Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LR699118 | Aquicella lusitana strain SGT-39 plasmid 5 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_LR699117 | Aquicella lusitana strain SGT-39 plasmid 4 | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_LR699115 | Aquicella lusitana strain SGT-39 chromosome 2 | 0 crisprs | RT,csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_LR699114 | Aquicella lusitana strain SGT-39 chromosome 1 | 0 crisprs | cas3,DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
NZ_LR699116 | Aquicella lusitana strain SGT-39 plasmid 3 | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
38777 : 67896
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LR699117|38777:67896|DBSCAN-SWA GTTAAGTCATTTTCAATTTTAATTTTTGCATATCATGATGCCTTTCCTTATCTATAGCATGAACGTAACGACGGGTTGTTTCATCACTTTCATGACGGTGATTAGCGCGGATATGCTTAAATTTAATGCCGGCACGATCTTGCATTGATGCTGATAGATGCCGTAACCAGTGTGCGGAAAACTTTTTTAATTTCGTTATTTTTTCTGCGTTACCCTCAAATTTTTTGGCAGTTTCATGCGCTAGTTTTTTAAGAATCTTGTTAATCTGTCGTGGTGTGATTGGCTCATTATTGACAAGTGAGGTAATGAGCGGTTCTGTTTCATTTTGATTAGGGAACGGAGATTTTTTTAAAAACGTTCGATAATGAATAATTGCACGCAACATATCATCGCACACAGGGATGATGCCTTCTTTGTCTCCTTTTCCAATGACATAAAACCACCAATCATTGTCAATTTTTCTAAATGAGCTCCATGTATGCGTTGTCAATTCCGCATTTCTTAACCCTAAAAAATATAAAATATTAATTAAAAATCGTAGCCGTTCTTTTTCTTTCTTATGAGAATATTCTTTTTCGGGCAACTCTTCCAAGGTATCTAACATTGCATACCATTCCTCAAGTTCCAGCATACGCTCTTGTAATAAAATTGATCTTGGGCGAGAGAATCGGGATAGATTCCTTTTCCGCATAAGTGATAAGGGATTAAAGGCGAGATAACGTGCATCAACCAGATAATTTAACAGTGAATCAATACAGCTTATCGCAACCTGTTTAGCTGAGAAACTTAAGCCACTCACGAAGGGACGCCAGCCTGGTTCACCCCTTTTTCTACCTCCCCCGTGGCTACGCGTGCACCAGACATTTCTGGGTTCAGGGCTATCTAAGAATGAGAGATATGCCTCAAAATCATCGCGATCTAAACCAGACAAGGGTTTTTTGCTCTGGTATATAGCCCATAAAAGTAATCGCTCAGCTTCTTTCTGGTAAGTGCGGTAAGTGGTGGCTTTATGACGGTATTCATTCAGCCAACATTGTATTGCTTCATAATCATTTTTTGCATGGATTTGGCAACGCTCCTGTTTTTCCCGATTGCATCCATTTGCACCATTGAGATTCAGGGAATGTAAGACAACTGGTAATTCCACTAAAGTGGGAAAATGATCCATTGAATCGTTCACTTCCGTGTTATTTATTGTCTGCATCCAATATTCCTATTTTTTTATTAAAGTCATCCAGAATGGATTTTGTTTCTCTGGATGTTTTAAAAAACTCCTGAAACTTGTCACTAGCCTCGGAAAAATAGCTGAGGGTTGATAGCGTCAAATCAATCTTTGGAATTTCTTTTACTTCAGACAAAATAAAACTCGTCATTTCATTATTTTTTTCAAGAAAATTCCAGTAATTTTTTTGTGGAATTATTTGTTCTGCAAGTTGATCACGTTCTTTTGTAATTGCTGTTAATTCGGTTTTTATTTTTACTAGCTCTATCTCTTTCTCTTTTATTTTAGCCTTGGCATCATCCAAATCTTTATTTAATTGTTGATTCTTCGTTTTTAATGAATCAACTTCAACGATAAAGTTCTGGCGTTGGATTTCATTATGATTTTTTAATTCAGAAATTAATTTTTGATTCGCATCATTTTGTATCTGTGATTTTTCAAGAACATAATTCATTTCCTTTTTGTGGGCTTGTGACAGGTCATCCTGATGTTGGACGGTGATGCGCTGAAAATCAGTGTACCGTTCATCCAATCCTCTATAGCGCTCTTGTAATAGAACATGTTCTTCCTGAAGCTTTCTATAATCTAACACCAGAATTTCCTTACTACCTTGTAATTGGTGAAATTGATCCTTCAAGATAACCAATTCACTTTGCATCTCTTCAATTTTTTGGGCAGCCAAATTTTCCTTTGTTTGAGCTTCAGTTATCAGCTGATTTGATTCTTCTCTGATCTTGTTAATTTCAGCATCTGTTTCCTCACGTAATTGTTGCCAGACGCGCTGTACGGCTGTTTGCACAGGATCAGATGGAGACGAAACACTAGTGCCAATTGCATAATGCCGCCATTCATTGAGATACTTGGAAATCGTGGTATTGCTACCCGTGCCACCCAATAAATTGCGGATGCGTTCAATCGTTGGAATTTCACCTTGTGAACGTAATTCGTCCGCAGCCTGAGCGACATCTTCATATGAAATACCCCTTCGGATCATGTTACTTCTCCCCTGTTAATGTCGGTTGATTTAAATCCACAGATTCTGATCCGATGAGATTTACAAATGCAGAACATGTGACCAACATAAAACGCGCCCATGCGGGATTGATTGGTTGGCTCTTATCGGTAAGTGCGTGACGGATTCCCTCTTCACCGGATGTGTAGTTATAAAGATTGAGCAGTGCCTGCCTAGCTTGAGGATGGTTTGGAAGAATCTTGGATTTCTGACATAACTCCGAAAGAGTTGCATTCTTGTTTCCAGTAACTTTTTTTGCTTTTGCCTCTACCGCTGAAATGGATTGCGCAATACTTTCGCGCGACTGATCATTTTTCTTGTTTGCCAACATTGTCAACGCACTACTAATATGCGTTGCCGCTTCATCCTCATTTATCAGACTTTCTTCAATACTTTTTATTTCCAGCCCTGAGGTGATTGGAGCAAGTACATCATTGATAAAGCGATAAGCCGAATTTTCCCGCTTTAGAACATAATTACAACCCTCGATAAATGCTGCCTTTCGCTTGTCACCAAACATGCTTAACAAGCCAGCAATAAATTCAAGAAACGAATAAACCTCATACCAAGGTAGGTTGTAATACTTATCTCTGATCATTTCTTTCTTATAGATCGGATATATTACCCGATCTATCATGTGAACGGGTTGTTTAAAGAAATCCCGCCAGCAAACTTCCATCACCGTTCTAAACGTCCCTTGCTCGCTATAGTATTCTTTAGATAATTCTTCAATTTCCTTAAAAAAATCGTCCAATTCATTCCATATGGAATGGCGTAAATCATCATCCATTATCGTCAGCTGCAGAGGTTTCTCCATTGCAAATCCATGACGTGTTGCAAAACTCATTCTCATTTCTCCGTTGACGAATATACCTTGCTCTCTATAATATGGTTAAATGTTTTTACATTCAACATCGTTTTACACATGATATTATTTAATGATGACCGATAATCACCATTATCAGAACTACTAAATCATTGACCCAAAATCGTGAGTGTCATTTCTAAAAAAAATATTCAGCGCGACAAAATAGAATTAGGCTATGGAAGCATTTGAGCTACTACATTTGGGTTGATAGGCACCTACTCGATAGTTCTTAATATCAACATTTATCGAATAGCTGGCCCGATTCCACCCATACCGCTTGTATCTAGAGCAATTTTGTTTTTCCTAATGGCCCAACCTCCTTTTGAACAAAAATTTATGAAAAAGTTTAAATTTGATTTATAAATGATGATTTATTCATGCTCCTTTTCAACAGTACTTTTTTTATTTGTAGATATCTTGAGATTAAGTTGGACTTCCGAAAAGGGCACAACCTTATTTCTGCCGGTGTTTTTAGCAACGTATAAAGCTTTATCGGCGGCTTCGATTAATTCTGAACCGGTTTTTCCATCTTGTGGATATTCAGATATGCCAATTGAGACGGTAATTTCGCCCGTATCTTGTGCACCGAATTTAACATGTAGCAATGAAACGGATTTGCGGATATTATCCGCACGCTTGATGGCCGTTTGCGCCTCAGTATCGTAAAGCACAATGATAAATTCTTCTCCGCCATATCGTGCTGCTAAGTCACCAGGACGTATCTCATTTATTAATAACTGAGATAGTTGCTTTAGAACCAAATCACCTGCATCATGGCCGTGTACATCATTAATTCTCTTAAAATGATCAAGATCTAACATTAAAACAGAAAGTGGTTGTTTTGTGCGTTCTGATTGATGAATTTGTTTTATAAGGAATTCTTCTAAATATCTCCGATTGTATAGAGAAGTTAAAGGATCACGAACGGATTGAAAACTCAAATTTTCCCGCAATCTCACGTTAGCTAAGGCAAGCGCTGCTAATTCTGCAAAAGCATTAACAAGCAATCGTTCATTGCTTGTTAGTTGTTGTTCGCCTTCTTTTTTAGCTACTTCAACATAGAGTAAACCATAAATATCATTTTGTGCGCGCAATGGCACACAAAGATAGGATATTTCTTCAGTAACATTATTGATTATATGATCACAAGTTAATTCTGTCTCTGAAAAACCTGCGTGATGAATATGACCTAATCGTAATGCCCAACATTGATCTTGAGTAAAATTGCTAGTATTTGAGATTGGCGATCCCCAGCTGGCACTCGCTTCAAGAAAATCTTTTGATGGATGCATAATATAAAATACACCTTTGGAAAAACTAAGCACTTTGCCACAATATTTAGCAGTGATTTCGCTTAATTCATTTATCGAGTTACAAGCCAGCATGACATCGCTCATTTCTAGTAATAGAGTGATCTTTTCATTTTTATCTTTCAGTTCATGCATGCCTTCATGCAATATATTTTCAGTTTTTAACCGCTCGGTAATATTTCTTTTGATATGCATCGCCCCAACAATATTATTTTGTGAGTTTTTTATTAAGCTAGATGTGACTTCATATATAATTTTTTTGTCATGTACATTAAATTCTATATTTTGAACATATTCTTTACCTTCGAGAGATTGTTTCCATGATGCTTTTAGTTTATTTTTTACTTCTGGAAAATTGATCAGAGCATCATCTAAACTCATTCCAATAGAAATTTTTGTATCAAAAAGACGCTGAAATTATTTTTCATAAGCGTGGTTAAAAATGATAAAACGATAGTTTAAATCAAGAGCAGCGATCATGTCACTTGCCCCTTCAATGATACTTCGTAATTGGTTTTCAAAATTTCTAATTTTGCTTTCGGCATGTCCTCGTTTTAATAGCTCTCGATTAAATAATAAAAATGCAAT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>NZ_LR699117|38777:67896|44460_45120_-|WP_114835030.1|DBSCAN-SWA MDTEAIETFDKFADEYDTWFDRHPAVFQSELAAFKKLIPESGDGLEIGVGSGRFASRRGIKTGVEPSDKLGEMAKIRGIDIHKCTAETLPFKDQQFDFILLSTVLCYVRVPLMALQEVKRVLKTNGILVIGMIDRKSFLGQIYEIKKQENKFYQHAHFYSAAEILDLLHEINFEEEVYQTIFSPIENISTPEPIKPDYGEGGFIVISAKLAKKFFYPSI |
33 | uncultured_virus(33.33%) | tRNA,transposase,integrase | attL 31720:31734|attR 51769:51783 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
88034 : 96848
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LR699115|88034:96848|DBSCAN-SWA CATGATTAGCTTACGTAACATCACCTTGCGCCGCGGCCAGACTATTTTGCTGCAGGACGTCAATTGGACCATTTATCACAAGCAGCGTATTGGGATCATAGGGGCGAACGGCTCTGGCAAATCCAGCTTGTTTGCCTTGTTGCTGCAGACGTTACATGCCGATAAAGGTGAGCTTGAAATTCCCCGGCAAATCCGCATTGCGCATGTAGCCCAGGAAACACCCGCTTTATCCATGTCAGCACTGGACTTTGTTCTGGATGGTGATATCGAATGGCGTGAATTACAAGCAGCGTTAAAAGAGGCTGAAGCAAAAAATGATGGTACGCGGATCGCCCTGCTGCACGAAAAGCTCAGCATTATTGATGGCTATACTGCACCCAGTCGGGCAGCCATTATCCTGGATGGGTTGGGCTTTAATCCGGAAGAACAACAAAAAGCAGTGAGTGATTTTTCTGGTGGATGGCGTGTTCGCCTGAATCTGGCAAAAGCATTGATGGCACGCTCGGATGTGCTGTTGCTGGATGAACCGACCAATCACCTCGATCTGGATGCCGTCATTTGGCTTGAGCAATGGCTTTTGAAATATGCGGGAACCTTATTACTGATCTCCCATGACCGTGATTTTTTGGATCAGACGGTTGATCACATTGCTCATCTTTCACACCAGCAGCTTAAATTGTATACCGGCAATTATTCTACCTTCGAAAAGCTGCGTGCCAATGAATTGCTCATGCAGCAAGCGGCATATGAAAAGCAGCAAAAAGCAATCGCGCATATGCAATCTTTTGTGGATCGATTTCGCTACAAAGCTTCCAAAGCGCGCCAGGCCCAGAGCCGACTAAAAGCATTAGAACGGATGGAAGTGATTTGTGCGGTTTCAGCCGAATCACCTTTTCAATTTCATTTCCGGCCGCCAGCACAATGCCCAAATCCTTTGTTGACACTTGAAAAAGCCGATGCAGGATATGGCGATAAATGTATTCTTCAGCATATCAATTTAAGCATTACCCCTAAGGATAGAATCACGATTCTTGGACCAAATGGTGCCGGAAAATCAACACTGATTAAACTGTTGGCGGGCGAACTCAGCCCTCTTCGTGGTAAAAGAGTGACAGGCCCGGGATTGAAAATAGGCTATTTTGCCCAGCATCAGGTTGACAGATTGCACCTTACTGAATCACCGCTCGCTCATTTGCGTGTGCTGGCAGAAAATGTACCTGAACTGGAATTGAGGAAGTACCTGGGTAGTTTTGGATTTTCAGGCGATATGGTATTAAAGTCAGTAGGACAGTTTTCAGGCGGCGAAAAATCACGCCTTGCGCTGGCGCTCCTGGTGTGGCAGCGACCCAACTTGCTACTGCTCGATGAGCCTACCAACCACCTGGATATGGACATGCGCAATGCACTCAGCATTGCCTTGCAGGAATATGAAGGCGCGATGATTCTAGTGACACATGACCGCTTTTTGGTGCGTTCAACCACAGACCAATTATTACTAGTGGCAAATGGTAAGCTGCAGCCTTTTGACGGTAATCTAGAGGATTATCAGCAGTGGCTATTCGAATTTCGCCGACAGCAAACCGCGGATACATCGGGATCACGAGACAAACCAGAAGAGTCACGTAAAGCGCAACGTCAGCATGAAGCAAAACAGCGAGAGCACCGCCGTCCTTTACTGCAGAAAATAAAAAAACTGGAAGATGAGCTGGCAAAATTACAAAAAGAAACGGCGCAAATTGAAGAAATGTTAACGGATTTGACGCTCTACGAGCCTCAGAATAAAGATCGGCTGCAAAAATACTTGTTGGCCCAGGCGCGCATCAAAGCCGCAGTCGAAGAGGCAGAAAATGCGTGGCTTAGCGCCTGCGAAGAAAAGGATCATCAAAATAACTAATTGATAATAATAGTTATTTATTGTAAATAGCCTGCTTGATAACACACTCGTATTTTTGTGTTTCTTGTTATATAAGTAGAGTTTGGGCTGAAAGAACTTTGCTTTCGAGCTAACAATAAATTGTATAAGAGCATTAAAAAATGAGGAGCCAATATGCCATTACTATTAAATCTGTGGGGTCCGGGTGAAAATGATGCAGGTCGACTGGAAATCAATGGCAAGGATCTAATTATCGAGTTTATCCCCCACACAAACTCGGCATCCGATACCAAACATGCGGCTATGCGCAGAGATCGTTTTAATTTTGCCCTTTCATTTTATTTATCTTATCTGCTCGAGGAACAGATTGATTACAGCAGCCTGGCCAGAATTACACAAGTCCAGGACGTTGAACGTGAAGGCTATTGTATTTTACTGAGCTTTAGCAAAAACGTGGATGCAGCTGTCATACAACTGCTCTTTGGGGGAGAATATTTGTCCCGCTCTGAATTGGCTAAATTTATGGATGAGGAATGCCGACGGAATATACTCGAGAAAACAGGAATTTATTTCAATCAGTTGCAGCAAAACAAGGATGAAATCAAAGAACGCAGTCATGGTGCTACCCGGCATCCTTTAGATGATTTAATCCAAGATGAATCCAATGAATTCGCAAAGCTAGATGCAGAGTATGAACTGGCAGCTAAAAACCATGCAAAGCATCTCGCGCAATATGAGGAAAAATTGGATGAGCAGAGCAGAAATCTGGCTCAACTGAACAAGGAGTTAAAGTTATTGGAACAAGCTATTAGCGAGTTCGCCCTAGAAGAAGAACAGCAGAAGAAGAAGTCACAGGAAGTCATGCTCGAAAAATATCACGAACTGATCACGCAGTTGGATCAGACTTATGCTGCAGCCAAGCTGCCTGTTGCGACGCCTTTGGTTACGTTGCATGAGCAAACAGGTATAGTAAATTCATCAGCTTTGGCAATCAAAATGGAATTTGAAACCCAGTTTGTGAAAATGGAAAATGCAATTGATCGAATTCAGCAAAGGAATCCTGTCGCTAAAATAGTGAATCAGTACGACGATGGTTTAAATAGTGAATTAGATGATAACAGAAATGTTTTTGAAGATTGGGCGGCGCAATCAAAAATCAAAACAGCTTACTATGCTAAAAGTATGGCCTTGCTGAAAAAAAATCTTGCTGAGTCTCAAACTGTACTAGTTTATGCAGCTTTTGAAGACCAGATTGCCATTCAGCGTACCATGAAAATAGAACAGCATCCCGATCATGAAATTTATGATGATATATGTATACTCGATGAGCAAGACAAGAAATTTTTTACCGAATTAGCTAAGCAAGTCACGTTAAATGCGCTCGCCCGCGAAGAAGAACTAAGAAACAAAATAGCGCTAGAGAACGCTCAAGTGACGGCGCCTGCTGCAAAACAGCTAACTTCTTATAAATCCCGGTCAAAGACAATGAGTTCCTCGTTTTATGAGGCGATGTCTAACTATACTTCGCAAGCGCGACAGCTGCTATTTACTACCTCAACCACCAATAAGGAAGTTGAGCTCAAGGAAAATAGCGGCACAATAACGCGCACTCGAGGTTTATCTTTTACACAGCAAAATAGCAAATGAGTTATCTAATTAGTCTTGATCATGTTTCACTCGCTTTTGGGCTGGATGCGCTGCTTGATAATGTCAAGCTGCAGATTGCTGGGGGCGAACGTGTTTGCTTAATTGGCCGTAACGGAGCGGGCAAGTCGTCGCTATTAAAAATTGTGGAAGGAACATGTCAGCCAGACAGTGGTACTGTCTGGCGTCAGCCGGGGCTACGGCTGTCCTGTCTTTCTCAGACGCTGCCTTCGGATCGTGAAATGACTGTGTATGAATACGTTGCGCAAGGGTTGGCTAGCACGGGTCAATTACTCGCAGCTTATCATGCGCTGACACAAAAAATTGCATTATCGCATACAGAGCGGGATTTAGCGGAACTGGAGCAATTGCAACACCGTATCGATGTTAATCAAGGATGGGCGTTTGAGCAGAATATCAATACCACACTAAGCCGACTGGAATTGAATGCGGACCAGAAAATGGCTGATTTATCCGGCGGCTGGCAGCGCCGTGCGGCACTTGCACGGGCCTTGGTGTCAGCACCTGATTTACTATTACTTGATGAGCCGACCAATCATCTCGATATTCATGCCATTCAATGGCTGGAAGAGTTACTGCTTTCAAGCAGCGTGACACTTCTGTTTGTGACGCACGATAGGACTTTGTTACGTCGTCTGGCAACACGTATTATTGAGCTGGATCGCGGACAACTGACTTCCTGGCCGGGTGATTATGATAATTTTCTGCGCCGCAAGGAAGAAATGCTGCACGCGGAAGCCAAGCAAAATGTAGAGTTTGATAAGAAGCTGGCGCAGGAAGAACGATGGATTCGGCAAGGCATCAAGGCTCGTCGTACGCGTAATGAAGGGCGTGTCCGCGCTCTTTATGCTATGCGCACAGAGCGGGCAAAACGTCGCGAAGTGCAGGGTGCATCATCCTTTAATATGAATACGGCGGAGCAATCCGGGCAGGTAGTGATAGAGGCAAAAAACATTTCCCACCATTTTAATCATACGCCGGTGATTCATAATTTCTCATTACGTATCATGCGCGGCGATAAGATTGGTCTCATCGGTCCCAATGGCGCTGGTAAAAGCACATTGCTGAATATTTTATTGGGGGAGTTGACGCCGCAACAAGGCTCTGTGACGCACGGAACCAAATTACATATCGCCTATTTCGATCAGTTGCGTCGTAATCTCGATTTGGAAAAATCTGTGATAGATAATGTTGCAGAGGGAAGAGAGTTTATTGAAATCAATGGTAATAGACGGCATATCATCAGCTATCTTGGTGATTTTCTCTTTACCCCGCAGCGTGCATTAACACCCGTTAAAGCGCTATCCGGAGGCGAATGTAACCGTTTACTGCTGGCGAGATTGTTTTCCCAGCCGGCTAATTTACTGGTCATGGATGAACCGACTAATGACCTTGATATTGAAACCTTGGAATTACTTGAAGAATTACTCAGTGAATATCAGGGCACACTGTTATTAGTGAGTCATGATAGAACTTTTTTGGATAATGTGGTAACCAGCACGCTGGTATTTGAAGGCAATGGTAAGGTGAGAGAATATATAGGCGGTTATCAGGACTGGTTGCGTCAGAGAAAAACAGAACCTGCACCGATGCTTCAGCCAGCACGCCAGCCAGCGCAGGCGATTCATCAAAAAATATCAAAGCAAAATAAAAAATTAAGCTATAAAGAGCAGCGTGAGTTGGATAAATTGCCGGCAAAGATCGAGGCACTGGAACACCAACAGAACGAATTACAAACCGAAGTTTCAAGTCCCGAATTTTATAAAAAGTCCCCTGATGTTGTTACCGAAACATTGGCAAAGTTGAAGAAAATATCCACGGATCTGGAGCAAGCCTATCAACGTTGGCAGGAATTGGAAGATCGATCATCCTGATATTTTGGGTTGTCACACGGGAACGATCCCGTGTGACAATATTAAATTGAATCCCCGGTTTTAATTGACTGCATTAGGTTTACCATTTGAATCGCCGCATCTGCTGCTTCAACGCCTTTGTGGCCTATTTTGCCGCCCACACGGTCTTCAGCCTGCTGCATATTGTTGGTCGTTAAAACGCCAAATATGACAGGAATTTCATAATCCAGCATCACGCGCTGACAACCTTGGCTCACCTGCTCACAAACATAATCATAATGATCTGTATCGCCTCGAATGACGCAGCCGAGACAAATAATGGCTGCATATTTTTTTGATTTTGCCAGCAATTGTGCAGGGAGAGGAATCTCAACTGCACCAGGGACACTGATCACAGTGATACTGTCCTGGTTAATGCCTTGAGCCTTTAAACCTGATAAAGCGCCTTCAAGTAATTTGTCTGTTATAGATTGATTGTACTGACTGACGACAATGGCAAATTTATTTTTCATTATCAAATTTCCTTACTGCTTAATTGCAAATCAAGGTGAATGGAGTGATTGAGCTTTTGTTTTTTGGTAAGCAGATAATGGCGGTTATGTTCATTATCAAAAGCGGGCAGCGCCACTTGGGTGACGTGGTCAACACCGTAGGCGATGAGGTCATTAATCTTATGCGGATTGTTTGTTAATAACTGTACGCGATTAATGTGCCGATTACGCAGGTAATTGGCTGCAATATAATATTTTCGGGCATCCACCGGCAATCCCAGTTTTTGGTTAGCTTCAACGGTGTCATAACCCTGTTCTTGCAGTGCATAAGCTTTTATTTTGTTGAATAAACCAATGCCTCTGCCTTCCTGACTCAGGTAAATTAACATACCGCCTTCTTCACTGATTTTTTTCAAGGCGAAGTGTAATTCCTGGTGGCAGTCACAACGCTGCGAAGCGAATAAATCACCGGTCGTGCAAGAGGAATGGACGCGCACAAGCAAAGGCTCATCTGGGGCGCGTGGGGCTTTGGAGAGGACCACATGCTGTTCGCCGGTAATTTTTTCTTTTATGACAGTGATGTTAAACATTCCGTAATTTTCAAGCGGAAGCGATGTAGCAGTTTCTTCTTCAATCAGATTTTCGCGATTAAGACGATAAGCAAGGATGTCATTCACGGACAGCAAGGTGAGCCCATGCTGGGCAGCAAAATTTTCCAATTGCTCGCCGCGCGTCATCGTGCCGTCTGTGTTCATTAGTTCACAAATGACTGCAGCGGGTTTTAAACCTGCCAATCGCATTAAATCAATGGAACCTTCGGTATGGCCTTGGCGTTCCAGCACCCCGCCGTCTTTGGCATGCAAGGGGAACACATGGCCGGGTCTTGCCAGATCTTCCGGTTTTGCATCATCACTGATAGCGAGCTGAACAGTCTTTACACGATCTGCCGCGGAAACACCACTTACTTCTTTTGCATCAATGGAAATTGTAAAGGGTGTACTGACAAAACTGGTATTTTCATTCGGTGGAACCATCAAGGGTAATTGCAATTGTTTTAATTTATCGGAGGTAAGCGGCAGACAAACAATGCCGCTGCCTTCACGAATCATAAAATTCATGATTTCAGGTGTAATCATTTCAGCTGGAAACACCAAGTCACCTTCATTTTCACGGCTGGCGTCATCCGTCAAAATAACCATTCTGCCTTGGCGCAGTTCCGCGAGCGCTTTTTCCACGCGTTTAATTTCAGGACGCATTAGCATACCCTCCCAGCAATTTTTCAACATATTTACCCATTATGTCGACTTCGATATTAATCATGTCGCCTTCGCTATATTGATGTGTGATGGTGACGGCCTGTGTATGGGGGATAAAGGTTACTGTAAACCATTCAGGCGTGGATTCGATGACGGTGATGCTCATGCCATCCAGGCCAATATAGCCTTTGGGCACCACGTATTTTGATAATTTTTCCGGGAGACTGATTTTCACCAGCCAGGCGTCACTCGCATCGTTTTTTATTTCTAGGATTTGACCGATCCCATCCACATGGCCTTGCACGTAATGACCGCCAATACGACGATTTAATGTCAATGAGCGCTCTAGATTAACCTTGCTGCCGACGGTGAGCCGATCCAGATTGGTTAGCCGTAAGGTTTCAGGAACAGCAGTAACCTGGAAGCTTTGGTCGGTAAACTGGGTAACAGTTAGGCATACGCCATTCACAGCAATGCTGTCGCCCACAACAAGGTCGTTAAAGACAGATTGAGGTGAAATGGTAAATTGTTTGCATCCATTTATTATTTCCAGTTGAGTAATGATACCCATTGTTTCGACTATTCCGCTGAACATGTGTGCTCCTTATAATAGTTGGCTTCAAAATGAAAATCGCCGTGGATTTGAGAAAACTGGACGTAAGGGATAAGCTGTTTTTGTTTCATAGCGCCTATAATCACAGGCGCAAGATAGACATGGATTTTGTTTACTAGGTTTTTTCTGAAAAAACTCTCATGTATAGTCATCCCGCCTTCGACCAGCAGACTAGTAATATTCTTTTTGCCAAGTTCGTCCAAAAGACTTGATAAATCAACCCGACCTTGTTCATCGGGAGGCAAAACCAGTACTTCAATATTTTTATCGCGCAAGGCCTTGTGCTGATCTGCCTTCATTGCATCAGTTGTAGCTAGCAGGATTTTAGCGGGCATTGAGGAATCAAAAAGCCGTAAATCAAGCGGTAGTTCACCGCGGCTGGATAAAATAAGGCGAACAGGATGTTTGATGTTTTTTTCATTCTCTGCATCAAGACGGACAGTGAGCAGTGGGTTGTCGTCGATGGCTGTGCGCGCGCCAATTAAAATAGCATCAACTTGTTGTCTTAGCAGATGAGTAGTATGCCGTGACTCACTGCTGGAAATATTTTTGGAATCGTGTGGATGAGTGATGGTTTTTCCATCCAGTGACATGGCCCATTTGGCAATCACAAAGGGACGCTTATGGCGCATGAAATGAAAAAATATTTCATTTAAGCGGCTTGCTTCTGCCTCTAGCATGCCCGTTTCAACCGTTATTCCTGCTTCCCGCAGCGCTTCAATGCCTTTACCTGCCACAAGTGGATTGGGGTCAAGGCAGGCGACGTAAACTTTTTTTATACCTGCCCGAATAAGGGCATCCGTGCAAGGCGGTGTTCGATTGTAATGGCAGCAGGGCTCGAGTGAAACATAGGCAGTTGCGCCCCGGGCTGCGGTTCCAGCTTCACGCAGAGCATAAATTTCTGCATGCGGTTCACCCGCGCGTTGGTGAAATCCTTGTCCGACAATGCGGTCATCTTTGACGATAATGCAACCTACCATCGGATTAGGCGAAACCGTCAAACGGCCTTGTTCAGCCAGTTGAAGTGCGAGTGACATGAAGCTTGAATGGGTTGTTGCCTGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LR699115|88034:96848|88034_89927_+|WP_114834638.1|DBSCAN-SWA MISLRNITLRRGQTILLQDVNWTIYHKQRIGIIGANGSGKSSLFALLLQTLHADKGELEIPRQIRIAHVAQETPALSMSALDFVLDGDIEWRELQAALKEAEAKNDGTRIALLHEKLSIIDGYTAPSRAAIILDGLGFNPEEQQKAVSDFSGGWRVRLNLAKALMARSDVLLLDEPTNHLDLDAVIWLEQWLLKYAGTLLLISHDRDFLDQTVDHIAHLSHQQLKLYTGNYSTFEKLRANELLMQQAAYEKQQKAIAHMQSFVDRFRYKASKARQAQSRLKALERMEVICAVSAESPFQFHFRPPAQCPNPLLTLEKADAGYGDKCILQHINLSITPKDRITILGPNGAGKSTLIKLLAGELSPLRGKRVTGPGLKIGYFAQHQVDRLHLTESPLAHLRVLAENVPELELRKYLGSFGFSGDMVLKSVGQFSGGEKSRLALALLVWQRPNLLLLDEPTNHLDMDMRNALSIALQEYEGAMILVTHDRFLVRSTTDQLLLVANGKLQPFDGNLEDYQQWLFEFRRQQTADTSGSRDKPEESRKAQRQHEAKQREHRRPLLQKIKKLEDELAKLQKETAQIEEMLTDLTLYEPQNKDRLQKYLLAQARIKAAVEEAENAWLSACEEKDHQNN >NZ_LR699115|88034:96848|95750_96848_-|WP_114834644.1|DBSCAN-SWA MQATTHSSFMSLALQLAEQGRLTVSPNPMVGCIIVKDDRIVGQGFHQRAGEPHAEIYALREAGTAARGATAYVSLEPCCHYNRTPPCTDALIRAGIKKVYVACLDPNPLVAGKGIEALREAGITVETGMLEAEASRLNEIFFHFMRHKRPFVIAKWAMSLDGKTITHPHDSKNISSSESRHTTHLLRQQVDAILIGARTAIDDNPLLTVRLDAENEKNIKHPVRLILSSRGELPLDLRLFDSSMPAKILLATTDAMKADQHKALRDKNIEVLVLPPDEQGRVDLSSLLDELGKKNITSLLVEGGMTIHESFFRKNLVNKIHVYLAPVIIGAMKQKQLIPYVQFSQIHGDFHFEANYYKEHTCSAE >NZ_LR699115|88034:96848|93938_95171_-|WP_114834642.1|DBSCAN-SWA MRPEIKRVEKALAELRQGRMVILTDDASRENEGDLVFPAEMITPEIMNFMIREGSGIVCLPLTSDKLKQLQLPLMVPPNENTSFVSTPFTISIDAKEVSGVSAADRVKTVQLAISDDAKPEDLARPGHVFPLHAKDGGVLERQGHTEGSIDLMRLAGLKPAAVICELMNTDGTMTRGEQLENFAAQHGLTLLSVNDILAYRLNRENLIEEETATSLPLENYGMFNITVIKEKITGEQHVVLSKAPRAPDEPLLVRVHSSCTTGDLFASQRCDCHQELHFALKKISEEGGMLIYLSQEGRGIGLFNKIKAYALQEQGYDTVEANQKLGLPVDARKYYIAANYLRNRHINRVQLLTNNPHKINDLIAYGVDHVTQVALPAFDNEHNRHYLLTKKQKLNHSIHLDLQLSSKEI >NZ_LR699115|88034:96848|93486_93936_-|WP_114834641.1|DBSCAN-SWA MKNKFAIVVSQYNQSITDKLLEGALSGLKAQGINQDSITVISVPGAVEIPLPAQLLAKSKKYAAIICLGCVIRGDTDHYDYVCEQVSQGCQRVMLDYEIPVIFGVLTTNNMQQAEDRVGGKIGHKGVEAADAAIQMVNLMQSIKTGDSI >NZ_LR699115|88034:96848|95160_95766_-|WP_114834643.1|DBSCAN-SWA MFSGIVETMGIITQLEIINGCKQFTISPQSVFNDLVVGDSIAVNGVCLTVTQFTDQSFQVTAVPETLRLTNLDRLTVGSKVNLERSLTLNRRIGGHYVQGHVDGIGQILEIKNDASDAWLVKISLPEKLSKYVVPKGYIGLDGMSITVIESTPEWFTVTFIPHTQAVTITHQYSEGDMINIEVDIMGKYVEKLLGGYANAS >NZ_LR699115|88034:96848|91549_93445_+|WP_114834640.1|DBSCAN-SWA MSYLISLDHVSLAFGLDALLDNVKLQIAGGERVCLIGRNGAGKSSLLKIVEGTCQPDSGTVWRQPGLRLSCLSQTLPSDREMTVYEYVAQGLASTGQLLAAYHALTQKIALSHTERDLAELEQLQHRIDVNQGWAFEQNINTTLSRLELNADQKMADLSGGWQRRAALARALVSAPDLLLLDEPTNHLDIHAIQWLEELLLSSSVTLLFVTHDRTLLRRLATRIIELDRGQLTSWPGDYDNFLRRKEEMLHAEAKQNVEFDKKLAQEERWIRQGIKARRTRNEGRVRALYAMRTERAKRREVQGASSFNMNTAEQSGQVVIEAKNISHHFNHTPVIHNFSLRIMRGDKIGLIGPNGAGKSTLLNILLGELTPQQGSVTHGTKLHIAYFDQLRRNLDLEKSVIDNVAEGREFIEINGNRRHIISYLGDFLFTPQRALTPVKALSGGECNRLLLARLFSQPANLLVMDEPTNDLDIETLELLEELLSEYQGTLLLVSHDRTFLDNVVTSTLVFEGNGKVREYIGGYQDWLRQRKTEPAPMLQPARQPAQAIHQKISKQNKKLSYKEQRELDKLPAKIEALEHQQNELQTEVSSPEFYKKSPDVVTETLAKLKKISTDLEQAYQRWQELEDRSS >NZ_LR699115|88034:96848|90080_91553_+|WP_114834639.1|DBSCAN-SWA MPLLLNLWGPGENDAGRLEINGKDLIIEFIPHTNSASDTKHAAMRRDRFNFALSFYLSYLLEEQIDYSSLARITQVQDVEREGYCILLSFSKNVDAAVIQLLFGGEYLSRSELAKFMDEECRRNILEKTGIYFNQLQQNKDEIKERSHGATRHPLDDLIQDESNEFAKLDAEYELAAKNHAKHLAQYEEKLDEQSRNLAQLNKELKLLEQAISEFALEEEQQKKKSQEVMLEKYHELITQLDQTYAAAKLPVATPLVTLHEQTGIVNSSALAIKMEFETQFVKMENAIDRIQQRNPVAKIVNQYDDGLNSELDDNRNVFEDWAAQSKIKTAYYAKSMALLKKNLAESQTVLVYAAFEDQIAIQRTMKIEQHPDHEIYDDICILDEQDKKFFTELAKQVTLNALAREEELRNKIALENAQVTAPAAKQLTSYKSRSKTMSSSFYEAMSNYTSQARQLLFTTSTTNKEVELKENSGTITRTRGLSFTQQNSK |
7 | Tupanvirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
43227 : 76984
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LR699116|43227:76984|DBSCAN-SWA TATGTACGAGTGTACGCAAAAAATCATTAAAAACAAGGTCGGTCTGTTAAATTTGGCAGAAGAGCTAGGGAATGTATCAAGAGCCTGCAAGGTAATGGGCTTCTCCAGAGATACGTTTTATCGTTATAAATCAGCAGTTGAGCAAGGAGGCATTGAGACCTTGTTCGACAAGAGCAGACGGCAGCCAAACATCAAGAACCGCACCGATGAAGCTACAGAGAATGCTGTATTGGACTATGCCATTGAGTACCCCGCGCATGGTCAATTAAGAGTCAGTAATGAGCTTAGGAAAAGAGGTGTTTTTGTTTCTCCTAGCGGTGTTCGTTGCATCTGGCTAAGGCATGATTTGGCATCATTTAAACAGCGTCTAACCGCACTGGAAAAGAAATCTGCCGAGGAGAACTTAATTCTAACTGAAGCACAACTGGCCGCGCTAGAACGCAAAAAAGACGATGATATGGCCTGCGGTGAAATTGAAACAGCACATCCTGGCTATCTTGGTTCACAAGATACCTTTTATGTTGGCAATCTCAAGGGTGTTGGGCGCATTTATCAGCAAACATTTGTTGATACCTACTCCAAAGTGGCTCATTGCAAGCTATATACCACAAAAACACCGATTACATCTGCTGACCTGTTAAATGATCGTGTGTTGCCATTCTTTGAAGAACAAGGCTTGGGCTTGCTGCGCGTATTAACGGATCGTGGCACTGAGTTTTGCGGCAAGGTAGAGCAACACGATTACGAGTTGTATTTGGCGCTCAATGATATTGAGCACACCAAAACGAAAGCTCAATCACCCCAGACCAATGGCATCTGTGAACGCTTTCATAGGACGATTCTGAATGAGTTTTATCAGGTTGCTTTCCGAAAGAAAGTTTACACAACTATTGACGAGTTGCAAAAAGATCTGGATGATTGGCTCGGTTATTACAACAATGAACGCACACATCAGGGTAAAATGTGTTGTGGCCGAACTCCGATGGCGACATTGATTGATGGTAAAAGAATCTGGAAGGAAAAAGTTGATAATCTCAACTTGAACTGACAGTAAAACCGTAACTGAAAAACGGGTAACTGTCAGATCAAGTCGGAACTTTTACAAATAATAGATACTACAGGAACGTTAGGATTTGCAGCTTTGCCACCTATGCTTGCTGCTATTGACCAACCCATTGGGCTCATCGATTTTACCTGAGTGAAGTGTTGTCTTGGTTCGTAGCAAATCCAATAATGCGACGCGATAAATCCGCTGGCACCTTCACCAGAAAATAATATCGTATTTTTTGGCATCACAGCACGTAATTCTTTTATAACACGCGCAGGATGGATAGGGATCTTATTGCTAGATAAATTTTCTTCGTCATAAAATTGAGGAATTTTTTTGTTGATTGTTTCAATCCATTTCTTTCTTTCGCTAATTGAATGTCGTAGTATTTTATTATCGCTGGATCGATTTAATTCTGCTAAAAACGTCTTAGTATCCCCTAAAATAAATAAATCAGGCGGGAAATTTCCGAAATAACTATTCTCGTTAATATCATTTATTATCAAAGCCTTACTTGGCAAAAACTTTTTCGACCACTTGGCAGTAGTAACTTGATTTAATCGAGAACCTAACACAATTAATACTTCAATTTCATCGCCTAATATTGTTTCTATAGCTCGAGGATTTCCAAACCAATTGAGGACGCCCAAGGATAACCGATGGTTCTCTGGAAAAACGCTTTTTCCGGCCAGGGTCGTTGCAATGGGGATCTCAAAATTCTCTGAGAAATGAACCAATTCCTCGGTGCTTTCAGAATGCAAACATCCCATTCCTGCAAGAACAACTATTCTTTGAGCGTTTTTTAAATAGCTCCATATTTTATCACATGCCTCGCGGTCCAAACTGCGAGGATGATAAAGTGAAGGGGACAGTTTTTTTATTGTAGAATTTATTTCACAATTTTCAAAATCAGATGGAATCGTAAGTTGCACAGGACCACGATTAACACCAAGCATATTTCTCAATAATGAATCGATGTGCGGTTTAAGTGTTTCAGCGTGAGTCACAACCAAACGTTTATTAGTTACTGGCATCAAAAAAGTATTTGCATCAAAATTAGAGGGTGTTGTATCTTGAAAACTACCACGTCCTTGTAAATTTGATTCTGCATCCCCAGTGATTATAAATATTGGCGTTTTGTCGCTAAAGGCCGTTGTAATGGCTGTCATCATATTAGTAATACCAGGTCCTCCAATACCTGCCACGATACCAAATTTTCCACTGACTTTCGCATAACCATCAGCCATCATAGCAGCACCACCTTCATGCGCAGCTACAATCCCAGTAAAGTCTGGAAATATTTGAAGTGCTGACATAATAGGATCAACATGAAAACCAGGCACCATAAATAAATGTCGAATACCTTCTTGTTCGAACATTTTAATTAAATATTCAGTAGCCTTCATGTATGGATTTCCAAATATTATTTGGATTTCTTTTTCAAGTAAGACGCGCTCTCGTTAATCCAATCTTCGCGCACAGGGGTGAAAAAATCGATATCAATCGTATCTTCTAAAGCAAAAAATTCATGGGGAACGTGCGGTGGAAAAATAATAATTTCGCCAGACTTTATAATAAATTCTTTTCCTTGTGAAAAAACTTTGACTGATCCTTTAGTTATCCACGTAATTTGTTCATTTACATGGTGATGCAAAGGAACTTCTGCGCCTTTTTTAAATATCCATTTAACTAGCATAGATTGACCAGAATATATGTATTGACGCGAAATTTTATCGTTAACCGTTTCGATAGACATATTTTCAAAATTGTAGAAAATAGGAGATGCTTTATAATGCTCAAAAATATGAGGAACAATACCAGAAGTCTTACTTTTCTGTCCTTTTGATTTCGTTTTCACACAATTTCCTCTTAAAGCTGGGCGAAAATAAAAACAGAAATGACTTATACTCATATTAACATATTTGTTTTAACATAATCTATCAGCTTGCTTATTTTGGTAACACTTGACCCTCATTTGAATAAATTTATTTCTGATATAGATAGCTCCTGACTGTTTCTATCCTATTAAATTTACTAAATATTCAATTAGTTAAAAATATTGAGTGATTAGCTATACTTAATATGATCTCATATTTATGGAGAAAGCATGACTACCAGCCGTTATTATCCTGATATTGATGTGACAAAAGTTAATTTGGAAAGTCATTCGGATGATGCTTCCCTTCTTTATCAATTTTTGTTGAACAACAAGGAGGATGTTATTAAGCCTGACGAAAAATTGACAGCAAAAGACCAAAAAGGCAATGCAAGCTATTTTCGCTTGGATTATCAAGCAGGTTACGGACTGCTTAAACGGAAGCGTTCTCATTCTAATGAAACAGTCTATGAGGTCATCGGACCGCGTATCGGTGCTGGAGAAAATGGAGAGGTTTTCAAAAGTGTCGGATATCTGTATTTTGATCATGTTAGGAAAAAAATTTGCTTTAAAAGTCGAGAAATGGCAATTAAACATGTTACTAAAGAAAGCGAAGATTATTTAATTAAAGAATATCAAATGACTCGATTAGCTGGACTTTTTAAAGTTAAATCCCCTATCATTTTTCAGAAAAAATATTCTTTACCAAAAAAATTTGAAATGTATATGGTAATCCAGTTTATTAAAGGTCATACATTAGCAGAAGTAGCCTATATTTCGTCAGATGGAAAATTTCTAAGAGATGCAGACCTACGATTATTAAATAACAACCAAAAATTTACCGCTGATGAGCGTATTAAGATAAGCATTAATTTGTTAAAATGTGTTAAGCAGTTAAATAGACGCAATATGGTTTGTGACGATATGCATAACTTAAATGTCATGATAGATCCTGTCACGTTTGATGCGTTTATAATTGACTTTGGTGGACCAGTGTCATTGGTTAATGCAGAGCAAAGTGACAGATTAAAGGAAAATATATATTGCATTATTTGTCACATAAGAACATTATGGTTAGATGATATTAAAAAGGGTGAGAATGAATATGACCATTTAAAAAACCTTGGCTTAAATGATAAACATATTAGTGAGCTATTGAAGTTTATGCGATTAACCATGAATGATTTTGAACTGAATTCAGTTGATTTATTTATTGATCAATTTCGTCAGCTTGGTATTGGTAGGCTGCTTGATTCAACGAATGGAAGTGAAAGGTCATATTTAGAAAATTCTATATCCCAGGCTAATCTCGCGGTCCATGAAATAAACACGGCTACATCAAAATTAGATTCTCTGGTAGCACACGCATCAATAATTATTAAATATGCCCAGTCTATTAAAAATGACGAAATTTGTGTAAAAACTTTTGTTGAAACACTTGGCATAAACTACTTACTTAAGGCTCGCACAACCGATGATGTTATAAACACATTAATAGAAGTTACCAAAGCTTACGCTAGCGTAGAGGAAAAAAAAGGTGATATTATCAGAATAAAAAATATCCTGCTATCATGCGAGGAAATGGCTAAAAATGGGGCTAGGCAGGAGTATGATCATAATAGAATTAGTAATTATCTTCAATACATTGAATATTTGTTAAATGAAAAGACTGCGAATATGACTATTCGTGATGATATAGTTAAGGTTGCGCAAAAACTTGATAAGTTTATTGCTGAGATATTAAGTGAGGTTAACCACGAAGAAACGCCTGGTAAATTATTCCCCTTTATGAGCAAATTCGCAAATGCTGGTCTTACGGATAAATTATCTGAACTTGAATTTATCCATTTAAAAGAAAAATTGATTTTTTCTGTCCGAAAATGCCAATCAGAATATACTACATTATTTAATACACTTATAAGCAGCAGATCTCAGTCTGACACGAGAAAAAAAGATATTAATGAAATAACAAAAATAATAGATCAAGCTAAAACTAGAGACGAATTAACAGAGCAATTGATCAGTTATTGTAAAAATATTAAAACTGGCCTACTTGGAAGAAGTGAATTGGCAAGT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30 | Escherichia_phage(54.55%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
900221 : 969389
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LR699114|900221:969389|DBSCAN-SWA 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60 | Escherichia_phage(18.75%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1491371 : 1543896
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LR699114|1491371:1543896|DBSCAN-SWA 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44 | uncultured_virus(30.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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