Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LR698989 | Lactobacillus gasseri isolate MGYG-HGUT-02387 chromosome 1 | 2 crisprs | cas3,cas2,csa3,DEDDh,cas9,cas1,csn2,WYL,DinG | 0 | 6 | 10 | 0 |
1. NZ_LR698989
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LR698989_1 | 1744290-1744919 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_LR698989_1
|
9 spacers
spacers of NZ_LR698989_1
>1.1|1744326|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTATTTCATTAAGTAGGTGATGCAGATG >1.2|1744392|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAATTGGTGTCCCTCCCAAGTCAATGCAC >1.3|1744458|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGAGCTTGGTTTAAGTCCTCGCGCTAGAA >1.4|1744524|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAAGTAATTTTCCAATGACACCAGCATT >1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAGAATTAAACAGATAGTAGGTGATTAG >1.6|1744656|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCGCATTATTCATCGTATCCATACCCGT >1.7|1744722|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCGTCGGTACGAGTTGTAATGCTGAATA >1.8|1744788|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGCATAATTAATGAAATCAGCGACAACA >1.9|1744854|30|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder,CRT AGTTAATCAAAGAAGGCGGACAAAAAGGCG |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LR698989_1
The CRISPR arrays of NZ_LR698989_1 >merge|NZ_LR698989|1|1744290-1744919|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATCGCTTATTTCATTAAGTAGGTGATGCAGATGGTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATCGAAATTGGTGTCCCTCCCAAGTCAATGCACGTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATCGAGAGCTTGGTTTAAGTCCTCGCGCTAGAAGTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATCTTTAAGTAATTTTCCAATGACACCAGCATTGTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATCCAAAGAATTAAACAGATAGTAGGTGATTAGGTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATCTATCGCATTATTCATCGTATCCATACCCGTGTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATCTATCGTCGGTACGAGTTGTAATGCTGAATAGTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATCTTTGCATAATTAATGAAATCAGCGACAACAGTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGTTTAGATCAGTTAATCAAAGAAGGCGGACAAAAAGGCGGTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAAGTTATTAGT >NZ_LR698989|1|1|1744290-1744853|PILER-CR GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC GCTTATTTCATTAAGTAGGTGATGCAGATG GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC GAAATTGGTGTCCCTCCCAAGTCAATGCAC GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC GAGAGCTTGGTTTAAGTCCTCGCGCTAGAA GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC TTTAAGTAATTTTCCAATGACACCAGCATT GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC CAAAGAATTAAACAGATAGTAGGTGATTAG GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC TATCGCATTATTCATCGTATCCATACCCGT GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC TATCGTCGGTACGAGTTGTAATGCTGAATA GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC TTTGCATAATTAATGAAATCAGCGACAACA GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGTTTAGATC >NZ_LR698989|1|1|1744290-1744919|CRISPRCasFinder GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC GCTTATTTCATTAAGTAGGTGATGCAGATG GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC GAAATTGGTGTCCCTCCCAAGTCAATGCAC GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC GAGAGCTTGGTTTAAGTCCTCGCGCTAGAA GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC TTTAAGTAATTTTCCAATGACACCAGCATT GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC CAAAGAATTAAACAGATAGTAGGTGATTAG GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC TATCGCATTATTCATCGTATCCATACCCGT GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC TATCGTCGGTACGAGTTGTAATGCTGAATA GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC TTTGCATAATTAATGAAATCAGCGACAACA GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGTTTAGATC AGTTAATCAAAGAAGGCGGACAAAAAGGCG GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAAGTTATTAGT >NZ_LR698989|1|1|1744290-1744919|CRT GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC GCTTATTTCATTAAGTAGGTGATGCAGATG GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC GAAATTGGTGTCCCTCCCAAGTCAATGCAC GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC GAGAGCTTGGTTTAAGTCCTCGCGCTAGAA GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC TTTAAGTAATTTTCCAATGACACCAGCATT GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC CAAAGAATTAAACAGATAGTAGGTGATTAG GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC TATCGCATTATTCATCGTATCCATACCCGT GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC TATCGTCGGTACGAGTTGTAATGCTGAATA GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGCTTAGATC TTTGCATAATTAATGAAATCAGCGACAACA GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAGGTTTAGATC AGTTAATCAAAGAAGGCGGACAAAAAGGCG GTTTTAGATGGTTGTTAGATCAATAAAGTTATTAGT
>NZ_LR698989.1|WP_087261412.1|1743588_1744257_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MLLSYLSHKKMVMKNSGIKVIATSSPIVYRDVVQSFQGKKDMLLSSDDDYNQLNIIKDFDFIADPVLNQNIFDKYMPVIIKEYIEVLNEADRNEILKTYHKLEGIIQDSLLLEDLPLELEFNENLKKFLKLENLHLDTKFLEEPYAIIESILKIHQNYNLHSIPVACNVAHYLNLAQVGMLNDLLKEMKLKLILIEFTSADFLFFPKDVDYFYIDQDLVDWY >NZ_LR698989.1|WP_087261458.1|1743286_1743628_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMIMFDLPVDTASERREYRQFRKRLINEGFLMIQYSIYERVCVSRKTATFLENRIKSFLPTSGVVQSLMVTEKQYNDMHFLVGNPVDDVRNSSDRTVILCFYLIYLIKRWL >NZ_LR698989.1|WP_020807053.1|1742400_1743309_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRSVIITQHAKLTYSMNMMIVQTKDGINQIPISDINLLLVSTSQAVITSALISKLAENQSKIIFVDAKYQPVSETIDYYPNSRSLAKLKSQFNWDEKRKELLWTKIVARKIQNQIKALQNYNLVWDDVQNELDQMELNDSTNREAAAARKYFINMFGKDFIRRNSGVINAALDYGYAILLSAFNREIAVNGYLSYLGIHHHSQENQFNLGSDLMEPFRPFVDYWVKAHENIDEFTPDIKFGLVELLSLEIKFNGRKTLLSNAITVYVRDCLRFLSGEIDKVKIEMELTDEVPNDAINDNV >NZ_LR698989.1|WP_020807054.1|1738034_1742195_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MTKIKNEYIVGLDIGTNSCGWVAMDFQNTILRMHGKTAIGSHLFDAGNSAADRRAFRTTRRRIKRRKWRLKLLEEIFDPYMTEVDPYFFARLKESGLSPLDKRKNASSIVFPTALEDKKFYCNYPTIYHLRYDLMSEDKKFDLREIYLAIHHIVKYRGNFLYNTPVKDFEASKIDVKDSLEKLNELYERLDSEFTVELDSSNALEIEKIIRDKNVFKINKVKSIHQLLSLKTENKERTKLIKDVSKQIINAILGYKTKFETILLKNISKDEADDWEFKLTDVDADNKFENLIGDLNENEQEILLVIRNLANAITLSNIVEEGKTLSESMIDKYNKHSDDLKLLKQVISDHPDRDKAKKLALAYDLYVNNRHGKLLQAKDVLGSKKTLSKEDFYKEVKKNLDDSKASQEILDAIALDSFMPKQRTNENGVIPYQLHQLELDRIIKNQGKYYPFLKEANPVSSHLKQAPYKLDELIRFRVPYYVGPLISPNESTKNKQTKKNQNFAWMIRKEQGQITPWNFDQKVDRMASANKFIKRMTTKDTYLLGEDVLPANSLLYQKFTVLNELNNIKINGKRISVPLKQELYNNLFKKNSTVTTNKLKSYLKENYNLINVEIKGLADEKKFNSGLTTYNKLRNLKIFDQQIDDLNYDKDFERIIEWSTIFEDKAIYKDKLKTIKWLSDRQIDKLSKIRMQGWGQLSKKLLSQLTDNNGQTIIEQLWDSQNNFMQIVNQADFKDAIAVANQNLLVNTSVEDILNEAYTSPANKKAIRQVVKVVDDIVKAASGKVPKQIAIEFTRDADDKAKISQTRANKLRKVYKELSNELASEAIRNELERVAKDQKLLKDKYYLYFMQLGRDAYTGEPIDIDELEQYDIDHILPQSFIKDDSLENRVLVKKAVNNGKSDNVPVKLYGNHMAADLGITIRHMWEKWKDQGLITKTKYNNLIIDPDKINKYESSGFIHRQLVETSQIIKLASTILQSKYPDTEIIVVKARYNHYLRKHLNLYKSREVNDYHHAIDAYLSAICGNLLYQVYPYLRPFFVYGQYKKFSSDPKKEKIIYDKTRKYNFISQIFENKGNDIISLETKKKVFDKKDIIEKLKHAYDYKYMLVSRETETRDQEMFKMTVYPRLSRDTKKSRNLIPKKKDMPTEIYGGYTNNSDAYMVIARINKKKETEYRVFGVPMRELVNLRKAEKKGHYNAYLKQVLEPEIMYNKNGKKNKTISSFEIVKSKVPYKQVILDGDKKFMLGSSTYVYNAKQLTLSQDAMQAITDNCENDTDEEKALIEAYDEILTNIDKYLPLFDINKFRDKLHAGREKFINLSLDVKKDTILQVLNGLHDNAVMPKIKSLGLSTELGKLQIPTGVKLSENAKLIYQSPTGLFEKRVKISDL >NZ_LR698989.1|WP_020807055.1|1736715_1737702_+|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase MKVFVTGVNGQLGHDVMNELAKRGYEGVGSDLAPEYAGVADGSSVTKAPYVSLDITDAKAVNKVISEVNPDVIVHCAAWTAVDMAEDDDKVAAVRKVNVDGTQNIANVAKKLDAPMVYLSTDYVFDGQGTTPWEPDFKGYKPLNVYGETKLGGEEAVANTLDKYFIVRIAWVFGVNGSNFIKTMLKVGSNHDEVKVVSDQIGTPTYTFDLARLLVDMIETDKYGYYHATNSELPATESGYDENGTKTGYISWYDFTKEIYRQAGYKTKVTPVTTEEYGLSKAVRPFNSRLDKSKLEKNGFKPLPTWTDAISRYLDILKDDGFFDELKK >NZ_LR698989.1|WP_003647168.1|1736090_1736699_+|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase MGQIKVEKNVGGIEGLAVITPTVHGDDRGYFMETFNQRDMMDAGFSINFVQDNQSSSTKGVLRGLHFQKKYPQIKLVRAVRGSVFDVAVDLRSESKTYGKWYGVELTAENKKQFLIPQGFAHGFLVLSDVAEFCYKVNDFWHPNDEGGMAWNDPEIGIEWPHLKGDYPGSPDASGYTLDDGTKLNMAERDQEWKGLKDTFKF >NZ_LR698989.1|WP_020807056.1|1735173_1736058_+|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA MKGIILAGGSGTRLYPLTLVTSKQLLPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIKDILVISTPADTPRFKELLGDGSQFGVNLSYKVQPTPDGLAQAFTLGEDFINGEPCAMVLGDNIFYGNGFTDLLKNAAEDAQKGKATVFGYYVNDPERFGVVDFDKNGNAISIEEKPEHPKSNYAVTGLYFYPAGVSEKAAQVKPSARGEVEITSLNDMYLQDGDLGVQLLGRGYAWLDTGTMQSLVDASNYVKMIEERQGVSVSAPEEIAYVHGWIDKDQLLEAAKHYGKSPYGKHLKSVAEGKVRY >NZ_LR698989.1|WP_003647166.1|1734129_1735167_+|dTDP-glucose-4,6-dehydratase MKVIVTGGAGFIGSNFIFYMLKKHPDYEIICLDSLTYAGNLSTLKDVMDNPNFKFVKLDIRDREGVYKLFEEEKPDVVVNFAAESHVDRSIENPEIFLETNIIGTSVLMDACRKYGIKRFHQVSTDEVYGDLPLDRPDLFFHEDTPLHTSSPYSSSKASADLLVGAYGRTFHLPVTISRCSNNYGPYQFPEKLIPLMIQRALNNEKLPVYGDGKNVRDWLYVEDHCKAIDLILEKGTPGEVYNIGGHNEMHNIDIVKLICDYLDKPYSLIEHVTDRKGHDRRYAIDPEKIHNELGWLPETMFKDGIKKTIQWYLDNKEWWENIISGDYQNYYDEMYGKKQVLDKD >NZ_LR698989.1|WP_020807057.1|1732872_1734048_+|methyltransferase-domain-containing-protein MPKYYTSGEFAKKAHVSIRTIRYYDQKNLLKPSTHTASGARRYTDTDFAKLQQILLLKYLGFSLSDIREMTLGSGDRQLLLDSLQIQKRLVEERLKEMQNVATAIDSTSSTLKAGQEVDWSKMLNLIHLTSMNQSLSTQYQNASNISARIRLHRDYSLNKEGWFHWLFKQLDLKPGMKILELGAGNGALWSQNLDKLPKGLTIVLSDISEGILADAKNEIGDNSEFQYAIFDAQKIPFADNTFDLVIANHMLFYCDDIPKTLKEVRRVMKKGASFACATYSKRHMHEITDLVQEFNPEIVLSSTNLYDRFGLDNGAEILSKDFTDVSCHKYQDAIELSESTPVISYILSCHGNQNAILLDHYNEFKNYVDEKVSGGFHITKDVGYFICKKT >NZ_LR698989.1|WP_113533095.1|1732084_1732252_-|DUF3938-domain-containing-protein MCQSKLLLKIITFFIFTPEEDSQSIVLFTVISTIGDILIYSSCDYDYTVLISTNR >NZ_LR698989.1|WP_020807050.1|1745568_1745994_+|hypothetical-protein MSIYRNDDVLITDLMDRIDKLENQVTDLKKVFYKQSGESHSTFLYGCEVRGSDYLHLEDKVIPRLKENDPVLLIREADNKYDKNAISVATPAGLKLGYIPREHNLIFSRLIDSGNLLFGRVKNFHWDGKNFELVIKVYLAN >NZ_LR698989.1|WP_024273054.1|1746060_1747110_-|IS30-like-element-ISLga1-family-transposase MDSLHSTMNQHVKGKHLSFEERVIIQLRLKDGCSLRAIARELNCSPSTISYEIKRGTVKLYHGKVKRYKATQGHDVYQAHRKNCGRKSDFLKKTQFIHYVHKHFFKDGWSLDVCSNRATAAGEFSSSDVVCTKTLYNYVDKGLLGIYNYDLPEKLKRNTKLHRVRKNKKKLGRSIEERPKEISERNEFGHWECDLVLGHKTKDDEVLLTLSERMSREFLIIRIPDKTSISVMQAFKELQRQYSEHWNDIFKTITTDNGSEFADLSNLEEASNTLVYYAHPYTSCDKGTVERHNGLIRRFIPKGEAIANYSLQNIIDIETWCNSLPRKILAYHTPDEIFERELDRIYQAA >NZ_LR698989.1|WP_020807049.1|1747284_1748202_+|M48-family-metalloprotease MLYKQIEQNKRNTWIILGLYTALLLILSIFLGMIFTKYVGIGFFIIGLIYIAHVYFDATQHLMKVTNAVEITKESDPEIYELVEELCLAGGLPVPKIYITPDSDPNAFATGRDPEHASLALTQGLLSMMNKKEVQGVIGHELSHIRNYDTRITVLASALTSLITITGIGIVLFGWGVLTSESKGWLGLIIKFFAMFLIIVGGIISIIGIPLAKLLFLLVSRQREYLADIGSVDLTREPSGLISALSKLEKMEESESTPEINSQDLALEHLYFNLPHPGNWIDRLFSDHPPLDKRIERLKNSDKIE >NZ_LR698989.1|WP_003648682.1|1748406_1749246_-|hypothetical-protein MTLQINTRVDSITWPLNQNLTNQEIISQLELTVTENGQLISNDNLSINKKAVNRSEAGVYPVIITAIGSNNEYATKKIQAWVTDKNNVNSATRPPVQPTPAPQYKTPSQTPSPKKKSKKKVVYIVLGVLVLLIAIIFGISACQAHNDTVQNEQAQSNALNNTNSKLDNLSEQNKQLMQQNKELQNAINNYKQDQNKEELQNQLDQIKNENQQLKNNAANNQALQNQIDQLGSTIDQIKQNPNQADSLLNQMKNNQNEFMQNLNATFQKLVSDFQQLIGK >NZ_LR698989.1|WP_020807048.1|1749369_1749810_+|8-oxo-dGTP-diphosphatase MKRSEPVTLTNMCMIKKKDKILVLDRNDPVWPGLTFPGGHVESHESFHDSVVREIKEETGLLIKNPHLVGVKQFFDKNDERYLVFFYVATEFTGTVKASDEGKLTWMTKEELTSKKLAYNFDHDLPVFFDKNLSEHLLDEKIDQTY >NZ_LR698989.1|WP_065169685.1|1749839_1750499_-|hypothetical-protein MEEFNLKKLIVGALSCGLLLLAGCRNNLVEPKHKSSADDYAIIQSSSHKKSHKKVEQPKKKSEDKKKKDKDKDKSKDENKKMDVQIDTLNKNENSSSSEAQSSSSALPSLNSSKRENSTETNRSLKSNFGTSLYTLPRQNYSYYTPKSNYYYSNNWSTNNNTGSSHQNSAVSNSKSEPSTSTSSSSSNDASTSTEEKQSPTTQNNDSNSSESSEDVQND >NZ_LR698989.1|WP_020807046.1|1750688_1751093_+|hypothetical-protein MYDLEDVMMKSFRDDNGISSAFSIEPVDDNEYRVSTNVVDGLNDMIHFNLIVYPNGTYALNDRVFTARMIDDNIGSFSSIAADVARLASEFGVLLDDRGELTRDYINSRDLRSEVNNFTQLLNRVVEFAQLNRY >NZ_LR698989.1|WP_020807045.1|1751169_1751553_+|DUF1828-domain-containing-protein MEESELKLIKHASFDWLKQNIQFIQAGEDIEVATPLIGAYGDLVYCWIEKEKNGAYRITDDGGTLFKLDPAQENLDLLEEAADIVIGAGFEFDEDNSEIYQIVDLENMAQTLSDLTQLQVALTYLAS >NZ_LR698989.1|WP_020807044.1|1751769_1752573_+|hypothetical-protein MMRQIKKRNIMTGLGTAALLASLSLNGTAFAASTDSVNAGAEQAKTYQTQLEQHKNLQAYTNPLSVKTLTTTKGVLPDATSGISNWSTVPAGTVANWDKTPEINKVGTSYGTVYVTFPDGSRSRLAVYVTVKDTAVSQDSKASKKDLNNGSATSATDQQDNASKQTTSVKKDVAKENTSKNSSEKTNKDVVVKDLGSTTVTEKNVSVVNNTKDNKKNSKKSSNPVSVATQLPETEGKAVNPLVVIGGLLVAAIGAVAIFGKKIKNRL >NZ_LR698989.1|WP_020807043.1|1752641_1753994_-|APC-family-permease MTNNNSVPKKLSFISIYFLGINAVIGSGTFLLPSVIYRYMNLTAILVLLCTAVTVSMIALCYADLSSRFTQSGAAWLYSYNAFGRFAGYELGIFTWFLGCTTLSAEVVALLTVLKSFLPIFKNNAVYIGSIIFLILLFSVINFFGRSWVKIVNNISAAAKIITLIVFIIIGAFFIKKSNFTPVIPHAALTGVTPFFKHFGDAFTPIFYLFTGFSFIPIAAKQMNNPEKNIPRVLVAVMTSVTILDCLMLLVAIGLSGQKLGSYSNPLASALKTGVGQWGFAFMIIGMLISIFGVAFSASFNTPSLIASLANEHGMLPKWIGKKNKHDAPWVGIIFTAILSAALATQSYLFLVSCTVLASFVQYVPSILAVIKFKHSNEYPTHGFSLPGKYTIPIIALIISCYMVTNFTPKTLLLGVVVAVLAAACYFFIDKDEKLEKEHENFLAKLRHIK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LR698989_2 | 2091681-2091783 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LR698989_2
|
1 spacers
spacers of NZ_LR698989_2
>2.1|2091718|29|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder GCGGGGGGGCGTCAACGAAGTCATGCGGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LR698989_2
The CRISPR arrays of NZ_LR698989_2 >merge|NZ_LR698989|2|2091681-2091783|CRISPRCasFinder CTTTCGATTTTCGAAATTCCGCTCGTAGCAAGGGTTTGCGGGGGGGCGTCAACGAAGTCATGCGGACTTTCGATTTTCGAAATTCCGCTCGTAGCAAGGGTTT >NZ_LR698989|2|2|2091681-2091783|CRISPRCasFinder CTTTCGATTTTCGAAATTCCGCTCGTAGCAAGGGTTT GCGGGGGGGCGTCAACGAAGTCATGCGGA CTTTCGATTTTCGAAATTCCGCTCGTAGCAAGGGTTT
>NZ_LR698989.1|WP_016373490.1|2090601_2090883_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelB/DinJ-family-antitoxin MAVKEKKRVQVKIDKDLADDTEAVLSQLGLNPTTAINMFYKRIVANGALPFNVSLSEEERANLRFLKATKETPVTEFKDAKEVADWLNDPDED >NZ_LR698989.1|WP_010620892.1|2090369_2090555_-|hypothetical-protein MKDTITINDFFEIAKETDLKDLLDKSLHEPDPEKRKVYDALYTYFLDKRQDEVIKRKDFVR >NZ_LR698989.1|WP_064534204.1|2089716_2090373_-|zeta-toxin-family-protein MIDKPQYIIVAGINGAGKSTLYDTFPILFDKTKRINADELLRQMGGDWHKDSDNLKAMKEEIKQLHYALDRQQSIHVETTLAGRGKAHKNGFEVTLLYVASRDENLAIQRVNERVQKGGHGVPVATIKKRYQESKHNLPLVAFKSDKVMIYDNSEKFTSVYAREKGQVFKNDLRHFPWINQNITYPEKVQKQLQNFADQNPEVKPKNDPENKNDRPSY >NZ_LR698989.1|WP_064534206.1|2089448_2089727_+|hypothetical-protein MSNQYEKLVKQQARLKQKIEREDFKLRQSKYYENRQARKARSRRLIQKGALLEKYFQADNLSVEQTEELLKIFANYVNAHKPDKLKNDQPNN >NZ_LR698989.1|WP_003555660.1|2089198_2089426_+|hypothetical-protein MIGGIVMSQSNLEKQEAKLKALNQKIKDEKNKIEQRLGKQIISQANLDYANLSNDQIKLLAKQFSEFLKVKSVDH >NZ_LR698989.1|WP_065169799.1|2086886_2088947_-|MobA/MobL-family-protein MAIFHISFSNISAGKGRSAIASAAYRSGEKLFDDKECRRYFYARSVIPESFILTPKNAPEWAIDREKLWNEVEKNDRKSNSRYAKEFNVALPVELSESEQKELLTKYVQENFVDQGMVADVAIHRDHPDNPHAHVMLTNRPFNPDGSWGLKAKTQYIKDENGKQLLTKSGFPKQRKIWLVDWDKKEKINEWRHNWATSVNQFLAQKNIPDRISEKSFVDQGIQETPTQHEGINSQRKNRKAFNQQVRAQRNAQAKYHNLDEKIRNHEHFDALTDELSFSEKHTISHLSQQLKTYVDLEHLDDKQRMLFNWKNSLLIKHAIGEDVTKQLLTIDQQTTSLAQANQLLNKVVERATKKLYPELNFEQTTAAERRELIKETNSEQTTFKGSELAERLADIRNDLLTQQLLTFTKRPYTSWQLVNQQAQTIEKQLTTVLAKHGHQLDDLKHTDRGMLAAYEPNELEFISKAVKNLRVMREVKAVVQTQYNSILTTAFPDSDLDKLETIDKEQIYTAVVYYDPELKPLSADDLRQLQQQPPVVFTSQQHQAGLNYLLGKMELKDIQDHRLQRVLKHDGTRQLFIGECGQDPKLDHQQIEMVQARLKQQTTRFDQYKQDQIKDYQAINYYPTSPKNYLTNILDEALMTILYAKNTDYLRKQQLRGLKETEWAMTKKQRQHQTRNRHEDGGMHL >NZ_LR698989.1|WP_172620138.1|2086649_2086829_-|LtrC-like-protein MKQQVQQARNPQQKSELKNKLNDIHHEISKRTQKQLQAFAEENPSIKQPESELDQSLKR >NZ_LR698989.1|WP_065169802.1|2085458_2085911_+|hypothetical-protein MIEKEKVLSDAPKVLNSDNNPWEVTVEGDSIIGTWKWMDARFFTEGGISDEDKEFTFTVTLKDNGKWKEVDSTSSKTSSIRMHNGKLSFSKDISFSKGKTYQKSISFGIGKDKKSGKVGIVESKLDTSIIKKSIRDYLKQCGWKKAGLFG >NZ_LR698989.1|WP_147614552.1|2085085_2085466_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MTPGDTWRTIAYKYAMSVEELLKVNCAKAVDVLSIGQYGFNLVKIPSSWLHMEFGLSFLHDTSPLVNKIGRTIDQFLLLAISRIIDIVYYGYSMIRFTTGDMTGLGIIRLVMFSNDYQKKEMISYD >NZ_LR698989.1|WP_016378676.1|2084372_2084477_+|putative-holin-like-toxin MSVADALQLMLAFGTFIVALIALIVELIKSQQKK >NZ_LR698989.1|WP_005728422.1|2092839_2093625_+|AAA-family-ATPase MNGKTLLNFNFKGGVGKTTLTVMETYLLGQEGKKVLLIDFDPQGNATEIMKETYKADLKPELSLYEGLLGGNLSKSIVSVTNQIDMIPTDWTLSLWIGAVEKVSRVKRNILLPQMLSKLKQNYDYIFIDVPPTINVFTNNAIMASDFISIVLQTQKQSYTSSLKTATHLGELREQYNGSFQLVGVILYLMKPRAKVDTEISAQAKDFFGEGVFSNSIRTQERVKTFANEGIRNKDHWDKRAIQMYQMVLNEQLLRIQQLEE >NZ_LR698989.1|WP_020807702.1|2093631_2093847_+|hypothetical-protein MAEDFLNKVSKKASEQLKNLKSPYQFETERTKTVQLRMSTYKEVKRIAFENDEKIVDVLEKIIREGLAKRR >NZ_LR698989.1|WP_020807705.1|2094657_2095071_-|hypothetical-protein MFLLKLHDLIKHNYENGLYSKDYSYKAKDYSYKSDDFNSLSDFDKGKFQAQTDYQKRSPWKYIIQRLIEDKTIPDYFYPHALEGLKDLKKQIKRQLNDANMTIIILELHFDGHNGDHLLVYVPTDKTVCLLSWHWYA >NZ_LR698989.1|WP_020807706.1|2095198_2095993_-|alpha/beta-hydrolase MFNARTKSIVINGYSMDYISFGKGNKWLILIPGLSINRIRGHALQMSFMYRQFARKYKVLMFDRRDHLTPSYSIGQMADELYSALRKLGIYKIDVVGVSEGGMIAQKLAINQPDIVHKLVLAVTISEPNNTSNTTIKQWISLAKNNQLKELVWDSFQRSYSTHYIHKHHHLLKLLATITKVKEVDRFIILAQAILNFNVAAQLTKIKCPVFVIGAQQDQVLSVEGTKTIAKILHAPLYIYPHYGHAVYIEAKDFNQRIYNFLMS >NZ_LR698989.1|WP_035426694.1|2096547_2098119_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein 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MSFQKLIKTNLLLFIVIIVLELLFAAGSAISSYIIQFAYNQLVKNILLGFLLIIASSVFLSFISYILSSLATYLFSKQTQKYIHSIRHKLISEYYHDKAPKVAEMENELNSNLQVLTKNYADQSLSIIQSGFLLVTSISSLLLMNWMLTLLAIILSVITLYIPRFTRQKASNATQKVASRNSKYLLVIEEWFNGLEELRKYTAFNQLDLVMQKVSQNLETSFVERKKVISVADFLNGCANSFSQIAITLLAAILFFNHQVTFGVIIAAGNFSSMILNCLLTITTSLTRIQSVQGLNKQIIESQKLVPFHKEINTDEICSISTHNLSISFKNGETIYFPDIHIKKGEKVLLSGDSGTGKSTLFKLILNKLQPTNGQVIFEDKYGKEISPDYAQIGYIPQDGKLFPTSIINNIIMFNNKLKKLSKNAVENNDLSKDIASMPNGLETEIDLDTNNFSGGQKQKIILARNEIHNFSIILADEATSAIDSKSSYRILKNLVSSNKTVIVIAHNLTPAMEKLFSRKISLGSNKR >NZ_LR698989.1|WP_020807709.1|2099722_2100565_-|hypothetical-protein MKIYKWKLSKLQVLKLSKVKVQGNLVAVTSDGNKYIPFGGIDSLYETAYKKAISELNERAAWFTMYSLHPSIVPNTTGFAAHTDKEKAIQSSIYEVIERKAFHYFIKLIMNNKIDEIYSNFHIQNKKDFLLFSKPYLTQAGELWITFAFDLGRKIIPVGMGKQNNLAESIDDAIDECIMVNHSIEKYLISHSNKQSTQSMSQEELLSFINLGKSTLLQDNLEKLSIENNYYENVKTKNIESLLTLNVTRYIPKFLSPTNRYVYLSVPLEKADSIKNNYRI >NZ_LR698989.1|WP_065169815.1|2100597_2101614_-|ThiF-family-adenylyltransferase 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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| NZ_LR698989_1 | 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744590-1744619 | 30 | NZ_CP014885 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1991 plasmid pL11991-4, complete sequence | 19723-19752 | 0 | 1.0 |
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| NZ_LR698989_1 | 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744590-1744619 | 30 | NZ_CP017699 | Lactobacillus coryniformis subsp. torquens DSM 20004 = KCTC 3535 plasmid pLDW-5, complete sequence | 3974-4003 | 0 | 1.0 |
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| NZ_LR698989_1 | 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744590-1744619 | 30 | NZ_CP018868 | Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence | 42038-42067 | 0 | 1.0 |
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| NZ_LR698989_1 | 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744590-1744619 | 30 | NZ_CP025208 | Lactobacillus sakei strain WiKim0074 plasmid pLSW74_2, complete sequence | 10173-10202 | 6 | 0.8 |
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| NZ_LR698989_1 | 1.4|1744524|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744524-1744553 | 30 | NC_049431 | Vibrio phage 1.097.O._10N.286.49.B3, partial genome | 16388-16417 | 8 | 0.733 |
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| NZ_LR698989_1 | 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744590-1744619 | 30 | CP013931 | Alteromonas mediterranea strain U10 plasmid pAMED10_300, complete sequence | 102585-102614 | 8 | 0.733 |
| NZ_LR698989_1 | 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744590-1744619 | 30 | NC_017498 | Lactococcus lactis plasmid pSK11A, complete sequence | 8628-8657 | 8 | 0.733 |
| NZ_LR698989_1 | 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744590-1744619 | 30 | NZ_CP016709 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain UC109 plasmid pUC109C, complete sequence | 9521-9550 | 8 | 0.733 |
| NZ_LR698989_1 | 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744590-1744619 | 30 | NC_019394 | Alteromonas mediterranea DE1 plasmid pAMDE1, complete sequence | 102956-102985 | 8 | 0.733 |
| NZ_LR698989_1 | 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744590-1744619 | 30 | NC_008504 | Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 2, complete sequence | 4914-4943 | 8 | 0.733 |
| NZ_LR698989_1 | 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744590-1744619 | 30 | NZ_CP016739 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3C, complete sequence | 14924-14953 | 8 | 0.733 |
| NZ_LR698989_1 | 1.8|1744788|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744788-1744817 | 30 | NC_048827 | Vibrio phage vB_VchM_Kuja, complete genome | 142116-142145 | 8 | 0.733 |
| NZ_LR698989_1 | 1.9|1744854|30|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder,CRT | 1744854-1744883 | 30 | NC_002580 | Propionibacterium freudenreichii plasmid p545, complete sequence | 137-166 | 8 | 0.733 |
| NZ_LR698989_1 | 1.1|1744326|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1744326-1744355 | 30 | AY583235 | Mycoplasma phage phiMFV1, complete genome | 2923-2952 | 9 | 0.7 |
1. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052067 (Lactobacillus paracasei strain 347-16 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019031 (Lactobacillus fermentum strain SNUV175 plasmid pSNU175-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014885 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1991 plasmid pL11991-4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017381 (Lactobacillus plantarum strain TMW 1.1623 plasmid pL11623-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP048005 (Lactobacillus paracasei strain CACC 566 plasmid p2CACC566, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017699 (Lactobacillus coryniformis subsp. torquens DSM 20004 = KCTC 3535 plasmid pLDW-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018868 (Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021516 (Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16C, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP037432 (Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KM063576 (Lactobacillus reuteri strain LU4 plasmid pLU4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028979 (Lactobacillus plantarum strain LQ80 plasmid pLQ802, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035557 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035557 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011352 (Lactobacillus paracasei plasmid plca36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011839 (Lactobacillus gasseri plasmid pLgLA39, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028232 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101222 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011537 (Lactobacillus fermentum 3872 plasmid pLF3872, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014891 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1992 plasmid pL11992-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaagaattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ******************************
20. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028242 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101518 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaagaattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ******************************
21. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035152 (Pediococcus acidilactici strain SRCM103367 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaagaattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ******************************
22. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032752 (Lactobacillus plantarum subsp. argentoratensis strain DSM 16365 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
23. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028227 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101187 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
24. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025691 (Lactobacillus plantarum strain IRG1 plasmid pIRG101, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
25. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035574 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103303 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
26. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035176 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103426 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
27. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017376 (Lactobacillus plantarum strain TMW 1.708 plasmid pL1708-2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
28. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024060 (Lactobacillus plantarum strain KACC 92189 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
29. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023493 (Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
30. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017368 (Lactobacillus plantarum strain TMW 1.277 plasmid pL1277-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
31. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023773 (Lactobacillus plantarum strain PC520 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
32. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015967 (Lactobacillus plantarum strain LZ206 plasmid LZ206p2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaagaattaaacagatagtgggtgattag Protospacer ********************.*********
33. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026509 (Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed4, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
34. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025416 (Lactobacillus plantarum strain X7021 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaagaattaaacagatagtgggtgattag Protospacer ********************.*********
35. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028336 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101167 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
36. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015603 (Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
37. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021933 (Lactobacillus plantarum strain TMW 1.1478 plasmid pL11478-1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
38. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035132 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103311 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
39. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035148 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103361 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
40. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024061 (Lactobacillus plantarum strain KACC 92189 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaagaattaaacggatagtaggtgattag Protospacer *************.****************
41. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017358 (Lactobacillus plantarum strain TMW 1.25 plasmid pL125-4, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
42. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029538 (Lactobacillus paracasei strain LC355 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
43. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020097 (Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
44. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035569 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103300 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
45. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023303 (Lactobacillus plantarum strain pc-26 plasmid p.pc-2602, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
46. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014682 (Lactobacillus hokkaidonensis JCM 18461 strain LOOC260 plasmid pLOOC260-2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
47. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032650 (Lactobacillus plantarum strain ZFM4 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaagaattaaacagatagtgggtgattag Protospacer ********************.*********
48. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028276 (Lactobacillus plantarum strain SRCM100995 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer caaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer *****.************************
49. spacer 2.1|2091718|29|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045730 (Lactobacillus gastricus strain LG045 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
gcgggggggcgtcaacgaagtcatgcgga CRISPR spacer gcggggggtcgtcaacgaagtcatgcgga Protospacer ******** ********************
50. spacer 2.1|2091718|29|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044413 (Lactobacillus sp. JM1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
gcgggggggcgtcaacgaagtcatgcgga CRISPR spacer gcggggggtcgtcaacgaagtcatgcgga Protospacer ******** ********************
51. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP017932 (Lactobacillus sakei strain LK-145 plasmid pLs145-a, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer aaaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ****.************************
52. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022710 (Lactobacillus sakei strain WiKim0063 plasmid pLBS01, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer aaaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ****.************************
53. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016802 (Lactobacillus brevis strain TMW 1.2112 plasmid pl12112-5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer aaaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ****.************************
54. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019751 (Lactobacillus brevis strain TMW 1.2113 plasmid pl12113-1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer aaaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ****.************************
55. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046038 (Lactobacillus sakei strain CBA3614 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer aaaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ****.************************
56. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027195 (Lactobacillus sp. CBA3606 plasmid pCBA3606-1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer aaaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ****.************************
57. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044413 (Lactobacillus sp. JM1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer aaaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ****.************************
58. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040377 (Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain BNH17 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer aaaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ****.************************
59. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LT907984 (Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K plasmid pJ23A1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer aaaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ****.************************
60. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LT907987 (Lactobacillus sakei strain T332 plasmid p332A2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer aaaaggattaaacagatagtaggtgattag Protospacer ****.************************
61. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025208 (Lactobacillus sakei strain WiKim0074 plasmid pLSW74_2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer tcacaaattaaacgaatagtaggtgattag Protospacer . * .********..***************
62. spacer 1.1|1744326|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK504443 (Lactobacillus phage 521B, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gcttatttcattaagtaggtgatgcagatg CRISPR spacer tgttaaactattcagtaggtgatgcagatg Protospacer *** ..*** *****************
63. spacer 1.9|1744854|30|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP022646 (Bacillus wiedmannii PL1 plasmid pBwiPL1-3 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
--agttaatcaaagaaggcggacaaaaaggcg CRISPR spacer gacatcaa--gaagaaggcggacaaagaggcg Protospacer .*.** .***************.*****
64. spacer 2.1|2091718|29|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045730 (Lactobacillus gastricus strain LG045 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
gcgggggggcgtcaacgaagtcatgcgga CRISPR spacer tagcaagggattcaacgaagtcatgcgga Protospacer * ..*** ******************
65. spacer 2.1|2091718|29|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044413 (Lactobacillus sp. JM1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
gcgggggggcgtcaacgaagtcatgcgga CRISPR spacer tagcaagggattcaacgaagtcatgcgga Protospacer * ..*** ******************
66. spacer 2.1|2091718|29|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder matches to NZ_KR052811 (Lactobacillus crispatus strain L6 plasmid pLc17, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
gcgggggggcgtcaacgaagtcatgcgga CRISPR spacer tagcaagggattcaacgaagtcatgcgga Protospacer * ..*** ******************
67. spacer 2.1|2091718|29|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046312 (Lactobacillus crispatus strain FDAARGOS_743 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
gcgggggggcgtcaacgaagtcatgcgga CRISPR spacer tagcaagggattcaacgaagtcatgcgga Protospacer * ..*** ******************
68. spacer 2.1|2091718|29|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026504 (Lactobacillus crispatus strain AB70 plasmid pLcAB70, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
gcgggggggcgtcaacgaagtcatgcgga CRISPR spacer tagcaagggattcaacgaagtcatgcgga Protospacer * ..*** ******************
69. spacer 2.1|2091718|29|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044414 (Lactobacillus sp. JM1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
gcgggggggcgtcaacgaagtcatgcgga CRISPR spacer tagcaagggtttcaacgaagtcatgcgga Protospacer * ..***. ******************
70. spacer 2.1|2091718|29|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP008839 (Lactobacillus gasseri DSM 14869 plasmid pEB01-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
gcgggggggcgtcaacgaagtcatgcgga CRISPR spacer tagcaagggtttcaacgaagtcatgcgga Protospacer * ..***. ******************
71. spacer 2.1|2091718|29|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012279 (Pediococcus damnosus strain TMW 2.1533 plasmid pL21533-4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
gcgggggggcgtcaacgaagtcatgcgga CRISPR spacer tagcaagggattcaacgaagtcatgcgga Protospacer * ..*** ******************
72. spacer 2.1|2091718|29|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder matches to NC_011352 (Lactobacillus paracasei plasmid plca36, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
gcgggggggcgtcaacgaagtcatgcgga CRISPR spacer tagcaagggtttcaacgaagtcatgcgga Protospacer * ..***. ******************
73. spacer 1.4|1744524|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049431 (Vibrio phage 1.097.O._10N.286.49.B3, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tttaagtaattttccaatgacaccagcatt CRISPR spacer tttaagtaattttccaattacatatccgcc Protospacer ****************** ***. *...
74. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013929 (Alteromonas mediterranea strain UM8 plasmid pAMEDUM8_300, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer ttgattgttaaacagatagtaagtgatttg Protospacer . .* .**************.****** *
75. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP013931 (Alteromonas mediterranea strain U10 plasmid pAMED10_300, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer ttgattgttaaacagatagtaagtgatttg Protospacer . .* .**************.****** *
76. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017498 (Lactococcus lactis plasmid pSK11A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer taaagaattaaagagatagtagcattatat Protospacer .*********** ********* **
77. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016709 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain UC109 plasmid pUC109C, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer taaagaattaaagagatagtagcattatat Protospacer .*********** ********* **
78. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019394 (Alteromonas mediterranea DE1 plasmid pAMDE1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer ttgattgttaaacagatagtaagtgatttg Protospacer . .* .**************.****** *
79. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008504 (Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer taaagaattaaagagatagtagcattatat Protospacer .*********** ********* **
80. spacer 1.5|1744590|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016739 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3C, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
caaagaattaaacagatagtaggtgattag CRISPR spacer taaagaattaaagagatagtagcattatat Protospacer .*********** ********* **
81. spacer 1.8|1744788|30|NZ_LR698989|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048827 (Vibrio phage vB_VchM_Kuja, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tttgcataattaatgaaatcagcgacaaca CRISPR spacer gaaaaagaattaatgaaatcagcatcaaca Protospacer . * ****************. *****
82. spacer 1.9|1744854|30|NZ_LR698989|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_002580 (Propionibacterium freudenreichii plasmid p545, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agttaatcaaagaaggcggacaaaaaggcg CRISPR spacer aaggcggcaaagaaggcggccacaaaggcg Protospacer *. . ************ ** *******
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gcttatttcattaagtaggtgatgcagatg CRISPR spacer ttttatttcattaattaggtgattttgcat Protospacer .************ ******** . *
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| DBSCAN-SWA_1 |
0 : 83709
Sequences of DBSCAN-SWA_1
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LR698989|0:83709|64171_64342_-|WP_147614540.1|DBSCAN-SWA MKVKTIVNMREDWFDDEINEFIQHKHIVDIKFSVLFDLNDDNYIFSALITYEEVGI >NZ_LR698989|0:83709|78873_79554_+|WP_087261235.1|DBSCAN-SWA MPRNKLSAFEQAARKLISANLKEYMHGMTQSELARKAGIPLTTLSGYLREKSTPNAGNLEKLALALNVKKSDIDPRYSFELDSEPTPSNSIDTSGMHYVRVPIIGTIACGKPILAEQNIEGYTHELFEEEPKKDELFALRCQGDSMEPLIPDGALVLIHKQPTVEDDEIAAVQVDDDTRATLKKVKHVGKDVFLYPINTTKYDPIILNEDNPGRILGKAIHVGFDM >NZ_LR698989|0:83709|26473_27502_-|WP_020807302.1|DBSCAN-SWA MILSFSIVLISFLLALATFVWVLTHERRSLWSGMTLVWTIITFGLLTAVSLMIAAEVFPITHQFVLLVFAVILIALMVLVFAFIAVLIVMFIYNGIKILIREGNRWTNFLSLAMGIGIIAYLFLFPVVGRLTRNNFGTYLYLFVNLTIIYLIFIMMMYTLTSWINLINFKIKKLNYIVVLGAGLIGKKVTPLLAARINRGIEIYRNNPGSKIIMSGGQGPGEEIPEAAAMAKYAEEKGISKQDIIVEDKSKTTRQNLAFSHKLMKADSRFAIVTNSYHVYRALVLAKRMGLDCIGYGAKTKWYFTLNAFVREFIAYLTITWRLQLSVVGCIGLVVLLGALLR >NZ_LR698989|0:83709|19423_20380_-|WP_020807298.1|DBSCAN-SWA 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100 | Lactobacillus_phage(71.93%) | portal,capsid,transposase,terminase,tail,protease,head,plate,integrase | attL 36300:36359|attR 83809:83875 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
257331 : 304807
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LR698989|257331:304807|DBSCAN-SWA AATGGACTCTTTACATTCTACCATGAACCAGCACGTTAAAGGAAAGCATTTATCATTTGAAGAGCGAGTTATTATTCAATTGCGTTTGAAAGATGGCTGCTCTTTGCGTGCAATTGCTCGTGAACTCAACTGTTCTCCTTCTACTATCAGTTATGAGATTAAACGTGGCACTGTAAAACTGTATCATGGTAAAGTCAAAAGATACAAGGCTACTCAAGGACATGATGTATATCAAGCTCATCGTAAAAATTGTGGGCGCAAATCAGACTTTCTCAAAAAAACTCAATTTATTCACTATGTCCACAAACATTTCTTTAAAGACGGTTGGTCGCTTGATGTTTGCAGTAATCGTGCCACTGCTGCTGGCGAATTCTCTAGCAGCGATGTTGTCTGCACCAAAACTCTTTATAATTACGTTGATAAGGGCTTATTAGGCATTTATAATTACGACTTGCCTGAGAAGCTTAAACGCAATACCAAGCTTCATCGTGTTCGCAAAAACAAGAAAAAGCTTGGCAGAAGTATTGAAGAACGTCCAAAAGAAATTAGTGAACGTAATGAATTCGGTCATTGGGAATGCGATTTGGTTCTTGGACATAAGACTAAAGATGATGAAGTGCTGTTAACCTTATCTGAGCGCATGAGTCGTGAATTCTTAATTATTCGTATTCCCGACAAGACTTCTATCAGTGTCATGCAAGCCTTTAAAGAACTCCAAAGACAATACAGTGAACACTGGAATGATATTTTTAAAACTATTACCACTGATAATGGTTCAGAATTTGCGGATCTGTCCAACCTAGAAGAAGCATCCAATACACTGGTTTACTATGCCCATCCTTACACTTCTTGTGATAAGGGAACAGTTGAAAGACACAATGGTCTTATTCGCAGATTCATTCCTAAAGGAGAAGCAATAGCTAACTATTCTTTACAAAATATCATTGATATTGAAACCTGGTGCAACTCATTGCCAAGAAAGATCTTAGCTTATCATACACCAGATGAAATCTTTGAAAGAGAATTAGATCGAATCTATCAAGCAGCTTAACCAAAAGTGTTCAATTTATTATTGCAATTTACGATAAAAATAAATTTATAATTAAAATAAGAAAAATATAATTTTATGTTGACATATTTTCAAATCGGCGTATTATTATGAGCACAAACATTATTATCAAACAGCTTTGATAAGGAAAAGTAATTAAGTGCTCGTCTCTCAGAGAATTTCTGGTTGGTGTGAAGAAATAGATAGAGTCTTAATGAAAATCACCTTTGAGCGTAAACTACGATTTAAAGTAGTTTAAGGGACAGCCCTTTATAGCGACGGCGTATCGTTCTCTTGTATTGAACCGTACGTTATTAAAGACTAGTTTTTCTAGTAAAAATAGGTGGTACAGCGACAAGACGCCCTATTGGATCATTACGATCTAATAGAGCGTCTTTTTGTTTTCTTAATCATGCTGTTATTGGATTTTTGACGAAATGAGAATTTTATATGAAGATGTCAAAGTCCAAACTGCTGTATGTAACACTAGCGAGCTCACTAGCGATTTTATCAACTGCTTGTGGTGCCAAGAAAACTATTCGAGCAACCAGCCCATCAAGTTTTCCCAGGCCGTTCCTCATAAAACCATTAAAAAAGGAGGAACCTTGACCTATGCTTTAGAAAATGAATCACCATTTACTGGAATTTTTTCAGCTGAAATTGCTGATACTAGTCCCGATTCTGAAGCAGCTGCTCCAGGAGACGAAGCACTTTTTGATATTAATGATCATTATCAATTCACCAATAAAGGAGCTGCCAGTTTAAAACTAAATCATAGTAACAATACTGCTGAAATCGAAGTGAAAAAGAAAGTTCGTTGGTCTGATGGCAAGCCAGTAACCGCTAAGGATTTGGAGTATGCATACGAAATTTTAGCTAATCCTAAAGTTCAAACTACTCAATATACCTCTTCGCTTGAAAATATTAAAGGAATGGCTGAATACCATCGGGGAAAAGCTAATAATATTTCTGGTCTTGAAATGCCAGATGGACCAAATGGAAAGAAATTAATCCTTCACTTTAAAGAATTAAAACCAGCAATGATGAACTCCGCTAATGGCTTCTTCTGGGAACACGCTGCTCCTTACCATTATTTGAAGCACGTTCCCTTTGACAAGCTTGTTTCTAGTCCGCAAGTAAGAAAGCACCCACTCTACTTTGGTCCATATAAAATGGATAAAACCGTTCAAGGACAATCTACTAGTTGGTCAAGAAATCCATATTACTGGCGCGGTAAACCTAACTTTGAACATATTTACATGTCAAATATTACTAATTCTAATGTCTCACAAGCAATTAAGAGCGAAAAATTCGACGTTGCAAATGTTCTAAGCTCACAATGGGAACAGGTAAAAAACACTAAGGGAGTTAATTTTGTTGGTAAAAAAACACTTAGCTACGATTACTTAGCCTTTAAAGTTGGAAAATGGGATGCAAAACTTGGTAAAAATGTTGAAAATCCTCATGCTAAGATGAATAATCCCGCTTTACGAAAAGCAATGGCCTATGCAATGAATGTTGATGTCATTAATAAACGGTTCTACCGTGGTTTAGAATTCAGAATTAATTCTTTGATTCCCTCACAATTTACTCCATATTATGACAAAAATATTCCAACCTATTCTTATAATCTAGATAAAGCCAATAAATTACTAGATAAAGCTGGCTATAAAAAAGCACCTGGCGCACTCTATCGGAGTCAACCAAATGGTAAGCCCTTAGTTATCAATCTAGCAGTACGTGGTTCTGGCGAAAACAGCGAGGCCATCTGGCGTAACTACATTCAACAATGGAAAAAAGCCGGTTTAAACGTTAAATTCTTAGGCGGCCGTCCGATGGAATTTAACCGCTGGGTAGCTGCAGTTAAAGCAAGTGATCCTAAAATTGATGTTCTTGAAGGAGCTTGGGGTGCAGCAGGTGATCCTTCTCCAAGCGTGTTCTACGGTGAAAAGATGCCTTATAATTTTGCCCGTTTTGTCTCTCCGACTAATACTAAATTATTGAATGAAATCGATTCTGCCAAATCTTTTGATAAAAAATATCGGGTGCAAAAATTCCACGAATGGCAAAGATGGATGTACAACAAAGCTTATGTAGTCCCAACTAGCGGTGCTTACTCAGTGACGGCAGTTAATAGCAAAGTAACTGGCTGGTCACTGAAACCTTCTGCCAACGTTTGGTATGAAGCTGGTTTTAGTAAATAAATATTATTAATATACTTATAAAAATAAAAACAATATCGACTTGTCCTAAAAAAGGAAGCATAACTTACTTGTTGGTGCTTCCTTTTTATTCATCAATTTTTACATAGCGACCACGTTCATCAACAACACCCTTGAAATGATACATTTTACCATCGTCAGTTCGTAATTCACCTAGGTCAATTTCACCATATCCTTTATCAGGATTGGTAATTTTTACATCATTAAAAGTATGTTCAAAAAAGGTACGTACAATTTTACTCTTTACCCTAATATCTTTTGAACGCTCAAAAGCTGCTGCTAATGTAAATCCCTTATCAAGTTGTTCTTTAATAAAAACAATTAAGTAAAGCGTCGATAAATTATATCTTCTAACACCGCTATTATCATCAGAAACAGGCTTAATATAGCCCTTTTCTTCCCAATAGCGTAATTGTCTTTGAGATACACCAACTACTTTGCTAACTTCTCCAATTCCTACTTCAATATTTTGAAAAACATTATGAAGTATCTTTTTTGATTCCATTATAAATTCCTTACCTCGTAATCTTATTTATAGTTTAATAGCTTATGTTAATTTTGACAACATATATGTTAAATATCATGACTTTTATGTAAGATAATTTGACAAGGGAATTATTTAAGAATATAGTTTTTATAGTTTGTAAGATTTTTTAACAATAGAAAGGAAAATTCAAATGGATCATCAACCAACCGATATTCACGGAAAAGCCTATAATCGAAACTTGCTTGTTCTAGTTTTAATTATTGGATCTTTCTGTACTGTGTTAAATGGAACCTTGCTTGCAACAGCTCTTCCCTCAATTATGCGTTCCTTTCATATCAGTACAGCAACTGCTGAATGGCTTTCAACTGCATTTTTATTAGTTAATGGAGTCATGATTCCAGTTTCAGCTTGGCTAATTAATCGTTTTGGCTCAAGAAAAATGTATTTGACAGCAATGTCAGTTTTCTTTATTGGAACAGTGACTGCTGCAGTTGCGCCAAATTTTGGGACTTTATTAACTGGAAGAATTATTCAAGGACTCGGCGTGGGTGTTACTATGCCGCTTCTTCAAACCATCATGCTTTCAATCTTTCCCGCTAATAAACGCGGTGCTGCGATGGGAACAGTTGGTATTGTTATTGGTCTCGCACCAGCTATTGGTCCAACCTTATCTGGGTGGATTGTTGATAATCTTTCCTGGCGTTACTTATTCAGTATTATTGCTCCAATTGCTGGAATTGTTATTATTTTAGCGTTTTTCCTAATTAAAGACGTTCTTCCAACTAAGAAAGAAAAAATTGACGTTTGGTCAGTGACAACTTCAACTATTGGTTTTGGTAGTTTACTTTACGGCTTTTCAGAAGCTGGTAATAAAGGATGGACTAACCCTGAAATTCTAGGATTTATTGGCGTAGGAATTATATTTGTTATTCTTTTTGGCATGCGGCAATTAAAGATGGCAGATCCATTTTTAGATATTACCGTCTTCAAACATTTCGAATTTTCTCTAGCAGCTGCTTTAAGTGGTATTACCAATTTAGCAATGGTTGGTATTGAAATGGTTTTGCCATTATATATTCAAAATTTACGTGGTGTATCAGCATTTCATTCAGGATTAATGCTATTACCTGGTGCCTTGATGATCGGAATTATGTCACCAATTACGGGACGTTTATTCGATAAATATGGTGCACGAAAAATGGCAATTACTGGAATGACCCTCTTAACACTTGGCACTATTCCA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40 | unidentified_phage(27.27%) | protease,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
309352 : 370289
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LR698989|309352:370289|DBSCAN-SWA 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54 | unidentified_phage(35.71%) | bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
598911 : 650529
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LR698989|598911:650529|DBSCAN-SWA 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40 | unidentified_phage(30.77%) | transposase,holin,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
879257 : 926737
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LR698989|879257:926737|DBSCAN-SWA 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48 | Streptococcus_phage(30.77%) | integrase,transposase | attL 903353:903412|attR 925654:926847 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1695530 : 1747110
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LR698989|1695530:1747110|DBSCAN-SWA 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49 | unidentified_phage(41.67%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1790791 : 1851586
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LR698989|1790791:1851586|DBSCAN-SWA 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56 | unidentified_phage(15.79%) | protease,transposase,integrase,tRNA | attL 1790109:1790126|attR 1792431:1792448 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1877656 : 2009485
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LR698989|1877656:2009485|DBSCAN-SWA AATGGACTCTTTACATTCTACCATGAACCAGCACGTTAAAGGAAAGCATTTATCATTTGAAGAGCGAGTTATTATTCAATTGCGTTTGAAAGATGGCTGCTCTTTGCGTGCAATTGCTCGTGAACTCAACTGTTCTCCTTCTACTATCAGTTATGAGATTAAACGTGGCACTGTAAAACTGTATCATGGTAAAGTCAAAAGATACAAGGCTACTCAAGGACATGATGTATATCAAGCTCATCGTAAAAATTGTGGGCGCAAATCAGACTTTCTCAAAAAAACTCAATTTATTCACTATGTCCACAAACATTTCTTTAAAGACGGTTGGTCGCTTGATGTTTGCAGTAATCGTGCCACTGCTGCTGGCGAATTCTCTAGCAGCGATGTTGTCTGCACCAAAACTCTTTATAATTACGTTGATAAGGGCTTATTAGGCATTTATAATTACGACTTGCCTGAGAAGCTTAAACGCAATACCAAGCTTCATCGTGTTCGCAAAAACAAGAAAAAGCTTGGCAGAAGTATTGAAGAACGTCCAAAAGAAATTAGTGAACGTAATGAATTCGGTCATTGGGAATGCGATTTGGTTCTTGGACATAAGACTAAAGATGATGAAGTGCTGTTAACCTTATCTGAGCGCATGAGTCGTGAATTCTTAATTATTCGTATTCCCGACAAGACTTCTATCAGTGTCATGCAAGCCTTTAAAGAACTCCAAAGACAATACAGTGAACACTGGAATGATATTTTTAAAACTATTACCACTGATAATGGTTCAGAATTTGCGGATCTGTCCAACCTAGAAGAAGCATCCAATACACTGGTTTACTATGCCCATCCTTACACTTCTTGTGATAAGGGAACAGTTGAAAGACACAATGGTCTTATTCGCAGATTCATTCCTAAAGGAGAAGCAATAGCTAACTATTCTTTACAAAATATCATTGATATTGAAACCTGGTGCAACTCATTGCCAAGAAAGATCTTAGCTTATCATACACCAGATGAAATCTTTGAAAGAGAATTAGATCGAATCTATCAAGCAGCTTAACCAAAAGTGTTCAATTTATTATTGCAATTTACGATAAGAAAATAAATTAAAATACCCGCAATAACAATTGATAGATAAAAATTATTATGACCAGGTTTACTATGATTATGCTTTATCTCTTTTTACCTTTTATTTTGAATGTTTCATAATAATTTTAAGAAATATTCAACTTAGTATCTAGCATATCCGAACTAACATGATCTAATTAAAAGCTTACTGGATTTAGATAAAAGAAATGTATCATGAACAAAAAAGTTTCGCATCCAGTAATTTATGAGTTCTTATAGCTAACAACTTAACAACTATTAATCAAGAACCATTTTAAAAGGCGTAGAATCGTCATCTCAACACTAAAGAAATAATCTAATCTGATTAATTGATAAAAATCTTTAGCTTAGTATTTTCAGCTGATTAATAAATGAAATAGAGGCTAAGAAAATTTCTGACTGTAAAAAGATTAATGTATTCTAATTGAAATGCTAGTAGATTTAAAAATGATTTTTAAAAAGTAACTTTTGATAAATAGTAGATAATTAGTTGATTGATGGTTGGGCTGTTGATTGTGATTAATTACAAATATGATATATTTTTATGTTCTACTTTACATAATATATATTACGCGAAGTATAGTCAAGATGAACTAAGCTACTCTCTTTTATAAGTAAAAAAAACTTTGAGTTTTATCATTCTCAAAGTTTCTCTATTAATTATTCATTTTTAGAAAAAGATAGTTTTTTTCTTTTATTTAAAGAGATCGTATAAACGATATTAATTGCTCCTAAAAGTAAAACAGCAAACCAAATAGTTTTTAAAACAAAGATCTTTTGGAGCAATGCTGATACAATTGCACCAAGTGCAAATGCAATAACCAAGAACATATAGTTAACAGCTGCGTTATGTTGTGACTTATCTTCACCAAAGAAATATGCGCTCCAAGCAACTACAGATTTTTTTAAGTTGCCAGTTGTAAATGCATTATTATATCCCATACCTTCAATTTTACTAAATGATGCATTCTGAACCGCTAAACCAAACGCAATTACCGGAACTACATAATAATTTGGTACGTTTTTAGGAACGAAACCAACGCCCAAGCAAATAAATAGAATTGGAAATAAACAAAATACACGCCAATAATTACTTTTTACATACTTATGAAAAAGTCCAACAAGTAGTAATCCTAAGGTAAAAGCAATAAACGTTGTTGCCCTGTTTAACATACCTGCAATATTATGGTCAGCAAATGCTGACGCAAAGAAGATGACGTTCCCTGTCTGTCCAGCAGATAAAGTATGTCCCCGTTGAATATAAGTGTAAGCATCAATAAATCCCGCAGAAAAAGTCAATGCAGTAGCTAAAATACGCGATTCAGATGGACGATATTTTTCATCTGAAAATATACCCACGATTAACCTCCAAGTTATAGTGAAAACAAATTAAAAACATGATCAATTTAGACCATGTTTAATTTGTTTAATCTTCAATATGAATACTCTTAATAATCACATCTTCTTTTGGCTTATCATTTGCTTTGTCACGTGGAACCTTTGCAATTTCATCAACAACATCCATACCTTTGATCACTTGACCAAAAACAGTATGGCGACCATCAAGCCATGGTGTTCCACCTTGCTTGTATGCCTTAACTAATTCTTTAGGATAACCTGCAGCATCCATTTCTTTAATCATGCGTTTAGGTACGTTTTTATTTTGAACAATAAAGAATTGGCTGCCATTTGTATTAGGCCCAGAATTAGCCATGGAAAGCGCACCACGTACATTGAATAATTTGTTTGAAAATTCATCTTCAAAAGGATGTCCCCAAATACTTTCACCACCAGTACCGTCACCCTTTGGATCACCGCCCTGGATCATGAAATCACTAATTACTCGATGAAAAGTAGTGCCATCATAATAGCCTTTTTTAGCTAAACGGACAAAATTTTCAACAGTCATTGGAGCTTCTTTTTCAAATAATTGAATTTTAATATCTCCATGATTTGTTTGAATTAAGGCTTTTGGACCTTTTGCATTTTCTAGGTCTAATTGTGGATATTCCATGTTAATCCTCCTGAATTTTATACTATTCTAATTTATTTTACACTTTATTTAACTACACTTCATTAGTCTGCGTCTTCTTTCAAGTAATTTTTGATTGCAGCTAGCATAATTTGACCATAGGATTTAAGCTTAGCTTGACCTACTCCTGAAATATTTAAAAATTCTGCTTTTGTCTTAGGTTTTTGCAGTGCCATTTCTCTTAAAGACTTATCTGAAAAGATATAAAAAGCTGGTATCCCCTGTTTTTTAGCTAAATCTAAACGAACTTCTTTTAAGCGAACAAATAAGTCATTCTCTTCTTTCGGAATTTGATTATAGGTTTGACTTAATTTTTCTATTTTTTTAGAAATCTTTTGAGTTACACGCTTTTTATTATCTAAAACGTCCCATCCTAAGTTAGTCACATGAACTACTGGATATTGACTATCAGTCAGTTGTAAATAATTATGGCTAATTAGATAGTTTATTAAGTTTATGACCCTACTCTTTCCAATCTTTAAACTGCCATAATGCCTTAAATGAGCTGCATCAATTTCTCTCATGCGTTGATTATTTGCTCCTGAAACTACATCAGCAACTACAGTCTTGCCAAAACGACCATCCAATTCATAAATAGTTGCAATAATGCTTTTACTTTCTGACGTAATGTCTTTTTCAATAAAGCTTCCTAAACAATTAGAACACTTACCACAGGGATCACACCTTTGTCCAAAATAACTGACAATAAACTGTTGTAAACACTCTGTGGTATTAACATATTTAGTAATCATAGCTAGTTTTTGATACTGTATTTTTTGATATTCATCAGCTAAATCAGATTGTTCAATAAACCAACGATAGAGCCGGATATCTTTAGGATGATAGATCAGGATACCCTCGCAACGCTCACCGTCTCTACCTGCTCTGCCAGCTTCTTGATAATACGATTCTAAGTTTGGCGTACTGTTAGCATGAATTACAAAGCGCACATTTCTTTTGTCAATCCCCATTCCAAAAGCATTAGTAGCAACTATCACTTGTACTTTATCGAATTGAAAAGCATCTTGTACATCTGATCTCTCTTCATTAGAAAGACCAGCATGGTAACTAGCTGTTAGAATACCATTTTGAGCTAAATAGTCAGTTAATTCTTCAACATGTTTTCTTGTACTGGCATATATAATTCCAGATTCATTAGGGTGCTTTTTAATATAGTCTAAAAGATACAAGTTAGTATTTTTAGGATTATCCACTACCTTGAAACTTAGATTTGGCCTTGCAAATGAAGTAATAACATAATTTTTATTAGGTATCTGCAATTGTTCTGCTATGTCTTTTTGAACTGAGGGTGTGGCAGTTGCAGTTAAGGCCAAAATATTCGGATTACTCTTAATTGATTTGACGCCATCCATTATTTGGCGATACGCTGGTCGAAAATCATGTCCCCACTGTGAAATACAATGTGCTTCATCGACTGCTACTAATGAAATATCTAAGAAGTTTAGCTGATAGCGAAAATAATCCATTGCTAATCGCTCAGGAGTCACATACAGAAGCTTTATTTTGCCTTCATATGCTTGTCTTAAAATTGGATTTACTTCTTCTTGAGGAGTCGCCGAATTTAGGGCTGCCGCATTAATACCATTTTGCTTTAAGGAATCAATTTGGTCTTTCATTAGCGAAATTAAGGGAGAAATTACTAAAGTCAAACCGGTATTAACTAAGGCGGGAATTTGATAGCACATTGATTTTCCTGCACCAGTTGGCATTACTGCTAGAACATTTTCTCCTTTAAGAACTAAATCAATAACTTTTTCTTGTCCTGGGCGAAATGTTGTGTAGCCAAATACATCTTTTAATACTTGTAATGATTTCATTTTTCCTAATTAAATAAAAAAACAAGTATGAA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147 | Lactobacillus_phage(52.11%) | portal,holin,transposase,terminase,tail,protease,head,capsid,integrase | attL 1978573:1978589|attR 2001905:2001921 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2017345 : 2084477
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LR698989|2017345:2084477|DBSCAN-SWA 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39 | unidentified_phage(33.33%) | holin,transposase,protease,tRNA,integrase | attL 2016214:2016228|attR 2022875:2022889 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
2111044 : 2118874
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_LR698989|2111044:2118874|DBSCAN-SWA ACTAAATCATACATTTCTGGCATTCTGCACCATTTTGAATTAAACATTCGTCTGCAGTCAAGTTCTCACTACCAGCTAAAACTTTTTCTCTTATTCTAACATAATAAATTGAGTTGCATCGCTTTTTAAAGGCATAAATATAAGCCTTATTTAAATCTCTTGTTGTTGCATTATCTTCAACAAATAAAGTTAACGAAATTGATTGATCAACATACTTTTGTGCAGCAGCTGTAATATCAATAATAGCATTAGGTCCTACTTCATATGCACCCTTTTCGTAATACTCATAATTGTCTTTATTAATCTTATAAGCTGGTACATAAATTCGACCCAAATCAGCCTCTTTGCGTGTTTCAACAGGAGCTACTACTGGCTGCAAACTTGGTGTACATGAAGATAAATAACTAATTGATCCAGTAGGTGCAACTGCTAACAAGTTAGCATTAGCTATACCTGTCTTTTTAATTTTAGTAATCAATTCTTCCCAATCTTCTTTAGTTGGAATAACTAATTTATATTTAGCTACAATTTCTTTAATCTTGTCTGTTTTCGGTGAAACTTCCTCATCAATAAATTTTTTGAAATAATCACCACTAGCATATGATGAATCTTTGAATCCTTTAAAAGCACCATACTTTTCAGCTAATTTATTTGATTCTTTAAATGCATGGTATGTAATTGTATAAAAGAAAATTCCTGTAAATTCAACTGCTTCTGGTGAATCATAATAAATATGATTAGTTGCTAAAAAGCCATGTAAATTCATTGCTCCTAGACCGATTGCTCGATTAGCTTTATTTCCCTTTTCAATTGAAGGAGCACAATCTAAATCTGAAGACCTGGCAACACGATTAAGCGCTTGAACACTATCAGAAACCAAACCACCTAACTTGTCAGCGCTATTCATTGCTGCTGCAATATTAAGTGATCCTAAATTACAACAAACATCGTAGCCCGTCTTATTAAAACTTAAGTCTTCATTATAGGTACTTGGCGTATTAACCTGAGCAATTTCTGAACATAAATTAGACATCACGATCCGCCCCAATTTCTTTTGTGGGTTTCTTCGATTGACAGTATCTTCATACATAATATAAGGATACCCTGATTCAAATTGAACTTCAGCAATAGTTTGGAAGAATTTTCTAGCACTGATAAATGTCTTTTTAATACATGGATTATTAAGGAGATTTTGGTATTCTTTAGTAATTGAAATATCTGACATTGGTTTACCATATTCACGTTTAATATCATATGGTGAAAACAAAGCCATCTTTTTATTTTCTTTGGCTAGTTCAAAAGTAATATCTGGAATCACTACGCCAAGTGATAAAGATTTAATTCTTACCTTTTCGTCAGCGTTTTCTCGTTTAGTATCTAAAAATTGCATAATCTGAGGATGATGGGCACTTAAATAAACTGCACCGGCACCTTGTCTTTGCCCTAATTGATTGGCATAAGAAAATGAATCTTCTAGTAATTTCATTACAGGAATTATCCCACTAGATAAATTCTTCATTTTTTTAATAGGTGCACCTAATTCACGCAAATTAGTTAAGCATAGAGCAACACCACCACCACGTTTAGATAATTGCAGACTTGTGCTTATTGCTCGTGAAATTGATTCCATATTGTCTTCAACTCTGAGCAAATAACATGAAATATATTCACCGCGTCTCTTCTTACCTGCATTCAAGAAAGTCGGAGTTGCTGGCTGGAAACGATTACTAATAATATCTTTAACTAAATTCAAGGCCAGTTCCTCATTGCCATCAGCTAAAAATAAAGCATTCATAACAGCCCGATCTTCAAAACGTTCTAAAAATTGTTTATTATCGTTTGTTTTTAAGGCATATGCTTTATAGAATTTAGCTGCACCCATAAAGTTCAAAAAGCTAAAATTTTGTGCATAAGCTAATTTGAAAATTTCTTTAATAAATTTAGCTGTATATAAATCTAGAACTTTTTTATCATAGTAATTATTATCAACTAAATAAGCTAATTTTTCTTCTAAAGAAGCAAACTTTTTCATTCTTGGTTCAATATGATTTTCAAGATATTGCTTAGTAGCTTCCTTGTCAGCTTTAAAATTATAATTTCCTTTTTCATCTTTAAATTTAGCAAGTGCATTTAAAGAAATATATGAATCATTATTAAGATTATCAGTCATTGTCTTCACCTGCATCAGCAATTATTTTATTAACATTATTTACATCTTCAGTTGTTCCCAGTAACTCAAATTTATATAGATAAGGAACATGTAATTTCTTAGAAATTACATCCCCTGCCAAGGCAAAAGAATTACCAAAATTGGTATTTCCACTAGCAATAACACCAATACATTTTTGCCGATTAGCCAATTTGTTCAAAAAGTGGATAACTTGCTCAGGCACAGCACCTGTAGTCCCATGGCCACCAGAATAAGTTGGCGTAATTAAAATATATTCTTCAGAAACTGAAATTTCTTTACTGAGTTTAATAGGAATCCTAATAGAATTACAATCTAACTTTTCTACAAAGCGTGCTGTATTATTTGAAGTGGAAGAATAATAGACAACTAATGGCTTTTTAGAAATCCCAGTCATCATCTTTAGTCTCCTCTCCTGTTCCCATTACATATGAAGAACCATTACCAGAAAAGAAATCATGGTTTTCATCAGCTTGAGCTGATAATTGAGCGAATACTTCTGGGGAAATATAAGTTTCTTCTGCGGTAAAAGGAGAATCATAGCCTAAATTTTGTAAAAATTTACCTGCATTATACAAACTGAAATGAATTGCATCATCAACCAAATCAAAATCATCATAAAGCTCGTGCAAATATTTCTTTTCCAAATCAATTAGTTTATCTAAGAAATCAAAAACGAATTTTTTCATTTCTGCTTGTTTAGCTGGAGCTAATTTCTTTACGGCCAATTGATATTTGTAACCACTATAATAATTGTGAATAACCTTATCTCTTAAGATCAATCTAATAATATCAGCAGTATTAGGCAATTTACCTCTTGCAGCTAAATAAAATGGTAAATAAAAACCACCATAGAGCAGGAACCCTGGCATAATTGCTGCGGCAACCTTTGATTTAAGCGGATCATTGCCTGTATAATACGGAATTACCGCTTTAGCTCTTGCTTGTAAAGCATCATTATTAACTACCCATTCATGCGCTTCTTCAATTTGTTCACTAGTACATAAAGTAGAAAAAATAGTTCCATATGATCTTGCATGGACAGCAACCATAAAAGCAAAATTTGCATAGATAGCTTGCTCTATATCAGTTTGTGAATTTTTAATTTGGGCTACATCACCCACACTTGATTGAGTTGTATCTAATAAAGTCAATCCAGTGAAAGTGCGAGTTATAAGCTGTTGCCAGTCATCAGATAATTGATTCCAAGAACTTATATCATTCGAAACTGGGATTTTTTCAGGTAACCAAAAGTTTTGAGTAACTCTGTTCCAAACCTCAAGATCCTTATCATCTTTAATGTCATTCCAGTTAATAGCTCGCATATTTTTGCCGTTGTTATTGTAAGCAAATTCAACTGGTGACTGTGAATGATCATAATAACTCATATTTGCTCCTATCATTATTTATTGTTTTATCTAATATTTGTGTGAACATAATATAGCATCTTCTGCTCAATAATACAACATGTGGATTTTTTGGTTATTTATAATCAATATATTGTGGCTAAGCCGTTTTGATAATACAAAATTATTTTCAAATTTATTTTATCTTCCAAAAATAATGTAGGTGTTGTTTTTTGCTTTTTTGACAAAAAAATCTCTAATAACTATTTTTATTGTTATTAGAGATTATTTATTCTAAATATTTTTTTAATGAAATCTCATTCCACCATCAACTTGAAGTGATTGTCCAGTAACATACCCAGCATCTGATGAAGCAAACCAAGCCACAACTTCAGCTACATCGCTAGGTTTTGCTTCACGACCAAGCGCTATCTCTTTGAGACAATTTGCTTGTTGCTGCGTTATTGTTTCATGTTTAATTTTTGCAATTTTTTATCAATTGCATCTCGCATTTTTGTGCGAACAATTCCTGGATTATAAGCATTAACAGTAATTTTATCTACTGCCAATTCTTTGGCCGCAGCTTGAAGCGTCGCCATGAAATTCATGTCGGCATTCAACACGGAGCACTAACAGCAGAGGTTGCCGGGGGAAGCTATTTAGCTAAATTAGATCGGATGTTAAACCACATAAAATATTAAGAAATTAAGGTCAGACTAATGGTTTTTGGACTACCGCAAAAATATTGACACTTACCCACATCGTGATCGCTTGTATTCGGCATCTGTTTGTGCTAATTCAGCCTGATAAGGTTGACATCGAGATAATTCATAAGAAATTGTTGACGGTGATCGGTTCAGCCGAACGCCCATTTGGATATTGGACAGCCCTAGTTCACAAAAGGTTTCGATTTTAATTCGTTCGAAATAGGTTATACTAGACAAAAGATCAGCTCCTAAAAGATGGGTTTGTGGTAAACACATTTTAAAGGAAGCTGATCTTTTTTGTCCGAACAGCGTTCGGATTAATTTTACAATCTGCCTGAAATTAAAGTAAAACATTTATAAAAAAAGCCAATTACTACAGTAATTGACCAGCCAATAACAACCATGGATTCATTTAAAAGATTGTTAAAAAGTTTAACATTAATCATTTTTTCTTAAATAAAATAAAAAAGTGGGTAAATGAAAAATGATCATGATGTATACACAGTCAGGGTGTCATTCTTGTATGACATCTCGTCGATAGTTTAATAAACACGGAATCAGATTCCAAGAAAAAAACTTTAGTAAACAACCTCCAAAACTATAAGTAAAGAAAATAGGGTCCCTATTTTCTTTTAATACCGTATTTCACACGGTATCGAATAAAGGTCGTCCGTTTAATCCCGGTATTTCGAGCCACATCAATGTCACTCATGCCTGCCTGATAAAGTTTAAAAGCGTGTTGTAAGCGGGGATCGTCTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_LR698989|2111044:2118874|2115906_2116494_-|WP_020807721.1|DBSCAN-SWA MAKIGYARVSSKEQHLDRQLAALKDVDKLFTDKLSGANTNRPELQKMLAYIREGDIVLVTELDRLGRNNQDLTKIMNTIQNKGATLDVLNLPSMTGIADPNLRQLMTNLIIELYKYQAESERKRIIERQQQGITLAKRQGKYHGRKPQYTQDDPRLQHAFKLYQAGMSDIDVARNTGIKRTTFIRYRVKYGIKRK >NZ_LR698989|2111044:2118874|2111044_2113213_-|WP_020807716.1|DBSCAN-SWA MTDNLNNDSYISLNALAKFKDEKGNYNFKADKEATKQYLENHIEPRMKKFASLEEKLAYLVDNNYYDKKVLDLYTAKFIKEIFKLAYAQNFSFLNFMGAAKFYKAYALKTNDNKQFLERFEDRAVMNALFLADGNEELALNLVKDIISNRFQPATPTFLNAGKKRRGEYISCYLLRVEDNMESISRAISTSLQLSKRGGGVALCLTNLRELGAPIKKMKNLSSGIIPVMKLLEDSFSYANQLGQRQGAGAVYLSAHHPQIMQFLDTKRENADEKVRIKSLSLGVVIPDITFELAKENKKMALFSPYDIKREYGKPMSDISITKEYQNLLNNPCIKKTFISARKFFQTIAEVQFESGYPYIMYEDTVNRRNPQKKLGRIVMSNLCSEIAQVNTPSTYNEDLSFNKTGYDVCCNLGSLNIAAAMNSADKLGGLVSDSVQALNRVARSSDLDCAPSIEKGNKANRAIGLGAMNLHGFLATNHIYYDSPEAVEFTGIFFYTITYHAFKESNKLAEKYGAFKGFKDSSYASGDYFKKFIDEEVSPKTDKIKEIVAKYKLVIPTKEDWEELITKIKKTGIANANLLAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVAPVETRKEADLGRIYVPAYKINKDNYEYYEKGAYEVGPNAIIDITAAAQKYVDQSISLTLFVEDNATTRDLNKAYIYAFKKRCNSIYYVRIREKVLAGSENLTADECLIQNGAECQKCMI >NZ_LR698989|2111044:2118874|2118031_2118874_-|WP_047036257.1|DBSCAN-SWA MDNRQQIHLENLSLRYRGIETSALKHISVDAEFGHVIGIIGNHHAGKTSLCRALAGIVPTIISGDVTGTIQVGSLSPNLDWQKYNQQTGVVLQNPAGQLSGLADTVADEIAFDLINQGVPADQIKRRVFNVADQLGLGDQLNQSPGTLSGGQKQRLAIATAIVTDPSILVLDDPTSEMDPLGRQHFFSWLVSVEKKTIFIVSNEVDDLCEIADQIWVLKAGELVAAGKPLTVFNHLKPDWQLAEPTVFRLAKLMKWSIPGAADEFPVTNQQLKEAYYAAN >NZ_LR698989|2111044:2118874|2113205_2113631_-|WP_003648207.1|DBSCAN-SWA MMTGISKKPLVVYYSSTSNNTARFVEKLDCNSIRIPIKLSKEISVSEEYILITPTYSGGHGTTGAVPEQVIHFLNKLANRQKCIGVIASGNTNFGNSFALAGDVISKKLHVPYLYKFELLGTTEDVNNVNKIIADAGEDND >NZ_LR698989|2111044:2118874|2113611_2114619_-|WP_020807718.1|DBSCAN-SWA MSYYDHSQSPVEFAYNNNGKNMRAINWNDIKDDKDLEVWNRVTQNFWLPEKIPVSNDISSWNQLSDDWQQLITRTFTGLTLLDTTQSSVGDVAQIKNSQTDIEQAIYANFAFMVAVHARSYGTIFSTLCTSEQIEEAHEWVVNNDALQARAKAVIPYYTGNDPLKSKVAAAIMPGFLLYGGFYLPFYLAARGKLPNTADIIRLILRDKVIHNYYSGYKYQLAVKKLAPAKQAEMKKFVFDFLDKLIDLEKKYLHELYDDFDLVDDAIHFSLYNAGKFLQNLGYDSPFTAEETYISPEVFAQLSAQADENHDFFSGNGSSYVMGTGEETKDDDWDF >NZ_LR698989|2111044:2118874|2117229_2118045_-|WP_065169814.1|DBSCAN-SWA MPQIEISGLRYTYPEHSFQVEIDRQSFDSPLTAIVGQNGAGKSTLLKLLIGLITPQEGAIMINGVSIDELKPQAKLKQIGVTFQDPDDQLFNATVQKEVVWGLSQIESDQLMIKKAVDQALIAVGLADKAAENPYDLSLSERKLLTFATVLAINPAIYLFDEPMMSLDWPSRKRMTNIFHQLVKSGHQVITITHDMDWVAAEFSTVHVMAHGQIAFSGTPSALFGNSGLVKRVGLLPPRIMTITSALGDHSVYLTPEDYCRKHKQVANNLN |
6 | Lactococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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