYNAIYDGQWRTPNQDYVTFHRIAVLKDHQGQGVAQTFLQGLIERFDQKDFRCDTHEKNNVMQHLLTKLGYVYCGKVPLDGVRLAYQKIKESHEQADYQEIDEDSRYGL >NZ_LR594045|386409:395974|387928_388591_+|WP_003059946.1|DBSCAN-SWA MSVKDYMTKEVISISPEESVAHAADLMRDKGLRRLPVIEKGQLVGLVTEGTMADASPSKATSLSIYEMNYLLNKTKIRDIMIRQVVTVEPDASLEDAIYEMMTYKVGVLPVVQNNQVVGIITDRDVFKAFLEVSGYGVEGIRVVLLADNAVGVLAKIADCLSQENLNIRRTVVANRSNGKTVIEMQLDGTTASQWLSERLAAAGITVESVLKTLAKPDLS >NZ_LR594045|386409:395974|395617_395974_+|WP_003060040.1|DBSCAN-SWA MITIYQYPKCSTCQRAMAELKQLVSDFEVIDIKANPPKAQDLKHWMETSGYTIKNFFNTSGNSYRELGLKDKIDQLSLDKAAELLATDGMLIKRPILIKDGNVLQVGYRKPYQELNLS >NZ_LR594045|386409:395974|388677_389313_+|WP_012766617.1|DBSCAN-SWA MITGKLITVEGPDGAGKTTVLEQVVPLLKERLSQEIVTTREPGGVAISEHIRELILDVNHTTMDPKTELLLYIAARRQHLVEKVLPALEAGQLVFIDRFIDSSVAYQGAGRGLSKTDIQWLNRFATDGLEPDLTLYFDVPSEIGLARIAANKNREVNRLDLEAVDMHQRVREGYLALAQEQPNRIVTIDASKPLEDVVDVALAHILALMEA >NZ_LR594045|386409:395974|387179_387884_+|WP_171841621.1|DBSCAN-SWA MLSVKQLSVNYGAIEAVKDVSFEVHEGEVVTLIGANGAGKTSILRTISGLVKPKSGSISFLGQDLLKQPARKIVAAGLSQVPEGRHVFAGLTVMENLEMGAFLSRNREQNQKNLRLIFDRFPRLEERKHQDAATLSGGEQQMLAMGRALMSQPKLLLLDEPSMGLAPLFIKEIFDIIQAIQRQGTTVLLIEQNANKALAIANRAYVLETGQLVLSGTGQELLTSEAVKKAYLGG >NZ_LR594045|386409:395974|391319_392183_+|WP_003058668.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKDKKTSGTLYLVPTPIGNLQDMTFRAVATLKEVDFICAEDTRNTGLLLKYFDIATKQISFHEHNAYEKIPDLIDLLISGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIDNDIAVVALPGASAGITALIASGLAPQPHIFYGFLPRKAGQQKSFFESKSLYPETQIFYESPYRVKDTLANMLTCYGDRQVVLVRELTKLFEEYQRGSISEILSYLEETPLKGECLLIVSGSQVDSEVELTAEVDLVSLVQKEIQAGAKPNQAIKTVAKAYQVNRQELYQQFHDL >NZ_LR594045|386409:395974|386409_387174_+|WP_003062488.1|DBSCAN-SWA MALLEVKQLSKHFGGLTAVGDVTMALEMGELVGLIGPNGAGKTTLFNLLTGVYEPSEGTIVLNGQLLNGKSPDKIASLGLSRTFQNIRLFKNMTVLENVLIGLANQGKSHFWSSLLRLPKFYQTEAALKEEALSLLARFQLEGEAETLAKNLPYGQQRRLEIVRALATKPKILFLDEPAAGMNPQETAELTALIRQLKTDFGITIILIEHDMSLVMEVTERIYVLEYGRLIAHGSPQDIKNNPRVIEAYLGGDL >NZ_LR594045|386409:395974|393394_394486_+|WP_003061119.1|DBSCAN-SWA MSQYYFSAGPAVLPRSVLKQAQASLLDIDGRGTNILELSHRSQRFEDIIQTAEELLRELMAIPDNYRVLFLQGGASTQFSMLPLNVARGKTAYYQVAGHWGKKAYLEALTLAREIEVKPILLASSEADAFEYIPTFDPKILDAEAAYVHITTNNTIEGTALYDLPQTNGIPLVADMSSNILTYPYQVEDFAMIYASAQKNMGPAGVTVVIIDEDFLNQEPTLSSMWDYRVQAEAHSLYNTPPTFSIYVLSLVLDWLKGMGGVAKMAKRNQEKAQLLYDYLDQSRFYHNPVRYADQRSMVNVPFTCPNPALDALFIQEAEARGLYGLQGHSSVGGMRASLYNAFPKEGVLALIEMMAAFEAKYQ >NZ_LR594045|386409:395974|392209_392602_+|WP_003062448.1|DBSCAN-SWA MTEDQTAVLILGTYGIILAIFLLSALLCLIANWRLFKRAGYKGWYSLIPFYAGFVKHKITFGEDNKWFYFIGWVIAIYYYYVHFCYVRAFGGSKGLAVFGLFFPGIATLIIAFGKAYTAEEYHPVPHLLN >NZ_LR594045|386409:395974|395123_395621_+|WP_003062357.1|DBSCAN-SWA MTLTESYYDSPLGKISLVATDHALLGAWFLGQAYFQAGLDRLPQRGTNAILQAAASWLDTYFEGNPTAISINLVPKGTPFQQNVWETLRQIPYGETITYGQLATQVACQSAQAVGAAIGRNPLSLFIPCHRVIAADGQLRGYAGGLDKKAWLLKHERSLITKEKK |
14 | Streptococcus_phage(81.82%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
572378 : 584583
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LR594045|572378:584583|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LR594045|572378:584583|572895_573477_+|WP_065355268.1|DBSCAN-SWA MFILELCQDGMSTELGLFDTIEEGRKFVSQLKGYKFEEIDGFEYETIKLDSISEYMELEINGNIVPLTKFMFTEDGDVEVYWKEIPNLSKKGTGIVEGATRVDAYTVANSDLREHIEARENNYLEVKKNLEKEGYQVERAYFGSEDGEAILFRKKDSEDWHFLTHMDPEFTEEFDLDECLEMVEEDISFISYS >NZ_LR594045|572378:584583|574411_575278_+|WP_014612130.1|DBSCAN-SWA MREIYSKVTRIAKKELYQFMKDYRVSTLNYHYSYYFEDCLRKHKIQLLEHHFSNRHIEGLTLIDVDGISFSYEKENPLVKQNFTKCHELGHFILGHSGSIFTEMKNASDSLQETEANLFSAFILMPDVVLLSKIYFRRDSFQMLLKDLTVSAEALEYRLRDLFRYHLSLSNQEVNNAINSYRRNDNSMILNYFELIKDQIVEEFKSIKANELILVLNYLKNNSFVASNKYFRLLENNFRKEIEEKASNIKTWVEYDFGQTIAYAWREDLLNSKQAKSRAKTILLLEKR >NZ_LR594045|572378:584583|575280_575964_+|WP_003058897.1|DBSCAN-SWA MYQPEKLKLKRTEHGFSQLSIAERIGVSKQAYSKWEKGISQPTNENLIKLENLFKVPAGYFNEEEILNLYHQLNSPNQSKAITYVRSLVSSQNKVSHLIQETLYEYKVFEKMSAGIGSSIYDDGEYDTVYFNEELAHDFASWIDGDSMEPTYHNHDVALIRESGFDYDGAIYAVVWNGQTYIKKVYRDEDGLRLVSINKDYADKFAPYDENPRIVGKIVGSFTPMEA >NZ_LR594045|572378:584583|581634_584583_-|WP_138083754.1|DBSCAN-SWA MDNKYIILANLRKLKADFENTLSTSRSSVSEEKIRSGFLNKLFELFGWNLSDITEVIEEKHLEGEAKKNLISISSGHKKPDYIFCENGVYKMVCDAKNITEDFKNSKSNAFQIRSYSWSMNLPLAMMSNFHEFGVYDTTFIPDQNQDPQFKAIFFTIDDLIQDFDKYSTFFYKDKIQKHDWDISDGLDIKLHNEKSKTLDIAFFEILENFRVRLGQAILENIPKINQDSLNYYTQVIINRVLFIRFLEDLNIETNGTLQSYLNTQNFWESFVRKTVSEFKLKYDGALFDIDLPNLALTNDVFVDFVSSITGNSPYRFDVIKPSFIAEIYDQFLGRQLFVYDNKLQISNKPLSPDGAVPTPYEMSSYICKQTIQLDHISNINDLLKLKILDPCVGSGSFLLATLELLVEKYKTITNSERIALSDVKAIIKNCLYGVDIDPTALEVLKMTLSLKIVMSNFILPEPFSKILSAIDNNFKYGNTIVQEDALMLASEEFEQFPTKFEELFPIIFKEGGFDYVVTNPPYVEPKHFKRKWPLTHRYLKNKYNLSDKVDISMFFLLRINDLLKSDGKYGLVIQKRFFNTEYGRKVRNYLTTQGVLHTIHDFESNYLFKDKTTYIACLFGGSSKTSKKLELSQIRYAKHEGKLNSTRTNLNEVIMTETRSALIESSLFINRNWSYESLTFTHFLEQKLLHSPDLVVLDDIERLNIGVGPQVLDSRFYFLHDVVKMSDGTIQAFNRRNEKVIIEQDLVRPVLRNDFPEEYNVVRETKDYLIFPYNEDGTLISLLDIQKSFPNGYDYLSYMNQHSTTEKVDNEDEFYRYTRETKLNSFQRPKIFIPMTIKNVKASFIEKNMFGDNSNMNSILDKYDDIIFLKAMCIVFNSKLFNDLAIILSGEASNGYRKLNKQFLKLVPVPILSTDSQNILVNFYEEISKLRNYISNSSGAKQTAYKNKLLAIINKANSKVKSLYNFSDAEIQSIEQLSERK >NZ_LR594045|572378:584583|579854_581480_-|WP_138084108.1|DBSCAN-SWA MAYQLDSIYSDNDRKKNGIYFTPKKIANLMGCYSLHIKNTIDIPNIFDPAIGSGIFLLTIAKELVKSSNVDIIKIIENHLFGVDIVKENVILSKILLGTLSYELKRSLPKKFSLVQLDSLSLTEKSVKSLFSIEHFDIVISNPPYVSGEQISDDTKIYFKHYPNTVYGNPDLYIPFFELGLKLLKPSGIGAFITPNSYFRSQNGKKLRAYLRDKTEVIKLINFNSDLVFDDISHYSAINFFIKKSNDQQQNRMYFLDNYHNNITVKDFNWMQMNPIDSWHTLNLIEKSIITKLENLSETTLNNLKFQNGVATQRNNIFMFKVLHEDEDFYYFENDSKKFQVEKYITRPFVLPNKSNRDDSLRIIFPYQYENNSDIVPITPEEMLNNYPFCLEYLKTFKDELNMRKSDKNMKYWYLYGRSQGLKQYGPRLYIPYMANRVTTSLSTSNDEVFAAGYAIFSSNLLLLSTISKILESKLFSFYISKVSKPYSSGYFSTAKNMIKNLSIPDIKEISNLDVKKLTDDKLYELYNLTQEEVSYIERSF >NZ_LR594045|572378:584583|575965_577381_+|WP_138083751.1|DBSCAN-SWA MGYFDYSREPKSDIAFVDMKSFYASVECVERGLHPLKTSLCVMSRADNSNGLILASSPKFKEVFGKSNVGRSYDLPFDIHTRKFSYYNAERQGLPTTPEYVRFIEEWAKNTFIVPPRMDLYIEKNIEIQHIFQDYASPADILPYSIDEGFIDLTSSLNYFISDKNISRKEKLDIISASIQKDIFRKTGIYSTIGMSNANPLLAKLALDNEAKKTVTMRSNWSYEDVETKVWAIPNMTDFWGIGRRIEKRLNKLGIFSIRELANANSDILKKEFGVIGVDLFFHANGIDESNVHKPYKAKSKGLGNSQVLPRDYDRQAEIELVLREMAEQVAIRLRRAHKKTTNVSIFVGYSRKEEKRPIQVQMKVEPTNNTKVLINHVLTLFHKKYESGSVRSVGVNYSGFVDESFGLISLFDDIEKIEKEERLQSAIDSIRNQFGFTTLQKANSLQEASRSIARSKLVGGHSAGGLDGLK >NZ_LR594045|572378:584583|577377_577755_+|WP_046177514.1|DBSCAN-SWA MIDRTYLPFQSAREHQDRGMLKWMGFFLSEHTTSLNDDKTKEDVSSELTLINKLKLISQLYAGQLAGLFTIKVNNRRRFKIGTITEISPKEITIKTTDGYQLLQVADILNINLWEGDLFDKERRL >NZ_LR594045|572378:584583|572378_572720_+|WP_014612128.1|DBSCAN-SWA MKFTERLKLLRTQAKLTQSQIAKKLGVSQQAYGDWERGVKKPTQDNLVKLSNIFNVSVDSLLVGEENDVDLSEVEILFRNTSKGMTKEEKLIFKNELMEFMKERKKILKSDCD >NZ_LR594045|572378:584583|577732_577942_+|WP_138083752.1|DBSCAN-SWA MIKKDVYENKLQIDYFSDSYYQFEEDFYKYSTLDIPLPFLTDAILREMAMTHKRYFKLNKENAKDCRVK >NZ_LR594045|572378:584583|573725_574331_+|WP_014612129.1|DBSCAN-SWA MDLGTNEKQLTARCELDHVNSQAQYPLYQSSIWNLVPVCHDCNRSKLDQVISFNSWTIDIKNEPFQIELSFTPEMEVGTYLKIPKYKNISELKINISSQDDLGNSDLVTLRLNELYMSRLECKLLDFILGHIFDGIRSSTKFKLEELKKNTSRDTGKEVFSYYFAISIDIFESKHYSKMLYSKLISEFIRQYISVDYFLDK >NZ_LR594045|572378:584583|577966_579315_-|WP_138083753.1|transposase|DBSCAN-SWA MKLSYEDKIEIYRLRQSGWTWPKISQTFNMSKYNLQYMVRLIDIHGLESVCKRKNRYYSPELKQEIINEVLMKGRSQLEVSLDYGLPNKGMLPNWIAQYKKNGYTILEKSRGRPVKMGRKPKKKLEEMTELERLQYENEYLRAENAVPKKVERTPLEGRSKAQRATEIIQGLINVFDLRILLNILKLSRSTYYYQVKRLTQGDKNKEFKEAIQDIYSENKGRYGYRRIHLELKNRGYKVNHKKVQRLMTELGLKARIRAKRRYNSYKGEVGKKADNLIKRQFKAAQPLKKCYTDVTEFSIPASDQKLYLSPVLDGFNSEIIAYHLSTSPNLQQLKTMLSEAFPEQTYQGTILHSDQGWQYQHTYYHHFLEEHGMRPSMSRKGNSLDNGMMESFFGTLKTEMFYGFEKEFTSLETLKTAISEYINYYNTKRIKLTLKGLSPVQYRTQSLT |
11 | Streptococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
767835 : 854730
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LR594045|767835:854730|DBSCAN-SWA 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107 | Streptococcus_phage(51.56%) | capsid,terminase,portal,tRNA,transposase,tail,holin,integrase,head,protease | attL 776803:776817|attR 804174:804188 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
936880 : 952635
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LR594045|936880:952635|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LR594045|936880:952635|942734_942941_+|WP_000922387.1|DBSCAN-SWA MLKYINHAGRLSILKFKIVMEQFEVVDTYECFYLMRFDENGQPDWSDPTIVQEGSVESEVTDEGTVNS >NZ_LR594045|936880:952635|942918_943314_+|WP_000661395.1|holin|DBSCAN-SWA MKELLTLNKILFSMIGGLIGSLFGELDGILYALLVFIIIDYLTGIFAAVVEKQLSSSIGFRGIFKKIAILFLVSLGHLIDTAIIKQGGTIRTMVIFFYLSNEGLSILENTVRIGLPISEKLQAILKQINER >NZ_LR594045|936880:952635|945253_946087_+|WP_000956790.1|DBSCAN-SWA MLTLLASVAQEESQNLSENIRWRIQKKFEKGIPHTPQDMYGYRWDGEQYQIEPNEAKVIRKVFKWYLDGDSVQQIVDKLNQEQVLTRLSNPFTVASIREFFKQEAYFGRLVLQKTYREAFSRNPKRNKGQRNKYIIENAHEPIVTKEYFDLVLHEKERRYQLMSQESHLNKGIFRDKISCSECGCLMIVKVDSKQVNKTVRYYCRTRNRFGASSCSCRTLGEKRLLASFKSKLDIIPDKEWVENNIKHIDYDFGQRIIWVIPVKGRKYPIEIREGRY >NZ_LR594045|936880:952635|946086_947649_+|WP_138083840.1|DBSCAN-SWA 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16 | Streptococcus_phage(90.91%) | holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1917607 : 1924191
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LR594045|1917607:1924191|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LR594045|1917607:1924191|1917998_1918373_+|WP_003056692.1|DBSCAN-SWA MSAKKTFFASNLKYLRLKNNMEQLELANLLGRKSSSSISEWEKGKYTPKSGLLSDIAAIFDVSLTALMEEDLTLENKGVSYQLPQRELAMISEQLSENNYTKWVDFAQILLEQQAKEDRELDNH >NZ_LR594045|1917607:1924191|1919645_1920836_-|WP_002983018.1|integrase|DBSCAN-SWA MSGKRRDSKNRVLRSGESQRKDGRYAYKYTDTFGKPQFVYAWKLVPTDKTPKGKREDKSLREKVKEIQKDLDDGIDPVGKKMTVCQLYEKHIRNHANVRHGTKQGRKQLMRILEKDTIGACSIENVKMSDAKEWALRMKEKGYSFITISNHKRSLKAAFYTAIQDDCIRKNPFDFHINTVIEDDTEPKIPLSPMQEESLLSFVKSDKVYYKYYDELIILLGTGLRISEFCGLTDSDIDFENRTINVDHQLQYSGKKSYRIETPKTENGIRKIPMSDRVLEALQRVMQNRRKSDFTVDGYTGFLFLTRNGTPQNYINYDIMFRKLVEKYNKKHEEVLPVVTTPHTLRHTFCTNMANAGMNPKALQYLMGHANITMTLNYYAHATFDSAQAEFFRLVA >NZ_LR594045|1917607:1924191|1917607_1917829_-|WP_003060222.1|DBSCAN-SWA MTKSTLKELRTTKKMTQQELSSLTGISVRTLARYEKDIHKLRRAKYEKLKSIAGALAVSVDDIFLGVDSDFMN >NZ_LR594045|1917607:1924191|1921775_1922219_-|WP_009220377.1|DBSCAN-SWA MNEPERTEWQIRCAFNGFCKRTLKNESINAHRDLKKRQAHEINFSDLTPKEENQLYTCEDFFTEDKEEQTFFAGGKELSANLIADAIHSLPEEKRRAVLLYYFFDMSDAEIAALYQIPRSTVQYRRTSSFELLKRYLEEHAYDYPGW >NZ_LR594045|1917607:1924191|1921543_1921795_-|WP_002983011.1|DBSCAN-SWA MTTQAGKTTDDERGLLPYPVIIAATKGEPQAMNIICQHYAGYIAHLSMRKLRDERGNTYYGIDEDMRDRLRSKLMQAVLIFKI >NZ_LR594045|1917607:1924191|1918935_1919472_-|WP_002983021.1|DBSCAN-SWA MSIKYKIIADIDLINNIDSLKQLLNSSNPNCYSEIAPKHKKFIEKFQKGTNNQVKTQEDIRNEINQIYNADKFMSPQSVEQIKSILREINSLKLLKTGGKSIIPQGECINLFNHINEFLKENNIFILECGEIERFVPDVLGHGNKWVENTFMKYDKIEAEVYHEARNFMKMILNHNSK >NZ_LR594045|1917607:1924191|1920911_1921115_-|WP_002983016.1|DBSCAN-SWA MNQTDVPIWEKYTLTIEEAAKYFRIGENKLRKLAEENPTANWVILNGNRIQIKRRQFEKMIDTVDTI >NZ_LR594045|1917607:1924191|1922724_1924191_-|WP_002983007.1|DBSCAN-SWA MIKVEHVSFTYENAENGAAILDNSAQISKGEIVLLCGESGSGKTTFSRLINGLIPNYYEGTLVGKVQVNTMIPKELELHELAPYIGSVFQNPKAQFYTLVTDTEIVFSCENMGMERKDILMRFDDTVTAMRLEPLLGRNLFTLSGGEKQKIACASVHALLPDILVLDEPTSNLDIGTIHELENILSLWKAQGKTVIVAEHRLAWLRRLADRVLYFRKGKIEQEFTGEIFFRKPLPSLHEMGLRGISHFVPLRVSSKRTDEGIELRDFSFTVGKENLLNIDYLKIPKGSVVAVLGNNGAGKTTLARCLCGLERKIKGTFSFLGREYKSKQRLKLCYMVMQDVNHQLFAESVFDEITLGAKNISEEERKNYTENILSMLDLLSYKDSHPMSLSGGQKQRVAIAGAIATHKEIIVYDEPTSGLDYRHMKEVAACIQKLSDMGKTQFIITHDPELVAYCCDYMMFMDNGIVSHFGEWTDENIAFISRYFENE |
8 | Streptococcus_phage(50.0%) | integrase | attL 1918562:1918580|attR 1932310:1932328 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2002473 : 2072424
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LR594045|2002473:2072424|DBSCAN-SWA 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59 | Bacillus_phage(30.0%) | holin,tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2141129 : 2152629
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LR594045|2141129:2152629|DBSCAN-SWA 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TACGTAAAGCTGACTTTACGCCATCTGCAACCACCACTTACAGTTTAGCTGATGCTGAAAGCTGGGAAATTATCAAACTTATCCAAGATTTCCCACGCATTATCAAGCGAACATCAGATAACTTTGAGCCTTCTATTATGGCTAAATTTGCTATTAACTTAGCCCAAAGCTTTAACAAATATTATGCTCACACTCGCATCCTCGATGACAACTCAGAACGTGATAGTCGCTTAGCCCTCTGCTATGCTACTGCCACTGTGCTTAAAGAAGCACTTCGTTTACTCGGTGTAGAAGCACCAAATGAAATGTAACCTAAACAGCATATTATTAGCCCTCTCCACAATAACATGGAGAGGGCTTTTGGTTTTGTCAAAAAATATTCAAAAGTGGTCTTTATCAATCTCCTCTAACTGCCCGTCCCTAATAACATAACAGCGATTGACCACAGATGATACAAACTGCTGATCATGTGACACTAGAACAAAAGGATAAGGGTACTGTTTTAAACACCTTTCCAGCGCTTCCATGGCAACAAGGTCCAAATAGTTCGTTGGTTCATCCAGAATCAGCAATTGGTGATCACCAAGCATAGCACCTACTAAAGCCAACCGAACCCTTTCACCTCCAGATAGACTAGCTATCTTTTGGTGTGCTTTTTGATAAGGAATCCCCATCATAGCTAGATAATTGAGAATAAGTCTGCTGTCTTGATTAGACTGTTCTTGTACAAACTCAAAAGCAGTTAATTGACTATCTAATTGCACCTGATCTTGCTTAAAAAAAGTTAGTTTAAGGTGGTCACTATAAAATCCAGGTAAGTCCTGATTGGCCAGAGACTCTAAAAACGTTGACTTCCCAGCCTTATTTCTACCAATAATAGCTAATTTACTGTCAGCTCTAATAGCTATGTCTGGATATGTAAACAAAATCTGCTTATTCCGAGATAAGTTCCCCTCTCTTAGATGGATAAGGGTGTGAGGGATTTTCTTCTCCTGAGGATTGAATTTCAATTTAGCCCAAATCTCTTTGCTTTCCTGTCTATTAGGTGTAAGTTTGGCTAAACGATTTTCCATCGCCTTTGCTGACTTGGCTATCCGCTTAGCCTGAGAATCATAACTACCTGCAAAAGCATTCACTTTCCAATCTGAACGTGAGATGTTTTTTTTAGGCTTTACCATTTGGTTGGCACGTTCTTTTTTCGCTTGAATTTGCTTTGTTAGCTTAGTCACCTGACGCTGATAGTTAGCCTTTTCAATAGCTTGTTTTTGCATTTCTAGTTCTTTGACTTGTCTATAGGCGTCATAATTTCCTTGATAAACCTTTATATCCTGTTTTTCAATGGCCCATATTTGTTGAGCTATCTGGTTCATCAAATAGCGGTCATGACTTACCACTAAAAGAGTACCACGATACCGTTTGAGTTGATGAATCAACCACTTCTGATTAGCCTTATCTAAGTGTGAACTAGGTTCATCCAGAATGAGCAAAGAAGCATTCTTTTGAAAAAGTACCTTTAATGAAGCCATCACCTTCTCTCCACCAGATTGGTTTTGAGCTGCTTGTAGTTGAGGCAAGTAAGCAACGTCACTATGTAAACTAAGTTGACCCTGATAAGATCGCCTTTCTCCTATAAGAGTTTGCAAAAAGCTCGTTTTCCCAGAACCATTGTCACCTATCAGAAAAACCTTATCCCCTTGATGAAGGTGTAATTGGTTAATCGATAAGAGAAGATTTCCTCCTACTTCTAATTGGTAATGAGACAATGTGAGTATTTCCATCGTGTTATCCTTTCTCTGACAAGAAAGGTTTGAAAAAGTGCACACAAAAAGCCCTGATTTTCAAACCTCAAAGTACACACTACTTCCTTGATTCACAATCATTCAAAGATTAGTGTATGACGATGAGTTAGTTGTTAATCATGGCTTTTTTCAACCTCTTATTTCATTTGTTGCTTTTATTTTAGCAGCTTAGGTTTCTTCTGTAAAGCCTTTTCAATAGGCTTATCAAAATTTTTACGACGAATTTTAAAATCTGAACTAATCACTTCATCCACATCAAGAATGGAGATAAAGGCATCTGGGTCTAATTCTGATAGTATCCGTTTCACTTCTCTGACTTCTGTTGGATTAAGGGTCACATACATGATATTGTAATCATTCCCTGAATAAGCCCCCTGACCCTTCAAGTAAGTCACCCCACGGTTAATTTCATTTAAAATAGCTTGAGCGGCAGCTTCAGAATGCTTGGTAATGATAATCATACCACGGATAGTATACCCACCATTTTGGACAACACTAATCATTTGGCTAAAGACAAAACTAGCCACTAGGGTGTAAAGCATATGTTTTAAGTCCACATAGGTTAAGGAAGCCGTCAAAACAAGGGCATCAACTAGCAGTAAAGTCTGACCTAATTTAGCTCCAAATTTTTCTTCAGCAATCCGTCCGATAATATCTGTTCCTCCCGTCGTTGCACCATAGCGGAAAACCAGGCCGCTGCCAATCCCCGAAAAGAGTCCTGCTACGACAGCTACTAACATCATATCATTTTCTAGACCCAATTCCATGGGAACCTTTTGCCACATCCAGATAAACACAGACATCAGAACTGTTCCGTAAATAGTCAATGCTAAGGAACGCTTCCCAAAAATTTTTGCCCCTAAAATAAAAAGCGGGAGGTTAAACAAAAGAGAAGAGTAAGCGGGGTTAATCCCAAAATGTGCATGTAGAATTAGGGTTATCCCTGCCACACCACCTTCAGCTAAGGCATTGGCCATATTAAAGTTAACAAAGCCAAAAGTGTAGATGGCCACTCCTAGGGCTATTAACAACAGTTCTATTAGTTTAGTCAGTTTATCGTGACGTGTCATTCATTATCCTCACTATTCGTTAAAATGGGTTACCGTTTGGAAACATTGCTTCGACTTTTCTTTTTATGGTATTTGCTCTTAGTGGCGACAAACTCTGGGCTATTCACTTCATCCACATCAAAATAAGAGACAAATGCATCCGGATCGATCTGAGCTAGAAAGGCTTTTAACTCCCTAATATCTGTTCGCCCCAAAGCCACATAAATGACTTTTTTATCACGACCAGAGTAGGCCCCTTCACCATGTAAGTAAGTAACCCCCCTCCCTAACTCCTCCATAATGAACCGGGCAATTGTCTCCGATTGATCTGAAATAATAAGGGTGCCACGTGCCGTATAACCGCCTTGTTGTACCAGACGAACAATCTGACCATACATAAAGCTAGCAATTAAAGCATACATCATTTGAGGTAATGAAATATAGGTTAAAGAAACAATCATGACAAAAATATCAATCCCCAAAAGGGCTTGATTCAGTTGTAAACCTAATTTGTCTTCAAATAATTTGGCAATAATATCTGCTCCACCGATGGTTCCCCCATTTCGAAAGACAAGTCCTCCACCAAGACCTCCTATAATCCCAGCCATCAACGAAACCACTAAATTATCATGATCCAAATCAACTACCAAAGGAAGTTGCTGAAAGACCCAAACAAAAAAGTAAAGCGAAAAAATGCCTGTCACTGTGTAAACCATAGCTCTTTTTCCAAAAAGTTTGGCGCCTAGTAGCACTAGAGGCAAATTTATCAGATATCCTGTCAAGGAGGGGTCGATATCAAACAGGGCCTTCCCAACTAACGTTAGACCAGCTAGTCCATTAGCCGCAATCCGATTAGCCATGTAAAAATAAACAAAGGCAAATGCATAGATAGCTGCTCCTAAAATAATAAAGCAAAAATTCTTTAGCTGTAACCGTTGATCAACTGTCATAGCACCTCCTGTGTTTTTTATTAATCTTCTTCAACAAATCGACCGATAATCCTCACGTTTTCAGCAACTGAAACAAAGGCTTGAGGGTCTGCTTTTAACATCAACCATTTAAATTCTGTGTATTCTTCTCGTGTCAAAATGGTAATTAAGACGGCTTTTTGTTCATGCTTATAGGTACCCTCTGCATCATTAATACTCGTCACGCCACGATGCAATCGTTTGTGAATCATTTGAATCACACGCTCTGGATGACTTGTAATAATGGTTGCCTGCATTTTCTTTTGCTTGGTGAAAATGGCATCCGTAACACGGCTCGATACAAAGATAGAGACCATAGAATAGAGAGCGTACTGCCAACCAAACAAGATGCCCGCAAAGGTCAAAATGGCACCATTCACCATCAATGACAAACTTCCCACATCTTTTCCAGTTCGCTTTCTAAGGGTCAAACTAATAATATCAGTTCCACCACTTGAAATCCGTGATTTAAAACCTGTACCAATCCCCATACCCATGACCAAACCACCAAAAATAGCATTGATAAGTGGATCAGTCGTCAATGTCACTTGAGGCATGATTTGAATAAAGAAAGAGCTCATGCTAACCGTAATAAAGGTAAAAATGGTAAATTGGTGCCCAATTTTATACCAAGCTAAGATAAGCAAAGGAATATTGATCAAGTAAAACGCAAGCGCAATAGGAAAATCGTAACCTAAAAGACGATGACTAAGAGCTGAAAAAACCTGTGCTAGACCAGTTGCCCCACTTGAATAAACATGCCCTGGCTGGAAGAAAAAATTCACAGCAATACTGGAGAGAATGCCATAAAGCAGAGAAGCCGAAATCTTCTCTGCATATTTTTCTCTTGAAATACTTCTTAGAGCGTGGAGTAGCCCAACTTTCTTGGCTCCCCTACTAATGACATATTTAACTTTTTTCTTGTAAGTTGTTTTCTTAATCATGACTTTCTATTTGAAGACTGAGTTCTTCTAATTGTTTTTCAGAAACAAGACTAGGTGCTTGCGTCATTGGATCAGAGGCTTTGTTATTTTTAGGGAAGGCAATAACTTCTCGAATATTGTCTTTTCCAGCAAGCAACATGACAAAACGGTCAAGACCAATCGCCAAGCCACCATGTGGTGGGAAGCCGTAGTCCATCGCTTCTAGTAAGAAACCAAATTGGTCATTAGCTTCTTCTGCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LR594045|2141129:2152629|2141129_2143685_-|WP_046177147.1|DBSCAN-SWA MAKANISPGMQQYLDIKKDYPDAFLLFRMGDFYELFYDDAVKAAQLLEIGLTSRNKNAENPIPMAGVPHHSAQQYIDVLIELGYKVAVAEQMEDPKQAVGVVKREVVQVITPGTVVDSAKPDSANNFLVAVDFDGCRYGLAYMDVSTGEFCVTDLADFTSVRSEIQNLKAKEVLLGFDLSEEEQTILVKQMNLLLSYEETVYEDKSLIDGQLTTVELTAAGKLLQYVHKTQMRELSHLQALVHYEIKDYLQMSYATKSSLDLVENARTNKKHGSLYWLLDETKTAMGMRLLRSWIDRPLVSKEAILERQEIIQVFLNAFIERTDLSNSLKGVYDIERLSSRVSFGKANPKDLLQLGHTLAQVPYIKAILESFNSPFVDKLVNDIDSLPELEYLIRTAIDPDAPATISEGSIIRNGFDERLDHYRKVMREGTGWIADIEAKERQASGINNLKIDYNKKDGYYFHVTNSNLSLVPDHFFRKATLKNSERYGTAELAKIEGQMLEAREESSSLEYDIFMCIRAQVETYINRLQKLAKTLATVDVLQSLAAVAETNHYIRPQFNDNHVIKIQEGRHAVVEKVMGVQEYIPNSISFNQETSIQLITGPNMSGKSTYMRQLALTVIMAQMGSFVAADHVDLPLFDAIFTRIGAADDLISGQSTFMVEMMEANQAIKRASDNSLILFDELGRGTATYDGMALAQAIIEYIHDRVGAKTMFATHYHELTDLSTKLTSLVNVHVATLEKDGDVTFLHKIAEGPADKSYGIHVAKIAGLPEALLSRADEVLTRLEAQAQSAEIISVPSKVEPSSAAREGQLSLFPDEDKSQEIIHTLEAIDVMNMTPLQAMTTLYELKKLL >NZ_LR594045|2141129:2152629|2149026_2149926_-|WP_003060132.1|DBSCAN-SWA MTVDQRLQLKNFCFIILGAAIYAFAFVYFYMANRIAANGLAGLTLVGKALFDIDPSLTGYLINLPLVLLGAKLFGKRAMVYTVTGIFSLYFFVWVFQQLPLVVDLDHDNLVVSLMAGIIGGLGGGLVFRNGGTIGGADIIAKLFEDKLGLQLNQALLGIDIFVMIVSLTYISLPQMMYALIASFMYGQIVRLVQQGGYTARGTLIISDQSETIARFIMEELGRGVTYLHGEGAYSGRDKKVIYVALGRTDIRELKAFLAQIDPDAFVSYFDVDEVNSPEFVATKSKYHKKKSRSNVSKR >NZ_LR594045|2141129:2152629|2144021_2144459_-|WP_138084084.1|DBSCAN-SWA MNKIERQHQIKQIIQAEHIGTQEDIKKALQKEGIVVTQATLSRDLREIGLLKLRDEQGKLYYSLSEPVATPFSPEVRFYVLSVDRAGFMLVLHTNLGEADVLANLIDNDDIEDILGTIAGADTLLVICRDEEISKRFEKDLAAGL >NZ_LR594045|2141129:2152629|2148082_2148997_-|WP_003055540.1|DBSCAN-SWA MTRHDKLTKLIELLLIALGVAIYTFGFVNFNMANALAEGGVAGITLILHAHFGINPAYSSLLFNLPLFILGAKIFGKRSLALTIYGTVLMSVFIWMWQKVPMELGLENDMMLVAVVAGLFSGIGSGLVFRYGATTGGTDIIGRIAEEKFGAKLGQTLLLVDALVLTASLTYVDLKHMLYTLVASFVFSQMISVVQNGGYTIRGMIIITKHSEAAAQAILNEINRGVTYLKGQGAYSGNDYNIMYVTLNPTEVREVKRILSELDPDAFISILDVDEVISSDFKIRRKNFDKPIEKALQKKPKLLK >NZ_LR594045|2141129:2152629|2146508_2147906_-|WP_014612639.1|DBSCAN-SWA MEILTLSHYQLEVGGNLLLSINQLHLHQGDKVFLIGDNGSGKTSFLQTLIGERRSYQGQLSLHSDVAYLPQLQAAQNQSGGEKVMASLKVLFQKNASLLILDEPSSHLDKANQKWLIHQLKRYRGTLLVVSHDRYLMNQIAQQIWAIEKQDIKVYQGNYDAYRQVKELEMQKQAIEKANYQRQVTKLTKQIQAKKERANQMVKPKKNISRSDWKVNAFAGSYDSQAKRIAKSAKAMENRLAKLTPNRQESKEIWAKLKFNPQEKKIPHTLIHLREGNLSRNKQILFTYPDIAIRADSKLAIIGRNKAGKSTFLESLANQDLPGFYSDHLKLTFFKQDQVQLDSQLTAFEFVQEQSNQDSRLILNYLAMMGIPYQKAHQKIASLSGGERVRLALVGAMLGDHQLLILDEPTNYLDLVAMEALERCLKQYPYPFVLVSHDQQFVSSVVNRCYVIRDGQLEEIDKDHF >NZ_LR594045|2141129:2152629|2150880_2152629_-|WP_003055520.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKRSMYAGRVREEHIGTTITLKGWVGRRRDLGGLIFIDLRDREGVMQLVINPEDVSSDVMATAERLRSEYVIEVEGLVEARQQANDKLATGMVELKVSALTILNTAKTTPFEIKDDVEVSDDTRLRYRYLDLRRPEMLENFKLRAKVTHSIRNYLDDLEFIDVETPMLTKSTPEGARDYLVPSRVSQGHFYALPQSPQITKQLLMNAGFDRYYQIVKCFRDEDLRGDRQPEFTQVDLETSFLSEQEIQDIVEGMITKVMKETKGIDVTLPFPRMSYDVAMNSYGSDKPDTRFEMLLQDLTETVKGIDFKVFSEAPAVKAIVVKENADRYSRKDIDKLTEFAKQFGAKGLAWVKVTDGQLAGPVAKFLTAIETELSSQLKLAENDLVLFVADTLEVANNTLGALRNRIAKDLDMIDQSQFNFLWVVDWPMFEWSEEEGRYMSAHHPFTLPTPESAHELEGDLAKVRAIAYDIVLNGYELGGGSLRINQKEMQERMFKALGFTAEEANDQFGFLLEAMDYGFPPHGGLAIGLDRFVMLLAGKDNIREVIAFPKNNKASDPMTQAPSLVSEKQLEELSLQIESHD >NZ_LR594045|2141129:2152629|2149946_2150888_-|WP_003055524.1|DBSCAN-SWA MIKKTTYKKKVKYVISRGAKKVGLLHALRSISREKYAEKISASLLYGILSSIAVNFFFQPGHVYSSGATGLAQVFSALSHRLLGYDFPIALAFYLINIPLLILAWYKIGHQFTIFTFITVSMSSFFIQIMPQVTLTTDPLINAIFGGLVMGMGIGTGFKSRISSGGTDIISLTLRKRTGKDVGSLSLMVNGAILTFAGILFGWQYALYSMVSIFVSSRVTDAIFTKQKKMQATIITSHPERVIQMIHKRLHRGVTSINDAEGTYKHEQKAVLITILTREEYTEFKWLMLKADPQAFVSVAENVRIIGRFVEED >NZ_LR594045|2141129:2152629|2144747_2146439_+|WP_015017500.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDTKTLIASEIAKVVPELEQDAIFNLLETPKNSDMGDLAFPAFSLAKVLRKAPQMIAGELAEQIDGSQFEKVVAVGPYINFFLDKAKISSQVLEQVITAGSDYAQQDEGQGRNVAIDMSSPNIAKPFSIGHLRSTVIGDSLANIFAKMGYQPVKINHLGDWGKQFGMLIVAYKKWGDEAAVQAHPIDELLKLYVRINAEAETDPTVDEEAREWFRKLEDGDKEATELWQWFRDESLLEFNRLYNQLNVTFDSYNGEAFYNDKMDEVLELLEAKNLLVESKGAQVVNLEKYGIEHPALIKKSDGATLYITRDLAAALYRKRTYDFAKSVYVVGNEQAAHFKQLKAVLKEMGYDWSDDMTHVAFGLVTKGGAKLSTRKGNVILLEPTVAEAINRAASQIEAKNPNLADKEAVAHAVGVGAIKFYDLKTDRMNGYDFDLEAMVSFEGETGPYVQYAHARIQSILRKADFTPSATTTYSLADAESWEIIKLIQDFPRIIKRTSDNFEPSIMAKFAINLAQSFNKYYAHTRILDDNSERDSRLALCYATATVLKEALRLLGVEAPNEM >NZ_LR594045|2141129:2152629|2143671_2144025_-|WP_003062220.1|DBSCAN-SWA MTSYQNALKDLIVAINAHPSIIAYKEAKQQLSQLDQFEDQAYQMKRYQQEAELFQKIAKNQAAAVSSNKAKELEYHLNHQPVIDDYREKMQDASDLIQYITKRIEEQLNEELTNGKS |
9 | Streptococcus_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
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NZ_LR594045.1|WP_000384270.1|236599_236926_+|replication-initiator-protein-A |
236599_236926_+
Protein sequences of NZ_LR594045.1|WP_000384270.1|236599_236926_+|replication-initiator-protein-A>NZ_LR594045.1|WP_000384270.1|236599_236926_+|replication-initiator-protein-A MDYDNDSYLIPKVLLQDDFYSSLSARDILVYAVLKDRQIEAPEKGWIDTDGSIYLNFKLIELAKMFSCSRTTMIDIMQRLEEVNLIERERVDVFYGYSLPYKTYINEV |
108 aa aa |
63
gnl|BL_ORD_ID|63 information
|
NA | NA | 188656-251185 | NA |